Temelji biokemije 2023 - seminar: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
No edit summary
Line 123: Line 123:
| David Valte||||||14.05.||17.05.||20.05.||Klara Kolenc||Boštjan Kramberger||Patricija Kolander
| David Valte||||||14.05.||17.05.||20.05.||Klara Kolenc||Boštjan Kramberger||Patricija Kolander
|-
|-
| Sofija Stevanović||||https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210402141745.htm||14.05.||17.05.||20.05.||Gaja Starc||Nuša Brdnik||Lev Jošt
| Sofija Stevanović||Delovanje in usoda konvencionalnih dendritičnih celic tipa 1 je pod nadzorom DC-SCRIPT proteina  ||https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210402141745.htm||14.05.||17.05.||20.05.||Gaja Starc||Nuša Brdnik||Lev Jošt
|-
|-
| Klara Ažbe||Kako bakterije Streptococcus pyogenes s pomočjo razgradnje arginina preživijo na koži||https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210331143115.htm||21.05.||24.05.||27.05.||Mark Loborec||Ema Kavčič||Tina Zajec
| Klara Ažbe||Kako bakterije Streptococcus pyogenes s pomočjo razgradnje arginina preživijo na koži||https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210331143115.htm||21.05.||24.05.||27.05.||Mark Loborec||Ema Kavčič||Tina Zajec

Revision as of 11:39, 3 May 2021

link title= Temelji biokemije- seminar =

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.

Seznam seminarjev

Naloga

  • samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2020. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
  • članke na temo lahko iščete z Google učenjakom.
  • naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah – najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1–2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
  • Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 10 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
  • Predstavitvi sledi razprava do 5 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
  • En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
  • Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate, poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:

  • TBK_2021_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2021_Guncar_Gregor.docx
  • TBK_2021_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
  • TBK_2021_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2021_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • TBK_2021_Priimek_Ime.pdf za prezentacijo (PowerPoint -> Shrani kot PDF), npr TBK_2021_Guncar_Gregor.pdf
  • TBK_2021_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2021_Guncar_Gregor_clanek.pdf

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije, za katero želite izvedeti faktor vpliva, in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za tekoče leto faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.

Ime in priimek Naslov seminarja Povezava Rok za oddajo Rok za recenzijo Datum predstavitve Recenzent 1 Recenzent 2 Recenzent 3
Anna Scott Moj naslov v slovenščini https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190214100038.htm 05.03. 08.03. 11.03. r1 r2 r3
Gašper Struna Kako sistem toksin-antitoksin vpliva na odpornost bakterij na antibiotike https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210201144911.htm 05.03. 08.03. 11.03. David Valte Klara Kolenc Boštjan Kramberger
Pia Špehar Mehanizem delovanja proteina omogoča odpornost na zdravila proti raku https://www.sciencedaily.com/releases/2020/12/201229080253.htm 05.03. 08.03. 11.03. Sofija Stevanović Gaja Starc Nuša Brdnik
Tinkara Butara Kako rastline zaznajo napad herbivorov https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210216133437.htm 05.03. 08.03. 11.03. Klara Ažbe Mark Loborec Ema Kavčič
Pia Trošt Barvna povezava v sposobnosti korale, da preživi višje temperature https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210221154616.htm 05.03. 08.03. 11.03. Mia Kobal Vanja Ivošević Urša Štefan
Živa Urh Zmanjšanje transkripcijske aktivnosti povzroči stresno pogojena jedrna kondenzacija NELF https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210210170104.htm 05.03. 08.03. 11.03. Andraž Rotar Petja Premrl Maj Priveršek
Urša Zevnik FOXO3, gen povezan z dolgoživostjo, ščiti možganske matične celice pred stresom https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210219155903.htm 12.03. 15.03. 18.03. Gašper Struna David Valte Klara Kolenc
Nika Ferk Formulacije na osnovi biomaterialov za boj proti virusnim nalezljivim boleznim https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210209113902.htm 12.03. 15.03. 18.03. Pia Špehar Sofija Stevanović Gaja Starc
Nataša Vujović Kako se HER2 pozitivne celice raka dojk izognejo terapijam, ki vključujejo T celice https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210223135516.htm 12.03. 15.03. 18.03. Tinkara Butara Klara Ažbe Mark Loborec
Thaler Nuša Kos Hitra evolucija litičnih genov v enoverižnih RNA bakteriofagih https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210205121236.htm 12.03. 15.03. 18.03. Pia Trošt Mia Kobal Vanja Ivošević
Sara Borišek Dieta z visoko vsebnostjo maščob lahko prekomerno aktivira destruktivni protein NOX-2 https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210302075358.htm 12.03. 15.03. 18.03. Živa Urh Andraž Rotar Petja Premrl
Lana Bajec Inhibicija encima 15-PGDH pomlajuje mišice in povečuje mišično moč https://www.sciencedaily.com/releases/2020/12/201210145751.htm 19.03. 22.03. 25.03. Urša Zevnik Gašper Struna David Valte
Leila Bohorč Dokaz o obstoju različnih mehanizmov delovanja majhnih molekul, ki inhibirajo vstop filovirusov v celico https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210208134421.htm 19.03. 22.03. 25.03. Nika Ferk Pia Špehar Sofija Stevanović
Špela Rapuš Kako mikobakterije tvorijo membranske vezikle https://www.sciencedaily.com/releases/2021/01/210114163907.htm 19.03. 22.03. 25.03. Nataša Vujović Tinkara Butara Klara Ažbe
Pavletič Primož Šenica Nov način preprečevanja širjenja malarije z gensko spremenjenimi komarji https://www.sciencedaily.com/releases/2020/11/201103140613.htm 19.03. 22.03. 25.03. Thaler Nuša Kos Pia Trošt Mia Kobal
Ivana Vukšinić Sekvestracija žvepla v času pomanjkanja hranil pospeši nastanek mnogoceličnega organizma https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210224143527.htm 19.03. 22.03. 25.03. Ela Kovač Živa Urh Andraž Rotar
Zarja Weingerl Odkritje novih malih proteinov v Salmonelli in njihov vpliv na bakterijsko virulenco https://www.sciencedaily.com/releases/2020/12/201216104643.htm 26.03. 29.03. 01.04. Lana Bajec Urša Zevnik Gašper Struna
Teja Spruk Bakterije, odporne na antibiotike: Fluorid kot rešitev https://www.sciencedaily.com/releases/2021/01/210104141521.htm 26.03. 29.03. 01.04. Leila Bohorč Nika Ferk Pia Špehar
Magdalena Ilievska Spomin brez možganov - Kako enocelični sluzni kalup pametno sprejema odločitve brez centralnega živčnega sistema. https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210223121643.htm 26.03. 29.03. 01.04. Špela Rapuš Nataša Vujović Tinkara Butara
Metka Rus Gensko spreminjanje jetrnih celic s pomočjo proteinskih nanodelcev z namenom zniževanja holesterola https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210301151545.htm 26.03. 29.03. 01.04. Pavletič Primož Šenica Thaler Nuša Kos Pia Trošt
Pia Sotlar Zdravljenje s sistemom za urejanje genoma, ki temelji na metodi CRISPR, uničuje rakave celice https://www.sciencedaily.com/releases/2020/11/201118161129.htm 26.03. 29.03. 01.04. Ivana Vukšinić Ela Kovač Živa Urh
Nik Vidmar Molekularne superstrukture zmožne vstopati v nevrone in aktivirati nevronske receptorje https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210223110435.htm 02.04. 05.04. 08.04. Zarja Weingerl Lana Bajec Urša Zevnik
Ana Maučec Retrovirusne integracije v genom zarodnih celic prispevajo k povišani verjetnosti za razvoj raka pri gostitelju https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210226103805.htm 02.04. 05.04. 08.04. Teja Spruk Leila Bohorč Nika Ferk
Neža Peternel Prehrana lahko spremeni proces trimetilacije H3K4 v semenčicah in posledično vpliva na izražanje fenotipa pri potomcih https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210316132129.htm 02.04. 05.04. 08.04. Magdalena Ilievska Špela Rapuš Nataša Vujović
Zoran Džon Ivanić Reprogramiranje za povrnitev mladostne epigenetske informacije in vida https://www.sciencedaily.com/releases/2020/12/201202114531.htm 02.04. 05.04. 08.04. Metka Rus Pavletič Primož Šenica Thaler Nuša Kos
Pia Mencin Povečana afiniteta hemoglobina do kisika ter okrepljen Bohrov učinek sta posledica prilagoditve pingvinov na vodno okolje https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210323103854.htm 02.04. 05.04. 08.04. Pia Sotlar Ivana Vukšinić Ela Kovač
Marko Kovačić Neselektivna avtofagija pospeši prilagajanje kvasovk Saccharomyces cerevisiae na aerobno dihanje v nefermentacijskem mediju https://www.sciencedaily.com/releases/2020/12/201210112157.htm 09.04. 12.04. 15.04. Nik Vidmar Zarja Weingerl Lana Bajec
Karidia Kolbl Mutacija na genu RORB pri zajčji vrsti "sauteur d'alfort" povzroča okvaro v gibanju https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210325150205.htm 09.04. 12.04. 15.04. Ana Maučec Teja Spruk Leila Bohorč
Klara Razboršek Kako molekularni šaperoni Hsp70 razgrajujejo proteinske agregate, povezane s Parkinsonovo boleznijo https://www.sciencedaily.com/releases/2020/11/201111122815.htm 09.04. 12.04. 15.04. Neža Peternel Magdalena Ilievska Sara Borišek
Katja Resnik Molekularna povezava med tveganjem za kolorektalni rak in Neu5Gc ter njegovimi serumskimi protitelesi https://www.sciencedaily.com/releases/2020/10/201022151749.htm 09.04. 12.04. 15.04. Zoran Džon Ivanić Metka Rus Pavletič Primož Šenica
Simona Kocheva Kako bakterije se upirajo antibiotikem https://www.sciencedaily.com/releases/2021/01/210130092739.htm 09.04. 12.04. 15.04. Pia Mencin Pia Sotlar Ivana Vukšinić
Miha Razdevšek Epigenetske spremembe povezane z Alzheimerjevo boleznijo https://www.sciencedaily.com/releases/2020/09/200928152907.htm 16.04. 19.04. 22.04. Marko Kovačić Nik Vidmar Zarja Weingerl
Janja Bohte Visokoločljivostno kvantitativno profiliranje številčnosti in modificiranosti tRNA z mim-tRNAseq https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210226140455.htm 16.04. 19.04. 22.04. Karidia Kolbl Ana Maučec Teja Spruk
Tea Amidović Mozaicizem in obsežne mutacije človeške placente https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210310122521.htm 16.04. 19.04. 22.04. Klara Razboršek Neža Peternel Magdalena Ilievska
Patricija Kolander Jedrni kompleks DICER - circRNA povzroči deregulacijo mikro-RNA v celicah glioblastoma https://www.sciencedaily.com/releases/2021/01/210108131103.htm 16.04. 19.04. 22.04. Katja Resnik Zoran Džon Ivanić Metka Rus
Lev Jošt Znanstveniki si predstavljajo strukturo ključnega encima, ki tvori trigliceride https://www.sciencedaily.com/releases/2020/03/200311082935.htm 16.04. 19.04. 22.04. Simona Kocheva Pia Mencin Pia Sotlar
Tina Zajec Epigenetski regulator HP1a usmerja de novo prostorsko reorganizacijo genoma v zgodnjem embriu Drosophile https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210415114120.htm 30.04. 03.05. 06.05. Miha Razdevšek Marko Kovačić Nik Vidmar
Tina Urh Depolimerizacija kompostabilne plastike z nano-disperziranimi encimi https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210421124624.htm 30.04. 03.05. 06.05. Janja Bohte Karidia Kolbl Ana Maučec
Žan Žnidar Prisotnost sekvenc genoma mišjih virusov v ksenotransplantatih, pridobljenih iz pacienta https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210401123902.htm 30.04. 03.05. 06.05. Tea Amidović Klara Razboršek Neža Peternel
Boštjan Kramberger Načrtovanje poti zvitja modularnih proteinov na osnovi ovitih vijačnic https://www.nature.com/articles/s41467-021-21185-5?fbclid=IwAR2jbjZ3amUYlXu2j8l94OQTS7ram6kTx9ZRekmN6ncmNCUyjsRuV3DF0mk 30.04. 03.05. 06.05. Patricija Kolander Katja Resnik Zoran Džon Ivanić
Nuša Brdnik Prostorsko omrežje ogrodnih proteinov v kamniti korali https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210408131455.htm 30.04. 03.05. 06.05. Lev Jošt Simona Kocheva Pia Mencin
Ema Kavčič Sinteza hondroitin sulfata v E. coli https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210302075412.htm 07.05. 10.05. 13.05. Tina Zajec Miha Razdevšek Marko Kovačić
Urša Štefan Utišanje retrotranspozonov LINE-1 kot karakteristika akutne mieloične levkemije https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210408153644.htm 07.05. 10.05. 13.05. Tina Urh Janja Bohte Karidia Kolbl
Maj Priveršek https://www.sciencedaily.com/releases/2021/02/210218141716.htm 07.05. 10.05. 13.05. Žan Žnidar Tea Amidović Klara Razboršek
Klara Kolenc 07.05. 10.05. 13.05. Boštjan Kramberger Patricija Kolander Katja Resnik
Gaja Starc Uporaba genetsko-epigenetskega tkivnega kartiranja plazemske DNA pri prenatalnih testiranjih, presaditvah in v onkologiji https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210323150723.htm 07.05. 10.05. 13.05. Nuša Brdnik Lev Jošt Simona Kocheva
Mark Loborec 14.05. 17.05. 20.05. Ema Kavčič Tina Zajec Miha Razdevšek
Vanja Ivošević 14.05. 17.05. 20.05. Urša Štefan Tina Urh Janja Bohte
Petja Premrl https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210414131945.htm 14.05. 17.05. 20.05. Maj Priveršek Žan Žnidar Tea Amidović
David Valte 14.05. 17.05. 20.05. Klara Kolenc Boštjan Kramberger Patricija Kolander
Sofija Stevanović Delovanje in usoda konvencionalnih dendritičnih celic tipa 1 je pod nadzorom DC-SCRIPT proteina https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210402141745.htm 14.05. 17.05. 20.05. Gaja Starc Nuša Brdnik Lev Jošt
Klara Ažbe Kako bakterije Streptococcus pyogenes s pomočjo razgradnje arginina preživijo na koži https://www.sciencedaily.com/releases/2021/03/210331143115.htm 21.05. 24.05. 27.05. Mark Loborec Ema Kavčič Tina Zajec
Mia Kobal https://www.sciencedaily.com/releases/2021/04/210430093215.htm 21.05. 24.05. 27.05. Vanja Ivošević Urša Štefan Tina Urh
Andraž Rotar Ustvarjanje in karakterizacija dvoencimskega sistema za depolimerizacijo plastike https://www.sciencedaily.com/releases/2020/09/200928152913.htm 21.05. 24.05. 27.05. Petja Premrl Maj Priveršek Žan Žnidar
Ela Kovač Veganska prehrana pri otrocih preoblikuje metabolizem in vpliva na zmanjšan nivo esencialnih hranil https://www.sciencedaily.com/releases/2021/01/210121132300.htm 21.05. 24.05. 27.05. Sara Borišek Špela Rapuš Tinkara Butara