BIO1-seminar

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak ponedeljek od 11:00 do 12:30.

Ocena seminarjev predstavlja ??% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/tbk/ username: tbk password: samozameDD

Seznam seminarjev

Ime in priimek Naslov seminarja Link Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3
Rok Ferenc Nov način zdravljenja Androgenic alopecia http://www.sciencedaily.com/releases/2012/10/121026125127.htm 04.03. 07.03. 11.03. Jure Fabjan Marjeta Horvat Tadej Rozman
Mojca Juteršek Sekrecijski sistem tipa III pri Pseudomonas aeruginosa in vpliv metabolizma na njegovo izražanje http://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130130083017.htm 04.03. 07.03. 11.03. Boštjan Petrič Maja Zupančič Milena Jovanov
Tjaša Bensa Sulforafan kot potencialni kandidat za zdravljenje levkemije http://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121212205602.htm 04.03. 07.03. 11.03. Peter Prezelj Luka Kavčič Nina Pirih
Petra Tavčar Zdravljenje Huntingtonove bolezni s proteini s cinkovimi prsti http://www.sciencedaily.com/releases/2012/10/121010131358.htm 04.03. 07.03. 11.03. Ana Krišelj Alja Zgonc Urša Kapš
Tilen Komel 11.03. 14.03. 18.03. Rok Ferenc Jure Fabjan Marjeta Horvat
Urška Kašnik Propionibacterium acnes - bakterija, ki povzroča akne http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130228080135.htm 11.03. 14.03. 18.03. Mojca Juteršek Boštjan Petrič Maja Zupančič
David Pignar 11.03. 14.03. 18.03. Tjaša Bensa Peter Prezelj Luka Kavčič
Maruša Prolič - Kalinšek Živčni strupi in butirilholinesteraza http://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130111101450.htm 11.03. 14.03. 18.03. Petra Tavčar Ana Krišelj Alja Zgonc
Domen Klofutar MICU1 kot regulator koncentracije Ca2+ v mitohondrijih http://www.sciencedaily.com/releases/2012/11/121127130025.htm 18.03. 21.03. 25.03. Tilen Komel Rok Ferenc Jure Fabjan
Jakob Rupert Vplivi na vezavo Aβ-oligomerov na nepatogene prione PrPC in povezava z nastankom Alzheimerjeve bolezni http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130205200241.htm 18.03. 21.03. 25.03. Urška Kašnik Mojca Juteršek Boštjan Petrič
Helena Jakše Resveratrol kot preventiva proti raku http://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121205084419.htm 18.03. 21.03. 25.03. David Pignar Tjaša Bensa Peter Prezelj
Lenka Tomešová Key to Controlling Toxicity of Huntington's Disease Protein May Be Cell Contents http://www.sciencedaily.com/releases/2012/06/120606092537.htm 18.03. 21.03. 25.03. Maruša Prolič - Kalinšek Petra Tavčar Ana Krišelj
Simon Bolta Vloga rjavega maščobnega tkiva pri termogenezi http://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130313160754.htm 25.03. 28.03. 08.04. Domen Klofutar Tilen Komel Rok Ferenc
Vita Vidmar Posttranskripcijska regulacija cirkadianega ritma pri Synechococcus elongatus http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130217134246.htm 25.03. 28.03. 08.04. Jakob Rupert Urška Kašnik Mojca Juteršek
Sabina Štukelj Struktura in pomen antifreeze proteinov http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130218092501.htm 25.03. 28.03. 08.04. Helena Jakše David Pignar Tjaša Bensa
Nika Strašek Zdravljenje avtizma s suraminom http://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130313182019.htm 25.03. 28.03. 08.04. Lenka Tomešová Maruša Prolič - Kalinšek Petra Tavčar
Vid Jazbec Interakcije seratoninskih in glutamatskih ter steratoninskih in dopaminskih receptorjev ter vpliv na psihoze http://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130307145720.htm 08.04. 11.04. 15.04. Simon Bolta Domen Klofutar Tilen Komel
Aneta Atanasova 08.04. 11.04. 15.04. Vita Vidmar Jakob Rupert Urška Kašnik
Rok Ipšek Delovanje alfa hidroksi kislin kot eksfoliantov http://www.sciencedaily.com/releases/2012/08/120813155644.htm 08.04. 11.04. 15.04. Sabina Štukelj Helena Jakše David Pignar
Helena Šneberger Nova imunološka terapija zdravljenja alergije na jajca http://www.sciencedaily.com/releases/2012/07/120718192044.htm 08.04. 11.04. 15.04. Nika Strašek Lenka Tomešová Maruša Prolič - Kalinšek
Tim Božič HMCV z vezavo glikoproteina UL141 na smrtne receptorje TRAIL spodnese imunski odziv http://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130313123504.htm 15.04. 18.04. 22.04. Vid Jazbec Simon Bolta Domen Klofutar
Sara Košenina Zdravljenje Alzheimerjeve bolezni z grelinom http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130402182457.htm 15.04. 18.04. 22.04. Aneta Atanasova Vita Vidmar Jakob Rupert
Eva Krivec 15.04. 18.04. 22.04. Rok Ipšek Sabina Štukelj Helena Jakše
Jan Rozman Ciljanje kronično levkemičnih celic z monoklonskim protitelesom specifičnim za CD44 http://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130325160234.htm 15.04. 18.04. 22.04. Helena Šneberger Nika Strašek Lenka Tomešová
Eva Vidak Antigenska subverzija - nov mehanizem s katerim se virus Ebole izogne imunskemu odzivu gostitelja http://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121213172300.htm 22.04. 25.04. 06.05. Tim Božič Vid Jazbec Simon Bolta
Toni Nagode Makromolekulski uničevalec RNA http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130204094606.htm 22.04. 25.04. 06.05. Sara Košenina Aneta Atanasova Vita Vidmar
Ema Guštin Vloga regulacije kompleksov Vps34 pri avtofagiji http://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130117132921.htm 22.04. 25.04. 06.05. Eva Krivec Rok Ipšek Sabina Štukelj
Dominik Dekleva Encimsko mapiranje proteinov v celici http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130212210009.htm 22.04. 25.04. 06.05. Jan Rozman Helena Šneberger Nika Strašek
Mojca Kostanjevec Sintetični nanodelci funkcionalizirani z biomimetičnimi levkocitnimi membranami http://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130131144114.htm 06.05. 09.05. 13.05. Eva Vidak Tim Božič Vid Jazbec
Eva Oblak Zvonar Vodikov sulfid, potencialno preventivno in terapevtsko sredstvo pri staranju in s starostjo povezanih boleznih http://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130129121945.htm 06.05. 09.05. 13.05. Toni Nagode Sara Košenina Aneta Atanasova
Barbara Sopčić 06.05. 09.05. 13.05. Ema Guštin Eva Krivec Rok Ipšek
Tadej Rozman Protein alfa-sinuklein se obnaša kot virus http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130425213758.htm 06.05. 09.05. 13.05. Dominik Dekleva Jan Rozman Helena Šneberger
Milena Jovanov 13.05. 16.05. 20.05. Mojca Kostanjevec Eva Vidak Tim Božič
Nina Pirih http://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130128133820.htm 13.05. 16.05. 20.05. Eva Oblak Zvonar Toni Nagode Sara Košenina
Urša Kapš Smc5/Smc6/MAGE kompleks daje odpornost pred kofeinom in genotoksičnim stresom v Drosophila melanogaster http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130418100150.htm 13.05. 16.05. 20.05. Barbara Sopčić Ema Guštin Eva Krivec
Marjeta Horvat Spremenjeno izražanje genov kot posledica metode RYGB oz. obvoda želodca http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130411123845.htm 13.05. 16.05. 20.05. Tadej Rozman Dominik Dekleva Jan Rozman
Maja Zupančič Jedrni receptorji PPARβ/δ in PPARα, ki usmerjajo metabolične procese za regulacijo v mišjem srcu http://www.sciencedaily.com/releases/2013/05/130508102648.htm 20.05. 23.05. 27.05. Milena Jovanov Mojca Kostanjevec Eva Vidak
Luka Kavčič Odsotnost proteina Sec24A zniža nivo holesterola v krvni plazmi preko zmanjšane sekrecije proteina PCSK9 http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130410141535.htm 20.05. 23.05. 27.05. Nina Pirih Eva Oblak Zvonar Toni Nagode
Alja Zgonc p53 učinkovito zatira razvoj tumorja v popolni odsotnosti p21, Puma in Noxa http://www.sciencedaily.com/releases/2013/05/130509123532.htm 20.05. 23.05. 27.05. Urša Kapš Barbara Sopčić Ema Guštin
Jure Fabjan Vpliv Dkk1 na nevrogenezo v starosti http://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130207131511.htm 20.05. 23.05. 27.05. Marjeta Horvat Tadej Rozman Dominik Dekleva
Boštjan Petrič RNA z Fe2+ kot kofaktorjem katalizira prenos elektronov http://www.sciencedaily.com/releases/2013/05/130519145653.htm 27.05. 30.05. 03.06. Maja Zupančič Milena Jovanov Mojca Kostanjevec
Peter Prezelj PGC1α4 regulira hipertrofijo skeletnega mišičnega tkiva http://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121206121728.htm 27.05. 30.05. 03.06. Luka Kavčič Nina Pirih Eva Oblak Zvonar
Ana Krišelj Stabilizacija tubulina s posttranslacijskimi modifikacijami http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130415172021.htm 27.05. 30.05. 03.06. Alja Zgonc Urša Kapš Barbara Sopčić

Naloga

  • samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2012. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka morate za seminar uporabiti še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
  • naslov izbrane teme in link do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 1800 do 2000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
  • Seminar oddajte do roka za oddajo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 16 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
  • Predstavitvi sledi razprava- 6 minut. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsak vsaj dve vprašanji.
  • En dan pred predstavitvijo oddajte končno verzijo doc. Gunčarju po e-mailu, v subject napišite TBK2013 in pripnite datoteko, ki ima ime v obliki TBK2013-Ime-Priimek.docx. Na dan predstavitve morate docentu oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.


Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.