Nova tehnika določevanja lokacije sladkorjev vezanih na proteine, utira pot odkritjem v medicini

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Line 1: Line 1:
Glikoproteini so proteini, na katere so kovalentno vezane sladkorne komponente. Kam na protein se le-te vežejo pa ima  pomembno vlogo pri spoznavanju bolezni (katere funkcije opravljajo proteini tekom razvoja ali v različnih bolezenskih stanjih) in v razvoju novih [http://en.wikipedia.org/wiki/Biomarker biomarkerjev] ter zdravil.  
Glikoproteini so proteini, na katere so kovalentno vezane sladkorne komponente. Kam na protein se le-te vežejo pa ima  pomembno vlogo pri spoznavanju bolezni (katere funkcije opravljajo proteini tekom razvoja ali v različnih bolezenskih stanjih) in v razvoju novih [http://en.wikipedia.org/wiki/Biomarker biomarkerjev] ter zdravil.  
-
Do nedavno so morali raziskovalci za določitev, kje na proteinu je glikozilacijsko mesto [http://www.uic.edu/classes/bios/bios100/lectf03am/glycoprotein.jpg slika1], poleg [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_mass_spectrometry masne spektrometrije], uporabiti več metod. Po zaslugi nove tehnike priprave [http://en.wikibooks.org/wiki/Proteomics/Protein_Sample_Preparation proteinskega vzorca], za izboljšanje metode masne spektrometrije, ki je bila objavljena v reviji [http://www.nature.com/nmeth/journal/v6/n11/abs/nmeth.1392.html Nature Methods], pa je to mogoče v enem koraku.
+
 
 +
Sladkorne komponente so na protein lahko N-vezane (glikozidna vez se vzpostavi med sladkorno verigo in NH2- skupino asparagina) ali O-vezane (glikozidna vez se vzpostavi med sladkorno verigo in OH- skupino serina ali treonina) [http://www.uic.edu/classes/bios/bios100/lectf03am/glycoprotein.jpg slika1].
 +
Do nedavno so morali raziskovalci za določitev, kje na proteinu je glikozilacijsko mesto , poleg [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_mass_spectrometry masne spektrometrije], uporabiti več metod. Po zaslugi nove tehnike priprave [http://en.wikibooks.org/wiki/Proteomics/Protein_Sample_Preparation proteinskega vzorca], za izboljšanje metode masne spektrometrije, ki je bila objavljena v reviji [http://www.nature.com/nmeth/journal/v6/n11/abs/nmeth.1392.html Nature Methods], pa je to mogoče v enem koraku.
Nova tehnika priprave vzorca, narekuje selektivno oksidacijo glikoproteinov, ki imajo na prostem koncu sladkorne verige [http://en.wikipedia.org/wiki/Sialic_acid sialično kislino], njihovo vezavo na hidrazidne kroglice, razgradnjo s [http://wiki.answers.com/Q/What_is_tripsin_and_activity tripsinom] ter odcep od kroglic s pomočjo kislinske hidrolize [http://en.wikipedia.org/wiki/Glycosidic_bond glikozidne vezi] med sialično kislino in sladkorjem v sladkorni verigi [http://images.google.si/imgres?imgurl=http://www.nature.com/nature/journal/v446/n7139/images/nature05816-f1.2.jpg&imgrefurl=http://www.nature.com/nature/journal/v446/n7139/fig_tab/nature05816_F1.html&usg=__XdkZL-uaIOlDcViFKppxxw7C0vk=&h=436&w=600&sz=61&hl=sl&start=11&um=1&itbs=1&tbnid=EsTCJxnc7ZwloM:&tbnh=98&tbnw=135&prev=/images%3Fq%3Dsialic%2Bacid%2Bglycoproteins%26hl%3Dsl%26client%3Dfirefox-a%26rls%3Dorg.mozilla:sl:official%26sa%3DN%26um%3D1 slika2]. Znanstveniki so tako analizirali proteine [http://sl.wikipedia.org/wiki/Likvor cerebrospinalnega likvorja], pri čemer so odkrili 36 N-vezavnih in 44 O-vezavnih glikozilacijskih mest.  
Nova tehnika priprave vzorca, narekuje selektivno oksidacijo glikoproteinov, ki imajo na prostem koncu sladkorne verige [http://en.wikipedia.org/wiki/Sialic_acid sialično kislino], njihovo vezavo na hidrazidne kroglice, razgradnjo s [http://wiki.answers.com/Q/What_is_tripsin_and_activity tripsinom] ter odcep od kroglic s pomočjo kislinske hidrolize [http://en.wikipedia.org/wiki/Glycosidic_bond glikozidne vezi] med sialično kislino in sladkorjem v sladkorni verigi [http://images.google.si/imgres?imgurl=http://www.nature.com/nature/journal/v446/n7139/images/nature05816-f1.2.jpg&imgrefurl=http://www.nature.com/nature/journal/v446/n7139/fig_tab/nature05816_F1.html&usg=__XdkZL-uaIOlDcViFKppxxw7C0vk=&h=436&w=600&sz=61&hl=sl&start=11&um=1&itbs=1&tbnid=EsTCJxnc7ZwloM:&tbnh=98&tbnw=135&prev=/images%3Fq%3Dsialic%2Bacid%2Bglycoproteins%26hl%3Dsl%26client%3Dfirefox-a%26rls%3Dorg.mozilla:sl:official%26sa%3DN%26um%3D1 slika2]. Znanstveniki so tako analizirali proteine [http://sl.wikipedia.org/wiki/Likvor cerebrospinalnega likvorja], pri čemer so odkrili 36 N-vezavnih in 44 O-vezavnih glikozilacijskih mest.  

Revision as of 00:29, 8 December 2009

Glikoproteini so proteini, na katere so kovalentno vezane sladkorne komponente. Kam na protein se le-te vežejo pa ima pomembno vlogo pri spoznavanju bolezni (katere funkcije opravljajo proteini tekom razvoja ali v različnih bolezenskih stanjih) in v razvoju novih biomarkerjev ter zdravil.


Sladkorne komponente so na protein lahko N-vezane (glikozidna vez se vzpostavi med sladkorno verigo in NH2- skupino asparagina) ali O-vezane (glikozidna vez se vzpostavi med sladkorno verigo in OH- skupino serina ali treonina) slika1. Do nedavno so morali raziskovalci za določitev, kje na proteinu je glikozilacijsko mesto , poleg masne spektrometrije, uporabiti več metod. Po zaslugi nove tehnike priprave proteinskega vzorca, za izboljšanje metode masne spektrometrije, ki je bila objavljena v reviji Nature Methods, pa je to mogoče v enem koraku.

Nova tehnika priprave vzorca, narekuje selektivno oksidacijo glikoproteinov, ki imajo na prostem koncu sladkorne verige sialično kislino, njihovo vezavo na hidrazidne kroglice, razgradnjo s tripsinom ter odcep od kroglic s pomočjo kislinske hidrolize glikozidne vezi med sialično kislino in sladkorjem v sladkorni verigi slika2. Znanstveniki so tako analizirali proteine cerebrospinalnega likvorja, pri čemer so odkrili 36 N-vezavnih in 44 O-vezavnih glikozilacijskih mest.


Novica: povezava1

Del članka: povezava2

Personal tools