BIO2 Seminar 2022

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

ime in priimek poglavje naslov seminarja recenzent 1 recenzent 2 datum oddaje datum recenzije datum predstavitve
Tinkara Korošec 12 Vpliv bakterijskega oponašanja evkariontskih signalih molekul na človeka Martin Kresal Lena Kogoj 24/10/20 25/10/20 26/10/20
Marcel Tušek 12 Pomembnost mitofagije, njena vloga ter korelacija z Atg32 receptorjem Laura Trček Naja Pečovnik Wutt 24/10/20 25/10/20 26/10/20
Pia Kristanc 12 Toksini kot inhibitorji ionskih kanalov Filip Petrovič Matija Novel 24/10/20 25/10/20 26/10/20
Samo Pucihar 12 Vpliv dopaminskega D1 receptorja na raka Patricija Kolander Sofija Stevanović 24/10/20 25/10/20 26/10/20
Luka Fink 12 Kako fosforilacija integrinov regulira celične stike in signalizacijo Tonja Jeromelj Martin Kresal 28/10/20 31/10/20 02/11/20
Tin Vranješ 12 Strukturni pogled signalizacije z G proteini povezanih receptorjev v zunanjem segmentu paličice Marcel Tušek Laura Trček 28/10/20 31/10/20 02/11/20
Lucija Kovaček 12 Nekroptoza in njena vloga pri raku Pia Kristanc Filip Petrovič 28/10/20 31/10/20 02/11/20
Mark Varlamov 12 GPCR-nadzorovana kemotaksa v amebah vrste D. discoideum Samo Pucihar Patricija Kolander 28/10/20 31/10/20 02/11/20
Klemen Justin 14-15 Luka Fink Tonja Jeromelj 04/11/20 07/11/20 09/11/20
Teja Mohar 14-15 Encimi za popravilo metabolitov Tin Vranješ Marcel Tušek 04/11/20 07/11/20 09/11/20
Tea Amidović 14-15 Karakterizacija glikoproteoma Lucija Kovaček Pia Kristanc 04/11/20 07/11/20 09/11/20
Taja Pojbič 14-15 Pentoza-fosfatna pot in rak Mark Varlamov Samo Pucihar 04/11/20 07/11/20 09/11/20
Deni Krašna 16 Krebsov cikel - zvezdišče viroimunometabolizma Klemen Justin Luka Fink 11/11/20 14/11/20 16/11/20
Zara Bunc 16 Krebsov cikel kot tarča za zdravljenje raka Teja Mohar Tin Vranješ 11/11/20 14/11/20 16/11/20
Urša Lah 16 Acetil CoA in kromatin Tea Amidović Lucija Kovaček 11/11/20 14/11/20 16/11/20
Žiga Koren 16 Vloga intermediatov krebsovega cikla pri zaščiti pred ishemijo Taja Pojbič Mark Varlamov 11/11/20 14/11/20 16/11/20
Tim-David Agrež 17 Trenutni dosežki raziskav lncRNA v lipidnem metabolizmu in signalizaciji Deni Krašna Klemen Justin 18/11/20 21/11/20 23/11/20
Aleš Poljanšek 17 Ketonska telesca in njihov vpliv na nevrodegenerativne bolezni Zara Bunc Teja Mohar 18/11/20 21/11/20 23/11/20
Tonja Jeromelj 17 Alteracije lipidnega metabolizma v rakavih matičnih celicah Urša Lah Tea Amidović 18/11/20 21/11/20 23/11/20
Miha Tomšič 17 Žiga Koren Taja Pojbič 18/11/20 21/11/20 23/11/20
Leila Bohorč 18 Katabolizem lizina pri rastlinah: vloga saharopinske poti pri odzivu na abiotski in biotski stres Tim-David Agrež Deni Krašna 25/11/20 28/11/20 30/11/20
Teo Trost 18 Oslabljen metabolizem razvejanih aminokislin Aleš Poljanšek Zara Bunc 25/11/20 28/11/20 30/11/20
Ivana Stojić 18 Motnje cikla sečnine v povezavi z zgodnjimi znaki raka Tinkara Korošec Urša Lah 25/11/20 28/11/20 30/11/20
Lara Rajterič 18 Vloga metabolizma razvejanih aminokislin pri zdravljenju raka Miha Tomšič Žiga Koren 25/11/20 28/11/20 30/11/20
Primož Šenica Pavletič 19 Mehanizmi mitohondrijske respiratorne prilagoditve Leila Bohorč Tim-David Agrež 02/12/20 05/12/20 07/12/20
Špela Auer 19 Kompleks II sukcinat dehidrogenaza Teo Trost Aleš Poljanšek 02/12/20 05/12/20 07/12/20
Gal Kastelic 19 Sestavljalne poti kompleksov oksidativne fosforilacije Ivana Stojić Tinkara Korošec 02/12/20 05/12/20 07/12/20
Tim-David Agrež 17 Trenutni dosežki raziskav lncRNA v lipidnem metabolizmu in signalizaciji Deni Krašna Klemen Justin 02/12/20 05/12/20 07/12/20
Taja Mužič 20 ROS in regulacija fotosinteze Primož Šenica Pavletič Leila Bohorč 09/12/20 12/12/20 14/12/20
Mia Kobal 20 Zgradba in delovanje Rubisca - najpogostejšega encima Špela Auer Teo Trost 09/12/20 12/12/20 14/12/20
Laura Simonič 20 Dinamično preoblikovanje kloroplastov ob spremembi svetlobe Gal Kastelic Ivana Stojić 09/12/20 12/12/20 14/12/20
Karin Rak 20 Manipulacija rastlin proti višjim izkoristkom fotosinteze preko fotorespiracije Miljan Trajković Lara Rajterič 09/12/20 12/12/20 14/12/20
Ula Mikoš 21 Vitamin E Taja Mužič Primož Šenica Pavletič 16/12/20 19/12/20 21/12/20
Lara Zupanc 21 Mia Kobal Špela Auer 16/12/20 19/12/20 21/12/20
Lena Kogoj 21 SPM lipidi Laura Simonič Gal Kastelic 16/12/20 19/12/20 21/12/20
Naja Pečovnik Wutt 22 Karin Rak Miljan Trajković 16/12/20 19/12/20 21/12/20
Matija Novel 22 Dopaminski transporter: regulacija in mehanizem interakcije z dopaminom Ula Mikoš Taja Mužič 30/12/20 02/01/21 04/01/21
Sofija Stevanović 22 Lara Zupanc Mia Kobal 30/12/20 02/01/21 04/01/21
Martin Kresal 23 Lena Kogoj Laura Simonič 30/12/20 02/01/21 04/01/21
Miljan Trajković 23 Naja Pečovnik Wutt Karin Rak 30/12/20 02/01/21 04/01/21
Filip Petrovič 23 Matija Novel Ula Mikoš 06/01/21 09/01/21 11/01/21
Patricija Kolander 23 Sofija Stevanović Lara Zupanc 06/01/21 09/01/21 11/01/21
  • številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim, da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo, in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom. Pvzetek je tudi del pisnega izdelka.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5–12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli, v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva, določenega v tabeli, določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 15-18 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji. Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili, vpišite na tukaj.
  • Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
  • Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate, poimenujete po naslednjem receptu:

  • 312_BIO_Priimek_Ime.docx za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
  • 312_BIO_Priimek_ime_final.docx za končno verzijo seminarja
  • 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.docx za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • 312_BIO_Priimek_Ime.pptx za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
  • 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje ... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.