Reverzna transkriptaza

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
m
Line 1: Line 1:
-
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub>
+
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub>
Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira -  reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira -  reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
-
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
+
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
-
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
+
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.   
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.   
-
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
+
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup>
Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup>
Line 24: Line 24:
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
 +
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

Revision as of 21:38, 12 December 2010

Reverzna transkriptaza je encim (EC 2.7.7.49), ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo").[1] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor transkripcija, od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija (shema procesa): [4]

  • Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
  • Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
  • Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
  • V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[2]

Katalizira procese v:[3]

  • retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
  • pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
  • retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
  • retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)


Viri

Zunanje povezave

Personal tools