EF-dlan (EF-hand)

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
The printable version is no longer supported and may have rendering errors. Please update your browser bookmarks and please use the default browser print function instead.

EF-dlan oziroma EF-hand je strukturna domena proteina, ki vsebuje motiv vijačnica-zanka-vijačnica, sestavljen ponavadi iz dveh alfa vijačnic (E-vijačnica in F-vijačnica) in kratke zanke (običajno okoli 12 aminokislin), ki veže kalcijeve ione. (slika dveh alfa vijačnic in zanke)

Ta motiv je v obliki razširjenega palca in kazalca človeške roke (slika EF-dlani), kjer so kalcijevi (2+) ioni koordinirani ligandi znotraj zanke. Zanka lahko sprejme kalcij ali magnezij z različnimi geometrijami: magnezij se običajno veže z šestimi ligandi v oktaeder, medtem ko pa sedem ligandov na ogljiščih peterokotne bipiramide koordinira kalcij.

Ime sta zasnovala Kretsinger in Nockolds, pred več kot petindvajsetimi leti, kot grafični opis vezave kalcija v proteinu parvalbumin. Vezava kalcija lahko povzroči potencialne premike (npr. raztegljivost polipeptidov), ki jih zaznamo v obliki razširjenega palca in kazalca. Funkcije proteinov ki vsebujejo EF-dlan motive so:

-kalcijevi pufri v citosolu

-prenos signalov med celičnimi predelki in mišičnim krčenjem

Družina proteinov z EF-dlan motivom ima vsaj še 66 poddružin. Ti proteini so razdeljeni v dve glavni skupini:

-kanonične EF-dlani

-Navidezne EF-dlani

Motiv EF dlani se pojavi naprimer v signalnem proteinu kalmodulinu in v mišičnem proteinu troponinu-C.

Viri in Literatura