Molekularna biologija

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Current revision (14:37, 1 August 2019) (view source)
(Ocenjevanje)
 
(9 intermediate revisions not shown.)
Line 1: Line 1:
-
Predmet 2. letnika študijskega programa Biokemija. Izvaja se v poletnem semestru. Ima 45 h predavanj, 20 h semnarjev in 10 h laboratorijskih vaj, skupaj 5 kreditnih točk ECTS.
+
Predmet 2. letnika študijskega programa Biokemija. Izvaja se v poletnem semestru. Ima 45 h predavanj, 20 h seminarjev in 10 h laboratorijskih vaj, skupaj 5 kreditnih točk ECTS.
-
Nosilec predmeta: izr. prof. dr. [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si Marko Dolinar]. Temi Dinamika proteinske strukture in Povezava struktura - funkcija predava doc. dr. Gregor Gunčar.
+
Nosilec predmeta: izr. prof. dr. [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si Marko Dolinar].
-
 
+
-
Izpitni roki letos: 12.6., 2.7., 19.8. in 4.9. 2014.
+
-
 
+
-
Ocene z zadnjega roka (8.9.):
+
-
30015113: 2 (vaje 2, teorija 15 %)
+
-
30015132: 2 (vaje 3, teorija 15 %)
+
-
30015354: 4 (vaje 9, teorija 39 %)
+
-
30016457: 4 (vaje 7, teorija 34 %)
+
-
30016474: 6 (vaje 1, teorija 53 %, seminar 9,2, poročila 9) 
+
-
30016477: 8 (vaje 5, teorija 68 %, seminar 9,2, poročila 9) 
+
-
30016479: 6 (vaje 7, teorija 50 %, seminar 5,3, poročila 8)
+
-
30016783: 4 (vaje 3, teorija 30 %)
+
-
30016938: 7 (vaje 6, teorija 57 %, seminar 6,9, poročila 9)
+
-
30016949: 7 (vaje 1, teorija 59 %, seminar 8,4, poročila 9) 
+
-
30016951: 5 (vaje 9, teorija 41 %) 
+
-
30016954: 10 (vaje 10, teorija 83 %, seminar 10, poročila 10) 
+
-
30017047: 4 (vaje 3, teorija 44 %)
+
-
30017070: 8 (vaje 8, teorija 73 %, seminar 9,2, poročila 9)
+
-
30017283: 6 (vaje 4, teorija 52 %, seminar 6,9, poročila 9)
+
-
Kdor ni bil prijavljen v VIS na rok 4.9., mu oceno vpišem direktno v VIS.
+
-
Dva študenta bi morala imeti izpit komisijski, zato se morata NUJNO prijaviti v VIS za 19.9.!
+
 +
Prvotno razpisani izpitni roki so bili: 12.6., 27.6. in 28.8.2019.
 +
Na željo študentov sem prvi razpisani rok premaknil v jesensko izpitno obdobje.
 +
Dokončni roki so: 27.6., 21.8., 9.9.2019.
=== Teme predavanj ===
=== Teme predavanj ===
# Mehanizem podvojevanja DNA
# Mehanizem podvojevanja DNA
-
# Rekombinacija in popravljanje mutacij
+
# Mutacije in popravljanje okvar na DNA
 +
# Homologna rekombinacija
# Transkripcija in posttranskripcijski procesi
# Transkripcija in posttranskripcijski procesi
# Genetski kod in tRNA
# Genetski kod in tRNA
Line 36: Line 19:
# Kontrola izražanja pri evkariontih
# Kontrola izražanja pri evkariontih
# Usmerjanje proteinov in posttranslacijske modifikacije
# Usmerjanje proteinov in posttranslacijske modifikacije
-
# Razgradnja proteinov
+
# Transpozicijski elementi
-
# *Dinamika proteinske strukture
+
-
# *Primeri povezave med strukturo in delovanjem proteina
+
# Virusi
# Virusi
-
# Čutila
+
 
-
'' * predava G. Gunčar''
+
=== Teme seminarjev ===
=== Teme seminarjev ===
Line 48: Line 28:
=== Teme laboratorijskih vaj ===
=== Teme laboratorijskih vaj ===
-
Navodila za vaje boste dobili pred začetkom vaj, to bo v mesecu marcu. Teme bodo:  
+
Navodila za vaje boste dobili pred začetkom vaj. Teme bodo:  
* Plazmidi in transformacija bakterijskih celic
* Plazmidi in transformacija bakterijskih celic
* Laktozni operon in alfa-komplementacija
* Laktozni operon in alfa-komplementacija
Line 54: Line 34:
=== Ocenjevanje ===
=== Ocenjevanje ===
-
Ocena je sestavljena iz 10 % za seminar (pol za pisni del na wikiju, pol za predstavitev), 20 % za vaje in 70 % za teorijo. Čeprav ti deleži na videz niso usklajeni z deleži kontaktnih ur, del ocene iz teorije vključuje znanje s seminarskih predstavitev in bodo vprašanja vključena v zaključni izpit. Pol ocene iz vaj bo predstavljalo sodelovanje pri vajah in poročila z vaj, druge pol pa odgovori na vprašanja z vaj, ki bodo dodana zaključnemu izpitu. Popravljanje ocene je možno samo s ponovnim pisanjem izpita (ki vključuje seminarske teme in vprašanja z vaj). Pogoj za opravljen izpit je, da iz teorije dosežete najmanj 50 % točk, da ste pripravili seminar, bili na vseh vajah in ste oddali poročila z vaj. Zgornje meje med ocenami bodo: (do vključno) 9 točk 1, 19 točk 2, 29 točk 3, 39 točk 4, 49 točk 5, 59 točk 6, 69 točk 7, 78 točk 8, 87 točk 9. Če se kdo prijavi na izpit, pa se potem ne odjavi, vpišem v VIS oceno 1, vas pa odjavim, če to odločitev sporočite do trenutka, ko dobite v roke izpitna vprašanja oziroma po e-pošti do razpisane ure izpita.
+
Ocena je sestavljena iz 10 % za seminar, 20 % za vaje in 70 % za teorijo. Čeprav ti deleži na videz niso usklajeni z deleži kontaktnih ur, del ocene iz teorije vključuje znanje s seminarskih predstavitev in bodo vprašanja vključena v zaključni izpit. Pol ocene iz vaj bo predstavljalo sodelovanje pri vajah in poročila z vaj, druge pol pa odgovori na vprašanja z vaj, ki bodo dodana zaključnemu izpitu. Popravljanje ocene je možno samo s ponovnim pisanjem celotnega izpita (ki vključuje seminarske teme in vprašanja z vaj). Pogoj za opravljen izpit je, da iz teorije dosežete najmanj 50 % točk, da ste pripravili seminar, bili na vseh vajah in ste oddali poročila z vaj. Zgornje meje med ocenami bodo: (do vključno) 49 točk 5, 59 točk 6, 69 točk 7, 78 točk 8, 87 točk 9. Če se kdo prijavi na izpit, pa se potem ne odjavi, vpišem v Studis NP (ni pristopil - rok vam pri tem zapade), vas pa odjavim, če to odločitev sporočite do trenutka, ko dobite v roke izpitna vprašanja oziroma po e-pošti do razpisane ure izpita.
'''Primeri sestavljanja ocene''':
'''Primeri sestavljanja ocene''':
Line 68: Line 48:
=== Literatura ===
=== Literatura ===
-
Voet & Voet: Biochemistry, 3. izdaja. Wiley, 2004. - Tema tega predmeta je 5. del knjige, poglavja 29-34. Temi, ki ju bo predstavil doc. Gunčar, sta opisani v poglavjih 8 in 9 iste knjige. Tema Čutila (obselali jo bomo, če bo to omogočal razpored predavanj) bo povzeta po učbeniku Berg, Tymoczko & Stryer: Biochemistry, 5. izdaja (Freeman, 2001).
+
Predavanja bodo potekala po učbeniku B.E. Tropp: Principles of Molecular Biology, 1. izdaja. Burlington: Jones & Bartlett Learning, 2014.
-
Učite se lahko tudi po novejših verzijah istih dveh učbenikov.
+
-
Lani so bile poskusno nekatere teme povzete po alternativnem učbeniku: Krebs, Goldstein & Kilpatrick: Lewin's Essential Genes, 3. izdaja. Jones & Bartlet, 2013. Tudi letos bom obdržal to prakso.
+
Pomožni učbenik: Krebs, Goldstein & Kilpatrick: Lewin's Essential Genes, 3. izdaja. Burlington: Jones & Bartlett Learning, 2013.

Current revision

Predmet 2. letnika študijskega programa Biokemija. Izvaja se v poletnem semestru. Ima 45 h predavanj, 20 h seminarjev in 10 h laboratorijskih vaj, skupaj 5 kreditnih točk ECTS.

Nosilec predmeta: izr. prof. dr. Marko Dolinar.

Prvotno razpisani izpitni roki so bili: 12.6., 27.6. in 28.8.2019.
Na željo študentov sem prvi razpisani rok premaknil v jesensko izpitno obdobje.
Dokončni roki so: 27.6., 21.8., 9.9.2019.


Contents

Teme predavanj

  1. Mehanizem podvojevanja DNA
  2. Mutacije in popravljanje okvar na DNA
  3. Homologna rekombinacija
  4. Transkripcija in posttranskripcijski procesi
  5. Genetski kod in tRNA
  6. Ribosomi in translacija
  7. Struktura kromosomov in organizacija genoma
  8. Kontrola izražanja pri prokariontih
  9. Kontrola izražanja pri evkariontih
  10. Usmerjanje proteinov in posttranslacijske modifikacije
  11. Transpozicijski elementi
  12. Virusi


Teme seminarjev

Seminarji bodo vključeni v termine predavanj, obdelali pa bomo poglavja, ki se navezujejo na snov predavanj oziroma jo dodatno ilustrirajo. Predvidoma trije tedni bodo namenjeni seminarjem, ki bodo z istega področja - temo določim vsako leto konec februarja. Isto temo bomo razdelali z več vidikov, delo pa bo potekalo v manjših skupinah. Skupine bodo predstavile svoja poglavja na spletu in s kratkim (ustrezno slikovno podprtim) nastopom v predavalnici.

Teme laboratorijskih vaj

Navodila za vaje boste dobili pred začetkom vaj. Teme bodo:

  • Plazmidi in transformacija bakterijskih celic
  • Laktozni operon in alfa-komplementacija
  • Utišanje genov

Ocenjevanje

Ocena je sestavljena iz 10 % za seminar, 20 % za vaje in 70 % za teorijo. Čeprav ti deleži na videz niso usklajeni z deleži kontaktnih ur, del ocene iz teorije vključuje znanje s seminarskih predstavitev in bodo vprašanja vključena v zaključni izpit. Pol ocene iz vaj bo predstavljalo sodelovanje pri vajah in poročila z vaj, druge pol pa odgovori na vprašanja z vaj, ki bodo dodana zaključnemu izpitu. Popravljanje ocene je možno samo s ponovnim pisanjem celotnega izpita (ki vključuje seminarske teme in vprašanja z vaj). Pogoj za opravljen izpit je, da iz teorije dosežete najmanj 50 % točk, da ste pripravili seminar, bili na vseh vajah in ste oddali poročila z vaj. Zgornje meje med ocenami bodo: (do vključno) 49 točk 5, 59 točk 6, 69 točk 7, 78 točk 8, 87 točk 9. Če se kdo prijavi na izpit, pa se potem ne odjavi, vpišem v Studis NP (ni pristopil - rok vam pri tem zapade), vas pa odjavim, če to odločitev sporočite do trenutka, ko dobite v roke izpitna vprašanja oziroma po e-pošti do razpisane ure izpita.

Primeri sestavljanja ocene:

Prvi primer: Seminar 8 (pisno 4 od 5 možnih, predstavitev 4 od 5 možnih), poročila z vaj 9 (od 10), vprašanja z vaj 7 (od 10), teorija vključno s seminarskimi temami 57 %. Ocena se sestavi takole: 8 + 9 + 7 + 57*0,7 = 63,9 točk od 100 možnih, kar pomeni končno oceno 7.

Drugi primer (zelo dober študent): Seminar 9, poročila 10, vprašanja z vaj 9, teorija 89 %: seštevek točk je 9 + 10 + 9 + 89*0,7 = 90,3, ocena 10.

Tretji primer (manj uspešen študent): Seminar 6, poročila 7, vaje 4, teorija 50 %: seštevek točk je 6 + 7 + 4 + 50*0,7 = 52, ocena 6.

Literatura

Predavanja bodo potekala po učbeniku B.E. Tropp: Principles of Molecular Biology, 1. izdaja. Burlington: Jones & Bartlett Learning, 2014.

Pomožni učbenik: Krebs, Goldstein & Kilpatrick: Lewin's Essential Genes, 3. izdaja. Burlington: Jones & Bartlett Learning, 2013.

Personal tools