BIO2 2010 Seminar: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
 
(182 intermediate revisions by 34 users not shown)
Line 1: Line 1:
= Biokemijski seminar =
= <span style="background:#00FF00">14. januarja se predavanje začne že ob 8:30 v Veliki predavalnici IJS! </span> =
= <span style="background:#00FF00">21. januarja bo predavanje v Kolarjevi predavalnici ob 9:00 </span> =
 
= Biokemijski seminar blablalbalblabllb =


Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.
Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.
Line 5: Line 8:
Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.
Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.


== Seznam seminarjev- datumi za seminarje, pri katerih še ni navedena tema, so le informativni in se bodo še spremenili==
{| {{table}}
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Ime in priimek'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Naslov članka'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Rok za oddajo'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Rok za recenzijo'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Datum predstavitve'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Recenzent1'''
| align="center" style="background:#f0f0f0;"|'''Recenzent2'''
|-
| Gregor Gunčar||[[ skopiraj url naslov od svojega dela; od BIO2_Povzetki_seminarja dalje| naslov seminarja]]|||||||||
|-
| DIMITRIJEVIĆ ĐORĐE||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#.C4.90or.C4.91e_Dimitrijevi.C4.87:_PLC_regulacija:_nastajajo.C4.8Di_modeli_molekularnih_mehanizmov|PLC regulacija: nastajajoči modeli molekularnih mehanizmov]]||20.10.||25.10.||29.10.||Berčič Tjaša||Berki Barbara
|-
| KRAJNC ALEKSANDER||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Aleksander_Krajnc:_Oligomerske_oblike_z_G_proteinom_sklopljenih_receptorjev_.28GPCR.29|Oligomerske oblike z G proteinom sklopljenih receptorjev (GPCR)]]||20.10.||25.10.||29.10.||Bevc Luka||Bezeljak Urban
|-
| FRANČIČ VITO||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Vito_Fran.C4.8Di.C4.8D:_Proteini_WD40:_sredi.C5.A1.C4.8Da_v_omre.C5.BEju_celi.C4.8Dnih_biokemijskih_interakcij|Proteini WD40: središča v omrežju celičnih biokemijskih interakcij]]||20.10.||25.10.||29.10.||Bigec Tjaša||Bratuš Maruša
|-
| CAF - FELDIN ŽAN||[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BIO2_Povzetki_seminarjev#.C5.BDan_Caf-Feldin:_Glikoliza:_Zgolj_bioenergetksa_vloga_ali_pot_pre.C5.BEivetja Glycolysis: a bioenergetic or a survival pathway?]||20.10.||27.10.||3.11.||Simonič Nataša||Bremec Kristina
|-
| ŽELEZNIK ŽAN||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Žan_Železnik:_Biokemijska_in_strukturna_osnova_za_trans-v-cis_izomerizacijo_retinoidov_v_kemiji_vida|Biokemijska in strukturna osnova za trans-v-cis izomerizacijo retinoidov v kemiji vida ]]||28.10.||2.11.||5.11.||Caf-Feldin||Dimitrijević
|-
| PRIMC TISA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Tisa_Primc:_Apoptoza_inducirana_prek_smrtnih_receptorjev| Apoptoza inducirana prek smrtnih receptorjev ]]||28.10.||2.11.||5.11.||Frančič||Hadanović
|-
| RAZBORŠEK BRIGITA||[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BIO2_Povzetki_seminarjev#Brigita_Razbor.C5.A1ek:_Adhezijski_GPCR-ji_-_Odkrivanje_pomena_novih_receptorjev Adhezijski GPCR-ji: odkrivanje pomena novih receptorjev]||28.10.||3.11.||10.11.||Hriberšek||Juvančič
|-
| SIMONIČ NATAŠA||[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BIO2_Povzetki_seminarjev#Nata.C5.A1a_Simoni.C4.8D:_Botulin_in_tetanus_nevrotoksin:_struktura.2C_delovanje_in_terapevtska_uporaba Botulin in tetanus nevrotoksin: struktura, delovanje in terapevtska uporaba]||29.10.||5.11.||12.11.||Kogoj||Kolar
|-
| OGRIN LAURA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Laura_Ogrin:_Kooperativni_in_nekooperativni_ionski_kanali_CNG| Kooperativni in nekooperativni ionski kanali CNG]]||29.10.||5.11.||12.11.||Kolenc||Krajnc
|-
| DIMITRIJEVIČ ĐORĐE||||3.11.||10.11.||17.11.||||
|-
| PERME NEJC||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Nejc_Perme:_Mehanizmi_zaznavanja_glukoze_v_evkariontskih_celicah|Mehanizmi zaznavanja glukoze v evkariontskih celicah]]||5.11.||12.11.||19.11.||Primc||Ogrin
|-
| PODJED ŠPELA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#.C5.A0pela_Podjed:_Strukturne_lastnosti_RNA-stikal.2C_ki_ve.C5.BEejo_metabolite| Strukturne lastnosti RNA-stikal, ki vežejo metabolite]]||5.11.||12.11.||19.11.||Perme||Rot
|-
| ŽBOGAR URŠKA||[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BIO2_Povzetki_seminarjev# Multifunkcionalnost glikolitičnih encimov]||10.11.||17.11.||24.11.||Podjed||Razboršek
|-
| NARAGLAV NIVES||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Nives_Naraglav:_Protein_kinaze:_evolucija_dinamično_reguliranih_proteinov|Protein kinaze: evolucija dinamično reguliranih proteinov]]||12.11.||19.11.||26.11.||Rovanšek||Rupar
|-
| BEZELJAK URBAN||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Urban_Bezeljak:_Na_novo_odkrite_skrivnosti_aktomiozinskega_delovnega_takta| Na novo odkrite skrivnosti aktomiozinskega delovnega takta]]||12.11.||19.11.||26.11.||Stupar||Šćuk
|-
| ŽLAJPAH MARGARETA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Margareta_Žlajpah:_Regulacija_HIF-1_proteina| Regulacija HIF-1 proteina]]||12.11.||19.11.||26.11.||Tolar||Žbogar
|-
| KOLAR SABINA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Sabina Kolar: Povezava med signalom inzulina in glukoznim prenašalcem| Bridging the GAP between insulin signaling and GLUT4 translocation]]||19.11.||24.11.||1.12.||Umek||Korpar
|-
| HANDANOVIĆ ELMINA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Elmina Handanović:_Biokemijski_pristop_k_staranju| Biokemijski pristop k staranju]]||26.11.||1.12.||3.12.||Žlajpah||Železnik
|-
| BRATUŠ MARUŠA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Maruša_Bratuš:_Mitohondriji_kot_jih_ne_poznamo| Mitohondriji kot jih ne poznamo]]||26.11.||1.12.||3.12.||Pavlovič||Primec
|-
| RUPAR KAJA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Kaja_Rupar:_Sirtuini_-_reguliranje_mitohondrija | Sirtuini - reguliranje mitohondrija]] ||2.12.||6.12.||8.12.||Gorečan||Gregorič
|-
| BERKI BARBARA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Barbara_Berki:_Evolucija_mitohondrijev | Evolucija mitohondrijev]]||3.12.||7.12.||10.12.||Tolar||Rovanšek
|-
| JUVANČIČ JANJA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Janja_Juvančič:_Uvoz_proteinov_v_mitohondrij| Uvoz proteinov v mitohondrij]]||3.12.||7.12.||10.12.||Caf-Feldin||Berčič
|-
| ROT ZALA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Zala_Rot:_Homologi_mitohondrijskega_razklopnega_proteina_UCP1| Homologi mitohondrijskega razklopnega proteina UCP1]]||3.12.||8.12.||15.12.||Primec||Korpar
|-
| KOLENC FILIP||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Filip_Kolenc:_Post-translacijske_modifikacije_v_signalni_integraciji | Post-translational modifications in signal integration ]]||3.12.||10.12.||17.12.||Bevc||Flis
|-
| ŠČUK DINO||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Dino_Ščuk:_Mehanizmi_tvorbe_lipidnih_telesc | Mechanisms of lipid-body formation ]]||6.12.||13.12.||17.12.||Bigec||Železnik
|-
| BEVC LUKA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Luka_Bevc:_Hormon_občutljiva_lipaza | Hormon sensitive lipase ]]||5.12.||10.12.||17.12.||Gorečan||Kolenc
|-
| nihče||Regulatory crosstalk of the metabolic network||8.12.||15.12.||22.12.||||
|-
| ROVANŠEK VERONIKA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Veronika_Rovanšek:_yink_in_yank_v_biokemiji_kobalamina | The yin-yang of cobalamin biochemistry]]||17.12.||19.12.||24.12.||Bezeljak||Ogrin
|-
| BERČIČ TJAŠA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Tjaša_Berčič:_Naddružina_tiolaz_Kondenzirajoči_encimi_ki_katalizirajo_različne_reakcije | The thiolase superfamily: condensing enzymes with diverse reaction specificities]]||17.12.||19.12.||24.12.||Hriberšek||Bremec
|-
| BIGEC TJAŠA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Tjaša Bigec:_Zasvojenost_z_glutaminom | Glutamine addiction ]]||17.12.||19.12.||24.12.||Juvančič||Razboršek
|-
| KOGOJ MAJA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Maja Kogoj:_Kontrola_metabolizma_s_cirkadianim_ritmom_in_obratno| Kontrola metabolizma s cirkadianim ritmom in obratno]]||22.12.||29.12.||5.1.||Rupar||Gregorič
|-
| BREMEC KRISTINA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Kristina Bremec:_Evkariontski_transkripcijski_faktorji_kot_direktni_senzorji_hranil| Evkariontski transkripcijski faktorji kot direktni senzorji hranil ]]||24.12.||3.1.||7.1.||Stupar||Žlajpah
|-
| STUPAR UROŠ||Many paths to methyltransfer: a chronicle of convergence||24.12.||3.1.||7.1.||Handanović||Pavlovič
|-
| TOLAR EVA||[[Light-regulated transcriptional networks in higher plants]]||24.12.||3.1.||7.1.||Dimitrijević||Podjed
|-
| UMEK ŠPELA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Špela Umek:_Membranski_lipidi:_lokalizacija_in_delovanje |Membrane lipids: where they are and how they behave]]||3.1.||7.1.||12.1.||Kranjc||Primc
|-
| HRIBERŠEK DAMJANA||[[Prenos signalov preko biološko aktivnih lipidov: Sfingolipidi]]||3.1.||7.1.||14.1.||Naraglav||Rot
|-
| KORPAR TANJA||[[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Celi%C4%8Dne_strategije_za_sestavljanje_molekularnih_strojev | Cellular strategies for the assembly of molecular machines]]||3.1.||7.1.||14.1.||Perme||Bratuš
|-
| PAVLOVIČ TONJA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Tonja_Pavlovi.C4.8D:_Vloga_adipokinov_pri_uravnavanju_lipidnega_metabolizma | Vloga adipokinov pri uravnavanju lipidnega metabolizma]]||7.1.||14.1.||19.1.||Frančič||Žbogar
|-
| GOREČAN PETRA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Petra Gorečan:_Leptin_in_uravnavanje_telesne_te.C5.BEe_pri_sesalcih | Leptin and the regulation of body weight in mammals ]]||5.1.||12.1.||14.1.||Simonič||Kolar
|-
| GREGORIČ TINA||mTOR- from growth signal integration to cancer, diabetes and ageing||13.1.||17.1.||21.1.||Kogoj||Umek
|-
| PRIMEC SARA||[[Inventarna kontrola:Citokrom c oksidazni sklop regulira mitohondrijsko translacijo]]||13.1.||17.1.||21.1.||Berki||Flis
|-
| FLIS TJAŠA||Fructose induced lipogenesis + sami poiščite še dodatne vire!||13.1.||17.1.||21.1.||Ščuk||Naraglav
|}
== <span style="background:#00FF00">Gradivo za seminarje </span>==
Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/
username: bio2
password: samozame


==Naloga==
==Naloga==
'''Vaša naloga za seminar je:<br>'''
'''Vaša naloga za seminar je:<br>'''
A) v skupini še z enim kolegom pripraviti opis enega gesla v poglavju Biokemijski leksikon<br>
A) v skupini še z enim kolegom pripraviti opis enega gesla v poglavju Biokemijski leksikon<br>
B) samostojno pripraviti opis novice s področja biokemije
B) samostojno pripraviti seminar, katerega osnova je znanstveni članek, ki ga določi docent


===A: Leksikografsko geslo===
===A: Leksikografsko geslo===
Za vpis gesla veljajo naslednja pravila:<br>
Za vpis gesla veljajo naslednja pravila:<br>
* Geslo je lahko iz katere od že vpisanih kategorij ali pa izberete svoje. Če geslo še ni vpisano v [[Leksikon_BMB | kazalu]], ga smiselno uvrstite vanj.
* Geslo je lahko iz katere od že vpisanih kategorij ali pa izberete svoje. Če geslo še ni vpisano v [[Leksikon_BMB | kazalu]], ga smiselno uvrstite vanj.
* Do 7. novembra do 12. ure vpišite v tabelo skupin [[BiokemSeminar-SkupineLeksikon-B09]], katero temo ste si izbrali. Preden se odločite za svojo temo, preverite, da si ni iste izbral že kdo drug.
* Do '''12. decembra 2010''' do 12. ure vpišite v tabelo skupin [[BIO2 Seminar-geslo]], katero temo ste si izbrali. Preden se odločite za svojo temo, preverite, da si ni iste izbral že kdo drug.
* Razlaga gesla naj obsega med 500 in 600 besed in vsaj eno povezavo na slikovno gradivo drugje na internetu. Ne nalagajte slik, ki so avtorsko zaščitene!  
* Razlaga gesla naj obsega med 500 in 600 besed in vsaj eno povezavo na slikovno gradivo drugje na internetu. Ne nalagajte slik, ki so avtorsko zaščitene!  
* Opis pod A morate dokončati do 1. decembra 2009 do 12. ure.
* Opis pod A morate dokončati do '''12. januarja 2010''' do 12. ure.


===B: Novica===
===B: Seminar===
Za obdelavo novice velja naslednje:<br>
Za pripravo seminarja velja naslednje:<br>
* Novico si izberete sami najkasneje 1 mesec pred terminom, ki ste si ga izbrali za predstavitev.
* Docent določi članek, ki ga boste obravnavali v okviru seminarja
* Preden začnete s pripravo seminarja, morate temo sporočiti docentu, ki vam bo temo odobril ali predlagal, da izberete drugo.
* [[BIO2 Povzetki seminarjev|Povzetek seminarja]] opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom. Povezave do slik so dobrodošle, niso pa nujne.
* Novico opišete na wikiju v približno 200 besedah - kot povzetek - najkasneje 2 tedna pred predstavitvijo. Povezave do slik so dobrodošle, niso pa nujne.
* Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
* Povezavo do povzetka vnesete v poglavje po lastni izbiri na [[BiokemSeminar-SeznamNovic-B09|seznamu seminarjev]] tekočega letnika.
* Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2800 do 3000 besed), vsebovati mora vsaj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.  
* Novico opišete v seminarski nalogi na ~2 straneh A4 (pisava 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg 1000-1200 besed) in z vsaj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.  
* Natisnjen seminar oddajte dva tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
* Natisnjen seminar oddate 2 tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga lahko pošljete po e-pošti).
* Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
* Recenzenti v enem tednu določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
* Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
* Ustna predstavitev sledi na dan, ki ste si ga izbrali in ga vpisali v seznam. Za predstavitev je na voljo 6-8 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
* Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsaj dve vprašanji.
* Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve.
* Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
* Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) verzijo seminarja v enem izvodu.
* Seminarska naloga, povzetek in opis gesla morajo biti v slovenskem jeziku!


==Ocenjevanje seminarjev==
==Ocenjevanje seminarjev==
Ocenjevanje seminarja bo letos nekoliko zapleteno. S seminarskim delom lahko dosežete 10 dodatnih točk, ki se prištejejo rezultatu izpita. Teh 10 točk bo sestavljenih iz 2 točk za leksikonsko predstavitev (ocene za vsakega člana skupine so enake) in 8 točk za obdelavo novice. Teh 8 točk bo sestavljenih iz ocene za predstavitev na vikiju in za pisni del seminarja (5 točk) - ocenjuje se prva verzija, ki jo dobijo recenzenti -, in za razlago pred kolegi (3 točke). Obdelavo delnih ocen seminarja bo opravil docent. Leksikografsko geslo oceni samo docent, seminarsko predstavitev novice pa docent in recenzenti. Za recenziranje uporabimo [http://web.fkkt.uni-lj.si/biokemija/Biokemija/Formular_OcenaSeminarja09.pdf formular], ki je na voljo v formatu PDF. Izpolnjen formular en teden pred predstavitvijo in tik po predstaviti oddate na seminarju docentu. Pri recenziranju besedila docent (če je treba) o morebitnih dodatnih potrebnih popravkih obvesti pripravljalca seminarja po e-pošti.
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [[https://spreadsheets.google.com/viewform?hl=en&formkey=dE1aOFU1aE1iMlBrNEJzLTRGeTdWZXc6MQ#gid=0 recenzentsko poročilo]] na spletu.
 
Pri ocenjevanju veljajo naslednji odbitki točk za zamujene ali neopravljene obveznosti:<br>
* zamuda pri oddaji 1. verzije seminarske naloge: do 1 dan -> -0,5 točke, 1-3 dni -> -1 točka, več kot 3 dni -> -2 točki<br>
* zamuda pri objavi kratkega povzetka na spletu: do 3 dni -> -0,5 točke, več kot 3 dni -> -2 točki<br>
* zamuda pri oddaji končne verzije seminarske naloge: do 3 dni -> -0,5 točke, več kot 3 dni -> -1 točka<br>
* zamuda pri oddaji recenzije: do 3 dni -> -0,5 točke, več kot 3 dni -> -1 točka<br>
* neoddana ocena predstavitve: -1 točka<br>
* seminar brez predstavitve -> -2 točki<br>
* zamuda pri objavi vsebine gesla za leksikon: do 2 dni -> -0,5 točke, 2-7 dni -> -1 točka, več kot 7 dni -> -2 točki
 
Pribitki točk so možni za vsako dobro, torej utemeljeno recenzijo in to največ po 0,25 točke. Ravno tako pa je za vsako nekritično oz. neutemeljeno recenzijo po 0,25 točke mogoče odšteti.
 
Če bi slučajno kdo zbral negativno število točk, to pomeni, da se ocena z izpita zniža za toliko odstotnih točk, kolikor je seštevek negativnih točk za seminar. Na primer če nekdo ne pripravi niti seminarske naloge, nima predstavitve, ne pripravi povzetka, ne opravi recenzentskih pregledov in ne napiše opisa gesla za leksikon, zgubi 2+2+2+2+2 = 10 točk, kar mu/ji torej zniža oceno z izpita za 10 odstotnih točk.
 
Če bi kdo s seminarji zbral več kot 10 točk (možno jih je skupaj z dodatkom za dve dobri recenziji zbrati 10,5), se mu upošteva samo 10,0 točk.


==Viri==
== Mnenje o predstavitvi ==
Viri za leksikografski del so lahko različni učbeniki, Wikipedija in druge enciklopedije, pregedni članki ipd. Pri tem ne prevajajte celih (od)stavkov, pač pa smiselno povzemajte vsebino. Vire je treba navesti.<br>
Vsak posameznik '''mora''' oceniti seminar, tako da odda svoje [https://spreadsheets.google.com/viewform?hl=en&formkey=dDlsbDlnclNrc3dIS2otRFdxUEFTNnc6MQ#gid=0 mnenje] najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja '''ne sme''' oddati.
Viri za novice so raziskovalne revije ali (verjetno pogosteje) spletni viri: blogi, portali z novicami s posameznih področij znanosti ipd. Nekaj uporabnih povezav za novice (dopolnite, če najdete kaj primernega!):
* [http://www.eurekalert.org/ EurekAlert] - poglavja Biologija, Kemija, Medicina
* [http://www.sciencedaily.com/ Science Daily]
* [http://feeds.reuters.com/reuters/UKScienceNews/ Reuters Science]
* [http://www.sciencentral.com/video/ ScienCentral]
* [http://www.bionity.com/news/e/ Bionity.COM News-Center]
* [http://www.sciam.com/ Scientific American]
* [http://newswire.rockefeller.edu/ Rockefeller University’s newswire]
* ...
 
==Časovni razpored==
Za nalogo A (Leksikografski opis) delo sami vpišete na wiki kot svojo stran, ki bo ustrezno povezana s kazalom. To opravite vse skupine do 1. decembra 2009 do 12. ure. Za oceno bo veljala verzija, ki bo na wikiju ob tej uri (seveda jo lahko kasneje še popravite, če najdete kakšno napako). Imena članov skupin in naslov izbrane teme vpišite na posebno [[BiokemSeminar-SkupineLeksikon-B09 | wiki stran ]] do 26. oktobra do 12. ure. Kdor ne bo vpisan, mu bo skupino določil vodja seminarja. Temo seminarja vpišite v seznam skupin najkasneje do 9. novembra do 12. ure.
 
Za nalogo B (Novica) si najprej rezervirajte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | datum predstavitve]]. Od tega je odvisno, kakšni bodo ostali roki. Temo, ki jo boste pripravili kot novico, mi sporočite najkasneje 1 mesec pred predstavitvijo, novica pa takrat ne sme biti starejša kot 1 mesec (torej če bi imeli predstavitev 15. decembra, bi mi povezavo do novice sporočili najkasneje 15. novembra, novica pa ne sme biti objavljena prej kot 15. oktobra). Pri vsaki uri so možne samo 3 predstavitve (sicer zmanjka časa za razpravo).
 
==Nasveti za pripravo novice==
V tem poglavju bom napisal samo, kako si predstavljam, da se boste lotili dela z obdelavo novice in pripravo seminarja. Lahko seveda naredite tudi drugače; pomemben je končni rezultat, ki ga bomo tudi ocenjevali.
# Izberite si novico, ki ni samo sporočilo o nekem zanimivem opažanju (dobil sem več predlogov za seminarje na osnovi novice tipa 'molekula A preprečuje nastajanje raka'), pač pa je vsaj nakazan tudi mehanizem delovanja. Po mojem se biokemija začne šele od opažanja naprej - z razlago delovanja, interakcij med molekulami, fizioloških učinkov...
# V novici, ki bo osnova seminarja, verjetno ne bo dovolj podatkov o molekuli, ki je glavna tema prispevka. Poiščite čimveč podatkov o lastnostih molekule in njenem delovanju v celici/organizmu. Kje se izraža, na katere tarče se veže, kaj uravnava njeno delovanje? Podatke boste našli v učbenikih, Wikipediji in drugje na spletu. Enako velja, da v primerih, ko molekula sodeluje pri pojavu ali širjenju kakšne bolezni, poiščete ključne podatke o bolezni in fiziologiji, ki je s tem povezana.
# Kako pripraviti kratko in kako dolgo novico, je odvisno od tega, koliko podatkov ste zbrali v prvi stopnji in kakšne tip študenta ste. Če imate malo podatkov, boste najbrž lažje najprej napisali povzetek z 200 znaki. Potem na osnovi tega pripravite razširjeni seminar s 1000-1200 besedami (ta podatek preverite v Wordu; če boste pod ali nad postavljeno mejo, bo to pomenilo minus točke). Vsak podatek iz povzetka razširite, predvsem opišite ozadje: lastnosti molekule, vpetost v biokemijske poti, lokalizacijo v celici ali organizmu, njen pomen v zdravi ali oboleli celici. Potem razložite, zakaj je odkritje iz novice, ki ste si jo izbrali pomembno, na koncu pa vsebino novice postavite v kontekst prejšnjih navedb. Dodajte seznam virov. Če pa ste bolj tak tip, da si najprej naberete goro podatkov, ki vas včasih tudi zasuje, potem si izpisujte, ko prebirate vire, ključne podatke in na njihovi osnovi sestavite seminar (1000-1200 besed). Nato pa iz vsakega npr. odstavka izpeljite en ali dva stavka, ki povesta bistvo, da boste prišli do kratkega povzetka (200 besed).
# Vire navedite tiste, ki se vam zdijo res pomembni (predvidevam, da jih ne bo več kot 5-10). Vsekakor morate navesti vire slik. Pri citiranju člankov, knjig in spletnih vsebin veljajo nekatera pravila, ki jih je treba upoštevati. Navedeni morajo biti avtorji, naslov, leto izida, pri člankih iz revij naslov revije in strani, pri knjigah založba, pri spletnih virih pa datum ogleda - upoštevajte naslednje poglavje na tej strani!.


==Urejanje spletnih strani na wikiju==
==Urejanje spletnih strani na wikiju==
Line 106: Line 174:
strangeguitars. ''On the brink of artificial life''. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life<br>
strangeguitars. ''On the brink of artificial life''. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life<br>
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.
==Ocenjevanje predstavitev novic==
Za ocenjevanje uporabite [http://web.fkkt.uni-lj.si/biokemija/Biokemija/Formular_OcenaSeminarja09.pdf formular]. Na vsakem listu sta dva formularja, saj bo vsak študent ocenjeval dva kolega. Pri recenziranju pisnega dela izpolnite del A in ga en teden pred predstavitvijo seminarja vrnete docentu. Na predstavitvi ga dobite vrnjenega, da izpolnite še del B.

Latest revision as of 14:56, 6 October 2011

14. januarja se predavanje začne že ob 8:30 v Veliki predavalnici IJS!

21. januarja bo predavanje v Kolarjevi predavalnici ob 9:00

Biokemijski seminar blablalbalblabllb

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev- datumi za seminarje, pri katerih še ni navedena tema, so le informativni in se bodo še spremenili

Ime in priimek Naslov članka Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent1 Recenzent2
Gregor Gunčar naslov seminarja
DIMITRIJEVIĆ ĐORĐE PLC regulacija: nastajajoči modeli molekularnih mehanizmov 20.10. 25.10. 29.10. Berčič Tjaša Berki Barbara
KRAJNC ALEKSANDER Oligomerske oblike z G proteinom sklopljenih receptorjev (GPCR) 20.10. 25.10. 29.10. Bevc Luka Bezeljak Urban
FRANČIČ VITO Proteini WD40: središča v omrežju celičnih biokemijskih interakcij 20.10. 25.10. 29.10. Bigec Tjaša Bratuš Maruša
CAF - FELDIN ŽAN Glycolysis: a bioenergetic or a survival pathway? 20.10. 27.10. 3.11. Simonič Nataša Bremec Kristina
ŽELEZNIK ŽAN Biokemijska in strukturna osnova za trans-v-cis izomerizacijo retinoidov v kemiji vida 28.10. 2.11. 5.11. Caf-Feldin Dimitrijević
PRIMC TISA Apoptoza inducirana prek smrtnih receptorjev 28.10. 2.11. 5.11. Frančič Hadanović
RAZBORŠEK BRIGITA Adhezijski GPCR-ji: odkrivanje pomena novih receptorjev 28.10. 3.11. 10.11. Hriberšek Juvančič
SIMONIČ NATAŠA Botulin in tetanus nevrotoksin: struktura, delovanje in terapevtska uporaba 29.10. 5.11. 12.11. Kogoj Kolar
OGRIN LAURA Kooperativni in nekooperativni ionski kanali CNG 29.10. 5.11. 12.11. Kolenc Krajnc
DIMITRIJEVIČ ĐORĐE 3.11. 10.11. 17.11.
PERME NEJC Mehanizmi zaznavanja glukoze v evkariontskih celicah 5.11. 12.11. 19.11. Primc Ogrin
PODJED ŠPELA Strukturne lastnosti RNA-stikal, ki vežejo metabolite 5.11. 12.11. 19.11. Perme Rot
ŽBOGAR URŠKA Multifunkcionalnost glikolitičnih encimov 10.11. 17.11. 24.11. Podjed Razboršek
NARAGLAV NIVES Protein kinaze: evolucija dinamično reguliranih proteinov 12.11. 19.11. 26.11. Rovanšek Rupar
BEZELJAK URBAN Na novo odkrite skrivnosti aktomiozinskega delovnega takta 12.11. 19.11. 26.11. Stupar Šćuk
ŽLAJPAH MARGARETA Regulacija HIF-1 proteina 12.11. 19.11. 26.11. Tolar Žbogar
KOLAR SABINA Bridging the GAP between insulin signaling and GLUT4 translocation 19.11. 24.11. 1.12. Umek Korpar
HANDANOVIĆ ELMINA Biokemijski pristop k staranju 26.11. 1.12. 3.12. Žlajpah Železnik
BRATUŠ MARUŠA Mitohondriji kot jih ne poznamo 26.11. 1.12. 3.12. Pavlovič Primec
RUPAR KAJA Sirtuini - reguliranje mitohondrija 2.12. 6.12. 8.12. Gorečan Gregorič
BERKI BARBARA Evolucija mitohondrijev 3.12. 7.12. 10.12. Tolar Rovanšek
JUVANČIČ JANJA Uvoz proteinov v mitohondrij 3.12. 7.12. 10.12. Caf-Feldin Berčič
ROT ZALA Homologi mitohondrijskega razklopnega proteina UCP1 3.12. 8.12. 15.12. Primec Korpar
KOLENC FILIP Post-translational modifications in signal integration 3.12. 10.12. 17.12. Bevc Flis
ŠČUK DINO Mechanisms of lipid-body formation 6.12. 13.12. 17.12. Bigec Železnik
BEVC LUKA Hormon sensitive lipase 5.12. 10.12. 17.12. Gorečan Kolenc
nihče Regulatory crosstalk of the metabolic network 8.12. 15.12. 22.12.
ROVANŠEK VERONIKA The yin-yang of cobalamin biochemistry 17.12. 19.12. 24.12. Bezeljak Ogrin
BERČIČ TJAŠA The thiolase superfamily: condensing enzymes with diverse reaction specificities 17.12. 19.12. 24.12. Hriberšek Bremec
BIGEC TJAŠA Glutamine addiction 17.12. 19.12. 24.12. Juvančič Razboršek
KOGOJ MAJA Kontrola metabolizma s cirkadianim ritmom in obratno 22.12. 29.12. 5.1. Rupar Gregorič
BREMEC KRISTINA Evkariontski transkripcijski faktorji kot direktni senzorji hranil 24.12. 3.1. 7.1. Stupar Žlajpah
STUPAR UROŠ Many paths to methyltransfer: a chronicle of convergence 24.12. 3.1. 7.1. Handanović Pavlovič
TOLAR EVA Light-regulated transcriptional networks in higher plants 24.12. 3.1. 7.1. Dimitrijević Podjed
UMEK ŠPELA Membrane lipids: where they are and how they behave 3.1. 7.1. 12.1. Kranjc Primc
HRIBERŠEK DAMJANA Prenos signalov preko biološko aktivnih lipidov: Sfingolipidi 3.1. 7.1. 14.1. Naraglav Rot
KORPAR TANJA [| Cellular strategies for the assembly of molecular machines] 3.1. 7.1. 14.1. Perme Bratuš
PAVLOVIČ TONJA Vloga adipokinov pri uravnavanju lipidnega metabolizma 7.1. 14.1. 19.1. Frančič Žbogar
GOREČAN PETRA Leptin and the regulation of body weight in mammals 5.1. 12.1. 14.1. Simonič Kolar
GREGORIČ TINA mTOR- from growth signal integration to cancer, diabetes and ageing 13.1. 17.1. 21.1. Kogoj Umek
PRIMEC SARA Inventarna kontrola:Citokrom c oksidazni sklop regulira mitohondrijsko translacijo 13.1. 17.1. 21.1. Berki Flis
FLIS TJAŠA Fructose induced lipogenesis + sami poiščite še dodatne vire! 13.1. 17.1. 21.1. Ščuk Naraglav

Gradivo za seminarje

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
 A) v skupini še z enim kolegom pripraviti opis enega gesla v poglavju Biokemijski leksikon
B) samostojno pripraviti seminar, katerega osnova je znanstveni članek, ki ga določi docent

A: Leksikografsko geslo

Za vpis gesla veljajo naslednja pravila:

  • Geslo je lahko iz katere od že vpisanih kategorij ali pa izberete svoje. Če geslo še ni vpisano v kazalu, ga smiselno uvrstite vanj.
  • Do 12. decembra 2010 do 12. ure vpišite v tabelo skupin BIO2 Seminar-geslo, katero temo ste si izbrali. Preden se odločite za svojo temo, preverite, da si ni iste izbral že kdo drug.
  • Razlaga gesla naj obsega med 500 in 600 besed in vsaj eno povezavo na slikovno gradivo drugje na internetu. Ne nalagajte slik, ki so avtorsko zaščitene!
  • Opis pod A morate dokončati do 12. januarja 2010 do 12. ure.

B: Seminar

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Docent določi članek, ki ga boste obravnavali v okviru seminarja
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom. Povezave do slik so dobrodošle, niso pa nujne.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2800 do 3000 besed), vsebovati mora vsaj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Natisnjen seminar oddajte dva tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsaj dve vprašanji.
  • Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga, povzetek in opis gesla morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.

Retrieved from "https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=BIO2_2010_Seminar&oldid=6322"