Seminarji-Modul2: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
 
(14 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
== Splošno ==
== Splošno ==


V študijskem letu 2020/21 bomo izvedli 2. modul (''Struktura in funkcija bioloških molekul in dizajniranih bioloških sistemov'') predmeta ''Izbrana poglavja iz biokemije in molekularne biologije'' v obliki predavanj in seminarjev. Vsak študent mora v okviru tega modula pripraviti in predstaviti dva seminarja. Pri vsakem učitelju lahko pripravi največ en seminar, pri katerem in katerega izmed razpisanih, pa si izbere vsak sam v okviru ponujenih možnosti. Pri izr. prof. Dolinarju je na voljo 5 seminarjev iz nabora, ki ga študenti dobijo po e-pošti.
V študijskem letu 2021/22 bomo izvedli 2. modul (''Struktura in funkcija bioloških molekul in dizajniranih bioloških sistemov'') predmeta ''Izbrana poglavja iz biokemije in molekularne biologije'' v obliki predavanj in seminarjev na spletu. Vsak študent mora v okviru tega modula pripraviti in predstaviti dva seminarja. Pri vsakem učitelju lahko pripravi največ en seminar, pri katerem in katerega izmed razpisanih, pa si izbere vsak sam v okviru ponujenih možnosti. Pri izr. prof. Dolinarju je na voljo 6 seminarjev, predstavljenih v spodnji tabeli.


Teme pri izr. prof. Dolinarju bodo: Proteinsko inženirstvo v biomedicini (11.2.), Rekombinantna in biotehnološka zdravila (16.2.) ter Dizajnerska protitelesa in njihova uporaba (18.2.). Tako bodo razporejene tudi teme seminarjev.
Teme pri izr. prof. Dolinarju bodo: Proteinsko inženirstvo v biomedicini (10.2.), Rekombinantna in biotehnološka zdravila (15.2.) ter Dizajnerska protitelesa in njihova uporaba (17.2.). Tako bodo razporejene tudi teme seminarjev.


== Seznam seminarjev ==
== Seznam seminarjev ==
Line 13: Line 13:
!referent
!referent
|-
|-
|11. 02. 2021/
|15. 02. 2022/
|[https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33383075/] ali [https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165620302765]....
| Munhoz Costa et al., [https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jctb.6933 Engineered asparaginase from ''Erwinia chrysanthemi'' enhances asparagine hydrolase activity and diminishes enzyme immunoreactivity - a new promise to treat acute lymphoblastic leukemia]. J. Chem. Technol. Biotechnol. 2021 .... Andreja
|-
|-
|-
|-
|15. 02. 2022/
|Prats-Ejarque et al., [https://www.mdpi.com/1422-0067/23/1/95/htm Structure-based design of an RNase chimera for antimicrobial therapy]. Int. J. Mol. Sci. 2022 .... Iza
|-
|-
|-
|-
|17. 02. 2022/
|Sinegubova et al., [https://www.mdpi.com/1999-4923/14/1/96/htm Purification Process of a Recombinant Human Follicle Stimulating Hormone Biosimilar (Primapur®) to Yield a Pharmaceutical Product with High Batch-to-Batch Consistency]. Pharmaceutics 2022 .... Rok
|-
|-
|-
|-
|16. 02. 2021/
|17. 02. 2022/
| [https://www.nature.com/articles/s41467-020-19138-5 A synthetic biology platform for Type IV–V glycopeptide antibiotic production and discovery]. ...
|Wang et al., [https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adma.202106669 Spatiotemporally controllable distribution of combination therapeutics in solid tumors by dually modified bacteria]. Adv. Materials 2021 .... Petra
|-
|-
|-
|-
|16. 02. 2021/
|22. 02. 2022/
|[https://www.nature.com/articles/s41467-020-16721-8 Reverse engineering synthetic antiviral amyloids]. ... Adrijana
|Svilenov et al., [https://www.nature.com/articles/s41467-021-27103-z Mechanistic principles of an ultra-long bovine CDR reveal strategies for antibody design]. Nat. Commun. 2021
|-
|-
|-
|-
|18. 02. 2021/
|22. 02. 2022/
|[https://www.thno.org/v11p1901.htm A general Fc engineering platform for the next generation of antibody therapeutics]....
|Rofo et al., [https://translationalneurodegeneration.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40035-021-00258-x Novel multivalent design of a monoclonal antibody improves binding strength to soluble aggregates of amyloid beta]. Transl. Neurodeg. 2021 .... Janez
|-
|-
|-
|-
|18. 02. 2021/
|22. 02. 2022/
|[https://science.sciencemag.org/content/370/6523/1473 An ultrapotent synthetic nanobody neutralizes SARS-CoV-2 by stabilizing inactive Spike]. ... Tea
|Wang et al., [https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bit.27953  The interplay of protein engineering and glycoengineering to fine-tune antibody glycosylation and its impact on effector functions]. Biotechnol. Bioeng. 2021 .... Nika   
|-
|-
|-
|/
|/     
|/
|-
|-
|}
|}

Latest revision as of 10:03, 14 February 2022

Splošno

V študijskem letu 2021/22 bomo izvedli 2. modul (Struktura in funkcija bioloških molekul in dizajniranih bioloških sistemov) predmeta Izbrana poglavja iz biokemije in molekularne biologije v obliki predavanj in seminarjev na spletu. Vsak študent mora v okviru tega modula pripraviti in predstaviti dva seminarja. Pri vsakem učitelju lahko pripravi največ en seminar, pri katerem in katerega izmed razpisanih, pa si izbere vsak sam v okviru ponujenih možnosti. Pri izr. prof. Dolinarju je na voljo 6 seminarjev, predstavljenih v spodnji tabeli.

Teme pri izr. prof. Dolinarju bodo: Proteinsko inženirstvo v biomedicini (10.2.), Rekombinantna in biotehnološka zdravila (15.2.) ter Dizajnerska protitelesa in njihova uporaba (17.2.). Tako bodo razporejene tudi teme seminarjev.

Seznam seminarjev

datum članek za seminar referent
15. 02. 2022/ Munhoz Costa et al., Engineered asparaginase from Erwinia chrysanthemi enhances asparagine hydrolase activity and diminishes enzyme immunoreactivity - a new promise to treat acute lymphoblastic leukemia. J. Chem. Technol. Biotechnol. 2021 .... Andreja
15. 02. 2022/ Prats-Ejarque et al., Structure-based design of an RNase chimera for antimicrobial therapy. Int. J. Mol. Sci. 2022 .... Iza
17. 02. 2022/ Sinegubova et al., Purification Process of a Recombinant Human Follicle Stimulating Hormone Biosimilar (Primapur®) to Yield a Pharmaceutical Product with High Batch-to-Batch Consistency. Pharmaceutics 2022 .... Rok
17. 02. 2022/ Wang et al., Spatiotemporally controllable distribution of combination therapeutics in solid tumors by dually modified bacteria. Adv. Materials 2021 .... Petra
22. 02. 2022/ Svilenov et al., Mechanistic principles of an ultra-long bovine CDR reveal strategies for antibody design. Nat. Commun. 2021
22. 02. 2022/ Rofo et al., Novel multivalent design of a monoclonal antibody improves binding strength to soluble aggregates of amyloid beta. Transl. Neurodeg. 2021 .... Janez
22. 02. 2022/ Wang et al., The interplay of protein engineering and glycoengineering to fine-tune antibody glycosylation and its impact on effector functions. Biotechnol. Bioeng. 2021 .... Nika

Izberite si enega od seminarjev in mi izbiro sporočite po e-pošti na naslov marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si. Prednost ima, kdor se prej javi.

Navodila za pripravo

Seminarji predstavljajo pomemben del modula in jih bomo tako tudi ocenjevali. Samo 50 % ocene modula bodo predstavljali odgovori na izpitna vprašanja, 50 % ocene pa je ocena seminarja. Ta polovica ocene se oblikuje iz 60 % za predstavitev in povzetek ter 40 % za sodelovanje pri razpravah o seminarjih.

Vsak doktorski študent, ki je vpisal 2. modul, mora:
- prebrati vsakega od člankov, ki jih bomo obravnavali na seminarjih, do datuma predstavitve
- pripraviti vprašanja za razpravo
- sodelovati v razpravi
- referent mora prebrati tudi morebitno dodatno gradivo k članku in seveda literaturo, s katero si bo razjasnil tematiko dela in uporabljene metode

Vsak od referentov mora pripraviti naslednje:
- povzetek seminarja s 1200-1600 besedami - lahko vključuje tudi slike, ni pa nujno (sklicujete se lahko na številke slik v originalnem članku); povzetek oddajte najkasneje en dan pred predstavitvijo v elektronski obliki in ga pošljite tudi vsem vpisanim študentom kot pomoč pri pripravi na izpit
- predstavitev v programu PowerPoint v obsegu in na način, ki bo omogočil natančen vpogled v snov, predstavljeno v članku in bo služil kot osnova za razpravo

Predstavitve naj bi bile dolge okrog 30 minut. V tem času boste morali razložiti:
- ozadje/problem, ki ga članek obravnava, pri čemer poskušajte izluščiti ne samo namen dela, pač pa tudi delovno hipotezo
- predhodno opravljeno delo (ali stanje stvari na tem področju)
- konkreten delovni načrt za izvedbo raziskave
- rezultate in metode (metode smiselno vključite v predstavitev rezultatov)
- kritično mnenje o članku (kaj je bilo dobro zastavljeno, izvedeno, predstavljeno, razloženo... in kaj ne)
- uvod v razpravo

Razprava o vsakem članku naj bi trajala okrog 20 minut in mora biti poglobljena in argumentirana. Zato je res nujno, da članke berete sproti in temeljito!