RNaza H: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
(New page: RNaza H ---- RNaza H je encim, ki ga najdemo skoraj v vseh organizmih, tako pri arhejah in prokariontih kot pri evkariontih. Je standardni encim v tehnologiji rDNA. RNaza H je bila ...)
 
No edit summary
 
Line 3: Line 3:
----
----


RNaza H je encim, ki ga najdemo skoraj v vseh organizmih, tako pri arhejah in prokariontih kot pri evkariontih. Je standardni [[encim]] v tehnologiji rDNA.
Ribonukleaza H (RNaza H) je endonukleaza, torej  encim, ki katalizira hidrolizo notranjih fosfoestrskih vezi v RNA. <sup>[[RNazaH#Viri|[1]]]</sup>. Najdemo jo lahko v evkariontskih in prokariontskih organizmih. RNaza H prepozna dupleks DNA-RNA in cepi RNA na naključnih mestih. Uporabljamo jo za odstranjevanje mRNA pri sintezi cDNA. Je standardni encim v tehnologiji rDNA.


RNaza H je bila prvič identificirana v telečjem timusu. Najbolje raziskan član družine Rnaze H pa je RNaza HI, ki jo najdemo v E.coli.
RNaza H je bila prvič identificirana v telečjem timusu. Najbolje raziskan član družine Rnaze H pa je RNaza HI, ki jo najdemo v E.coli.


RNaza H katalizira razcep RNA. Spada med hidrolaze (E.C.: 3.1.26.4),<ref>http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/</ref> torej katalizira razcep vezi s hidrolizo. RNaza H prepozna dupleks DNA-RNA in cepi RNA na naključnih mestih. Aktivna je pri reverznih transkriptazah, kar pomeni da katalizira sintezo cDNA na osnovi matrice mRNA. Pogost kofaktor, ki je pri uporabljen pri hidrolizi je magnezijev ion.<ref>http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H</ref>   
3-D struktura RNaze H je običajno sestavljena iz β-strukture, ki jo obdajajo α-vijačnice. Lahko pa, tako kot pri RNazi H, najdeni v virusu HIV-1, manjka ena od α-vijačnic, C-vijačnica, ki poveča sposobnost vezave. <sup>[[RNazaH#Viri|[2]]]</sup>. Njena molekulska masa je 18,5 kDa.<ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>   


Sestavljena je iz petih β-verig, ki so obdane z α-vijačnicami. Njena molekulska masa je 18,5 kDa.<ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>
RNaza H ima pomembno vlogo pri dozorevanju virusa HIV in je ena glavnih tarč farmacevtskih raziskav pri iskanju zdravila proti AIDSu. Pri procesu sinteze DNA v virusu je RNaza H del encima reverzna transkriptaza in degradira RNA v DNA-RNA hibridu. S tem osvobodi enoverižno DNA, komplementarno R sekvenci na 3' koncu mRNA retrotranspozona. Osvobojeni del verige DNA se premesti na 3' konec mRNA retrotranspozona, pri čemer se sinteza komplementarne verige DNA nadaljuje. <sup>[[RNazaH#Viri|[3]]]</sup>.


RNaza H je kot del reverzne transkriptaze nujno potrebna za širjenje retrovirusov kot sta npr. HIV in virus mišje levkemije.  Zaviralci tega encima bi torej lahko zagotovili zdravila proti boleznim kot je aids, zato je raziskovanje RNaze H zelo pomembno v farmaciji in medicini.<ref>http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H</ref>


VIRI
== Viri ==
 
* <sup>[1]</sup> [http://books.google.si/books/about/Temelji_biokemije.html?id=c8CpAAAACAAJ&redir_esc=y R. Boyer: Temelji biokemije, stran 261-263]
----
* <sup>[2]</sup> [http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H RNase H, Wikipedia]
* <sup>[2]</sup> [http://bib.irb.hr/datoteka/97768.Diplomski.pdf L. Ester: Aktivnost retrotranspozona Tpv2 u stanicama uročnjaka Arabidopsis thaliana L., stran 6]
<ref>http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/</ref>
<ref>http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/</ref>
<ref>http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H</ref>  
<ref>http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H</ref>  
<ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>  
<ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>  
== Zunanje povezave ==
*[http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H RNase H, Wikipedia]
    
    
<ref>[[Category:LEX]]</ref>
[[Category:LEX]]

Latest revision as of 23:14, 23 January 2014

RNaza H

Ribonukleaza H (RNaza H) je endonukleaza, torej encim, ki katalizira hidrolizo notranjih fosfoestrskih vezi v RNA. [1]. Najdemo jo lahko v evkariontskih in prokariontskih organizmih. RNaza H prepozna dupleks DNA-RNA in cepi RNA na naključnih mestih. Uporabljamo jo za odstranjevanje mRNA pri sintezi cDNA. Je standardni encim v tehnologiji rDNA.

RNaza H je bila prvič identificirana v telečjem timusu. Najbolje raziskan član družine Rnaze H pa je RNaza HI, ki jo najdemo v E.coli.

3-D struktura RNaze H je običajno sestavljena iz β-strukture, ki jo obdajajo α-vijačnice. Lahko pa, tako kot pri RNazi H, najdeni v virusu HIV-1, manjka ena od α-vijačnic, C-vijačnica, ki poveča sposobnost vezave. [2]. Njena molekulska masa je 18,5 kDa.<ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>

RNaza H ima pomembno vlogo pri dozorevanju virusa HIV in je ena glavnih tarč farmacevtskih raziskav pri iskanju zdravila proti AIDSu. Pri procesu sinteze DNA v virusu je RNaza H del encima reverzna transkriptaza in degradira RNA v DNA-RNA hibridu. S tem osvobodi enoverižno DNA, komplementarno R sekvenci na 3' koncu mRNA retrotranspozona. Osvobojeni del verige DNA se premesti na 3' konec mRNA retrotranspozona, pri čemer se sinteza komplementarne verige DNA nadaljuje. [3].


Viri

<ref>http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/</ref> <ref>http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H</ref> <ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>

Zunanje povezave

Retrieved from "https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=RNaza_H&oldid=8858"