BIO1-seminar

From Wiki FKKT

Jump to: navigation, search

Contents

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak ponedeljek od 11:00 do 12:30.

Ocena seminarjev predstavlja ??% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/tbk/ username: tbk password: samozameDD

Seznam seminarjev

Ime in priimek Naslov seminarja Link Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3
Rok FerencNov način zdravljenja Androgenic alopeciahttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/10/121026125127.htm04.03.07.03.11.03.Jure FabjanMarjeta HorvatTadej Rozman
Mojca JuteršekSekrecijski sistem tipa III pri Pseudomonas aeruginosa in vpliv metabolizma na njegovo izražanjehttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130130083017.htm04.03.07.03.11.03.Boštjan PetričMaja ZupančičMilena Jovanov
Tjaša BensaSulforafan kot potencialni kandidat za zdravljenje levkemijehttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121212205602.htm04.03.07.03.11.03.Peter PrezeljLuka KavčičNina Pirih
Petra TavčarZdravljenje Huntingtonove bolezni s proteini s cinkovimi prstihttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/10/121010131358.htm04.03.07.03.11.03.Ana KrišeljAlja ZgoncUrša Kapš
Tilen Komel11.03.14.03.18.03.Rok FerencJure FabjanMarjeta Horvat
Urška KašnikPropionibacterium acnes - bakterija, ki povzroča aknehttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130228080135.htm11.03.14.03.18.03.Mojca JuteršekBoštjan PetričMaja Zupančič
David Pignar11.03.14.03.18.03.Tjaša BensaPeter PrezeljLuka Kavčič
Maruša Prolič - KalinšekŽivčni strupi in butirilholinesterazahttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130111101450.htm11.03.14.03.18.03.Petra TavčarAna KrišeljAlja Zgonc
Domen KlofutarMICU1 kot regulator koncentracije Ca2+ v mitohondrijihhttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/11/121127130025.htm18.03.21.03.25.03.Tilen KomelRok FerencJure Fabjan
Jakob RupertVplivi na vezavo Aβ-oligomerov na nepatogene prione PrPC in povezava z nastankom Alzheimerjeve boleznihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130205200241.htm18.03.21.03.25.03.Urška KašnikMojca JuteršekBoštjan Petrič
Helena Jakše Resveratrol kot preventiva proti rakuhttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121205084419.htm18.03.21.03.25.03.David PignarTjaša BensaPeter Prezelj
Lenka TomešováKey to Controlling Toxicity of Huntington's Disease Protein May Be Cell Contents http://www.sciencedaily.com/releases/2012/06/120606092537.htm18.03.21.03.25.03.Maruša Prolič - KalinšekPetra TavčarAna Krišelj
Simon BoltaVloga rjavega maščobnega tkiva pri termogenezihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130313160754.htm25.03.28.03.08.04.Domen KlofutarTilen KomelRok Ferenc
Vita VidmarPosttranskripcijska regulacija cirkadianega ritma pri Synechococcus elongatushttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130217134246.htm25.03.28.03.08.04.Jakob RupertUrška KašnikMojca Juteršek
Sabina ŠtukeljStruktura in pomen antifreeze proteinovhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130218092501.htm25.03.28.03.08.04.Helena JakšeDavid PignarTjaša Bensa
Nika StrašekZdravljenje avtizma s suraminomhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130313182019.htm25.03.28.03.08.04.Lenka TomešováMaruša Prolič - KalinšekPetra Tavčar
Vid JazbecInterakcije seratoninskih in glutamatskih ter steratoninskih in dopaminskih receptorjev ter vpliv na psihozehttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130307145720.htm08.04.11.04.15.04.Simon BoltaDomen KlofutarTilen Komel
Aneta Atanasova08.04.11.04.15.04.Vita VidmarJakob RupertUrška Kašnik
Rok IpšekDelovanje alfa hidroksi kislin kot eksfoliantovhttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/08/120813155644.htm08.04.11.04.15.04.Sabina ŠtukeljHelena JakšeDavid Pignar
Helena ŠnebergerNova imunološka terapija zdravljenja alergije na jajca http://www.sciencedaily.com/releases/2012/07/120718192044.htm08.04.11.04.15.04.Nika StrašekLenka TomešováMaruša Prolič - Kalinšek
Tim BožičHMCV z vezavo glikoproteina UL141 na smrtne receptorje TRAIL spodnese imunski odzivhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130313123504.htm15.04.18.04.22.04.Vid JazbecSimon BoltaDomen Klofutar
Sara KošeninaZdravljenje Alzheimerjeve bolezni z grelinomhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130402182457.htm15.04.18.04.22.04.Aneta AtanasovaVita VidmarJakob Rupert
Eva Krivec15.04.18.04.22.04.Rok IpšekSabina ŠtukeljHelena Jakše
Jan RozmanCiljanje kronično levkemičnih celic z monoklonskim protitelesom specifičnim za CD44http://www.sciencedaily.com/releases/2013/03/130325160234.htm15.04.18.04.22.04.Helena ŠnebergerNika StrašekLenka Tomešová
Eva VidakAntigenska subverzija - nov mehanizem s katerim se virus Ebole izogne imunskemu odzivu gostiteljahttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121213172300.htm22.04.25.04.06.05.Tim BožičVid JazbecSimon Bolta
Toni NagodeMakromolekulski uničevalec RNAhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130204094606.htm22.04.25.04.06.05.Sara KošeninaAneta AtanasovaVita Vidmar
Ema GuštinVloga regulacije kompleksov Vps34 pri avtofagijihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130117132921.htm22.04.25.04.06.05.Eva KrivecRok IpšekSabina Štukelj
Dominik DeklevaEncimsko mapiranje proteinov v celicihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130212210009.htm22.04.25.04.06.05.Jan RozmanHelena ŠnebergerNika Strašek
Mojca KostanjevecSintetični nanodelci funkcionalizirani z biomimetičnimi levkocitnimi membranamihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130131144114.htm06.05.09.05.13.05.Eva VidakTim BožičVid Jazbec
Eva Oblak ZvonarVodikov sulfid, potencialno preventivno in terapevtsko sredstvo pri staranju in s starostjo povezanih boleznihhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130129121945.htm06.05.09.05.13.05.Toni NagodeSara KošeninaAneta Atanasova
Barbara Sopčić06.05.09.05.13.05.Ema GuštinEva KrivecRok Ipšek
Tadej RozmanProtein alfa-sinuklein se obnaša kot virushttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130425213758.htm06.05.09.05.13.05.Dominik DeklevaJan RozmanHelena Šneberger
Milena Jovanov13.05.16.05.20.05.Mojca KostanjevecEva VidakTim Božič
Nina Pirihhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/01/130128133820.htm13.05.16.05.20.05.Eva Oblak ZvonarToni NagodeSara Košenina
Urša KapšSmc5/Smc6/MAGE kompleks daje odpornost pred kofeinom in genotoksičnim stresom v Drosophila melanogasterhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130418100150.htm13.05.16.05.20.05.Barbara SopčićEma GuštinEva Krivec
Marjeta HorvatSpremenjeno izražanje genov kot posledica metode RYGB oz. obvoda želodcahttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130411123845.htm13.05.16.05.20.05.Tadej RozmanDominik DeklevaJan Rozman
Maja ZupančičJedrni receptorji PPARβ/δ in PPARα, ki usmerjajo metabolične procese za regulacijo v mišjem srcuhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/05/130508102648.htm20.05.23.05.27.05.Milena JovanovMojca KostanjevecEva Vidak
Luka KavčičOdsotnost proteina Sec24A zniža nivo holesterola v krvni plazmi preko zmanjšane sekrecije proteina PCSK9http://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130410141535.htm20.05.23.05.27.05.Nina PirihEva Oblak ZvonarToni Nagode
Alja Zgoncp53 učinkovito zatira razvoj tumorja v popolni odsotnosti p21, Puma in Noxahttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/05/130509123532.htm20.05.23.05.27.05.Urša KapšBarbara SopčićEma Guštin
Jure FabjanVpliv Dkk1 na nevrogenezo v starostihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/02/130207131511.htm20.05.23.05.27.05.Marjeta HorvatTadej RozmanDominik Dekleva
Boštjan PetričRNA z Fe2+ kot kofaktorjem katalizira prenos elektronovhttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/05/130519145653.htm27.05.30.05.03.06.Maja ZupančičMilena JovanovMojca Kostanjevec
Peter PrezeljPGC1α4 regulira hipertrofijo skeletnega mišičnega tkivahttp://www.sciencedaily.com/releases/2012/12/121206121728.htm27.05.30.05.03.06.Luka KavčičNina PirihEva Oblak Zvonar
Ana KrišeljStabilizacija tubulina s posttranslacijskimi modifikacijamihttp://www.sciencedaily.com/releases/2013/04/130415172021.htm27.05.30.05.03.06.Alja ZgoncUrša KapšBarbara Sopčić

Naloga

  • samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2012. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka morate za seminar uporabiti še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
  • naslov izbrane teme in link do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 1800 do 2000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
  • Seminar oddajte do roka za oddajo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 16 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
  • Predstavitvi sledi razprava- 6 minut. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsak vsaj dve vprašanji.
  • En dan pred predstavitvijo oddajte končno verzijo doc. Gunčarju po e-mailu, v subject napišite TBK2013 in pripnite datoteko, ki ima ime v obliki TBK2013-Ime-Priimek.docx. Na dan predstavitve morate docentu oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.


Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.

Personal tools