Wiki FKKT - User contributions [en]

Transkripcijski faktorji

2010-12-14T20:49:28Z

Andreja.p: /* Zunanje povezave */

'''Transkripcijski faktor''' je [[beljakovina]], ki je potrebna za pričetek [[transkripcija|transkripcije]] (prepisovanja), vendar ni del polimeraznega kompleksa. Veže razpoznavni element [[DNK]]. Preko protein-protein interakcij sodeluje z drugimi transkripcijskimi faktorji, s [[s transkripcijo povezani faktor|transkripcijo povezanimi faktorji (TAFi)]] ali z [[RNK-polimeraza|RNK-polimerazo]]. Ločimo dva splošna tipa transkripcijskih faktorjev:
* bazalne transkripcijske faktorje ter
* faktorje, ki kontrolirajo izražanje posameznih [[gen]]ov in so zato odgovorni za uravnavanje genske ekspresije.

Transkripcijski faktorji so potrebni za pričetek prepisovanja z določenega [[promotor]]ja ali niza [[promotor]]jev. Sestavljeni so iz več funkcionalnih domen.

Najbolje preučevani transkripcijski faktorji so transkripcijski aktivatorji. Le-ti se vežejo na regulatorna [[DNK]]-zaporedja in stimulirajo prepisovanje. Na splošno naj bi bili ti faktorji sestavljeni iz dveh domen; ena regija proteina se specifično veže na DNK, druga pa aktivira transkripcijo z interakcijo ostalih komponent [[transkripcijske mašinerije]]. Osnovna funkcija DNK vezavne domene je »zasidranje« transkripcijskih faktorjev na pravilno mesto DNK; aktivacijska domena nato neodvisno stimulira transkripcijo s povezovanjem ostalih proteinov.
Mnogo DNK vezavnih domen teh proteinov je sorodnih. Domene, imenovane [[cinkov prst]], vsebujejo ponovitve [[cistein]]skih in [[histidin]]skih ostankov, ki vežejo [[cink]]ove ione in se pri tem zvijejo v »zankasto« strukturo (»prst«), ki veže DNK. Te domene so odkrili pri [[TFIIIA]] in [[Sp1]]. Te aktivacijske domene naj bi uravnavale transkripcijo tako, da interagirajo z bazalnimi transkripcijskimi faktorji (npr. [[TFIIB]] ali [[TFIID]]). Tako naj bi omogočili združitev transkripcijskega kompleksa na promotor [http://AtlasGeneticsOncology.org/Educ/TFactorsEng.html 1]

== Viri ==
http://en.wikipedia.org/wiki/Transcription_factor

http://atlasgeneticsoncology.org/Deep/TranscripFactorsID20043.html

http://www.iscid.org/encyclopedia/Transcription_Factor

== Zunanje povezave ==
http://atlasgeneticsoncology.org/Educ/TFactorsEng.html

http://biotech.about.com/od/proteinengineering/f/transcriptfact.htm

http://www.scientificamerican.com/blog/post.cfm?id=transcription-factors-boost-genetic-2010-03-18

[[Category:LEX]]

Transkripcijski faktorji

2010-12-14T20:49:13Z

Andreja.p: /* Viri */

'''Transkripcijski faktor''' je [[beljakovina]], ki je potrebna za pričetek [[transkripcija|transkripcije]] (prepisovanja), vendar ni del polimeraznega kompleksa. Veže razpoznavni element [[DNK]]. Preko protein-protein interakcij sodeluje z drugimi transkripcijskimi faktorji, s [[s transkripcijo povezani faktor|transkripcijo povezanimi faktorji (TAFi)]] ali z [[RNK-polimeraza|RNK-polimerazo]]. Ločimo dva splošna tipa transkripcijskih faktorjev:
* bazalne transkripcijske faktorje ter
* faktorje, ki kontrolirajo izražanje posameznih [[gen]]ov in so zato odgovorni za uravnavanje genske ekspresije.

Transkripcijski faktorji so potrebni za pričetek prepisovanja z določenega [[promotor]]ja ali niza [[promotor]]jev. Sestavljeni so iz več funkcionalnih domen.

Najbolje preučevani transkripcijski faktorji so transkripcijski aktivatorji. Le-ti se vežejo na regulatorna [[DNK]]-zaporedja in stimulirajo prepisovanje. Na splošno naj bi bili ti faktorji sestavljeni iz dveh domen; ena regija proteina se specifično veže na DNK, druga pa aktivira transkripcijo z interakcijo ostalih komponent [[transkripcijske mašinerije]]. Osnovna funkcija DNK vezavne domene je »zasidranje« transkripcijskih faktorjev na pravilno mesto DNK; aktivacijska domena nato neodvisno stimulira transkripcijo s povezovanjem ostalih proteinov.
Mnogo DNK vezavnih domen teh proteinov je sorodnih. Domene, imenovane [[cinkov prst]], vsebujejo ponovitve [[cistein]]skih in [[histidin]]skih ostankov, ki vežejo [[cink]]ove ione in se pri tem zvijejo v »zankasto« strukturo (»prst«), ki veže DNK. Te domene so odkrili pri [[TFIIIA]] in [[Sp1]]. Te aktivacijske domene naj bi uravnavale transkripcijo tako, da interagirajo z bazalnimi transkripcijskimi faktorji (npr. [[TFIIB]] ali [[TFIID]]). Tako naj bi omogočili združitev transkripcijskega kompleksa na promotor [http://AtlasGeneticsOncology.org/Educ/TFactorsEng.html 1]

== Viri ==
http://en.wikipedia.org/wiki/Transcription_factor

http://atlasgeneticsoncology.org/Deep/TranscripFactorsID20043.html

http://www.iscid.org/encyclopedia/Transcription_Factor

== Zunanje povezave ==
http://atlasgeneticsoncology.org/Educ/TFactorsEng.html
http://biotech.about.com/od/proteinengineering/f/transcriptfact.htm
http://www.scientificamerican.com/blog/post.cfm?id=transcription-factors-boost-genetic-2010-03-18

[[Category:LEX]]

Transkripcijski faktorji

2010-12-14T20:46:48Z

Andreja.p: New page: '''Transkripcijski faktor''' je beljakovina, ki je potrebna za pričetek transkripcije (prepisovanja), vendar ni del polimeraznega kompleksa. Veže razpoznavni elemen...

'''Transkripcijski faktor''' je [[beljakovina]], ki je potrebna za pričetek [[transkripcija|transkripcije]] (prepisovanja), vendar ni del polimeraznega kompleksa. Veže razpoznavni element [[DNK]]. Preko protein-protein interakcij sodeluje z drugimi transkripcijskimi faktorji, s [[s transkripcijo povezani faktor|transkripcijo povezanimi faktorji (TAFi)]] ali z [[RNK-polimeraza|RNK-polimerazo]]. Ločimo dva splošna tipa transkripcijskih faktorjev:
* bazalne transkripcijske faktorje ter
* faktorje, ki kontrolirajo izražanje posameznih [[gen]]ov in so zato odgovorni za uravnavanje genske ekspresije.

Transkripcijski faktorji so potrebni za pričetek prepisovanja z določenega [[promotor]]ja ali niza [[promotor]]jev. Sestavljeni so iz več funkcionalnih domen.

Najbolje preučevani transkripcijski faktorji so transkripcijski aktivatorji. Le-ti se vežejo na regulatorna [[DNK]]-zaporedja in stimulirajo prepisovanje. Na splošno naj bi bili ti faktorji sestavljeni iz dveh domen; ena regija proteina se specifično veže na DNK, druga pa aktivira transkripcijo z interakcijo ostalih komponent [[transkripcijske mašinerije]]. Osnovna funkcija DNK vezavne domene je »zasidranje« transkripcijskih faktorjev na pravilno mesto DNK; aktivacijska domena nato neodvisno stimulira transkripcijo s povezovanjem ostalih proteinov.
Mnogo DNK vezavnih domen teh proteinov je sorodnih. Domene, imenovane [[cinkov prst]], vsebujejo ponovitve [[cistein]]skih in [[histidin]]skih ostankov, ki vežejo [[cink]]ove ione in se pri tem zvijejo v »zankasto« strukturo (»prst«), ki veže DNK. Te domene so odkrili pri [[TFIIIA]] in [[Sp1]]. Te aktivacijske domene naj bi uravnavale transkripcijo tako, da interagirajo z bazalnimi transkripcijskimi faktorji (npr. [[TFIIB]] ali [[TFIID]]). Tako naj bi omogočili združitev transkripcijskega kompleksa na promotor [http://AtlasGeneticsOncology.org/Educ/TFactorsEng.html 1]

== Viri ==
http://en.wikipedia.org/wiki/Transcription_factor
http://atlasgeneticsoncology.org/Deep/TranscripFactorsID20043.html
http://www.iscid.org/encyclopedia/Transcription_Factor

== Zunanje povezave ==
http://atlasgeneticsoncology.org/Educ/TFactorsEng.html
http://biotech.about.com/od/proteinengineering/f/transcriptfact.htm
http://www.scientificamerican.com/blog/post.cfm?id=transcription-factors-boost-genetic-2010-03-18

[[Category:LEX]]