Retrotranspozoni: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
Line 1: Line 1:
'''Retrotranzpozoni'''  so  mobilni genetski elementi, ki se lahko sami razširjajo v [[genom|genomu]] in so  vseprisotni  sestavni del  [[DNA]] mnogih evkariontskih organizmov.
'''Retrotranspozoni'''  so  mobilni genetski elementi, ki se lahko sami razširjajo v [[genom|genomu]] in so  vseprisotni  sestavni del  [[DNA]] mnogih evkariontskih organizmov.


So podrazred [[transpozoni|transpozonov]]. Ti so še posebej v veliki meri v rastlinah , kjer so pogosto glavni element jedrne dna. Igrajo pomembno vlogo v  genih rastlin in v razvoju [[genom|genoma]]. V koruzi 49-78% [[genom|genoma]] sestavljajo retrotranspozoni. V sesalcih skoraj polovica [[genom|genoma]] (45-48%) vključuje transpozone ali ostanke transpozonov. Človeški  [[genom]] je  sestavljen iz približno  42%  retrotranspozonov od tega  jih je v [[DNA]] 2-3%.
So podrazred [[transpozoni|transpozonov]]. Ti so še posebej v veliki meri v rastlinah, kjer so pogosto glavni element jedrne dna. Igrajo pomembno vlogo v  genih rastlin in v razvoju [[genom|genoma]]. V koruzi 49-78% [[genom|genoma]] sestavljajo retrotranspozoni. V sesalcih skoraj polovica [[genom|genoma]] (45-48%) vključuje transpozone ali ostanke transpozonov. Človeški  [[genom]] je  sestavljen iz približno  42%  retrotranspozonov od tega  jih je v [[DNA]] 2-3%.
Retrotranspozoni lahko povečajo velikost genoma , tako da s pomočjo prenosa [[RNA]] povečuje število kopij elementov.  Lahko tudi povzročijo [[mutacije]], ki jih vstavijo v bližino ali znotraj gena.
Retrotranspozoni lahko povečajo velikost genoma, tako da s pomočjo prenosa [[RNA]] povečuje število kopij elementov.  Lahko tudi povzročijo [[mutacije]], ki jih vstavijo v bližino ali znotraj gena.


==Tipi retrotranspozonov==
==Tipi retrotranspozonov==
Line 8: Line 8:
Retrotranspozone delimo na dva dela:
Retrotranspozone delimo na dva dela:
*'''Virusna skupina''': vsebuje bralni okvir za reverzno transkriptazo/integrazo in  ima na terminih direktne ponovitve.
*'''Virusna skupina''': vsebuje bralni okvir za reverzno transkriptazo/integrazo in  ima na terminih direktne ponovitve.
Te delimo na  
Te delimo na :
:'''LTR-long terminal repeat''' (npr. Insert non-formatted text here Ty pri kvasovkah in copia pri D.melanogaster
:'''LTR-long terminal repeat''' (npr. Insert non-formatted text here Ty pri kvasovkah in copia pri D.melanogaster)
:'''non-LTR''' (npr. LINE-long interspersed element, SINE-short interspersed element)
:'''non-LTR''' (npr. LINE-long interspersed element, SINE-short interspersed element)



Revision as of 16:43, 3 January 2012

Retrotranspozoni so mobilni genetski elementi, ki se lahko sami razširjajo v genomu in so vseprisotni sestavni del DNA mnogih evkariontskih organizmov.

So podrazred transpozonov. Ti so še posebej v veliki meri v rastlinah, kjer so pogosto glavni element jedrne dna. Igrajo pomembno vlogo v genih rastlin in v razvoju genoma. V koruzi 49-78% genoma sestavljajo retrotranspozoni. V sesalcih skoraj polovica genoma (45-48%) vključuje transpozone ali ostanke transpozonov. Človeški genom je sestavljen iz približno 42% retrotranspozonov od tega jih je v DNA 2-3%. Retrotranspozoni lahko povečajo velikost genoma, tako da s pomočjo prenosa RNA povečuje število kopij elementov. Lahko tudi povzročijo mutacije, ki jih vstavijo v bližino ali znotraj gena.

Tipi retrotranspozonov

Retrotranspozone delimo na dva dela:

  • Virusna skupina: vsebuje bralni okvir za reverzno transkriptazo/integrazo in ima na terminih direktne ponovitve.

Te delimo na :

LTR-long terminal repeat (npr. Insert non-formatted text here Ty pri kvasovkah in copia pri D.melanogaster)
non-LTR (npr. LINE-long interspersed element, SINE-short interspersed element)

Virusna skupina se od retrovirusov razlikuje v tem, da ne pride do litične faze v celicah. Virusna skupina je retrovirusom podobna v mehanizmu, ki ga uporablja pri transpoziciji.

  • Nevirusna skupina je nastala iz virusne. V genomu je take retrotranspozone mogoče prepoznati po terminih, vmesni del ne kodira ničesar. Ta tip retrotranspozonov je verjetno nastal iz celičnih transkriptov preko neznanega encima.

Viri

Zunanje povezave