BIO2 Seminar 2021

From Wiki FKKT
Revision as of 19:27, 7 January 2022 by Pia Trošt (talk | contribs) (→‎Seznam seminarjev)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to navigationJump to search

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

priimek, ime poglavje naslov seminarja recenzent 1 recenzent 2 datum oddaje datum recenzije datum predstavitve
Valte, David 12 Jedrni hormonski receptorji in izražanje genov Mitkov, Kostadin Brdnik, Nuša 29/10/21 01/11/21 03/11/21
Kolar, Alliana 12 Pomen upravljanja z agonisti, antagonisti in signalnimi modulatorji receptorjev abscizinske kisline (ABA) v agronomiji Vukšinić, Ivana Premrl, Petja 29/10/21 01/11/21 03/11/21
Glavnik, Hana 12 S-glutationilacija proteinov kot globalni inhibitor celičnega metabolizma za zmanjšanje občutljivosti signalov vodikovega peroksida Kovač, Ela Kavčič, Ema 29/10/21 01/11/21 03/11/21
Štefan, Urša 12 Signalizacija STING - obseg delovanja in povezava z rakavimi obolenji Vujović, Nataša Zajec, Tina 29/10/21 01/11/21 03/11/21
Butara, Tinkara 12 Transmembranska signalizacija v bakterijskih kemoreceptorjih Sotlar, Špela Žnidar, Žan 29/10/21 01/11/21 03/11/21
Špehar, Pia 12 Integrini in njihova vloga pri vezikularnem transportu Trošt, Pia Rus, Metka 05/11/21 08/11/21 10/11/21
Urh, Tina 12 Nevrotransmiterji, agonisti in antagonisti kot tarča zdravljenja Maučec, Ana Loborec, Mark 05/11/21 08/11/21 10/11/21
Rotar, Andraž 12 Vloga signalne poti JAK/STAT in njeni inhibitorji pri človeških boleznih Priveršek, Maj Kastelic, Ana 05/11/21 08/11/21 10/11/21
Starc, Gaja 12 Medsebojni vpliv vodikovega sulfida in drugih signalnih molekul pri uravnavanju signaliziranja celic zapiralk in odzivu na abiotski oziroma biotski stres Spruk, Teja Možina, Gašper 05/11/21 08/11/21 10/11/21
Resnik, Katja 12 Signalna omrežja, ki povzročajo raka Deutsch, Maja Sotlar, Pia 05/11/21 08/11/21 10/11/21
Bohte, Janja 14-15 Vloga in regulacija aerobne glikolize pri hepatocelularnem karcinomu Valte, David Mitkov, Kostadin 12/11/21 15/11/21 17/11/21
Miklošič, Maja 14-15 ni opravila Kolar, Alliana Vukšinić, Ivana 12/11/21 15/11/21 17/11/21
Kovačić, Marko 14-15 Vloga citokinov poddružine IL-1 pri regulaciji glikolize in njihov vpliv na bolezni, povezane z glikolizo Glavnik, Hana Kovač, Ela 12/11/21 15/11/21 17/11/21
Kolbl, Karidia 14-15 Metabolizem možganskega glikogena; povezava z motnjami spanja in glavobolom Štefan, Urša Vujović, Nataša 12/11/21 15/11/21 17/11/21
Kos Thaler, Nuša 14-15 Motnje metabolizma glikogena in njihove posledice Butara, Tinkara Sotlar, Špela 12/11/21 15/11/21 17/11/21
Ažbe, Klara 16 Vpliv metabolitov Krebsovega cikla na fiziologijo in bolezni Špehar, Pia Trošt, Pia 19/11/21 22/11/21 24/11/21
Jerič, Sara 16 Vpliv intermediatov Krebsovega cikla na metiliranje histonov in DNA ter posledično na proces staranja Urh, Tina Maučec, Ana 19/11/21 22/11/21 24/11/21
Mencin, Pia 16 Akonitaza in njena vloga v celici Rotar, Andraž Priveršek, Maj 19/11/21 22/11/21 24/11/21
Weingerl, Zarja 16 Sukcinat in njegova vloga v metabolizmu Starc, Gaja Spruk, Teja 19/11/21 22/11/21 24/11/21
Kartal, Ena 16 Metabolizem lipojske kisline in mitohondrijska redoks regulacija Resnik, Katja Deutsch, Maja 19/11/21 22/11/21 24/11/21
Struna, Gašper 17 Oksidacija maščobnih kislin v peroksisomih Bohte, Janja Valte, David 26/11/21 29/11/21 01/12/21
Špenko, Andrej 17 Miklošič, Maja Kolar, Alliana 26/11/21 29/11/21 01/12/21
Zevnik, Urša 17 Genetske napake mitohondrijske oksidacije maščobnih kislin in karnitinskega transporta Kovačić, Marko Glavnik, Hana 26/11/21 29/11/21 01/12/21
Peternel, Neža 17 Uravnavanje oksidacije maščobnih kislin s prehrano in telesno vadbo Kolbl, Karidia Štefan, Urša 26/11/21 29/11/21 01/12/21
Vidmar, Nik 17 Presnova, učinki ter bolezenska stanja kot posledica povišanih koncentracij ketonskih telesc Kos Thaler, Nuša Butara, Tinkara 26/11/21 29/11/21 01/12/21
Trebušak, Jan 18 Vloga karbamoil fosfat sintetaze Ažbe, Klara Špehar, Pia 03/12/21 06/12/21 08/12/21
Kores, Lana 18 Urinska bolezen javorjevega sirupa (MSUD) Jerič, Sara Urh, Tina 03/12/21 06/12/21 08/12/21
Razdevšek, Miha 18 Motnje razgradnje glicina in njihove posledice Mencin, Pia Rotar, Andraž 03/12/21 06/12/21 08/12/21
Javeršek, Tina 18 Nedavni napredek pri zdravljenju hiperamoniemije Weingerl, Zarja Starc, Gaja 03/12/21 06/12/21 08/12/21
Kočman, Klara 18 Bowman-Birkov inhibitor Kartal, Ena Resnik, Katja 03/12/21 06/12/21 08/12/21
Jošt, Lev 19 Tvorba ROS in njihov prispevek k signalizaciji in razumevanju bolezni Struna, Gašper Bohte, Janja 10/12/21 13/12/21 15/12/21
Razboršek, Klara 19 Regulacija apoptoze v zdravju in bolezni: uravnoteženo delovanje BCL-2 proteinov Špenko, Andrej Miklošič, Maja 10/12/21 13/12/21 15/12/21
Rapuš, Špela 19 Zlivanje in cepitve mitohondrijev Zevnik, Urša Kovačić, Marko 10/12/21 13/12/21 15/12/21
Mencigar, Maša 19 Reaktivne kisikove zvrsti in njihova vloga pri rakavih obolenjih Peternel, Neža Kolbl, Karidia 10/12/21 13/12/21 15/12/21
Ivošević, Vanja*gg 19 Kompleksnost biosinteze ubikinona Vidmar, Nik Kos Thaler, Nuša 10/12/21 13/12/21 15/12/21
Kogovšek, Jan 20 Karbonska anhidraza in molekularna evolucija C4 fotosinteze Trebušak, Jan Ažbe, Klara 17/12/21 20/12/21 22/12/21
Brdnik, Nuša 20 Vloga šaperonov v biogenezi encima Rubisco Kores, Lana Jerič, Sara 17/12/21 20/12/21 22/12/21
Premrl, Petja 20 Encimi Calvinovega cikla ter GAPDH/CP12/PRK kompleks Razdevšek, Miha Mencin, Pia 17/12/21 20/12/21 22/12/21
Kavčič, Ema 20 Sinteza celične stene: vir ogljika in regulacija Javeršek, Tina Weingerl, Zarja 17/12/21 20/12/21 22/12/21
Zajec, Tina 20 Avtotrofna asimilacija ogljika pri mikroorganizmih Kočman, Klara Kartal, Ena 17/12/21 20/12/21 22/12/21
Žnidar, Žan 21 Signalizacija bioaktivnih (sfingo)lipidov Jošt, Lev Struna, Gašper 17/12/21 20/12/21 22/12/21
Rus, Metka 21 Vpliv hormonov ščitnice na biosintezo lipidov v jetrih Razboršek, Klara Špenko, Andrej 31/12/21 03/01/22 05/01/22
Loborec, Mark 21 Cirkadiana regulacija lipidnega metabolizma Rapuš, Špela Zevnik, Urša 31/12/21 03/01/22 05/01/22
Kastelic, Ana 21 Prolaktin in diferenciacija mlečnih žlez med nosečnostjo in dojenjem Mencigar, Maša Peternel, Neža 31/12/21 03/01/22 05/01/22
Možina, Gašper 21 Učinki alkohola na jetrni metabolizem lipidov Ivošević, Vanja Vidmar, Nik 31/12/21 03/01/22 05/01/22
Sotlar, Pia 22 Metabolizem purinov in purinergična signalizacija Kogovšek, Jan Trebušak, Jan 31/12/21 03/01/22 05/01/22
Mitkov, Kostadin 22 Heme biosynthesis and congenital erythropoietic porphyria Brdnik, Nuša Kores, Lana 03/01/22 06/01/22 11/01/22
Vukšinić, Ivana 22 Vloga bilirubina kot signalne molekule Premrl, Petja Razdevšek, Miha 04/01/22 07/01/22 11/01/22
Kovač, Ela 22 Aminokislinska regulacija skeletnih mišic Kavčič, Ema Javeršek, Tina 05/01/22 08/01/22 11/01/22
Vujović, Nataša 22 Glutamine metabolism and its role in cardiomyocytes Zajec, Tina Kočman, Klara 06/01/22 09/01/22 11/01/22
Sotlar, Špela 23 Funkcija in regulacija leptina Žnidar, Žan Jošt, Lev 07/01/22 10/01/22 12/01/22
Trošt, Pia 23 Metabolizem vitamina D in njegova funkcija pri rakavih obolenjih Rus, Metka Razboršek, Klara 07/01/22 10/01/22 12/01/22
Maučec, Ana 23 Vloga deiodinaz pri homeostazi tiroidnih hormonov Loborec, Mark Rapuš, Špela 07/01/22 10/01/22 12/01/22
Priveršek, Maj 23 Sinteza in transport dopamina v presinaptičnem nevronu Kastelic, Ana Mencigar, Maša 07/01/22 10/01/22 12/01/22
Spruk, Teja 23 Maščobno tkivo in adipociti v patogenezi metaboličnega sindroma Možina, Gašper Ivošević, Vanja 07/01/22 10/01/22 12/01/22
Deutsch, Maja 23 Mehanizem delovanja tiroidnih hormonov Sotlar, Pia Kogovšek, Jan 07/01/22 10/01/22 12/01/22
  • številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim, da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo, in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5–12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli, v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva, določenega v tabeli, določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20–25 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji. Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili, vpišite na tukaj.
  • Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
  • Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate, poimenujete po naslednjem receptu:

  • 312_BIO_Priimek_Ime.docx za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
  • 312_BIO_Priimek_ime_final.docx za končno verzijo seminarja
  • 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.docx za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • 312_BIO_Priimek_Ime.pptx za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
  • 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje ... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.