BIO2 Seminar 2015

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

Ime Priimek	poglavje	Naslov seminarja	Recenzent 1	Recenzent 2	Datum oddaje	Datum recenzije	Datum predstavitve
Kristjan Stibilj	12	moj naslov	Lovro Kotnik	Blaž Lebar	21/10/15	23/10/15	28/10/15
Tjaša Lukšič	12		Karmen Žbogar	Aleksandra Uzar	21/10/15	23/10/15	28/10/15
Klara Kuret	12		Klara Lenart	Petra Hruševar	21/10/15	23/10/15	28/10/15
Rok Miklavčič	12		Katja Čop	Lovro Kotnik	28/10/15	30/10/15	04/11/15
Ema Gašperšič	12		Nejc Kejžar	Karmen Žbogar	28/10/15	30/10/15	04/11/15
Tadej Satler	12		Neža Brezovar	Klara Lenart	28/10/15	30/10/15	04/11/15
Tina Šimunović	14-15		Kristjan Stibilj	Katja Čop	04/11/15	06/11/15	11/11/15
Maja Zupanc	14-15		Tjaša Lukšič	Nejc Kejžar	04/11/15	06/11/15	11/11/15
Tilen Tršelič	14-15		Klara Kuret	Neža Brezovar	04/11/15	06/11/15	11/11/15
Lara Jerman	16		Rok Miklavčič	Kristjan Stibilj	11/11/15	13/11/15	18/11/15
Eva Rajh	16		Ema Gašperšič	Tjaša Lukšič	11/11/15	13/11/15	18/11/15
Sara Tekavec	16		Tadej Satler	Klara Kuret	11/11/15	13/11/15	18/11/15
Fran Krstanović	17		Tina Šimunović	Rok Miklavčič	18/11/15	20/11/15	25/11/15
Elvira Boršić	17		Maja Zupanc	Ema Gašperšič	18/11/15	20/11/15	25/11/15
Janja Krapež	17		Tilen Tršelič	Tadej Satler	18/11/15	20/11/15	25/11/15
Janez Javornik	18		Lara Jerman	Tina Šimunović	25/11/15	27/11/15	02/12/15
Miha Koprivnikar Krajnc	18		Eva Rajh	Maja Zupanc	25/11/15	27/11/15	02/12/15
Špela Malenšek	18		Sara Tekavec	Tilen Tršelič	25/11/15	27/11/15	02/12/15
Urša Kopač	19		Fran Krstanović	Lara Jerman	02/12/15	04/12/15	09/12/15
Neža Koritnik	19		Elvira Boršić	Eva Rajh	02/12/15	04/12/15	09/12/15
Gašper Virant	19		Janja Krapež	Sara Tekavec	02/12/15	04/12/15	09/12/15
Uroš Zavrtanik	20		Janez Javornik	Fran Krstanović	09/12/15	11/12/15	16/12/15
Simon Aleksič	20		Miha Koprivnikar Krajnc	Elvira Boršić	09/12/15	11/12/15	16/12/15
Matej Hvalec	20		Špela Malenšek	Janja Krapež	09/12/15	11/12/15	16/12/15
Urša Čerček	21		Urša Kopač	Janez Javornik	16/12/15	18/12/15	23/12/15
Katja Brezovar	21		Neža Koritnik	Miha Koprivnikar Krajnc	16/12/15	18/12/15	23/12/15
Gašper Žun	21		Gašper Virant	Špela Malenšek	16/12/15	18/12/15	23/12/15
Blaž Lebar	22		Uroš Zavrtanik	Urša Kopač	23/12/15	03/01/16	06/01/16
Aleksandra Uzar	22		Simon Aleksič	Neža Koritnik	23/12/15	03/01/16	06/01/16
Petra Hruševar	22		Matej Hvalec	Gašper Virant	23/12/15	03/01/16	06/01/16
Lovro Kotnik	23		Urša Čerček	Uroš Zavrtanik	06/01/16	08/01/16	13/01/16
Karmen Žbogar	23		Katja Brezovar	Simon Aleksič	06/01/16	08/01/16	13/01/16
Klara Lenart	23		Gašper Žun	Matej Hvalec	06/01/16	08/01/16	13/01/16
Katja Čop	23		Blaž Lebar	Urša Čerček	13/01/16	15/01/16	20/01/16
Nejc Kejžar	23		Aleksandra Uzar	Katja Brezovar	13/01/16	15/01/16	20/01/16
Neža Brezovar	23		Petra Hruševar	Gašper Žun	13/01/16	15/01/16	20/01/16

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo!

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Zelo pomembno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 25 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v toku celega seminarskega obdobja.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Poprava

Če ste več kot 50% seminarja prepisali iz istega članka ali kateregakoli drugega vira, stavek za stavkom (izpuščeni stavki ne štejejo za prekinitev te kontinuitete- pobarvajte ga), potem imate možnost, da seminar popravite. To storite tako, da do 16.12.2014 oddate prijavo za popravljanje seminarja. S tem pridobite še eno možnost, napaka pa ne bo vplivala na oceno. Če se ne boste prijavili, vaš seminar pa je prepisan, kot je definirano zgoraj, seminarja ne boste opravili. Brez opravljenega seminarja to leto ne boste mogli opraviti izpita, ker je opravljen seminar pogoj za prijavo na izpit.Če ste se prijavili za popravo, lahko obdržite isto temo le, če ste za osnovo izbrali pregledni članek. Drugače lahko sami v obrazcu predlagate novo temo in pregledni članek, ki ste ga izbrali za osnovo. Teme morajo soditi v teme predavanj. Če teme ne boste obdržali ali je predlagali sami, jo bom določil jaz.

Če seminarja niste prepisali, želite pa ga izboljšati, lahko to storite tako, da popravljeno verzijo seminarja oddate do 14.1.2015 preko elektronskega obrazca za oddajo seminarjev. V tem primeru se za popravo ne prijavljajte. Za ime datoteke glejte spodaj. Če ste oddali prijavo za popravo seminarja, je rok za oddajo petek, 23. januar 2015.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
• 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši
• 116_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, ki je napisan na novo in je bil prijavljen v shemo 50%

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v sedmih dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.