Reverzna transkriptaza

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
m
Line 1: Line 1:
-
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvira tudi ime encima.
+
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub>
-
Kratka shema reakcije:     deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub>
+
Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira -  reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
 +
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
 +
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
 +
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
 +
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja. 
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
Line 11: Line 15:
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)
-
Proces reverzne transkripcije:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
 
-
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
 
-
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
 
-
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
 
-
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja. 
 
== Viri ==
== Viri ==
* <sup>[1]</sup> [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* <sup>[1]</sup> [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
-
* <sup>[2]</sup> [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
+
* <sup>[2]</sup> [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
-
* <sup>[3]</sup> [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
+
* <sup>[3]</sup> [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
-
* <sup>[4]</sup> [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
+
* <sup>[4]</sup> [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
 +
== Zunanje povezave ==
 +
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
 +
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]

Revision as of 21:30, 12 December 2010

Reverzna transkriptaza je encim (EC 2.7.7.49), ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).[1] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor transkripcija, od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija (shema procesa): [4]

  • Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
  • Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
  • Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
  • V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[2]

Katalizira procese v:[3]

  • retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
  • pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
  • retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
  • retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)


Viri

Zunanje povezave

Personal tools