Reverzna transkriptaza: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
(New page: '''Reverzna transkriptaza''' je encim (EC 2.7.7.49)<sup>[1]</sup>, ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi...)
 
No edit summary
 
(19 intermediate revisions by one other user not shown)
Line 1: Line 1:
'''Reverzna transkriptaza''' je encim (EC 2.7.7.49)<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup>, ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ). Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]]
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA-matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''angl. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ začetni oligonukleotid (RNA ali DNA) – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup>


Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.
Kratka shema reakcije: deoksinukleozid-trifosfat + DNA<sub>n</sub> = difosfat + DNA<sub>n+1</sub>
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}


Katalizira procese v:
Prepis poteka tako, da na obstoječi začetni oligonukleotid dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA-matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira -  reverzna (obratna) transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
* retrovirusih
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis verige RNA v [[dsDNA|dsDNA]] (dvojnoverižna DNA, angl. ''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* hepadnavirusih in caulimovirusih
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* retrotransposonih
* Že med sintezo cepi verigo RNA na krajše kose - PPT (angl. ''polypurine tract'').
* bakterijki msDNA
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja. 
* intronih tipa II
 
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin (University of Wisconsin-Madison) in David Baltimore (MIT, ''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
 
Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup>
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA v DNA, ki nato vstopi v genom gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, kaulimovirusi - okužijo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotranspozonih, tj. [[transpozon|transpozonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotranspozoni se v genomu premeščajo preko RNA- intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (angl. ''multi-copy single-stranded DNA'')


Reakcija, ki jo katalizira:
deoxynucleoside triphosphate + <math>DNA_n</math> = diphosphate + <math>DNA_{n+1}</math>


== Viri ==
== Viri ==
* <sup>[1]</sup> [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* <sup>[1]</sup> [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* <sup>[2]</sup> [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* <sup>[3]</sup> [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* <sup>[4]</sup> [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]
 
[[Category:LEX]]

Latest revision as of 16:22, 26 January 2011

Reverzna transkriptaza je encim (EC 2.7.7.49), ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA-matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (angl. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ začetni oligonukleotid (RNA ali DNA) – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo").[1]

Kratka shema reakcije: deoksinukleozid-trifosfat + DNAn = difosfat + DNAn+1

Slika: HIV reverse transcriptase

Prepis poteka tako, da na obstoječi začetni oligonukleotid dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA-matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor transkripcija, od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna (obratna) transkripcija (shema procesa): [4]

  • Reverzna transkriptaza omogoča prepis verige RNA v dsDNA (dvojnoverižna DNA, angl. double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
  • Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
  • Že med sintezo cepi verigo RNA na krajše kose - PPT (angl. polypurine tract).
  • V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin (University of Wisconsin-Madison) in David Baltimore (MIT, Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[2]

Katalizira procese v:[3]

  • retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA v DNA, ki nato vstopi v genom gostitelja
  • pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, kaulimovirusi - okužijo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
  • retrotranspozonih, tj. transpozonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotranspozoni se v genomu premeščajo preko RNA- intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
  • retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (angl. multi-copy single-stranded DNA)


Viri

Zunanje povezave

Retrieved from "https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Reverzna_transkriptaza&oldid=5305"