BIO2 Seminar 2011

From Wiki FKKT

Jump to: navigation, search

Contents

Biokemijski seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev

Ime in priimek Naslov seminarja Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent1 Recenzent2
Ula ŠtokTipping the mind17.10.1119.10.1121.10.11Maja RemškarMirjam Kmetič
Maša MirkovićThe twisted way of things17.10.1119.10.1121.10.11Eva KnapičMarko Radojković
Sara DraščičOn the spur of a whim 17.10.1119.10.1121.10.11Matevž MerljakMonika Škrjanc
Katra KomanProtein of the 20th century18.10.1123.10.1126.10.11Ines KerinVeronika Jarc
Ana DolinarThe juice of life21.10.1125.10.1128.10.11Tjaša GoričanAndreja Bratovš
Urška RauterA green glow21.10.1125.10.1128.10.11Maša MoharSandi Botonjić
Taja KarnerThrob21.10.1126.10.1102.11.11Karmen HrovatTamara Marić
Rok ŠtembergerForbidden fruit21.10.1128.10.1104.11.11Špela PohlevenMaja Grdadolnik
Maša MoharThe tenuous nature of sex21.10.1128.10.1104.11.11Andreja BratovšInes Kerin
Veronika JarcOur hollow architecture21.10.1128.10.1104.11.11Sabina MavretičMatevž Ambrožič
Mirjam KmetičMint condition26.10.1102.11.1109.11.11Sandi BotonjićTina Gregorič
Janez MedenThe Japanese Horseshoe Crab and Deafness28.10.1101.12.1120.1.12Veronika JarcAna Dolinar
Tjaša FlisLife's tremors28.10.1104.11.1111.11.11Ana DolinarŠpela Pohleven
Sandi BotonjićNature's junkie28.10.1104.11.1111.11.11Maša MirkovićAlenka Mikuž
Kaja JavoršekA grey matter02.11.1109.11.1116.11.11Dominik KertTjaša Flis
Rok VeneA mind astray04.11.1111.11.1118.11.11Tamara MarićMaja Remškar
Ines ŠterbalLTP104.11.1111.11.1118.11.11Ula ŠtokRok Vene
Matja ZalarDo it yourself04.11.1111.11.1118.11.11Monika ŠkrjancMatevž Merljak
Matevž AmbrožičOf fidgets and food09.11.1116.11.1123.11.11Kaja JavoršekPetra Malavašič
Matevž MerljakProtein wars12.12.1119.12.1120.1.12Teja BaničUrška Navodnik
Mitja CrčekWhen your day draws to an end11.11.1118.11.1125.11.11Marko RadojkovićAndrej Vrankar
Dominik KertFOXP2, govoreči protein11.11.1118.11.1125.11.11Alja ZottelKaja Javoršek
Petra MalavašičGoing unnoticed16.11.1123.11.1130.11.11Maja GrdadolnikMitja Crček
Eva KnapičLife's first breath18.11.1125.11.1102.12.11Mirjam KmetičAndrej Vrankar
Marko RadojkovićPaint my thoughts18.11.1125.11.1102.12.11Sara DraščičUrška Rode
Tjaša GoričanNerve regrowth: nipped by a no-go18.11.1125.11.1102.12.11Ana RemžgarInes Šterbal
Tina GregoričGrelin - hormon lakote23.11.1130.11.1107.12.11Janez MedenUrška Rauter
Tamara MarićThe dark side of RNA25.11.1102.12.1109.12.11Dominik KertRok Štemberger
Ana RemžgarI'll have you for supper25.11.1102.12.1109.12.11Jana VerbančičEva Knapič
Maja RemškarQuestioning Colour25.11.1102.12.1109.12.11Katra KomanKarmen Belšak
Andreja BratovšThe power behind pain30.11.1107.12.1114.12.11Matevž AmbrožičTeja Banič
Urška NavodnikDarwin's dessert02.12.1109.12.1116.12.11Taja KarnerKarmen Hrovat
Jernej MustarSilent pain02.12.1109.12.1116.12.11Petra MalavašičJana Verbančič
Ines KerinA queen's dinner02.12.1109.12.1116.12.11Tjaša FlisIza Ogris
Alja ZottelSleepless nights07.12.1114.12.1121.12.11Ines ŠterbalKatra Koman
Alenka MikužZP3 in njegova vloga pri oploditvi jajčeca09.12.1116.12.1123.12.11Urška RodeJanez Meden
Maja GrdadolnikOtopetrin1 in regulacija kalcija pri sintezi statokonijev09.12.1116.12.1123.12.11Karmen BelšakAna Potočnik
Jana VerbančičA balanced mind09.12.1116.12.1123.12.11Alenka MikužAna Remžgar
Karmen HrovatThe thread of life14.12.1121.12.1104.01.12Iza OgrisTaja Karner
Andrej VrankarThe things we forget16.12.1123.12.1106.01.12Jernej MustarMaša Mohar
Teja BaničCool news16.12.1123.12.1106.01.12Sara DraščičJernej Mustar
Špela PohlevenThe making of crooked16.12.1123.12.1106.01.12Mitja CrčekMaša Mirković
Sabina MavretičA short story21.12.1104.01.1211.01.12Rok VeneAlja Zottel
Karmen BelšakAnother dark horse23.12.1106.01.1213.01.12Urška RauterTina Gregorič
Iza OgrisFat, wonderful fat.23.12.1106.01.1213.01.12Ana PotočnikMatja Zalar
Monika ŠkrjancThe greenest of us all[1]23.12.1106.01.1213.01.12Rok ŠtembergerTjaša Goričan
Ana PotočnikSkin-deep[2]04.01.1211.01.1218.01.12Matja ZalarUla Štok
Urška RodeSmart sweat06.01.1213.01.1220.01.12Urška NavodnikSabina Mavretič
Ime in priimekNaslov seminarja06.01.1213.01.1220.01.12

Gradivo za seminarje

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o enem od proteinov opisanih v ProteinSpotlight Poiskati morate vsaj še tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo!

V okviru seminarske naloge morate opraviti še naslednje naloge, katerih rešitve predložite na dodatni strani seminarske naloge, ki se ne šteje v kvoto obsega seminarja:

  • sekvenca proteina in UniProt oznaka proteina
  • slika strukture proteina (če je le-ta znana), ki jo naredite sami s programom Pymol. Če struktura še ni znana, vključite sliko proteina, ki je vašemu najbolj podoben po sekvenci in katerega struktura je znana
  • poiskati morate, na katerem kromosomu se v človeškem genu nahaja ta protein in narisati shematsko sliko gena (eksonov in intronov) tega proteina. Če protein ni človeškega izvora, poiščite protein, ki je vašemu najbolj podoben in vse navedeno opišite za ta protein.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli vsakemu od recenzentov in docentu (docentu ga pošljite po e-pošti).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.
  • Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v šestih dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.

Personal tools