TBK2016-seminar

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.

Seznam seminarjev

Ime in priimek Naslov seminarja Povezava Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3
Anna Scott Moj naslov v slovenščini http://www.bioscirep.org/content/36/1/e00291.long 12.12. 12.12. 12.12. r1 r2 r3
Domen Vaupotič Biokemija v boju proti otrokom https://www.sciencedaily.com/releases/2015/10/151020091651.htm 01.03. 04.03. 07.03. Eva Klemenčič Ana Halužan Vasle Veronika Razpotnik
Aljaž Božič Bakterije prehajajo med celicami sočasno s procesom trogocitoze https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160215143327.htm 01.03. 04.03. 07.03. Tomaž Žigon Tanja Peric Luka Okorn
Lana Vogrinec Uporaba nefotosintetskih bakterij za pridobivanje spojin iz sončne energije https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160104164221.htm 01.03. 04.03. 07.03. Tina Ivančir Iztok Štuhec Maša Zorman
Polona Skrt Aktivnost mitohondrija in staranje kožnih celic https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160226080947.htm 01.03. 04.03. 07.03. Ajda Cafun Maksimiljan Adamek Jošt Hočevar
Andrej Ivanovski Genski spmenjeni komarji bi lahko pomagali borbi proti malariji https://www.sciencedaily.com/releases/2015/12/151207113839.htm 08.03. 11.03. 14.03. Domen Vaupotič Eva Klemenčič Ana Halužan Vasle
Dominik Rebek Vloga RQC sistema pri agregaciji proteinov https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160303112912.htm 08.03. 11.03. 14.03. Aljaž Božič Tomaž Žigon Tanja Peric
Kaja Ujčič Imunski sistem kot spodbujevalec raka http://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160218060937.htm 08.03. 11.03. 14.03. Eva Klemenčič Tina Ivančir Iztok Štuhec
David Dolhar Umetna mišična tkiva s sposobnostjo samoobnove le stvar prihodnosti? https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160128154827.htm 08.03. 11.03. 14.03. Polona Skrt Ajda Cafun Maksimiljan Adamek
Vida Štrancar Vloga konformacijske spremembe kinaze v procesu bakterijske kemotakse https://www.sciencedaily.com/releases/2015/12/151208134129.htm 15.03. 18.03. 21.03. Andrej Ivanovski Domen Vaupotič Lana Vogrinec
Lara Turk naslov link 15.03. 18.03. 21.03. Dominik Rebek Aljaž Božič Tomaž Žigon
Janja Murn Virus HSV uspešen v boju z imunskim sistemom https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160204094928.htm 15.03. 18.03. 21.03. Kaja Ujčič Lana Vogrinec Tina Ivančir
Zorana Andonović naslov link 15.03. 18.03. 21.03. David Dolhar Polona Skrt Ajda Cafun
Ana Obaha Vloga miRNA pri razvoju osteosarkoma in glioblastoma https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160223132545.htm 29.03. 01.04. 04.04. Vida Štrancar Andrej Ivanovski Domen Vaupotič
Nadja Škafar Ionska črpalka za transport cezijevih ionov https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160222090654.htm 29.03. 01.04. 04.04. Lara Turk Dominik Rebek Aljaž Božič
Marijana Mijatović naslov link 29.03. 01.04. 04.04. Janja Murn Kaja Ujčič Lana Vogrinec
Aljaž Puž naslov link 29.03. 01.04. 04.04. Zorana Andonović David Dolhar Polona Skrt
Ana Erčulj Endogeni retrovirusi - regulatorji pluripotence https://www.sciencedaily.com/releases/2015/11/151123202505.htm 05.04. 08.04. 11.04. Ana Obaha Vida Štrancar Andrej Ivanovski
Urban Ferčec naslov link 05.04. 08.04. 11.04. Nadja Škafar Lara Turk Dominik Rebek
Karin Kokalj Uporaba hiperpolariziranih diazirinov, kot molekulskih označevalcev https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160325151726.htm 05.04. 08.04. 11.04. Marijana Mijatović Janja Murn Kaja Ujčič
Aljoša Savić naslov link 05.04. 08.04. 11.04. Aljaž Puž Zorana Andonović David Dolhar
Ela Hudovernik Nevroni pod žarometi proteina FlicR1 https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160224151217.htm 12.04. 15.04. 18.04. Ana Erčulj Ana Obaha Vida Štrancar
David Titovšek Odstranitev HIV-1 iz človeških celic s CRISPR/Cas9 sistemom http://www.nature.com/articles/srep22555 12.04. 15.04. 18.04. Urban Ferčec Nadja Škafar Lara Turk
Zala Živič Svetlobno nadzorovan eksport proteinov iz celičnega jedra https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160215123751.htm 12.04. 15.04. 18.04. Karin Kokalj Marijana Mijatović Janja Murn
Neli Sedej Označevanje RNK z uporabo CRISPR/Cas9 https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160317150008.htm 12.04. 15.04. 18.04. Aljoša Savić Aljaž Puž Zorana Andonović
Aljoša Marinko Vloga proteina DART pri odstranitvi virusa HIV https://www.sciencedaily.com/releases/2015/09/150928183114.htm 19.04. 22.04. 25.04. Ela Hudovernik Ana Erčulj Ana Obaha
Melita Flander naslov link 19.04. 22.04. 25.04. David Titovšek Urban Ferčec Nadja Škafar
Pia Lavriha Interakcija proteina p53 in subtelomerov za zaščito DNA človeških telomerov https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160115100943.htm 19.04. 22.04. 25.04. Zala Živič Karin Kokalj Marijana Mijatović
Katja Malenšek Kako celica določi, kje se sinteza proteinov začne? https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160120142955.htm 19.04. 22.04. 25.04. Neli Sedej Aljoša Savić Aljaž Puž
Kevin Heric Proizvajanje enantioselektivnih biokatalizatorjev s pomočjo fotosinteze http://microbialcellfactories.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12934-015-0233-5 03.05. 06.05. 09.05. Aljoša Marinko Ela Hudovernik Domen Vaupotič
Jurij Nastran Intramolekularna alosterična komunikacija v dopaminskem receptorju D2 https://www.sciencedaily.com/releases/2016/03/160317094742.htm 03.05. 06.05. 09.05. Melita Flander David Titovšek Urban Ferčec
Ajda Lenardič Kombinacija RNA-stikal in RNA-termometrov uravnava gibanje bakterij https://http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2016/04/08/nar.gkw232 03.05. 06.05. 09.05. Pia Lavriha Zala Živič Karin Kokalj
Katarina Petra van Midden Učinkovitost molekule GS-5734 proti virusu ebola http://www.nature.com/nature/journal/v531/n7594/full/nature17180.html 03.05. 06.05. 09.05. Katja Malenšek Neli Sedej Aljoša Savić
Valentina Novak Transgeneracijski vplivi motnje v metilaciji histonov https://www.sciencedaily.com/releases/2015/10/151008142622.htm 10.05. 13.05. 16.05. Kevin Heric Aljoša Marinko Ela Hudovernik
Veronika Razpotnik Vpliv gena CACNA1C na psihološke anksiozne motnje in možnosti zdravljenja le-teh s spojinami iz družine aminopropil karbazolov https://www.sciencedaily.com/releases/2016/04/160426144747.htm 10.05. 13.05. 16.05. Jurij Nastran Melita Flander David Titovšek
Luka Okorn Pretvorba prionov: iz dobrih v slabe http://www.nature.com/articles/srep15253 10.05. 13.05. 16.05. Ajda Lenardič Pia Lavriha Zala Živič
Maša Zorman Zvijanje kromatina in inhibicija DNA replikacije s platinastim kompleksom 5-H-Y http://www.nature.com/articles/srep24712 10.05. 13.05. 16.05. Katarina Petra van Midden Katja Malenšek Neli Sedej
Jošt Hočevar Regulacija krvnega sladkorja preko reprogramiranih želodčnih celic https://www.sciencedaily.com/releases/2016/02/160218132245.htm 17.05. 20.05. 23.05. Valentina Novak Kevin Heric Aljoša Marinko
Ana Halužan Vasle In vivo: CRISPR/Cas9 izboljša mišično funkcijo https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160104080244.htm 17.05. 20.05. 23.05. Veronika Razpotnik Jurij Nastran Melita Flander
Tanja Peric Cinamtanin pospešuje celjenje ran https://www.sciencedaily.com/releases/2016/04/160421085700.htm 17.05. 20.05. 23.05. Luka Okorn Ajda Lenardič Pia Lavriha
Iztok Štuhec Večvalentni prikaz minimalnih glikanskih epitopov C. difficile posnema antigenske lastnosti večjih glikanov https://www.sciencedaily.com/releases/2016/05/160512102620.htm 17.05. 20.05. 23.05. Maša Zorman Katarina Petra van Midden Katja Malenšek
Maksimiljan Adamek naslov https://www.sciencedaily.com/releases/2015/08/150825094915.htm 24.05. 27.05. 30.05. Jošt Hočevar Valentina Novak Kevin Heric
Eva Klemenčič naslov link 24.05. 27.05. 30.05. Ana Halužan Vasle Veronika Razpotnik Jurij Nastran
Tomaž Žigon naslov link 24.05. 27.05. 30.05. Tanja Peric Luka Okorn Ajda Lenardič
Tina Ivančir naslov https://www.sciencedaily.com/releases/2016/01/160128133352.htm 24.05. 27.05. 30.05. Iztok Štuhec Maša Zorman Katarina Petra van Midden
Ajda Cafun naslov link 31.05. 03.06. 06.06. Maksimiljan Adamek Jošt Hočevar Valentina Novak

Naloga

  • samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2015. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
  • članke na temo lahko iščete v PubMed povezavi tukaj
  • naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
  • Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 12 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
  • Predstavitvi sledi razprava do 8 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
  • En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:

  • TBK_2016_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2016_Guncar_Gregor.docx
  • TBK_2016_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
  • TBK_2016_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2016_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • TBK_2016_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2016_Guncar_Gregor.pptx
  • TBK_2016_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2016_Guncar_Gregor_clanek.pdf

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.


Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.). Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.