TBK2016-seminar

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
(Seznam seminarjev)
m
Line 102: Line 102:
| Iztok Štuhec||Večvalentni prikaz minimalnih glikanskih epitopov C. difficile posnema antigenske lastnosti večjih glikanov||https://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512102620.htm||17.05.||20.05.||23.05.||Maša Zorman||Katarina Petra van Midden||Katja Malenšek
| Iztok Štuhec||Večvalentni prikaz minimalnih glikanskih epitopov C. difficile posnema antigenske lastnosti večjih glikanov||https://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512102620.htm||17.05.||20.05.||23.05.||Maša Zorman||Katarina Petra van Midden||Katja Malenšek
|-
|-
-
| Maksimiljan Adamek||naslov||https://www.sciencedaily.com/releases/2015/08/150825094915.htm||24.05.||27.05.||30.05.||Jošt Hočevar||Valentina Novak||Kevin Heric
+
| Maksimiljan Adamek||Vezava AVR efektorjev na NLR receptor kot osnova zaznavanja patogenov v rastlinah||https://www.sciencedaily.com/releases/2015/08/150825094915.htm||24.05.||27.05.||30.05.||Jošt Hočevar||Valentina Novak||Kevin Heric
|-
|-
| Eva Klemenčič||CRISPR-Cas9 nukleaze, ki ne povzročajo nezaželjenih mutacij na ne-tarčnih mestih na DNA||https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160106143018.htm||24.05.||27.05.||30.05.||Ana Halužan Vasle||Veronika Razpotnik||Jurij Nastran
| Eva Klemenčič||CRISPR-Cas9 nukleaze, ki ne povzročajo nezaželjenih mutacij na ne-tarčnih mestih na DNA||https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160106143018.htm||24.05.||27.05.||30.05.||Ana Halužan Vasle||Veronika Razpotnik||Jurij Nastran

Revision as of 19:31, 23 May 2016

Contents

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.

Seznam seminarjev

Ime in priimek Naslov seminarja Povezava Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3
Anna ScottMoj naslov v slovenščinihttp://www.bioscirep.org/content/36/1/e00291.long12.12.12.12.12.12.r1r2r3
Domen VaupotičBiokemija v boju proti otrokomhttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/10/151020091651.htm01.03.04.03.07.03.Eva KlemenčičAna Halužan VasleVeronika Razpotnik
Aljaž BožičBakterije prehajajo med celicami sočasno s procesom trogocitozehttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160215143327.htm01.03.04.03.07.03.Tomaž ŽigonTanja PericLuka Okorn
Lana VogrinecUporaba nefotosintetskih bakterij za pridobivanje spojin iz sončne energije https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160104164221.htm01.03.04.03.07.03.Tina IvančirIztok ŠtuhecMaša Zorman
Polona SkrtAktivnost mitohondrija in staranje kožnih celichttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160226080947.htm01.03.04.03.07.03.Ajda CafunMaksimiljan AdamekJošt Hočevar
Andrej IvanovskiGenski spmenjeni komarji bi lahko pomagali borbi proti malarijihttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/12/151207113839.htm08.03.11.03.14.03.Domen VaupotičEva KlemenčičAna Halužan Vasle
Dominik RebekVloga RQC sistema pri agregaciji proteinovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160303112912.htm08.03.11.03.14.03.Aljaž BožičTomaž ŽigonTanja Peric
Kaja UjčičImunski sistem kot spodbujevalec rakahttp://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160218060937.htm08.03.11.03.14.03.Eva KlemenčičTina IvančirIztok Štuhec
David DolharUmetna mišična tkiva s sposobnostjo samoobnove le stvar prihodnosti?https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160128154827.htm08.03.11.03.14.03.Polona SkrtAjda CafunMaksimiljan Adamek
Vida ŠtrancarVloga konformacijske spremembe kinaze v procesu bakterijske kemotaksehttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/12/151208134129.htm15.03.18.03.21.03.Andrej IvanovskiDomen VaupotičLana Vogrinec
Lara Turknaslovlink15.03.18.03.21.03.Dominik RebekAljaž BožičTomaž Žigon
Janja MurnVirus HSV uspešen v boju z imunskim sistemomhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160204094928.htm15.03.18.03.21.03.Kaja UjčičLana VogrinecTina Ivančir
Zorana Andonovićnaslovlink15.03.18.03.21.03.David DolharPolona SkrtAjda Cafun
Ana ObahaVloga miRNA pri razvoju osteosarkoma in glioblastomahttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160223132545.htm29.03.01.04.04.04.Vida ŠtrancarAndrej IvanovskiDomen Vaupotič
Nadja ŠkafarIonska črpalka za transport cezijevih ionovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160222090654.htm29.03.01.04.04.04.Lara TurkDominik RebekAljaž Božič
Marijana Mijatovićnaslovlink29.03.01.04.04.04.Janja MurnKaja UjčičLana Vogrinec
Aljaž Pužnaslovlink29.03.01.04.04.04.Zorana AndonovićDavid DolharPolona Skrt
Ana ErčuljEndogeni retrovirusi - regulatorji pluripotencehttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/11/151123202505.htm05.04.08.04.11.04.Ana ObahaVida ŠtrancarAndrej Ivanovski
Urban Ferčecnaslovlink05.04.08.04.11.04.Nadja ŠkafarLara TurkDominik Rebek
Karin KokaljUporaba hiperpolariziranih diazirinov, kot molekulskih označevalcevhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160325151726.htm05.04.08.04.11.04.Marijana MijatovićJanja MurnKaja Ujčič
Aljoša Savićnaslovlink05.04.08.04.11.04.Aljaž PužZorana AndonovićDavid Dolhar
Ela HudovernikNevroni pod žarometi proteina FlicR1https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160224151217.htm12.04.15.04.18.04.Ana ErčuljAna ObahaVida Štrancar
David TitovšekOdstranitev HIV-1 iz človeških celic s CRISPR/Cas9 sistemomhttp://www.nature.com/articles/srep2255512.04.15.04.18.04.Urban FerčecNadja ŠkafarLara Turk
Zala ŽivičSvetlobno nadzorovan eksport proteinov iz celičnega jedrahttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160215123751.htm12.04.15.04.18.04.Karin KokaljMarijana MijatovićJanja Murn
Neli SedejOznačevanje RNK z uporabo CRISPR/Cas9https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160317150008.htm12.04.15.04.18.04.Aljoša SavićAljaž PužZorana Andonović
Aljoša MarinkoVloga proteina DART pri odstranitvi virusa HIVhttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/09/150928183114.htm19.04.22.04.25.04.Ela HudovernikAna ErčuljAna Obaha
Melita Flandernaslovlink19.04.22.04.25.04.David TitovšekUrban FerčecNadja Škafar
Pia LavrihaInterakcija proteina p53 in subtelomerov za zaščito DNA človeških telomerovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160115100943.htm19.04.22.04.25.04.Zala ŽivičKarin KokaljMarijana Mijatović
Katja MalenšekKako celica določi, kje se sinteza proteinov začne?https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160120142955.htm19.04.22.04.25.04.Neli SedejAljoša SavićAljaž Puž
Kevin HericProizvajanje enantioselektivnih biokatalizatorjev s pomočjo fotosintezehttp://microbialcellfactories.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12934-015-0233-503.05.06.05.09.05.Aljoša MarinkoEla HudovernikDomen Vaupotič
Jurij NastranIntramolekularna alosterična komunikacija v dopaminskem receptorju D2https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160317094742.htm03.05.06.05.09.05.Melita FlanderDavid TitovšekUrban Ferčec
Ajda LenardičKombinacija RNA-stikal in RNA-termometrov uravnava gibanje bakterijhttps://http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2016/04/08/nar.gkw23203.05.06.05.09.05.Pia LavrihaZala ŽivičKarin Kokalj
Katarina Petra van MiddenUčinkovitost molekule GS-5734 proti virusu ebolahttp://www.nature.com/nature/journal/v531/n7594/full/nature17180.html03.05.06.05.09.05.Katja MalenšekNeli SedejAljoša Savić
Valentina NovakTransgeneracijski vplivi motnje v metilaciji histonovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/10/151008142622.htm10.05.13.05.16.05.Kevin HericAljoša MarinkoEla Hudovernik
Veronika RazpotnikVpliv gena CACNA1C na psihološke anksiozne motnje in možnosti zdravljenja le-teh s spojinami iz družine aminopropil karbazolovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/04/160426144747.htm10.05.13.05.16.05.Jurij NastranMelita FlanderDavid Titovšek
Luka OkornPretvorba prionov: iz dobrih v slabehttp://www.nature.com/articles/srep1525310.05.13.05.16.05.Ajda LenardičPia LavrihaZala Živič
Maša ZormanZvijanje kromatina in inhibicija DNA replikacije s platinastim kompleksom 5-H-Yhttp://www.nature.com/articles/srep2471210.05.13.05.16.05.Katarina Petra van MiddenKatja MalenšekNeli Sedej
Jošt HočevarRegulacija krvnega sladkorja preko reprogramiranih želodčnih celichttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160218132245.htm17.05.20.05.23.05.Valentina NovakKevin HericAljoša Marinko
Ana Halužan VasleIn vivo: CRISPR/Cas9 izboljša mišično funkcijohttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160104080244.htm17.05.20.05.23.05.Veronika RazpotnikJurij NastranMelita Flander
Tanja PericCinamtanin B1 pospešuje celjenje ranhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/04/160421085700.htm17.05.20.05.23.05.Luka OkornAjda LenardičPia Lavriha
Iztok ŠtuhecVečvalentni prikaz minimalnih glikanskih epitopov C. difficile posnema antigenske lastnosti večjih glikanovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512102620.htm17.05.20.05.23.05.Maša ZormanKatarina Petra van MiddenKatja Malenšek
Maksimiljan AdamekVezava AVR efektorjev na NLR receptor kot osnova zaznavanja patogenov v rastlinahhttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/08/150825094915.htm24.05.27.05.30.05.Jošt HočevarValentina NovakKevin Heric
Eva KlemenčičCRISPR-Cas9 nukleaze, ki ne povzročajo nezaželjenih mutacij na ne-tarčnih mestih na DNAhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160106143018.htm24.05.27.05.30.05.Ana Halužan VasleVeronika RazpotnikJurij Nastran
Tomaž Žigonnaslovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2015/10/151029102730.htm24.05.27.05.30.05.Tanja PericLuka OkornAjda Lenardič
Tina Ivančirnaslovhttps://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160506132211.htm24.05.27.05.30.05.Iztok ŠtuhecMaša ZormanKatarina Petra van Midden
Ajda Cafunnaslovlink31.05.03.06.06.06.Maksimiljan AdamekJošt HočevarValentina Novak

Naloga

  • samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2015. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
  • članke na temo lahko iščete v PubMed povezavi tukaj
  • naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
  • Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 12 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
  • Predstavitvi sledi razprava do 8 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
  • En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:

  • TBK_2016_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2016_Guncar_Gregor.docx
  • TBK_2016_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
  • TBK_2016_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2016_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • TBK_2016_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2016_Guncar_Gregor.pptx
  • TBK_2016_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2016_Guncar_Gregor_clanek.pdf

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.


Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.). Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.

Personal tools