BIO2 Seminar 2011

From Wiki FKKT

Revision as of 20:51, 10 October 2011 by Tina Gregorič (Talk | contribs)
Jump to: navigation, search

Contents

Biokemijski seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev - datumi še niso dokončni, listka na katerem imam napisano kdaj kdo ne more nimam doma in bom to popravil v ponedeljek

Vpišite svoj izbrani naslov!!!

Ime in priimek Naslov seminarja Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent1 Recenzent2
Ula ŠtokTipping the mind17.10.1119.10.1121.10.11
Maša MirkovićNaslov seminarja17.10.1119.10.1121.10.11
Sara DraščičOn the spur of a whim17.10.1119.10.1121.10.11
Katra KomanNaslov seminarja18.10.1123.10.1126.10.11
Iza OgrisLove,love, love...21.10.1125.10.1128.10.11
Ana DolinarThe juice of life21.10.1125.10.1128.10.11
Urška RauterA green glow21.10.1125.10.1128.10.11
Taja KarnerThrob21.10.1126.10.1102.11.11
Rok ŠtembergerForbidden fruit21.10.1128.10.1104.11.11
Maša MoharThe tenuous nature of sex21.10.1128.10.1104.11.11
Veronika JarcOur hollow architecture21.10.1128.10.1104.11.11
Mirjam KmetičMint condition26.10.1102.11.1109.11.11
Janez MedenThe Japanese Horseshoe Crab and Deafness 28.10.1104.11.1111.11.11
Tjaša FlisNaslov seminarja28.10.1104.11.1111.11.11
Sandi BotonjićNaslov seminarja28.10.1104.11.1111.11.11
Kaja JavoršekNaslov seminarja02.11.1109.11.1116.11.11
Rok VeneNaslov seminarja04.11.1111.11.1118.11.11
Ines ŠterbalNaslov seminarja04.11.1111.11.1118.11.11
Andreja BratovšThe power behind pain04.11.1111.11.1118.11.11
Matevž AmbrožičNaslov seminarja09.11.1116.11.1123.11.11
Matevž MerljakNaslov seminarja11.11.1118.11.1125.11.11
Mitja CrčekNaslov seminarja11.11.1118.11.1125.11.11
Dominik KertNaslov seminarja11.11.1118.11.1125.11.11
Petra MalavašičGoing unnoticed16.11.1123.11.1130.11.11
Eva KnapičLife's first breath18.11.1125.11.1102.12.11
Marko RadojkovićPaint my thoughts18.11.1125.11.1102.12.11
Tjaša GoričanNerve regrowth: nipped by a no-go18.11.1125.11.1102.12.11
Tina GregoričGut feelings23.11.1130.11.1107.12.11
Tamara MarićThe dark side of RNA25.11.1102.12.1109.12.11
Ana RemžgarNaslov seminarja25.11.1102.12.1109.12.11
Maja RemškarQuestioning Colour25.11.1102.12.1109.12.11
Matja ZalarDo it yourself30.11.1107.12.1114.12.11
Urška NavodnikNaslov seminarja02.12.1109.12.1116.12.11
Jernej MustarSilent pain02.12.1109.12.1116.12.11
Ines KerinA queen's dinner02.12.1109.12.1116.12.11
Alja ZottelSleepless nights07.12.1114.12.1121.12.11
Alenka MikužMolecular chastity09.12.1116.12.1123.12.11
Maja GrdadolnikEar of Stone09.12.1116.12.1123.12.11
Jana VerbančičHidden power09.12.1116.12.1123.12.11
Petra GorečanNaslov seminarja14.12.1121.12.1104.01.12
Karmen HrovatNaslov seminarja16.12.1123.12.1106.01.12
Andrej VrankarThe things we forget16.12.1123.12.1106.01.12
Teja BaničCool news16.12.1123.12.1106.01.12
Špela PohlevenNaslov seminarja21.12.1104.01.1211.01.12
Sabina Mavretič A short story23.12.1106.01.1213.01.12
Karmen Belšak Another dark horse23.12.1106.01.1213.01.12
Ime in priimek Naslov seminarja23.12.1106.01.1213.01.12
Ime in priimek Naslov seminarja04.01.1211.01.1218.01.12
Ime in priimek Naslov seminarja06.01.1213.01.1220.01.12
Ime in priimek Naslov seminarja06.01.1213.01.1220.01.12
Ime in priimek Naslov seminarja06.01.1213.01.1220.01.12

Gradivo za seminarje

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o enem od proteinov opisanih v ProteinSpotlight Poiskati morate vsaj še tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! V seminarsko nalogo mora biti vključeno:

  • sekvenca proteina in SwissProt oznaka proteina
  • slika strukture proteina (če je le-ta znana), ki jo naredite sami s programom Pymol. Če struktura še ni znana, vključite sliko proteina, ki je vašemu najbolj podoben po sekvenci in katerega struktura je znana
  • poiskati morate, na katerem kromosomu se v človeškem genu nahaja ta protein in narisati shematsko sliko gena (eksonov in intronov) tega proteina. Če protein ni človeškega izvora, poiščite protein, ki je vašemu najbolj podoben in vse navedeno opišite za ta protein.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah, besedilo naj vsebuje sliko strukture proteina, ki jo sami narišete s programom PyMol - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Natisnjen seminar oddajte dva tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.
  • Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.

Personal tools