Oblikovanje sintetičnega faga iz P. aeruginosa z reduciranim genomom

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search

Povzeto po članku: D.P. Pires, R. Monteiro, D. Mil-Homens et al: Designing P. aeruginosa synthetic phages with reduced genomes. Sci. Rep. 2021, 11(1), 2164. https://doi.org/10.1038/s41598-021-81580-2

Uvod

Odpornost bakterij na antibiotike postaja vedno večji problem, zato se v zadnjem času kot potencialna terapevtska učinkovina preučujejo tudi bakteriofagi. Kljub temu da je fagna terapija obetaven način zdravljenja, se sooča s številnimi izzivi, kot so varnost, stabilnost in način dostave učinkovine, sposobnost bakteriofagov, da lahko okužijo omejeno število gostiteljskih bakterij, odpornost na bakteriofage ter stranski učinki zaradi lize bakterijskih celic. Ena izmed potencialnih rešitev nekaterih izmed teh omejitev je oblikovanje genetsko spremenjenih bakteriofagov s povečano protibakterijsko učinkovitostjo. V ta namen moramo v fagni genom vstaviti dodatne gene, kar pa zaradi omejitve dolžine DNA, ki se lahko zapakira v virusno kapsido, predstavlja velik problem. Zato bi lahko iz virusnega genoma odstranili gene, ki zapisujejo proteine z neznano funkcijo, gene, ki omogočajo odpornost proti antibiotikom, kot tudi zapise za toksine in druge virulenčne faktorje. Hkrati bi torej zmanjšali verjetnost, da bi bili v genomu prisotni potencialno nevarni geni. Cilj raziskave je bil oblikovati sintetični fag z reduciranim genomom, ki ohrani sposobnost okužbe, razmnoževanja in lize gostiteljske celice [1].

Pseudomonas aeruginosa je patogena bakterija, ki ima izjemno sposobnost razvoja odpornosti na antibiotike. Okužba se pojavi predvsem pri hospitaliziranih pacientih in je lahko smrtno nevarna za ljudi s cistično fibrozo in imunsko pomanjkljivostjo. Problematično je predvsem zdravljenje okužb z bolnišničnimi sevi, zato predstavlja fagna terapija potencialno rešitev [2], [3].

Izolacija bakteriofaga PE3 in njegova karakterizacija

Priprava rekombinantnih bakteriofagov

Karakterizacija rekombinantnih bakteriofagov

Zaključek