Nukleaza S1

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
Current revision (20:14, 3 January 2013) (view source)
 
(7 intermediate revisions not shown.)
Line 1: Line 1:
-
[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
+
[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].
 +
 
 +
Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.
-
== Funkcije nukleaze S1 <sup>[[nukleaza S1#Viri|[1]]]</sup> ==
+
== Funkcije nukleaze S1 ==
-
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA<br />
+
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA <sup>[[nukleaza S1#Viri|[1]]]</sup><br />
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA<br />
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA<br />
-
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena<br />
+
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena)<br />
- Linearizira dodatno zvite plazmide<br />
- Linearizira dodatno zvite plazmide<br />
- Specifično cepi antikodone tRNA<br />
- Specifično cepi antikodone tRNA<br />
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze<br />
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze<br />
-
Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn<sup>2+</sup> ionov <sup>[[nukleaza S1#Viri|[2]]]</sup> (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca<sup>2+</sup> ioni).<br />
+
Optimalni pH njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn<sup>2+</sup> ionov <sup>[[nukleaza S1#Viri|[2]]]</sup> (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca<sup>2+</sup> ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co<sup>2+</sup> ioni).<br />
-
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).<br />
+
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost, so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[natrijev dodecil sulfat|NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).<br />
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''.<br />
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''.<br />
[[EC številka]]: 3.1.30.1
[[EC številka]]: 3.1.30.1
Line 25: Line 27:
== Zunanje povezave ==
== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
-
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1
+
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
-
from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma-Aldrich, Inc.]
+
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]
-
 
+
-
KATALOGI RAZNIH PODJETIJ:<br />
+
-
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf<br />
+
-
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf<br />
+
-
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/<br />
+
-
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html<br />
+
-
 
+
-
BAZE:<br />
+
-
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021<br />
+
-
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022<br />
+
-
SPLET:<br />
+
[[Category:LEX]]
-
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/<br />
+

Current revision

Encim nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med nukleinskimi kislinami (skica cepitve).

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji. Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je monomer, torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim Asn na mestih 92 in 228.

Contents

Funkcije nukleaze S1

- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [1]
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena)
- Linearizira dodatno zvite plazmide
- Specifično cepi antikodone tRNA
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze

Optimalni pH njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [2] (nukleazo S1 izolirano iz Neurospore crassa aktivirajo tudi Ca2+ ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co2+ ioni).
Inhibitorji, ki zavirajo njeno aktivnost, so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije NaDS (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni Aspergillus Oryzae.
EC številka: 3.1.30.1

Alternativni imeni

- Deoksiribonukleaza S1
- Endonukleaza S1

Viri

Zunanje povezave

Personal tools