Wiki FKKT - User contributions [en]

Seminarji SB 2024/25

2025-05-18T21:17:12Z

Bine Brunec:

V študijskem letu 2024/25 študenti in študentke pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme:

RAZISKOVALNI ČLANKI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do izhodiščnega članka na spletu.) <br>
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inženiring_umetnih_medvrstnih_promotorjev_z_različnimi_transkripcijskimi_močmi Inženiring umetnih medvrstnih promotorjev z različnimi transkripcijskimi močmi] (Miljan Trajković)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Preprečevanje_nastanka_multimerov_pogosto_uporabljenih_plazmidov_v_sintezni_biologiji Preprečevanje nastanka multimerov pogosto uporabljenih plazmidov v sintezni biologiji] (Lev Jošt)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Priprava_Nicotiane_benthamiane_za_proizvodnjo_krisoeriola_z_uporabo_tehnik_sintezne_biologije Priprava ''Nicotiane benthamiane'' za proizvodnjo krisoeriola z uporabo tehnik sintezne biologije] (Nika Frelih)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_spremenjeni_receptorji_za_komunikacijo_med_celicami_preko_topnih_signalov_in_zaznavanje_bolezni Gensko spremenjeni receptorji za komunikacijo med celicami preko topnih signalov in zaznavanje bolezni] (Zara Bunc)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nadzor_nad_izražanjem_heterolognih_genov_pri_Bdellovibrio_bacteriovorus_z_uporabo_sintezne_biologije Nadzor nad izražanjem heterolognih genov pri Bdellovibrio bacteriovorus z uporabo sintezne biologije] (Živa Flego)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Uporaba_konzorcija_kvasovk_za_de_novo_biosintezo_rastlinskih_lignanov Uporaba konzorcija kvasovk za de novo biosintezo rastlinskih lignanov] (Urša Lah)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sonogenetsko_nadzorovane_gensko_spremenjene_celice_za_zdravljenje_raka_v_mišjih_tumorskih_modelih Sonogenetsko nadzorovane gensko spremenjene celice za zdravljenje raka v mišjih tumorskih modelih] (Pia Mencin)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Združitev_difuzijskega_modela_in_transformerja_za_sintezo_izboljšanih_promotorjev_ter_napoved_moči_sintetičnih_promotorjev_z_uporabo_globokega_učenja Združitev difuzijskega modela in transformerja za sintezo izboljšanih promotorjev ter napoved moči sintetičnih promotorjev z uporabo globokega učenja] (Tinkara Korošec)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Z_dvojno_svetlobo_nadzirani_kokulturni_sistem_omogoča_uravnavanje_sestave_populacije Z dvojno svetlobo nadzirani sistem omogoča uravnavanje sestave populacije] (Ula Mikoš)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Načrtovanje_močnih_inducibilnih_sinteznih_promotorjev_v_kvasovkah Načrtovanje močnih inducibilnih sinteznih promotorjev v kvasovkah] (Bor Kunstelj)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolni_inženiring_E._coli_za_izboljšano_produkcijo_diolov_iz_acetata Metabolni inženiring ''E. coli'' za izboljšano produkcijo diolov iz acetata] (Teo Trost)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inkorporacija_fotosintetsko_aktivnih_kloroplastov_iz_alg_v_kultivirane_celice_sesalcev_kot_pot_k_fotosintezi_pri_Živalih Inkorporacija fotosintetsko aktivnih kloroplastov iz alg v kultivirane celice sesalcev kot pot k fotosintezi pri živalih] (Peter Gričar Vintar)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Izgradnja_metabolične_poti_za_biosintezo_treonina_iz_etilen_glikola Izgradnja metabolične poti za biosintezo treonina iz etilen glikola] (Tinkara Butara)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Povezava_sintezne_in_sistemske_biologije_za_in_vivo_encimatiko Povezava sintezne in sistemske biologije za ''in vivo'' encimatiko] (Gaja Starc)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nanotelo_proti_Pdc1p_kot_gensko_kodiran_inhibitor_proizvodnje_etanola_omogoča_dvojni_transkripcijski_in_posttranslacijski_nadzor_fermentacije_v_kvasovkah Nanotelo proti Pdc1p kot gensko kodiran inhibitor proizvodnje etanola omogoča dvojni transkripcijski in posttranslacijski nadzor fermentacije v kvasovkah] (Lara Zupanc)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/S_fazno_separacijo_posredovano_sestavljanje_ve%C4%8Dencimskih_kompleksov_in_vivo S fazno separacijo posredovano sestavljanje večencimskih kompleksov ''in vivo''] (Lana Kores)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetna_nevronska_mreža_na_proteinski_ravni_v_sesalskih_celicah Umetna nevronska mreža na proteinski ravni v sesalskih celicah] (Gal Kastelic)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Molekularni_inženiring_funkcionalnih_siRNA Molekularni inženiring funkcionalnih siRNA] (Nataša Vujović)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Uporaba_sintezne_virologije_za_hitro_inženirstvo_virusa_vezikularnega_stomatitisa_VSV Uporaba sintezne virologije za hitro inženirstvo virusa vezikularnega stomatitisa (VSV)] (Bine Brunec)
NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/SynPlode SynPlode] (Leila Bohorč)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/PETal:_izdelovanje_eteričnega_olja_sandalovine_iz_PET_plastike PETal: izdelovanje eteričnega olja sandalovine iz PET plastike] (Lara Krampač)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/PET_TWINS:_Praktična_uporaba_PETaze_za_učinkovitejše_recikliranje_plastike PET TWINS: Praktična uporaba PETaze za učinkovitejše recikliranje plastike] (Tina Urh)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CAU-China:_Nodulska_tovarna_DHA_in_EPA CAU-China: Nodulska tovarna DHA in EPA] (Luka Fink)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/nuCloud:_Nov_oblak_za_shranjevanje_podatkov_na_osnovi_nukleotidov nuCloud: Nov oblak za shranjevanje podatkov na osnovi nukleotidov] (Aleš Poljanšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nova_metoda_diagnosticiranja_multiple_skleroze_-_miRADAR Nova metoda diagnosticiranja multiple skleroze - miRADAR] (Petja Premrl)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Biostimulant_za_rast_rastlin_na_Luni_–_BioMoon Biostimulant za rast rastlin na Luni – BioMoon] (Žan Žnidar)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=CAPTURE:_Boj_proti_oku%C5%BEbam_s_Pseudomonas_aeruginosa_z_nosilci_protimikrobnih_peptidov&action=edit&redlink=1 Boj proti okužbam s Pseudomonas aeruginosa z nosilci protimikrobnih peptidov - CAPTURE] (Metka Rus)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/REPARO REPARO] (Lina Kopač)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Tarakate Tarakate] (Pia Špehar)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Heartecho:_presejalni_test_za_raka_pri_pacientih_po_miokardnem_infarktu Heartecho: presejalni test za raka pri pacientih po miokardnem infarktu] (Zarja Doberšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Synhesion Synhesion] (Janja Bohte)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Rebolutionaries Rebolutionaries] (Mia Kobal)

Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Povzetek je treba objaviti dva dni pred predstavitvijo do polnoči (za seminarje v torek torej najkasneje v ponedeljek). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo približno 5-minutna razprava.

Terminski razpored bo razviden iz preglednice na strežniku Google Drive.

Kako je videti končni seznam seminarjev, lahko preverite pri lanskem letniku: [[Seminarji_SB_2023/24]].

Uporaba sintezne virologije za hitro inženirstvo virusa vezikularnega stomatitisa VSV

2025-05-18T21:14:44Z

Bine Brunec: Created page with "Izhodiščni članek: [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39459973/Leveraging Synthetic Virology for the Rapid Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV)] == Uvod == Virus vezikularnega stomatitisa (VSV) je negativno orientiran RNA virus iz družine Rhabdoviridae. Njegov genom je dolg približno 11,1 kb in vsebuje pet genov: N (nukleoprotein), P (fosfoprotein), M (matriks protein), G (glikoprotein) in L (RNA-odvisna RNA polimeraza), znan pa je kot živalski patogen..."

Izhodiščni članek: [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39459973/Leveraging Synthetic Virology for the Rapid Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV)]

== Uvod ==
Virus vezikularnega stomatitisa (VSV) je negativno orientiran RNA virus iz družine Rhabdoviridae. Njegov genom je dolg približno 11,1 kb in vsebuje pet genov: N (nukleoprotein), P (fosfoprotein), M (matriks protein), G (glikoprotein) in L (RNA-odvisna RNA polimeraza), znan pa je kot živalski patogen in po svoji visoki infektivnosti ter hitri replikaciji. Zaradi teh lastnosti je postal pomemben modelni sistem za raziskave virusne biologije in razvoj cepiv, terapij proti raku ter protivirusnih sredstev. VSV je bil uspešno uporabljen pri razvoju cepiv proti eboli, HIV-u, SARS-CoV-2 in drugim boleznim, pogosto tudi v obliki t.i. psevdotipiziranih virusov, kjer se naravni glikoprotein nadomesti s tujim [1,2].
Kljub temu je klasično gensko inženirstvo VSV še vedno zamudno in kompleksno, saj temelji na restrikcijskih encimih, rekombinaciji in počasnem testiranju. Tudi naprednejše metode, kot je CRISPR, imajo svoje pomanjkljivosti, kot so nespecifični učinki in nizka učinkovitost pri večkratnih spremembah. Sintezna virologija predstavlja rešitev teh izzivov, saj omogoča načrtovanje in sintezo celotnih virusnih genomov de novo. Ta pristop, ki se je začel z umetno sintezo poliovirusa leta 2002, omogoča izdelavo novih ali prilagojenih virusov za raziskave, terapije in cepiva. V tej raziskavi avtorji predstavijo tehnični preboj – metodološki okvir, ki združuje računalniško podprto načrtovanje z učinkovito sintezo in sestavo genoma VSV. Rezultat je hitra, prilagodljiva in stroškovno učinkovita platforma za ustvarjanje funkcionalnih, replikacijsko sposobnih virusov, ki omogoča nove možnosti v biomedicinskih aplikacijah [1].
Inženirska platforma pa deluje tako, da se najprej sintetizirajo fragmenti, nato pa se DNA sestavi v celoten plazmid. Ta se transformira v bakterije, pomnoži in prečisti. Plazmidi z virusnim genomom se potrdijo s kolonijsko PCR in sekvenciranjem celotnega plazmida. Ti genomski plazmidi VSV se transficirajo v celice 293T, okužene s cepitvenim virusom T7, skupaj s podpornimi plazmidi, ki izražajo beljakovine VSV N, P in L. Virus se obnovi, validira in po potrebi razširi za povečanje titra [1].

== Sestava in validacija sintetičnega genoma VSV (synVSV) ==
V raziskavi no najprej pridobili plazmide VSV (Indiana sev) in pomožne plazmide (pBS-N, -P, -G in -L), potrebne za virusno reševanje. Za proizvodnjo T7 polimeraze so uporabili vakcinijski virus. Sekvenco genoma VSV so potrdili s sekvenciranjem, nato pa z uporabo programske opreme BioCAD digitalno razdelili genom na štiri sintezne fragmente F1-F4, z vključenimi 30-baznimi prekritji za natančno sestavljanje brez stranskih produktov [1].
Ta modularni pristop omogoča tudi kasnejšo zamenjavo posameznih segmentov brez potrebe po celotni rekonstrukciji. Zasnovali so tudi različici virusa z vstavljenim glikoproteinom virusa Sindbis (VSV-SIN) in s preurejenim zaporedjem genov (VSV-M2P3) [1].
Sintezo DNA so izvedli preko podjetja Twist Bioscience. Fragmenti (dolžine 0,3–7 kb) so bili kvantificirani z Nanodropom in preverjeni z gelsko elektroforezo. Nato so jih sestavili z uporabo metode HiFi DNA Assembly. Po sestavi so transformirali E. coli bakterije, izbrali kolonije in izvedli colony PCR za preverjanje prisotnosti gena VSV-G (~1,5 kb). Vse kolonije so bile pozitivne, katere so nato uporabili za pripravo plazmidne DNA (miniprep), ki je bila ponovno sekvencirana za potrditev celovitosti. Rezultati sekvenciranja pa so pokazali 100% ujemanje z referenčnim genom, kar je potrdilo uspešno sintezo celotnega VSV genoma de novo [1].

== Reševanje in karakterizacija sintetične VSV ==
Za testiranje funkcionalnosti so uporabili celične linije 293T, BHK-21, Vero, HepG2 in HepaRG. Po transfekciji 293T celic z genomom VSV in podporno ekspresijo potrebnih proteinov, je sledilo reševanje virusa, to je proces, s katerim iz umetno vnesenega virusnega genoma v celici nastane funkcionalen in infektiven virus. Po pojavu citopatskih efektov (CPE) so virusni supernatant filtrirali, shranili in uporabili za nadaljnje teste. Citopatske učinke in popolno lizo celic so po 48 urah opazili le pri 75 % primerov [1].
Za potrditev prisotnosti in kvantifikacijo virusa so izvedli kvantitativni real-time reverzno transkripcijski PCR (RT-qPCR) z uporabo specifičnih primerjev za gen VSV-M. Ekstrahirano RNA iz supernatanta so reverzno transkribirali in analizirali z metodo SYBR Green qPCR [1].
Za določitev infektivnosti virusa so izvedli Tissue culture infectious does 50 (TCID₅₀) test na 293T celicah. Titri virusa so bili visoki tako v 293T kot tudi v HepG2 celičnih linijah, kar kaže na visoko učinkovitost replikacije. Serijske razredčitve virusa so inkubirali 72 ur, opazovali pojav CPE in jih dodatno potrdili z imunocitokemijo (ICC) z uporabo protiteles proti VSV in fluorescenčno označenega sekundarnega protitelesa. Za spremljanje kinetike infekcije in celične konfluence v realnem času so uporabili Incucyte sistem za živo-celično slikanje. Merili so delež pokritosti površine z živimi celicami in analizirali spremembe skozi čas [1].
Primerjava z naravnim VSV (wildtype) na Hep3B celicah z uporabo sistema IncuCyte je pokazala, da ima synVSV hitrejši pojav citopatskih učinkov in upad konfluence celic. Možni vzroki vključujejo višjo homogenost začetne virusne populacije in večjo genomsko stabilnost sintetičnega virusa. To kaže, da sintezni pristopi lahko vodijo do virusov z izboljšanimi kinetičnimi lastnostmi [1].

== Inženirstvo tujih glikoproteinov: VSV-Sindbis (VSV-ΔG SIN-E3/E2/6K/E1) ==
Ko so dokazali koncept s synVSV, so želeli platformo dodatno potrditi in ugotoviti kako jo je mogoče uporabiti za hitro konstrukcijo novih VSV. Zato so razvili rekombinantni VSV z glikoproteinom virusa Sindbis. Virus je bil uspešno sestavljen, potrjen in rešen [1].
Infektivnost so testirali na HepaRG (zdrave) in HepG2 (rakave) jetrne celice. Rezultati so pokazali zelo nizko infekcijo v HepRG tudi pri visokem razmerju med številom virusnih delcev in številom tarčnih celic (angl. multiplicity of infection - MOI), ter zelo visoko infekcijo v HepG2 in sicer kar 80 % celic je bilo inficiranih že pri MOI 0,1 [1].
To potrjuje specifično afiniteto virusa za rakave celice (zaradi izražanja lamininskega receptorja – LAMR), kar nakazuje potencial za onkolitično terapijo jeter. Uspešna konstrukcija potrjuje fleksibilnost platforme za raziskovanje tujih glikoproteinov [1].

== Ocena virusa VSV s spremembo genov z uporabo platforme za sintetično virologijo ==
Raziskali so tudi vpliv spremembe vrstnega reda genov na virusno učinkovitost. Tipičen vrstni red genov pri VSV je 3′-N-P-M-G-L-5′. V tej študiji pa so zamenjali gena M in P [1].
Po zasnovi in sintezi zamenjanega fragmenta je bil virus uspešno rešen. Testi na celicah 293T (produkcijske celice) in Hep3B (rakave jetrne celice) so pokazali Primerljivo delovanje pri visokih MOI ter zmanjšano učinkovitost pri nizkih MOI, kar kaže na upočasnjeno replikacijo preurejenega virusa. S tem so dokazali, da spremembe v zaporedju genov lahko oslabijo virus [1].

== Zaključek ==
V tej študiji so avtorji predstavili de novo pristop za sestavo virusa VSV, ki pomeni pomemben tehnični napredek glede hitrosti, prilagodljivosti in učinkovitosti pri ustvarjanju VSV-vektorjev. Medtem ko so modularna sestava DNA in reverzna genetika dobro uveljavljene pri pozitivno orientiranih RNA virusih (npr. SARS-CoV-2), so tovrstne metode redko uporabljene pri negativno orientiranih virusih, kot je VSV. V raziskavi so izpostavili tudi ključne prednosti sintezne virologije in sicer, da ni potrebe po obstoječem plazmidu, saj se virusi lahko načrtujejo in sestavijo zgolj na podlagi digitalne sekvence. Pri sintezni virologiji imamo tudi popoln nadzor nad genetsko zasnovo, ki omogoča natančne mutacije, bolj čisto sestavo in daljše sekvence brez PCR napak, ter manj napak v splošnem kontekstu v primerjavi s tradicionalnimi metodami, saj je manj možnosti za kontaminacijo ali delne produkte. Kljub vsem prednostim pa ima ta sintezni pristop tudi razne omejitve kot je predvsem odvisnost od točne referenčne sekvence, saj se tudi v javnih bazah podatkov lahko pojavijo določene napake, enako kot se jim je v tem poskusu, saj so ugotovili 14 nukleotidnih razlik, ki so vplivale na več virusnih genov. Vendar kljub tem izzivom pa ta platforma omogoča hitro spreminjanje genomov in tako imajo raziskovalci orodje za razvoj novih cepiv, terapevtskih vektorjev ter onkolitičnih virusov in tako predstavlja sintezna virologija izjemen potencial za pospešitev razvoja novih biomedicinskih rešitev.

== Literatura ==
[1] Moles CM, Basu R, Weijmarshausen P, Ho B, Farhat M, Flaat T, Smith BF. Leveraging Synthetic Virology for the Rapid Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV). Viruses 2024;16(10):1641. https://doi.org/10.3390/v16101641

[2] Liu G, Cao W, Salawudeen A, Zhu W, Emeterio K, Safronetz D, Banadyga L. Vesicular Stomatitis Virus: From Agricultural Pathogen to Vaccine Vector. Pathogens. 2021;10(9):1092. https://doi.org/10.3390/pathogens10091092

Seminarji SB 2024/25

2025-05-18T20:59:47Z

Bine Brunec:

V študijskem letu 2024/25 študenti in študentke pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme:

RAZISKOVALNI ČLANKI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do izhodiščnega članka na spletu.) <br>
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inženiring_umetnih_medvrstnih_promotorjev_z_različnimi_transkripcijskimi_močmi Inženiring umetnih medvrstnih promotorjev z različnimi transkripcijskimi močmi] (Miljan Trajković)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Preprečevanje_nastanka_multimerov_pogosto_uporabljenih_plazmidov_v_sintezni_biologiji Preprečevanje nastanka multimerov pogosto uporabljenih plazmidov v sintezni biologiji] (Lev Jošt)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Priprava_Nicotiane_benthamiane_za_proizvodnjo_krisoeriola_z_uporabo_tehnik_sintezne_biologije Priprava ''Nicotiane benthamiane'' za proizvodnjo krisoeriola z uporabo tehnik sintezne biologije] (Nika Frelih)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_spremenjeni_receptorji_za_komunikacijo_med_celicami_preko_topnih_signalov_in_zaznavanje_bolezni Gensko spremenjeni receptorji za komunikacijo med celicami preko topnih signalov in zaznavanje bolezni] (Zara Bunc)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nadzor_nad_izražanjem_heterolognih_genov_pri_Bdellovibrio_bacteriovorus_z_uporabo_sintezne_biologije Nadzor nad izražanjem heterolognih genov pri Bdellovibrio bacteriovorus z uporabo sintezne biologije] (Živa Flego)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Uporaba_konzorcija_kvasovk_za_de_novo_biosintezo_rastlinskih_lignanov Uporaba konzorcija kvasovk za de novo biosintezo rastlinskih lignanov] (Urša Lah)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sonogenetsko_nadzorovane_gensko_spremenjene_celice_za_zdravljenje_raka_v_mišjih_tumorskih_modelih Sonogenetsko nadzorovane gensko spremenjene celice za zdravljenje raka v mišjih tumorskih modelih] (Pia Mencin)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Združitev_difuzijskega_modela_in_transformerja_za_sintezo_izboljšanih_promotorjev_ter_napoved_moči_sintetičnih_promotorjev_z_uporabo_globokega_učenja Združitev difuzijskega modela in transformerja za sintezo izboljšanih promotorjev ter napoved moči sintetičnih promotorjev z uporabo globokega učenja] (Tinkara Korošec)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Z_dvojno_svetlobo_nadzirani_kokulturni_sistem_omogoča_uravnavanje_sestave_populacije Z dvojno svetlobo nadzirani sistem omogoča uravnavanje sestave populacije] (Ula Mikoš)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Načrtovanje_močnih_inducibilnih_sinteznih_promotorjev_v_kvasovkah Načrtovanje močnih inducibilnih sinteznih promotorjev v kvasovkah] (Bor Kunstelj)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolni_inženiring_E._coli_za_izboljšano_produkcijo_diolov_iz_acetata Metabolni inženiring ''E. coli'' za izboljšano produkcijo diolov iz acetata] (Teo Trost)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inkorporacija_fotosintetsko_aktivnih_kloroplastov_iz_alg_v_kultivirane_celice_sesalcev_kot_pot_k_fotosintezi_pri_Živalih Inkorporacija fotosintetsko aktivnih kloroplastov iz alg v kultivirane celice sesalcev kot pot k fotosintezi pri živalih] (Peter Gričar Vintar)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Izgradnja_metabolične_poti_za_biosintezo_treonina_iz_etilen_glikola Izgradnja metabolične poti za biosintezo treonina iz etilen glikola] (Tinkara Butara)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Povezava_sintezne_in_sistemske_biologije_za_in_vivo_encimatiko Povezava sintezne in sistemske biologije za ''in vivo'' encimatiko] (Gaja Starc)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nanotelo_proti_Pdc1p_kot_gensko_kodiran_inhibitor_proizvodnje_etanola_omogoča_dvojni_transkripcijski_in_posttranslacijski_nadzor_fermentacije_v_kvasovkah Nanotelo proti Pdc1p kot gensko kodiran inhibitor proizvodnje etanola omogoča dvojni transkripcijski in posttranslacijski nadzor fermentacije v kvasovkah] (Lara Zupanc)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/S_fazno_separacijo_posredovano_sestavljanje_ve%C4%8Dencimskih_kompleksov_in_vivo S fazno separacijo posredovano sestavljanje večencimskih kompleksov ''in vivo''] (Lana Kores)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetna_nevronska_mreža_na_proteinski_ravni_v_sesalskih_celicah Umetna nevronska mreža na proteinski ravni v sesalskih celicah] (Gal Kastelic)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Molekularni_inženiring_funkcionalnih_siRNA Molekularni inženiring funkcionalnih siRNA] (Nataša Vujović)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Uporaba_sintezne_virologije_za_hitro_inženirstvo_virusa_vezikularnega_stomatitisa_VSV] (Bine Brunec)
NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/SynPlode SynPlode] (Leila Bohorč)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/PETal:_izdelovanje_eteričnega_olja_sandalovine_iz_PET_plastike PETal: izdelovanje eteričnega olja sandalovine iz PET plastike] (Lara Krampač)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/PET_TWINS:_Praktična_uporaba_PETaze_za_učinkovitejše_recikliranje_plastike PET TWINS: Praktična uporaba PETaze za učinkovitejše recikliranje plastike] (Tina Urh)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CAU-China:_Nodulska_tovarna_DHA_in_EPA CAU-China: Nodulska tovarna DHA in EPA] (Luka Fink)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/nuCloud:_Nov_oblak_za_shranjevanje_podatkov_na_osnovi_nukleotidov nuCloud: Nov oblak za shranjevanje podatkov na osnovi nukleotidov] (Aleš Poljanšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nova_metoda_diagnosticiranja_multiple_skleroze_-_miRADAR Nova metoda diagnosticiranja multiple skleroze - miRADAR] (Petja Premrl)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Biostimulant_za_rast_rastlin_na_Luni_–_BioMoon Biostimulant za rast rastlin na Luni – BioMoon] (Žan Žnidar)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=CAPTURE:_Boj_proti_oku%C5%BEbam_s_Pseudomonas_aeruginosa_z_nosilci_protimikrobnih_peptidov&action=edit&redlink=1 Boj proti okužbam s Pseudomonas aeruginosa z nosilci protimikrobnih peptidov - CAPTURE] (Metka Rus)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/REPARO REPARO] (Lina Kopač)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Tarakate Tarakate] (Pia Špehar)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Heartecho:_presejalni_test_za_raka_pri_pacientih_po_miokardnem_infarktu Heartecho: presejalni test za raka pri pacientih po miokardnem infarktu] (Zarja Doberšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Synhesion Synhesion] (Janja Bohte)
# [https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Rebolutionaries Rebolutionaries] (Mia Kobal)

Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Povzetek je treba objaviti dva dni pred predstavitvijo do polnoči (za seminarje v torek torej najkasneje v ponedeljek). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo približno 5-minutna razprava.

Terminski razpored bo razviden iz preglednice na strežniku Google Drive.

Kako je videti končni seznam seminarjev, lahko preverite pri lanskem letniku: [[Seminarji_SB_2023/24]].