BIO1-seminar-2012

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak ponedeljek od 10:00 do 11:30.

Ocena seminarjev predstavlja ??% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/tbk/ username: tbk password: samozameDD

Seznam seminarjev

Ime in priimek Naslov seminarja Link Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3
Ana Cirnski TAL efektorji - proteini za urejanje genov povezava 29.02. 02.03. 05.03. Matej Prevc Ana Grom Erik Mršnik
Griša Prinčič DNK nanoroboti povezava 29.02. 02.03. 05.03. Katja Leben Jernej Pušnik Maja Kostanjevec
Bojana Lazović Vloga prionov pri preživetju in razvoju kvasovk povezava 29.02. 02.03. 05.03. Matic Urlep Špela Tomaž Sandra Zupančič
Vesna Radić Odziv imunskega sistema z IFN-λ povezava 07.03. 09.03. 12.03. Ana Grom Katarina Tolar Ana Cirnski
Julija Mazej Pretvorba HDL v LDL preko CETP molekule povezava 07.03. 09.03. 12.03. Aleksander Benčič Mirana Krim Godler Bojana Lazović
Matej Prevc Moj naslov povezava 07.03. 09.03. 12.03. Jan Taškar Zala Gluhić Špela Tomaž
Erik Kristian Janežič Študije golih krtovskih podgan povezava 14.03. 16.03. 19.03. Griša Prinčič Rok Razpotnik Matic Urlep
Ana Grom Visokotehnološko zaznavanje rakavih celic dojk povezava 14.03. 16.03. 19.03. Matic Kovačič Jan Taškar Katja Leben
Robert Berger Svetlobno stikalo za bolečino povezava 14.03. 16.03. 19.03. Sara Bitenc Rok Babič Ajda Rojc
Filip Mihalič Kako lizocimi v solzah uničijo nevarne bakterije povezava 14.03. 16.03. 19.03. Matej Vrhovnik Dejan Marjanovič Vesna Radić
Samo Zakotnik Telomeri in nesmrtnost celic povezava 19.03. 22.03. 26.03. Ana Kunšek Tomaž Rozmarič Ana Grom
Špela Tomaž Specifično gibanje motornega proteina Dineina povezava 19.03. 22.03. 26.03. Erik Kristian Janežič Matej Prevc Rok Babič
Katarina Tolar Razvoj plastidov in Paulinella povezava 19.03. 22.03. 26.03. Alenka Mikuž Sara Bitenc Monika Biasizzo
Zala Gluhić Rubisco aktivaza povezava 19.03. 22.03. 26.03. Luka Krmpotić Aleksander Benčič Nastja Pirman
Veronika Furlan Moj naslov povezava 21.03. 26.03. 02.04. Špela Tomaž Katja Leben Sara Bitenc
Nastja Pirman Aktinidni kelatorji http://www.sciencedaily.com/releases/2012/03/120306181212.htm povezava 21.03. 26.03. 02.04. Jernej Pušnik Sandra Zupančič Estera Merljak
Barbara Dušak Funkcionalne posledice spremenjenih podenot v RNA polimerazah povezava 21.03. 26.03. 02.04. Rok Babič Bojana Lazović Rok Razpotnik
Rok Razpotnik Botulinum toksin v kompleksu z NTNHA [1] 23.03. 28.03. 02.04. Ajda Rojc Veronika Furlan Luka Krmpotić
Erik Mršnik Sintetični protein Oct4 amplificira gene matičnih celic povezava 04.04. 11.04. 16.04. Ana Cirnski Julija Mazej Filip Mihalič
Matic Kovačič Kronični stres vodi do poškodb DNA povezava 04.04. 11.04. 16.04. Bojana Lazović Samo Zakotnik Aleksander Benčič
Matej Vrhovnik Nove spojine, ki preprečujejo širjenje in izboljšajo zdravljenje raka povezava 04.04. 11.04. 16.04. Mirana Krim Godler Luka Krmpotić Erik Kristian Janežič
Andreja Kukovec Epigenetska blokada kognitivnih funkcij pri Alzheimerjevi demenci http://www.sciencedaily.com/releases/2012/02/120229155534.htm 04.04. 11.04. 16.04. Monika Biasizzo Ellen Malovrh Bojan Juloski
Rok Babič Moj naslov povezava 11.04. 16.04. 23.04. Tomaž Rozmarič Matej Vrhovnik Ellen Malovrh
Sara Bitenc Okužba s Toxoplasmo gondii in povečana količina dopamina povezava 11.04. 16.04. 23.04. Sandra Zupančič Matic Urlep Matic Kovačič
Jan Taškar Pridobivanje elektrike s stratosferskimi bakterijami povezava 11.04. 16.04. 23.04. Jakob Gašper Lavrenčič Alenka Mikuž Tomaž Rozmarič
Bojan Juloski Moj naslov povezava 11.04. 16.04. 23.04. Erik Mršnik Robert Berger Katarina Tolar
Monika Biasizzo Vloga signalne poti TOR pri regeneraciji tkiv povezava 19.04. 26.04. 07.05. Ellen Malovrh Ajda Rojc Alenka Mikuž
Katja Leben Staranje celic povezava 19.04. 26.04. 07.05. Maja Kostanjevec Matic Kovačič Janez Meden
Maja Kostanjevec Antioksidanti - spojine, ki lahko poškodujejo DNK povezava 19.04. 26.04. 07.05. Barbara Dušak Jakob Gašper Lavrenčič Matej Vrhovnik
Matic Urlep Odpornost bakterij na sulfonamidne antibiotike povezava 19.04. 26.04. 07.05. Katarina Tolar Vesna Radić Mirjana Malnar
Tomaž Rozmarič Inženiring hiper-katalitičnega encima http://www.sciencedaily.com/releases/2012/04/120417152732.htm 07.05. 11.05. 14.05. Veronika Furlan Ana Kunšek Andreja Kukovec
Mirjana Malnar Zastoji v procesu translacije povezava 26.04. 07.05. 14.05. Janez Meden Erik Kristian Janežič Veronika Furlan
Luka Krmpotić Vpliv 4 genov na spomin pri odraslih povezava 26.04. 07.05. 14.05. Vesna Radić Monika Biasizzo Ana Kunšek
Ellen Malovrh Dolgoživi jedrni proteini in njihov vpliv na celično staranje povezava 26.04. 07.05. 14.05. Julija Mazej Janez Meden Mirana Krim Godler
Aleksander Benčič S1P1 receptorji in njihov vpliv na multiplo sklerozo ter ostale bolezni povezava 07.05. 14.05. 21.05. Zala Gluhić Griša Prinčič Julija Mazej
Jakob Gašper Lavrenčič Bio-sončne celice [2] 07.05. 14.05. 21.05. Dejan Marjanovič Estera Merljak Jernej Pušnik
Dejan Marjanovič Moj naslov http://www.sciencedaily.com/releases/2012/02/120216094728.htm 07.05. 14.05. 21.05. Rok Razpotnik Erik Mršnik Samo Zakotnik
Esra Böğürcü Triple-negative breast cancer http://www.sciencedaily.com/releases/2012/04/120404133755.htm 07.05. 14.05. 21.05. Samo Zakotnik Nastja Pirman Matej Prevc
Ana Kunšek Proteini za zaznavanje bolečine povezava 14.05. 21.05. 28.05. Estera Merljak Mirjana Malnar Jan Taškar
Sandra Zupančič Možnosti uporabe matičnih krvnih celic pri okužbi z virusom HIV povezava 14.05. 21.05. 28.05. Filip Mihalič Maja Kostanjevec Zala Gluhić
Ajda Rojc Nematociste - najhitrejši mehanizem v naravi povezava 14.05. 21.05. 28.05. Mirjana Malnar Barbara Dušak Jakob Gašper Lavrenčič
Jernej Pušnik Zaznavanje proteinov z zlatimi nanodelci povezava 14.05. 21.05. 28.05. Nastja Pirman Andreja Kukovec Griša Prinčič
Estera Merljak Potencialna terapevtska vloga funkcionalnih inkluzijskih telesc povezava 21.05. 28.05. 04.06. Andreja Kukovec Bojan Juloski Barbara Dušak
Alenka Mikuž Pretvorba belega v rjavo maščobno tkivo [3] 21.05. 28.05. 04.06. Bojan Juloski Ana Cirnski Robert Berger
Janez Meden Struktura ključnega proteina pri parkinsovi bolezni [4] 21.05. 28.05. 04.06. Robert Berger Filip Mihalič Dejan Marjanovič

Naloga

  • samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2011. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka morate za seminar uporabiti še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
  • naslov izbrane teme in link do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 1800 do 2000 besed), vsebovati mora najmanj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
  • Seminar oddajte do roka za oddajo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 18 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava- 4 minute. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsak vsaj dve vprašanji.
  • En dan pred predstavitvijo oddajte končno verzijo doc. Gunčarju po e-mailu, v subject napišite TBK2012 in pripnite datoteko, ki ima ime v obliki TBK2012-Ime-Priimek.docx. Na dan predstavitve morate docentu oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.


Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.