Raznoliko in modelno zasnovana priprava sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi: Difference between revisions
(New page: == Uvod == Ideja sintezne biologije je aplikacija inženirskih principov na bioloških sistemih.<ref>[https://doi.org/10.1038/msb4100073 Andrianantoandro, E., Basu, S., Karig, D.K. & Weiss...) |
No edit summary |
||
| Line 1: | Line 1: | ||
== Stran je še v izdelavi ... == | |||
== Uvod == | == Uvod == | ||
Ideja sintezne biologije je aplikacija inženirskih principov na bioloških sistemih.<ref>[https://doi.org/10.1038/msb4100073 Andrianantoandro, E., Basu, S., Karig, D.K. & Weiss, R. Synthetic biology: new engineering rules for an emerging discipline. ''Mol. Syst. Biol.'' '''2''', 2006–0028 (2006).]</ref> Želja pa, da s podatkovnimi bazami dobro okarakteriziranih standardnih delov in naprav omogoči sintezo sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi. <ref>[https://doi.org/10.1126/science.1067407 Guet, C.C., Elowitz, M.B., Hsing, W. & Leibler, S. Combinatorial synthesis of genetic networks. ''Science'' '''296''', 1466–1470 (2002).]</ref> Kljub velikemu zanimanju za področje in vse večje baze "okarakteriziranih standardnih delov", so takšne sinteze precej težavne in zamudne.<ref>[https://dx.doi.org/10.1098%2Frsif.2006.0206 Marguet, P., Balagadde, F., Tan, C. & You, L. Biology by design: reduction and synthesis of cellular components and behaviour. ''J. R. Soc. Interface'' '''4''', 607–623 (2007).]</ref> Predvsem zaradi slabe karakterizacije delov (npr. veliko promotorjev je opisanih le z močen ali švoh). | Ideja sintezne biologije je aplikacija inženirskih principov na bioloških sistemih.<ref>[https://doi.org/10.1038/msb4100073 Andrianantoandro, E., Basu, S., Karig, D.K. & Weiss, R. Synthetic biology: new engineering rules for an emerging discipline. ''Mol. Syst. Biol.'' '''2''', 2006–0028 (2006).]</ref> Želja pa, da s podatkovnimi bazami dobro okarakteriziranih standardnih delov in naprav omogoči sintezo sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi. <ref>[https://doi.org/10.1126/science.1067407 Guet, C.C., Elowitz, M.B., Hsing, W. & Leibler, S. Combinatorial synthesis of genetic networks. ''Science'' '''296''', 1466–1470 (2002).]</ref> Kljub velikemu zanimanju za področje in vse večje baze "okarakteriziranih standardnih delov", so takšne sinteze precej težavne in zamudne.<ref>[https://dx.doi.org/10.1098%2Frsif.2006.0206 Marguet, P., Balagadde, F., Tan, C. & You, L. Biology by design: reduction and synthesis of cellular components and behaviour. ''J. R. Soc. Interface'' '''4''', 607–623 (2007).]</ref> Predvsem zaradi slabe karakterizacije delov (npr. veliko promotorjev je opisanih le z močen ali švoh). | ||
Dodaten problem zaradi pomanjkanja standardnih delov, je nezmožnost spremembe dinamičnega območja nekega dela, da bi delal z drugimi komponentami, ne da bi za to bilo potrebno ponovno načrtovanje celotnega sistema. Na primer; promotor Lac je po testiranju prešibek, tako ga je potrebno zamenjati. Zaradi pomanjkanja negativno regulatornih promotorjev, bomo tega zamenjali najverjetneje s promotorjem Tet. '''Shema 1a''' prikazuje, kako je zaradi takšnega posega potrebno ponovno načrtovanje celotnega sistema. '''Shema 1b''' pa kako se bi temu lahko izognili, če bi imeli promotorje Lac z različno transkripcijsko aktivnostjo.<ref>[https://dx.doi.org/10.1038%2Fnbt0509-450 Bennett, M.R. & Hasty J. Overpowering the component problem ''Nat. biotechnol.'' '''27''', 450-451 (2009).]</ref> | |||
== Viri == | |||
<references/> | |||
Revision as of 18:15, 28 November 2018
Stran je še v izdelavi ...
Uvod
Ideja sintezne biologije je aplikacija inženirskih principov na bioloških sistemih.<ref>Andrianantoandro, E., Basu, S., Karig, D.K. & Weiss, R. Synthetic biology: new engineering rules for an emerging discipline. Mol. Syst. Biol. 2, 2006–0028 (2006).</ref> Želja pa, da s podatkovnimi bazami dobro okarakteriziranih standardnih delov in naprav omogoči sintezo sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi. <ref>Guet, C.C., Elowitz, M.B., Hsing, W. & Leibler, S. Combinatorial synthesis of genetic networks. Science 296, 1466–1470 (2002).</ref> Kljub velikemu zanimanju za področje in vse večje baze "okarakteriziranih standardnih delov", so takšne sinteze precej težavne in zamudne.<ref>Marguet, P., Balagadde, F., Tan, C. & You, L. Biology by design: reduction and synthesis of cellular components and behaviour. J. R. Soc. Interface 4, 607–623 (2007).</ref> Predvsem zaradi slabe karakterizacije delov (npr. veliko promotorjev je opisanih le z močen ali švoh).
Dodaten problem zaradi pomanjkanja standardnih delov, je nezmožnost spremembe dinamičnega območja nekega dela, da bi delal z drugimi komponentami, ne da bi za to bilo potrebno ponovno načrtovanje celotnega sistema. Na primer; promotor Lac je po testiranju prešibek, tako ga je potrebno zamenjati. Zaradi pomanjkanja negativno regulatornih promotorjev, bomo tega zamenjali najverjetneje s promotorjem Tet. Shema 1a prikazuje, kako je zaradi takšnega posega potrebno ponovno načrtovanje celotnega sistema. Shema 1b pa kako se bi temu lahko izognili, če bi imeli promotorje Lac z različno transkripcijsko aktivnostjo.<ref>Bennett, M.R. & Hasty J. Overpowering the component problem Nat. biotechnol. 27, 450-451 (2009).</ref>
Viri
<references/>
