BIO2 2010 Seminar: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
 
(58 intermediate revisions by 18 users not shown)
Line 1: Line 1:
= Biokemijski seminar =
= <span style="background:#00FF00">14. januarja se predavanje začne že ob 8:30 v Veliki predavalnici IJS! </span> =
= <span style="background:#00FF00">21. januarja bo predavanje v Kolarjevi predavalnici ob 9:00 </span> =
 
= Biokemijski seminar blablalbalblabllb =


Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.
Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.
Line 55: Line 58:
| BRATUŠ MARUŠA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Maruša_Bratuš:_Mitohondriji_kot_jih_ne_poznamo| Mitohondriji kot jih ne poznamo]]||26.11.||1.12.||3.12.||Pavlovič||Primec
| BRATUŠ MARUŠA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Maruša_Bratuš:_Mitohondriji_kot_jih_ne_poznamo| Mitohondriji kot jih ne poznamo]]||26.11.||1.12.||3.12.||Pavlovič||Primec
|-
|-
| RUPAR KAJA||Sirtuin regulation of mitochondria- energy production, apoptosis, and signaling||2.12.||6.12.||8.12.||Gorečan||Gregorič
| RUPAR KAJA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Kaja_Rupar:_Sirtuini_-_reguliranje_mitohondrija | Sirtuini - reguliranje mitohondrija]] ||2.12.||6.12.||8.12.||Gorečan||Gregorič
|-
|-
| BERKI BARBARA||Mitochondrial Evolution||3.12.||7.12.||10.12.||Tolar||Primec
| BERKI BARBARA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Barbara_Berki:_Evolucija_mitohondrijev | Evolucija mitohondrijev]]||3.12.||7.12.||10.12.||Tolar||Rovanšek
|-
|-
| JUVANČIČ JANJA||Versatility of the mitochondrial protein import machinery||3.12.||7.12.||10.12.||Caf-Feldin||Berčič
| JUVANČIČ JANJA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Janja_Juvančič:_Uvoz_proteinov_v_mitohondrij| Uvoz proteinov v mitohondrij]]||3.12.||7.12.||10.12.||Caf-Feldin||Berčič
|-
|-
| ROT ZALA||The mitochondrial uncoupling-protein homologues||3.12.||8.12.||15.12.||Rovanšek||Korpar
| ROT ZALA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Zala_Rot:_Homologi_mitohondrijskega_razklopnega_proteina_UCP1| Homologi mitohondrijskega razklopnega proteina UCP1]]||3.12.||8.12.||15.12.||Primec||Korpar
|-
|-
| KOLENC FILIP||Post-translational modifications in signal integration||3.12.||10.12.||17.12.||Bevc||Flis
| KOLENC FILIP||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Filip_Kolenc:_Post-translacijske_modifikacije_v_signalni_integraciji | Post-translational modifications in signal integration ]]||3.12.||10.12.||17.12.||Bevc||Flis
|-
|-
| ŠČUK DINO||Mechanisms of lipid-body formation||3.12.||10.12.||17.12.||Bigec||Železnik
| ŠČUK DINO||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Dino_Ščuk:_Mehanizmi_tvorbe_lipidnih_telesc | Mechanisms of lipid-body formation ]]||6.12.||13.12.||17.12.||Bigec||Železnik
|-
|-
| BEVC LUKA||Hormone-sensitive lipase – new roles for an old enzyme||5.12.||10.12.||17.12.||Gorečan||Kolenc
| BEVC LUKA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Luka_Bevc:_Hormon_občutljiva_lipaza | Hormon sensitive lipase ]]||5.12.||10.12.||17.12.||Gorečan||Kolenc
|-
|-
| MEDEN JANEZ||Regulatory crosstalk of the metabolic network||8.12.||15.12.||22.12.||Naraglav||Flis
| nihče||Regulatory crosstalk of the metabolic network||8.12.||15.12.||22.12.||||
|-
|-
| ROVANŠEK VERONIKA||The yin-yang of cobalamin biochemistry||17.12.||19.12.||24.12.||Bezeljak||Ogrin
| ROVANŠEK VERONIKA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Veronika_Rovanšek:_yink_in_yank_v_biokemiji_kobalamina | The yin-yang of cobalamin biochemistry]]||17.12.||19.12.||24.12.||Bezeljak||Ogrin
|-
|-
| BERČIČ TJAŠA||The thiolase superfamily: condensing enzymes with diverse reaction specificities||17.12.||19.12.||24.12.||Hriberšek||Bremec
| BERČIČ TJAŠA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Tjaša_Berčič:_Naddružina_tiolaz_Kondenzirajoči_encimi_ki_katalizirajo_različne_reakcije | The thiolase superfamily: condensing enzymes with diverse reaction specificities]]||17.12.||19.12.||24.12.||Hriberšek||Bremec
|-
|-
| BIGEC TJAŠA||Glutamine addiction||17.12.||19.12.||24.12.||Juvančič||Razboršek
| BIGEC TJAŠA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Tjaša Bigec:_Zasvojenost_z_glutaminom | Glutamine addiction ]]||17.12.||19.12.||24.12.||Juvančič||Razboršek
|-
|-
| KOGOJ MAJA||Metabolism control by the circadian clock and vice versa||22.12.||29.12.||5.1.||Rupar||Gregorič
| KOGOJ MAJA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Maja Kogoj:_Kontrola_metabolizma_s_cirkadianim_ritmom_in_obratno| Kontrola metabolizma s cirkadianim ritmom in obratno]]||22.12.||29.12.||5.1.||Rupar||Gregorič
|-
|-
| BREMEC KRISTINA||Eukaryotic transcription factors as direct nutrient sensors||24.12.||3.1.||7.1.||Stupar||Žlajpah
| BREMEC KRISTINA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Kristina Bremec:_Evkariontski_transkripcijski_faktorji_kot_direktni_senzorji_hranil| Evkariontski transkripcijski faktorji kot direktni senzorji hranil ]]||24.12.||3.1.||7.1.||Stupar||Žlajpah
|-
|-
| STUPAR UROŠ||Many paths to methyltransfer: a chronicle of convergence||24.12.||3.1.||7.1.||Handanović||Pavlovič
| STUPAR UROŠ||Many paths to methyltransfer: a chronicle of convergence||24.12.||3.1.||7.1.||Handanović||Pavlovič
|-
|-
| TOLAR EVA||Light-regulated transcriptional networks in higher plants||24.12.||3.1.||7.1.||Dimitrijević||Podjed
| TOLAR EVA||[[Light-regulated transcriptional networks in higher plants]]||24.12.||3.1.||7.1.||Dimitrijević||Podjed
|-
|-
| UMEK ŠPELA||||3.1.||7.1.||12.1.||Kranjc||Primc
| UMEK ŠPELA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Špela Umek:_Membranski_lipidi:_lokalizacija_in_delovanje |Membrane lipids: where they are and how they behave]]||3.1.||7.1.||12.1.||Kranjc||Primc
|-
|-
| HRIBERŠEK DAMJANA||||3.1.||7.1.||14.1.||Naraglav||Rot
| HRIBERŠEK DAMJANA||[[Prenos signalov preko biološko aktivnih lipidov: Sfingolipidi]]||3.1.||7.1.||14.1.||Naraglav||Rot
|-
|-
| KORPAR TANJA||||3.1.||7.1.||14.1.||Perme||Bratuš
| KORPAR TANJA||[[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Celi%C4%8Dne_strategije_za_sestavljanje_molekularnih_strojev | Cellular strategies for the assembly of molecular machines]]||3.1.||7.1.||14.1.||Perme||Bratuš
|-
|-
| PAVLOVIČ TANJA||||3.1.||7.1.||14.1.||Frančič||Žbogar
| PAVLOVIČ TONJA||[[BIO2_Povzetki_seminarjev#Tonja_Pavlovi.C4.8D:_Vloga_adipokinov_pri_uravnavanju_lipidnega_metabolizma | Vloga adipokinov pri uravnavanju lipidnega metabolizma]]||7.1.||14.1.||19.1.||Frančič||Žbogar
|-
|-
| GOREČAN PETRA||||5.1.||12.1.||19.1.||Simonič||Kolar
| GOREČAN PETRA||[[ BIO2_Povzetki_seminarjev#Petra Gorečan:_Leptin_in_uravnavanje_telesne_te.C5.BEe_pri_sesalcih | Leptin and the regulation of body weight in mammals ]]||5.1.||12.1.||14.1.||Simonič||Kolar
|-
|-
| GREGORIČ TINA||||7.1.||14.1.||21.1.||Kogoj||Umek
| GREGORIČ TINA||mTOR- from growth signal integration to cancer, diabetes and ageing||13.1.||17.1.||21.1.||Kogoj||Umek
|-
|-
| PRIMEC SARA||||7.1.||14.1.||21.1.||Berki||Meden
| PRIMEC SARA||[[Inventarna kontrola:Citokrom c oksidazni sklop regulira mitohondrijsko translacijo]]||13.1.||17.1.||21.1.||Berki||Flis
|-
|-
| FLIS TJAŠA||||7.1.||14.1.||21.1.||Ščuk||Meden
| FLIS TJAŠA||Fructose induced lipogenesis + sami poiščite še dodatne vire!||13.1.||17.1.||21.1.||Ščuk||Naraglav
|}
|}


== <span style="background:#00FF00">Gradivo za seminarje </span>==
== <span style="background:#00FF00">Gradivo za seminarje </span>==
Gradivo za seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/seminarji/
Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/
username: bio2
username: bio2
password: samozame
password: samozame

Latest revision as of 14:56, 6 October 2011

14. januarja se predavanje začne že ob 8:30 v Veliki predavalnici IJS!

21. januarja bo predavanje v Kolarjevi predavalnici ob 9:00

Biokemijski seminar blablalbalblabllb

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev- datumi za seminarje, pri katerih še ni navedena tema, so le informativni in se bodo še spremenili

Ime in priimek Naslov članka Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent1 Recenzent2
Gregor Gunčar naslov seminarja
DIMITRIJEVIĆ ĐORĐE PLC regulacija: nastajajoči modeli molekularnih mehanizmov 20.10. 25.10. 29.10. Berčič Tjaša Berki Barbara
KRAJNC ALEKSANDER Oligomerske oblike z G proteinom sklopljenih receptorjev (GPCR) 20.10. 25.10. 29.10. Bevc Luka Bezeljak Urban
FRANČIČ VITO Proteini WD40: središča v omrežju celičnih biokemijskih interakcij 20.10. 25.10. 29.10. Bigec Tjaša Bratuš Maruša
CAF - FELDIN ŽAN Glycolysis: a bioenergetic or a survival pathway? 20.10. 27.10. 3.11. Simonič Nataša Bremec Kristina
ŽELEZNIK ŽAN Biokemijska in strukturna osnova za trans-v-cis izomerizacijo retinoidov v kemiji vida 28.10. 2.11. 5.11. Caf-Feldin Dimitrijević
PRIMC TISA Apoptoza inducirana prek smrtnih receptorjev 28.10. 2.11. 5.11. Frančič Hadanović
RAZBORŠEK BRIGITA Adhezijski GPCR-ji: odkrivanje pomena novih receptorjev 28.10. 3.11. 10.11. Hriberšek Juvančič
SIMONIČ NATAŠA Botulin in tetanus nevrotoksin: struktura, delovanje in terapevtska uporaba 29.10. 5.11. 12.11. Kogoj Kolar
OGRIN LAURA Kooperativni in nekooperativni ionski kanali CNG 29.10. 5.11. 12.11. Kolenc Krajnc
DIMITRIJEVIČ ĐORĐE 3.11. 10.11. 17.11.
PERME NEJC Mehanizmi zaznavanja glukoze v evkariontskih celicah 5.11. 12.11. 19.11. Primc Ogrin
PODJED ŠPELA Strukturne lastnosti RNA-stikal, ki vežejo metabolite 5.11. 12.11. 19.11. Perme Rot
ŽBOGAR URŠKA Multifunkcionalnost glikolitičnih encimov 10.11. 17.11. 24.11. Podjed Razboršek
NARAGLAV NIVES Protein kinaze: evolucija dinamično reguliranih proteinov 12.11. 19.11. 26.11. Rovanšek Rupar
BEZELJAK URBAN Na novo odkrite skrivnosti aktomiozinskega delovnega takta 12.11. 19.11. 26.11. Stupar Šćuk
ŽLAJPAH MARGARETA Regulacija HIF-1 proteina 12.11. 19.11. 26.11. Tolar Žbogar
KOLAR SABINA Bridging the GAP between insulin signaling and GLUT4 translocation 19.11. 24.11. 1.12. Umek Korpar
HANDANOVIĆ ELMINA Biokemijski pristop k staranju 26.11. 1.12. 3.12. Žlajpah Železnik
BRATUŠ MARUŠA Mitohondriji kot jih ne poznamo 26.11. 1.12. 3.12. Pavlovič Primec
RUPAR KAJA Sirtuini - reguliranje mitohondrija 2.12. 6.12. 8.12. Gorečan Gregorič
BERKI BARBARA Evolucija mitohondrijev 3.12. 7.12. 10.12. Tolar Rovanšek
JUVANČIČ JANJA Uvoz proteinov v mitohondrij 3.12. 7.12. 10.12. Caf-Feldin Berčič
ROT ZALA Homologi mitohondrijskega razklopnega proteina UCP1 3.12. 8.12. 15.12. Primec Korpar
KOLENC FILIP Post-translational modifications in signal integration 3.12. 10.12. 17.12. Bevc Flis
ŠČUK DINO Mechanisms of lipid-body formation 6.12. 13.12. 17.12. Bigec Železnik
BEVC LUKA Hormon sensitive lipase 5.12. 10.12. 17.12. Gorečan Kolenc
nihče Regulatory crosstalk of the metabolic network 8.12. 15.12. 22.12.
ROVANŠEK VERONIKA The yin-yang of cobalamin biochemistry 17.12. 19.12. 24.12. Bezeljak Ogrin
BERČIČ TJAŠA The thiolase superfamily: condensing enzymes with diverse reaction specificities 17.12. 19.12. 24.12. Hriberšek Bremec
BIGEC TJAŠA Glutamine addiction 17.12. 19.12. 24.12. Juvančič Razboršek
KOGOJ MAJA Kontrola metabolizma s cirkadianim ritmom in obratno 22.12. 29.12. 5.1. Rupar Gregorič
BREMEC KRISTINA Evkariontski transkripcijski faktorji kot direktni senzorji hranil 24.12. 3.1. 7.1. Stupar Žlajpah
STUPAR UROŠ Many paths to methyltransfer: a chronicle of convergence 24.12. 3.1. 7.1. Handanović Pavlovič
TOLAR EVA Light-regulated transcriptional networks in higher plants 24.12. 3.1. 7.1. Dimitrijević Podjed
UMEK ŠPELA Membrane lipids: where they are and how they behave 3.1. 7.1. 12.1. Kranjc Primc
HRIBERŠEK DAMJANA Prenos signalov preko biološko aktivnih lipidov: Sfingolipidi 3.1. 7.1. 14.1. Naraglav Rot
KORPAR TANJA [| Cellular strategies for the assembly of molecular machines] 3.1. 7.1. 14.1. Perme Bratuš
PAVLOVIČ TONJA Vloga adipokinov pri uravnavanju lipidnega metabolizma 7.1. 14.1. 19.1. Frančič Žbogar
GOREČAN PETRA Leptin and the regulation of body weight in mammals 5.1. 12.1. 14.1. Simonič Kolar
GREGORIČ TINA mTOR- from growth signal integration to cancer, diabetes and ageing 13.1. 17.1. 21.1. Kogoj Umek
PRIMEC SARA Inventarna kontrola:Citokrom c oksidazni sklop regulira mitohondrijsko translacijo 13.1. 17.1. 21.1. Berki Flis
FLIS TJAŠA Fructose induced lipogenesis + sami poiščite še dodatne vire! 13.1. 17.1. 21.1. Ščuk Naraglav

Gradivo za seminarje

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
A) v skupini še z enim kolegom pripraviti opis enega gesla v poglavju Biokemijski leksikon
B) samostojno pripraviti seminar, katerega osnova je znanstveni članek, ki ga določi docent

A: Leksikografsko geslo

Za vpis gesla veljajo naslednja pravila:

  • Geslo je lahko iz katere od že vpisanih kategorij ali pa izberete svoje. Če geslo še ni vpisano v kazalu, ga smiselno uvrstite vanj.
  • Do 12. decembra 2010 do 12. ure vpišite v tabelo skupin BIO2 Seminar-geslo, katero temo ste si izbrali. Preden se odločite za svojo temo, preverite, da si ni iste izbral že kdo drug.
  • Razlaga gesla naj obsega med 500 in 600 besed in vsaj eno povezavo na slikovno gradivo drugje na internetu. Ne nalagajte slik, ki so avtorsko zaščitene!
  • Opis pod A morate dokončati do 12. januarja 2010 do 12. ure.

B: Seminar

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Docent določi članek, ki ga boste obravnavali v okviru seminarja
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom. Povezave do slik so dobrodošle, niso pa nujne.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2800 do 3000 besed), vsebovati mora vsaj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Natisnjen seminar oddajte dva tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsaj dve vprašanji.
  • Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga, povzetek in opis gesla morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.