BIO2 Seminar 2013

From Wiki FKKT
Revision as of 19:03, 26 November 2013 by Boštjan Petrič (talk | contribs)
Jump to navigationJump to search

Biokemijski seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak petek od 13:00 do 16:00.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev

Ime Priimek Tema* Naslov seminarja Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3 Datum oddaje Datum recenzije Datum predstavitve
Triplat Katjuša 12 Signalizacija s člani TGF – β pri žilni morfogenezi in boleznih Ipšek Rok Štukelj Sabina Krmpotić Luka 04.11.2013 06.11.2013 08.11.2013
Krišelj Ana 12 Signalna pot sfingozin-1-fosfata in njegova vloga v boleznih Tavčar Petra Zgonc Alja Petrič Boštjan 04.11.2013 06.11.2013 08.11.2013
Zupančič Maja 12 Menin: ogrodni protein, ki nadzoruje ekspresijo genov in celično signalizacijo Guštin Ema Jakše Helena Bolta Simon 04.11.2013 06.11.2013 08.11.2013
Božič Tim 12 Motorični protein z regulacijo serotoninskega receptorja vpliva na razpoloženje Oblak Zvonar Eva Strašek Nika Juteršek Mojca 04.11.2013 06.11.2013 08.11.2013
Vidmar Vita 14 Vloga pentozafosfatne poti v metabolizmu rakavih celic Rupert Jakob Nagode Toni Vidak Eva 04.11.2013 06.11.2013 08.11.2013
Radić Vesna 14 Vloga betatrofina pri zdravljenju diabetesa Triplat Katjuša Ipšek Rok Štukelj Sabina 04.11.2013 08.11.2013 15.11.2013
Guštin Ema 14 Warburgov efekt in možnosti za zdravljenje raka Krišelj Ana Tavčar Petra Zgonc Alja 04.11.2013 08.11.2013 15.11.2013
Kapš Urša 15 Uravnavanje maščob: lipidi in človeške bolezni Zupančič Maja Guštin Ema Jakše Helena 04.11.2013 08.11.2013 15.11.2013
Kavčič Luka 15 Vloga glikolitičnega regulatornega encima PKM2 v metabolizmu rakave celice Božič Tim Oblak Zvonar Eva Strašek Nika 04.11.2013 08.11.2013 15.11.2013
Mihalič Filip 15 Pomen microRNA molekul v metabolizmu in metabolnih nepravilnostih Vidmar Vita Rupert Jakob Nagode Toni 04.11.2013 08.11.2013 15.11.2013
Košenina Sara 16 Zdravljenje hipoksije in z njo povezanega nastanka raka preko citratnega cikla Radić Vesna Triplat Katjuša Ipšek Rok 08.11.2013 15.11.2013 22.11.2013
Bensa Tjaša 16 α-ketoglutarat dehidrogenazni kompleks in nevrodegenerativne bolezni Horvat Marjeta Krišelj Ana Tavčar Petra 08.11.2013 15.11.2013 22.11.2013
Ferenc Rok 16 Medsebojne fizične povezave encimov TCA cikla v Bacillus subtilis Kapš Urša Zupančič Maja Guštin Ema 08.11.2013 15.11.2013 22.11.2013
Buh Tajda 16 Mutacije izocitrat dehidrogenaze 1 in 2 pri raku Kavčič Luka Božič Tim Oblak Zvonar Eva 08.11.2013 15.11.2013 22.11.2013
Jazbec Vid 17 Vpliv maščobnih kislin na rakave celice Mihalič Filip Vidmar Vita Rupert Jakob 08.11.2013 15.11.2013 22.11.2013
Tahirović Aneja 17 Omega - 3 maščobne kisline in njihov vpliv na človeško telo Košenina Sara Radić Vesna Triplat Katjuša 15.11.2013 22.11.2013 29.11.2013
Klofutar Domen 17 Lipoliza - reguliran multiencimski kompleks, ki vpliva na katabolizem zalog maščobe Bensa Tjaša Horvat Marjeta Krišelj Ana 15.11.2013 22.11.2013 29.11.2013
Prolič - Kalinšek Maruša 17 Vloga PPAR pri razgradnji maščobnih kislin Ferenc Rok Kapš Urša Zupančič Maja 15.11.2013 22.11.2013 29.11.2013
Fabjan Jure 18 Oksidativni in nitrozativni stres v nevrotoksičnosti amoniaka Buh Tajda Kavčič Luka Božič Tim 15.11.2013 22.11.2013 29.11.2013
Rozman Jan 18 Proteini - Alternativni vir energije rastlin ob pomanjkanju ogljikovih hidratov Jazbec Vid Mihalič Filip Vidmar Vita 15.11.2013 22.11.2013 29.11.2013
Prezelj Peter 18 Aminokisline in regulacija proteinske sinteze v skeletnem mišičnem tkivu Tahirović Aneja Košenina Sara Radić Vesna 22.11.2013 29.11.2013 06.12.2013
Omahna Aljaž 18 Sinteza melanina v celicah Klofutar Domen Bensa Tjaša Horvat Marjeta 22.11.2013 29.11.2013 06.12.2013
Taškar Jan 19 Zgodnje napake pri oksidativni fosforilaciji v odpovedujočem človeškem srcu Prolič - Kalinšek Maruša Ferenc Rok Kapš Urša 22.11.2013 29.11.2013 06.12.2013
Kašnik Urška 19 Moj izbrani naslov Fabjan Jure Buh Tajda Kavčič Luka 22.11.2013 29.11.2013 06.12.2013
Kostanjevec Mojca 19 Mitohondrijske reaktivne kisikove spojine Rozman Jan Jazbec Vid Mihalič Filip 22.11.2013 29.11.2013 06.12.2013
Krmpotić Luka 19 cAMP narejena v mitohondrijih regulira oksidativno fosforilacijo Prezelj Peter Tahirović Aneja Košenina Sara 29.11.2013 06.12.2013 13.12.2013
Petrič Boštjan 19 Regulacija in inhibicija citokrom c oksidaze Omahna Aljaž Klofutar Domen Bensa Tjaša 29.11.2013 06.12.2013 13.12.2013
Bolta Simon 20 Fotosinteza C4 Taškar Jan Prolič - Kalinšek Maruša Ferenc Rok 29.11.2013 06.12.2013 13.12.2013
Juteršek Mojca 20 Moj izbrani naslov Kašnik Urška Fabjan Jure Buh Tajda 29.11.2013 06.12.2013 13.12.2013
Vidak Eva 20 Fotosintetska plastičnost CAM fotosinteze: evolucijska novost za trajnostno proizvodnjo Kostanjevec Mojca Rozman Jan Jazbec Vid 29.11.2013 06.12.2013 13.12.2013
Štukelj Sabina 21 Moj izbrani naslov Krmpotić Luka Prezelj Peter Tahirović Aneja 20.12.2013 24.12.2013 03.01.2014
Zgonc Alja 21 Moj izbrani naslov Petrič Boštjan Omahna Aljaž Klofutar Domen 20.12.2013 24.12.2013 03.01.2014
Jakše Helena 21 Moj izbrani naslov Bolta Simon Taškar Jan Prolič - Kalinšek Maruša 20.12.2013 24.12.2013 03.01.2014
Strašek Nika 22 Porfirija: napredek v diagnostiki in zdravljenju Juteršek Mojca Kašnik Urška Fabjan Jure 20.12.2013 24.12.2013 03.01.2014
Nagode Toni 22 Fiksacija dušika Vidak Eva Kostanjevec Mojca Rozman Jan 20.12.2013 24.12.2013 03.01.2014
Ipšek Rok 22 Moj izbrani naslov Štukelj Sabina Krmpotić Luka Prezelj Peter 24.12.2013 03.01.2014 10.01.2014
Tavčar Petra 23 Moj izbrani naslov Zgonc Alja Petrič Boštjan Omahna Aljaž 24.12.2013 03.01.2014 10.01.2014
Horvat Marjeta 23 Uravnavanje metabolizma železa pri sesalcih Jakše Helena Bolta Simon Taškar Jan 24.12.2013 03.01.2014 10.01.2014
Oblak Zvonar Eva 23 Moj izbrani naslov Strašek Nika Juteršek Mojca Kovačič Matic 24.12.2013 03.01.2014 10.01.2014
Rupert Jakob 23 Moj izbrani naslov Nagode Toni Vidak Eva Kostanjevec Mojca 24.12.2013 03.01.2014 10.01.2014
  • številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju (peta izdaja), v katerega naj izbrana tema spada

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo!

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 25-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.
  • Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

  • 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
  • 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
  • 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v sedmih dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.