Retrotranzpozoni: Difference between revisions
From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
No edit summary |
No edit summary |
||
| Line 2: | Line 2: | ||
So podrazred [[transpozoni|transpozonov]]. Ti so še posebej v veliki meri v rastlinah , kjer so pogosto glavni element jedrne dna. Igrajo pomembno vlogo v genih rastlin in v razvoju [[genom|genoma]]. V koruzi 49-78% [[genom|genoma]] sestavljajo retrotranspozoni. V sesalcih skoraj polovica [[genom|genoma]] (45-48%) vključuje transpozone ali ostanke transpozonov. Človeški [[genom]] je sestavljen iz približno 42% retrotranspozonov od tega jih je v [[DNA]] 2-3%. | So podrazred [[transpozoni|transpozonov]]. Ti so še posebej v veliki meri v rastlinah , kjer so pogosto glavni element jedrne dna. Igrajo pomembno vlogo v genih rastlin in v razvoju [[genom|genoma]]. V koruzi 49-78% [[genom|genoma]] sestavljajo retrotranspozoni. V sesalcih skoraj polovica [[genom|genoma]] (45-48%) vključuje transpozone ali ostanke transpozonov. Človeški [[genom]] je sestavljen iz približno 42% retrotranspozonov od tega jih je v [[DNA]] 2-3%. | ||
Retrotranspozoni lahko povečajo velikost genoma , tako da s pomočjo prenosa [[RNA]] povečuje število kopij elementov. Lahko tudi povzročijo [[mutacije]], ki jih vstavijo v bližino ali znotraj gena. | Retrotranspozoni lahko povečajo velikost genoma , tako da s pomočjo prenosa [[RNA]] povečuje število kopij elementov. Lahko tudi povzročijo [[mutacije]], ki jih vstavijo v bližino ali znotraj gena. | ||
==Tipi retrotranspozonov== | ==Tipi retrotranspozonov== | ||
| Line 9: | Line 9: | ||
*'''Virusna skupina''': vsebuje bralni okvir za reverzno transkriptazo/integrazo in ima na terminih direktne ponovitve. | *'''Virusna skupina''': vsebuje bralni okvir za reverzno transkriptazo/integrazo in ima na terminih direktne ponovitve. | ||
Te delimo na | Te delimo na | ||
*'''LTR-long terminal repeat''' (npr Ty pri kvasovkah in copia pri D.melanogaster | **'''LTR-long terminal repeat''' (npr. Insert non-formatted text here Ty pri kvasovkah in copia pri D.melanogaster | ||
*'''non-LTR''' (npr. LINE-long interspersed element, SINE-short interspersed element) | **'''non-LTR''' (npr. LINE-long interspersed element, SINE-short interspersed element) | ||
Virusna skupina se od retrovirusov razlikuje v tem, da ne pride do litične faze v celicah | Virusna skupina se od retrovirusov razlikuje v tem, da ne pride do litične faze v celicah. Virusna skupina je retrovirusom podobna v mehanizmu, ki ga uporablja pri transpoziciji. | ||
*'''Nevirusna skupina''' je nastala iz virusne. V [[genom|genomu]] je take retrotranspozone mogoče prepoznati po terminih, vmesni del ne kodira ničesar. Ta tip retrotranspozonov je verjetno nastal iz celičnih transkriptov preko neznanega [[encim|encima]]. | *'''Nevirusna skupina''' je nastala iz virusne. V [[genom|genomu]] je take retrotranspozone mogoče prepoznati po terminih, vmesni del ne kodira ničesar. Ta tip retrotranspozonov je verjetno nastal iz celičnih transkriptov preko neznanega [[encim|encima]]. | ||
Revision as of 16:35, 3 January 2012
Retrotranzpozoni so mobilni genetski elementi, ki se lahko sami razširjajo v genomu in so vseprisotni sestavni del DNA mnogih evkariontskih organizmov.
So podrazred transpozonov. Ti so še posebej v veliki meri v rastlinah , kjer so pogosto glavni element jedrne dna. Igrajo pomembno vlogo v genih rastlin in v razvoju genoma. V koruzi 49-78% genoma sestavljajo retrotranspozoni. V sesalcih skoraj polovica genoma (45-48%) vključuje transpozone ali ostanke transpozonov. Človeški genom je sestavljen iz približno 42% retrotranspozonov od tega jih je v DNA 2-3%. Retrotranspozoni lahko povečajo velikost genoma , tako da s pomočjo prenosa RNA povečuje število kopij elementov. Lahko tudi povzročijo mutacije, ki jih vstavijo v bližino ali znotraj gena.
Tipi retrotranspozonov
Retrotranspozone delimo na dva dela:
- Virusna skupina: vsebuje bralni okvir za reverzno transkriptazo/integrazo in ima na terminih direktne ponovitve.
Te delimo na
- LTR-long terminal repeat (npr. Insert non-formatted text here Ty pri kvasovkah in copia pri D.melanogaster
- non-LTR (npr. LINE-long interspersed element, SINE-short interspersed element)
Virusna skupina se od retrovirusov razlikuje v tem, da ne pride do litične faze v celicah. Virusna skupina je retrovirusom podobna v mehanizmu, ki ga uporablja pri transpoziciji.
- Nevirusna skupina je nastala iz virusne. V genomu je take retrotranspozone mogoče prepoznati po terminih, vmesni del ne kodira ničesar. Ta tip retrotranspozonov je verjetno nastal iz celičnih transkriptov preko neznanega encima.
Viri
- http://www.scribd.com/doc/59053465/27/Retrotranspozoni-retropozoni
- http://en.wikipedia.org/wiki/Retrotransposon
- http://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.genet.33.1.479
- http://tu-dresden.de/die_tu_dresden/fakultaeten/fakultaet_mathematik_und_naturwissenschaften/fachrichtung_biologie/botanik/zellmolbiopflanzen/forschung/LTR%20Retrotransposons
