https://wiki.fkkt.uni-lj.si/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Da%C5%A1a+Pavc 2026-05-05T07:26:16Z User contributions MediaWiki 1.45.3 https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Kako_blizu_smo_dosegu_komercialno_dostopne_masovne_fotobiolo%C5%A1ke_proizvodnje_vodika_z_cianobakterijam:_pregled_z_biolo%C5%A1kega_vidika.&diff=10654 2015-06-08T20:33:48Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>==UVOD==<br /> Koncentracija CO2 v atmosferi se predvsem zaradi izgorevanja fosilnih goriv s časoma povečuje. Posledica povečane koncentracija CO2 je dvig temperature. Temu lahko sledijo številne neprijetne posledice, kot je topljenje ledenikov. Zato je potrebno zmanjšati izpuste CO2 v ozračje. Velik potrošnik fosilnih goriv so avtomobili. Ena izmed možnosti za bolj ekološko vožnjo so avtomobili na vodik. Ti delujejo s pomočjo gorivnih celic, ki pretvarjajo kemijsko energijo v električno. Pri tem se porabljata kisik, ki ga lahko dovajamo z zrakom in vodik. Pri procesu izhaja voda, ki je ekološko nesporna. Danes že obstajajo avtomobili na vodik, ki se lahko primerjajo z motornimi avtomobili. Eden takih je Mirai, ki so ga izdelali pri Toyoti.<br /> <br /> ==PREGLED==<br /> Pridobivanje vodika pa je do sedaj še drag proces in bi bilo potrebno poiskati nove metode proizvajanja vodika, ki bi se cenovno lahko primerjale s fosilnimi gorivi. Ena izmed možnosti so cianobakterije, ki vsebujejo encim nitrogenazo. Le-ta katalizira reakcijo fiksacije dušika. V odsotnosti dušika (v argonu) pa se vsi elektroni v reakciji porabijo za tvorbo vodika. Občutljiva je na kisik, zato mora biti ločena od prvih stopenj fotosinteze. Cianobakterije so to rešile na tri načine. Prvi način je prostorska ločitev teh dveh procesov, ki ga uporabljaja heterocistični filamentozni tip cianobakterij. Pri tem tipu cianobakterij ločimo dve vrsti celic to sta vegetativne in heterocistične. Vegetativni z reakcijami fotosinteze tvori saharide, ki se potem prenesejo v heterociste in tam služijo kot donorji elektronov. V heterocistah najdemo še encim hidroksilazo, ki pridobljen vodik z nitrogenazo uporabi naprej. Z zavrtjem gena za hidroksilazo hup se vodik v celici 7-30% akumulira. Opazili pa so, da ima pomembno vlogo pri zaščiti nitrogenaze pred kisikom zato je to potrebno uporabiti take seve, kjer je ta vpliv minimalen. <br /> V tem članku so predlagali, da bi bakterije gojili v plastičnih bioreaktorjih, ki bi plavali na morju. Razlog za izbiro je nizka cena in možnost recikliranja. V notranjem sloju bi bile cianobakterije, drugi sloj bi bil neprepusten za vodik, tretji pa bi mehanjsko ščitil celoten reaktor. Zaradi visoke cene bi uporabo argona lahko izločili z uporabo posebnih mutantov, ki fiksirajo dušik v zelo majhnih količinah v prisotnosti dušika. Vodik bi v reaktorjih zbirali več tednov do nekaj mesecev ga ločili od kisika in ga očistili med prevozom na ladjah z PSA. Metoda za ločitev kisika od vodika še ni dorečena ena izmed možnih so membrane, ki bolje prepuščajo vodik. Očiščen vodik bi bilo potrebno kondenzirati ali kemijsko pretvoriti za transport. Prednosti proizvajanje vodika z cianobakterijami so večkratna uporaba gojišča saj med rastjo cianobakterije ne potrebujejo veliko dela, hranil in energije, kulture pa, ko je sistem uzpostavljen lahko dolgotrajno proizvajajo vodik (več mesecev) brez menjave gojišča in z večkratnim odvzetjem produkta.<br /> <br /> ==ZAKLJUČKI==<br /> Potrebno je izboljšati učinkovitost pretvorbe svetlobne energije ter zmožnost proizvajanja vodika. Potrebno so raziskave v tej smeri, da bi lahko iskali izboljšave. Mnoga stališča proizvajanja vodika in z njim povezane tehnologije so še vedno v razvoju in zato je težko napovedati ceno produkcije. Sukarai v svojem članku ocenjuje na 26,4 ¢/kWh kar je dražje kot sedanja cena za elektriko, vendar pa je vrednost blizu tistih z subvencijo za obnovljive vire. Verjamejo pa da se bodo, ko bo enkrat to dejansko izvedeno pokazale možnosti za izboljšanje in da bo cena proizvajanja vodika še padla.</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Kako_blizu_smo_dosegu_komercialno_dostopne_masovne_fotobiolo%C5%A1ke_proizvodnje_vodika_z_cianobakterijam:_pregled_z_biolo%C5%A1kega_vidika.&diff=10653 2015-06-08T20:22:33Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>==UVOD==<br /> Koncentracija CO2 v atmosferi se predvsem zaradi izgorevanja fosilnih goriv s časoma povečuje. Posledica povečane koncentracija CO2 je dvig temperature. Temu lahko sledijo številne neprijetne posledice, kot je topljenje ledenikov. Zato je potrebno zmanjšati izpuste CO2 v ozračje. Velik potrošnik fosilnih goriv so avtomobili. Ena izmed možnosti za bolj ekološko vožjo so avtomobili na vodik. Ti delujejo s pomočjo gorivnih celic, ki pretvarjajo kemijsko energijo v električno. Pri tem se porabljata kisik, ki ga lahko dovajamo z zrakom in vodik. Pri procesu izhaja voda, ki je ekološko nesporna. Danes že obstajajo avtomobili na vodik, ki se lahko primerjajo z motornimi avtomobili. Eden takih je Mirai, ki so ga izdelali pri Toyoti.<br /> <br /> ==PREGLED==<br /> Pridobivanje vodika pa je do sedaj še drag proces in bi bilo potrebno poiskati nove metode proizvajanja vodika, ki bi se cenovno lahko primerjale s fosilnimi gorivi. Ena izmed možnosti so cianobakterije, ki vsebujejo encim nitrogenazo. Le-ta katalizira reakcijo fiksacije dušika. V odsotnosti dušika (v argonu) pa se vsi elektroni v reakciji porabijo za tvorbo vodika. Občitljiva je na kisik, zato mora biti ločena od prvih stopenj fotosinteze. Cianobakterije so to rešile na tri načine. Prvi način je prostorska ločitev teh dveh procesov, ki ga uporabljaja heterocistični filamentozni tip cianobakterij. Pri tem tipu cianobakterij ločimo dve vrsti celic to sta vegetativne in heterocistične. Vegetativni z reakcijami fotosinteze tvori saharide, ki se potem prenesejo v heterociste in tam služijo kot donorji elektronov. V heterocistah najdemo še encim hidroksilazo, ki pridobljen vodik z nitrogenazo uporabi naprej. Z zavrtjem gena za hidroksilazo hup se vodik v celici 7-30% akumulira. Opazili pa so, da ima pomembno vlogo pri zaščiti nitrogenaze pred kisikom zato je to potrebno uporabiti take seve, kjer je ta vpliv minimalen. <br /> V tem članku so predlagali, da bi bakterije gojili v plastičnih bioreaktorjih, ki bi plavali na morju. Razlog za izbiro je nizka cena in možnost recikliranja. V notranjem sloju bi bile cianobakterije, drugi sloj bi bil neprepusten za vodik, tretji pa bi mehanjsko ščitil celoten reaktor. Zaradi visoke cene bi uporabo argona lahko izločili z uporabo posebnih mutantov, ki fiksirajo dušik v zelo majhnih količinah v prisotnisti dušika. H2 bi v reaktorjih zbirali več tednov do nekaj mesecev ga ločili od kisika in ga očistili med prevozom na ladjah z PSA. Metoda za ločitev kisika od vodika še ni dorečena ena izmed možnih so membrane, ki bolje prepuščajo vodik. Očiščen vodik bi bilo potrebno kondenzirati ali kemijsko pretvoriti za transport. Prednosti proizvajanje vodika z cianobakterijami so večkratna uporaba gojišča saj med rastjo cianobakterije ne potrebujejo veliko dela, hranil in energije, kulture pa, ko je sistem uspostavljen lahko dolgotrajno proizvajajo vodik (več mesecev) brez menjave gojišča in z večkratnim odvzetjem produkta.<br /> <br /> ==ZAKLJUČKI==<br /> Potrebno je izboljšati učinkovitost pretvorbe svetlobne energije ter zmožnost proizvajanja vodika. Potrebno so raziskave v tej smeri, da bi lahko iskali izboljšave. Mnoga stališča proizvajanja vodika in z njim povezane tehnologije so še vedno v razvoju in zato je težko napovedati ceno produkcije. Sukarai v svojem članku ocenjuje na 26,4 c/kWh kar je dražje kot sedanja cena za elektriko, vendar pa je vrednost blizu tistih z subvencijo za obnovljive vire.Verjamejo pa da se bodo, ko bo enkrat to dejansko izvedeno pokazale možnosti za izboljšanje in da bo cena proizvajanja vodika še padla.</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Kako_blizu_smo_dosegu_komercialno_dostopne_masovne_fotobiolo%C5%A1ke_proizvodnje_vodika_z_cianobakterijam:_pregled_z_biolo%C5%A1kega_vidika.&diff=10652 2015-06-08T19:31:28Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>UVOD</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Kako_blizu_smo_dosegu_komercialno_dostopne_masovne_fotobiolo%C5%A1ke_proizvodnje_vodika_z_cianobakterijam:_pregled_z_biolo%C5%A1kega_vidika.&diff=10651 2015-06-08T19:31:00Z

<p>Daša Pavc: New page: bla bla</p> <hr /> <div>bla bla</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=MBT_seminarji_2015&diff=10650 2015-06-08T19:30:46Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2014/15'''<br /> <br /> Tabela za razpored po tednih bo objavljena v spletni učilnici, vanjo pa se vpišite tudi za kratke predstavitve novic (3 min, dvakrat v semestru). Na tej strani bo samo seznam odobrenih člankov za seminar in povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje tri dni pred predstavitvijo (ponedeljek oz. torek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. lani).<br /> <br /> Način vnosa:<br /> <br /> # The importance of ''Arabidopsis'' glutathione peroxidase 8 for protecting ''Arabidopsis'' plant and ''E. coli'' cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops &amp; Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline ''Arabidopsis thaliana'' in bakterije ''Escherichia coli'' pred oksidativnim stresom. Janez Novak, 15. marca 2014<br /> (slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)<br /> <br /> <br /> '''Naslovi odobrenih člankov po temah:'''<br /> <br /> '''Gensko spremenjene rastline'''&lt;br&gt;<br /> # Successful high-level accumulation of fish oil omega-3 long-chain polyunsaturated fatty acids in a transgenic oilseed crop (Ruiz-Lopez, N., et al; The plant journal 77, 198-208, 2014; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24308505). [[Uspešna priprava gensko spremenjene oljne rastline z visoko vsebnostjo omega-3 polinenasičenih maščobnih kislin.]] Petra Malavašič, 20. marca 2015<br /> #A simplified and accurate detection of the genetically modified wheat MON71800 with one calibrator plasmid (Jae Juan, S.,et al; Food Chemistry 176, 1-6, ;http://www.sciencedirect.com.nukweb.nuk.uni-lj.si/science/article/pii/S03088146140196572015 [[Poenostavljena in točna detekcija gensko spemenjene pšenice MON71800 z enim kalibratorskim plazmidom]]. Matej Lesar, 20. marca 2015<br /> <br /> '''Gensko spremenjene živali'''&lt;br&gt;<br /> # [[A novel adenoviral vector carrying an all-in-one Tet-On system with an autoregulatory loop for tight, inducible transgene expresion]] (H. Chen; et all.; BMC Biotechnology 2015, 15:4, doi:10.1186/s12896-015-0121-4; http://www.biomedcentral.com/1472-6750/15/4). Edvinas Grauželis, 27. marca 2015 (in English)<br /> # Production of functional active human growth factors in insects used as living biofactories (B. Dudognon, et al; Journal of Biotechnology 184, 229–239, 2014; http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2014.05.030). [[Proizvodnja funkcionalno aktivnih človeških rastnih faktorjev v insektih uporabljenih kot žive biotovarne]] Maxi Sagmeister, 27. marca 2015<br /> <br /> '''Okolje'''&lt;br&gt;<br /> # Bioremediation of pesticide contaminated water using an organophosphate degrading enzyme immobilized on nonwoven polyester textiles (Yuan Gao ''et al.'', Enzyme and Microbial Technology, vol. 54, pages 38-44, 10.1.2014, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141022913002044). [[Bioremediacija s pesticidi okužene vode z uporabo encima, ki razgrajuje organofosfate in je vezan na netkan poliestrski tekstil]]. Mitja Crček, 3. aprila 2015<br /> # Biodegradation of atrazine by three transgenic grasses and alfalfa expressing a modified bacterial atrazine chlorohydrolase gene (A. W. Vail ''et al.''; Transgenic Research, 29. 11. 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-014-9851-7). [[Biorazgradnja atrazina s tremi transgenskimi travami in lucerno, ki izražajo gen za modificirano bakterijsko atrazin klorohidrolazo]]. Mirjam Kmetič, 3. aprila 2015 <br /> <br /> '''Terapevtiki'''&lt;br&gt;<br /> # Glycosylated enfuvirtide: A long-lasting glycopeptide with potent anti-HIV activity; http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jm5016582 [[Glikoliziran Enfuvirtid: glikopeptid z močno proti HIV aktivnostjo s podaljšanim delovanjem]]. Sebastian Pleško, 10. aprila <br /> # Microbicidal effects of α- and θ-defensins against antibiotic-resistant Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa; http://ini.sagepub.com/content/21/1/17.long. [[Mikrobicidno delovanje α in θ defenzinov na antibiotik-odporne Staphylococcus aureus in Pseudomonas aeruginosa]]. Ana Kapraljević, 10. aprila<br /> <br /> '''Encimi'''&lt;br&gt;<br /> # Immobilization and controlled release of β-galactosidase from chitosan-grafted hydrogels; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0308814615001028. [[Imobilizacija in nadzorovano sproščanje β-galaktozidaze iz hitozanskega hidrogela]]. Mojca Banič, 16. aprila 2015<br /> # Construction of efficient xylose utilizing ''Pichia pastoris'' for industrial enzyme production (Li ''et al''; Microbial Cell Factories 14:22, 1-10, 2015; http://www.microbialcellfactories.com/content/14/1/22). [[Priprava Pichie pastoris, ki učinkovito uporablja ksilozo, za industrijsko proizvodnjo encimov]]. Špela Tomaž, 17. aprila 2015<br /> # Postharvest application of a novel chitinase cloned from ''Metschnikowia fructicola'' and overexpressed in ''Pichia pastoris'' to control brown rot of peaches; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168160515000033. [[Uporaba hitinaze, klonirane iz Metschnikowie fructicola in prekomerno izražene v Pichii pastoris za nadzor rjave gnilobe breskev po obiranju]] Špela Pohleven, 17. aprila 2015<br /> <br /> '''Protitelesa'''&lt;br&gt; <br /> # Optimization of heavy chain and light chain signal peptides for high level expression of therapeutic antibodies in CHO cells; http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0116878. Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah. [[Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah]] Tjaša Blatnik, 23. aprila 2015<br /> # Ethanol precipitation for purification of recombinant antibodies (A. Tscheliessnig ''et al''; Journal of Biotechnology 188, 17-28, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165614007810). [[Čiščenje rekombinantnih protiteles z obarjanjem z etanolom]]. Urška Rauter, 24. aprila 2015<br /> # Functional mutations in and characterization of VHH against ''Helicobacter pylori'' urease (R. Hoseinpoor ''et al''; Applied Biochemistry and Biotechnology 172, 3079-3091, 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s12010-014-0750-4). [[Funkcionalne mutacije in karakterizacija VHH proti ureazi Helicobacter pylori]]. Marko Radojković, 7. maja 2015<br /> <br /> '''Cepiva'''&lt;br&gt;<br /> # Development of anti-E6 pegylated lipoplexes for mucosal application in the context of cervical preneoplastic lesions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517315001507. [[Razvoj pegiliranih lipopleksov proti E6 za aplikacijo na sluznico pri predrakavih spremembah materničnega vratu]]. Tanja Korpar, 7. maja 2015<br /> # A novel “priming-boosting” strategy for immune interventions in cervical cancer (S. Liao et al.; Molecular Immunology 64, 295-305, 2015, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589014003460. [[Nova &quot;priming-boosting&quot; strategija za imunsko posredovanje pri raku materničnega vratu]]. Anita Kustec, 8. maja 2015<br /> # Potentiation of anthrax vaccines using protective antigen-expressing viral replicon vectors (H.C. Wang et al.; Immunology letters 163, 206-213, 2015, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25102364 ) [[Izboljšava cepiv proti antraksu z uporabo iz virusnih replikonov izvedenih vektorjev, ki omogočajo izražanje zaščitnega antigena.]] Daša Pavc, 8. maja 2015<br /> <br /> '''Male molekule in polimeri'''&lt;br&gt;<br /> # Methanol-induced chain termination in poly(3-hydroxybutyrate) biopolymers: Molecular weight control; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008307. [[Z metanolom inducirana terminacija polimerizacije poli(3-hidroksibutiratnih) polimerov: Vpliv na molekulsko maso]]. Gašper Lavrenčič, 14. maja 2015<br /> # Purification and characterization of gamma poly glutamic acid from newly Bacillus licheniformis NRC20; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008216. Uroš Stupar, 14. maja 2015<br /> # Sequence-specific antimicrobials using efficiently delivered RNA-guided nucleases (Citorik RJ. ''et al''; Nature Biotechnology 32, 1141-1145, 2014; http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n11/full/nbt.3011.html). [[Sekven%C4%8Dno specifi%C4%8Dna protimikrobna sredstva]] Iza Ogris, 15. maja 2015<br /> # Chromosomal integration of hyaluronic acid synthesis (''has'') genes enhances the molecular weight of hyaluronan produced in ''Lactococcus lactis'' (R. V. Hmar et al; Biotechnol. J. 9 (12), 2014; http://dx.doi.org/10.1002/biot.201400215) [[Integracija genov za sintezo hialuronske kisline v kromosom bakterije Lactococcus lactis izboljša sintezo visokomolekularne hialuronske kisline]] Maja Grdadolnik, 15. maja 2015<br /> <br /> '''Pretvorba biomase'''&lt;br&gt;<br /> # Effect of pretreatment methods on the synergism of cellulase and xylanase during the hydrolysis of bagasse (L. Jia ''et al''; Bioresource Technology 185, 2015; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415002114) [[Vpliv metod predobdelave na sinergizem celulaze in ksilanaze pri hidrolizi bagase]]. Eva Lucija Kozak, 21. maja 2015<br /> # Third generation biohydrogen production by Clostridium butyricum and adapted mixed cultures from Scenedesmus obliquus microalga biomass; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016236115002550?np=y [[Tretja generacija proizvodnje biovodika s pomočjo, z mikroalgami Scenedesmus obliquus hranjenimi bakterijami Clostridium butyricum in mešanico prilagojenih mikroorganizmov]] Nives Naraglav, 22. maja 2015<br /> # Bio-catalytic action of twin-screw extruder enzymatic hydrolysis on the deconstruction of annual plant material: Case of sweet corn co-products; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926669015000436 [[Biokatalitični učinek encimske hidrolize dvovijačnega ekstruderja na destrukturiranje rastlinskega materiala]]. Griša Prinčič, 22. maja 2015<br /> <br /> '''Metabolično inženirstvo'''&lt;br&gt;<br /> # Engineering lipid overproduction in the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica (K. Qiao ''et al.''; Metabolic Engineering 29, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717615000166) [[Povečanje proizvodnje lipidov v kvasovki Yarrowia lipolytica]]. Andreja Bratovš, 28. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals (Weerawat Runguphana, Jay D. Keasling; Metabolic Engineering, vol 21, January 2014, Pages 103–113; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717613000670). [[Metabolno inženirstvo kvasovke Saccharomyces cerevisiae za proizvodnjo biogoriva in kemikalij iz maščobnih kislin]]. Dominik Kert, 29. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Klebsiella pneumoniae for the production of cis,cis-muconic acid (Jung,H.-M. Jung,M.-Y. Oh, M.-K.;Applied Microbiology and Biotechnology, Published online: 14 February 2015; http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-015-6442-3). [[Metabolno inženirstvo Klebsiella pneumoniae za produkcijo cis,cis-mukonične kisline]]. Jure Zabret, 29. maja 2015<br /> <br /> '''Biološki viri energije'''&lt;br&gt;<br /> # Anodic and cathodic microbial communities in single chamber microbial fuel cells; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1871678414021694. [[Anodna in katodna mikrobna združba v eno-celični mikrobni gorivni celici]] Tamara Marić, 4. junija 2015<br /> # Combination of dry dark fermentation and mechanical pretreatment for lignocellulosic deconstruction: An innovative strategy for biofuels and volatile fatty acids recovery; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0306261915002196. [[Kombinacija temne fermentacije v trdnem stanju in mehanske obdelave za razgradnjo lignoceluloze: Inovativen pristop za proizvodnjo biogoriv in hlapnih organskih kislin.]] Jernej Pušnik, 4. junija 2015<br /> # Potential use of feedlot cattle manure for bioethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415001960. [[Uporaba govejega gnoja v proizvodnji bioetanola.]] Nastja Pirman, 5. junija 2015<br /> # Cellulolytic enzymes produced by a newly isolated soil fungus Penicillium sp. TG2 with potential for use in cellulosic ethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960148114007022. [[Celulolitični encimi talne glive Penicillium sp. TG2 in njihov potencial pri proizvodnji etanola.]] Jana Verbančič, 5. junija 2015<br /> <br /> '''Novi pristopi v molekularni biotehnologiji'''&lt;br&gt;<br /> # Exploring the potential of algae/bacteria interactions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166915000269. Matja Zalar, 11. junija<br /> # How close we are to achieving commercially viable large-scale photobiological hydrogen production by cyanobacteria: A review of the biological aspects; http://www.mdpi.com/2075-1729/5/1/997/htm. [[Kako blizu smo dosegu komercialno dostopne masovne fotobiološke proizvodnje vodika z cianobakterijam: pregled z biološkega vidika.]] Monika Škrjanc, 11. junija<br /> # Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant (M. Folcher; Nature Communications 5, 1–11, 2014; http://www.nature.com/ncomms/2014/141111/ncomms6392/full/ncomms6392.html) [[Z EEG nadzorovano izražanje transgena preko brezžično napajanega optogenetskega celičnega vsadka.]] Luka Smole, 11. junija 2015</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=MBT_seminarji_2015&diff=10649 2015-06-08T18:10:47Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2014/15'''<br /> <br /> Tabela za razpored po tednih bo objavljena v spletni učilnici, vanjo pa se vpišite tudi za kratke predstavitve novic (3 min, dvakrat v semestru). Na tej strani bo samo seznam odobrenih člankov za seminar in povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje tri dni pred predstavitvijo (ponedeljek oz. torek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. lani).<br /> <br /> Način vnosa:<br /> <br /> # The importance of ''Arabidopsis'' glutathione peroxidase 8 for protecting ''Arabidopsis'' plant and ''E. coli'' cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops &amp; Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline ''Arabidopsis thaliana'' in bakterije ''Escherichia coli'' pred oksidativnim stresom. Janez Novak, 15. marca 2014<br /> (slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)<br /> <br /> <br /> '''Naslovi odobrenih člankov po temah:'''<br /> <br /> '''Gensko spremenjene rastline'''&lt;br&gt;<br /> # Successful high-level accumulation of fish oil omega-3 long-chain polyunsaturated fatty acids in a transgenic oilseed crop (Ruiz-Lopez, N., et al; The plant journal 77, 198-208, 2014; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24308505). [[Uspešna priprava gensko spremenjene oljne rastline z visoko vsebnostjo omega-3 polinenasičenih maščobnih kislin.]] Petra Malavašič, 20. marca 2015<br /> #A simplified and accurate detection of the genetically modified wheat MON71800 with one calibrator plasmid (Jae Juan, S.,et al; Food Chemistry 176, 1-6, ;http://www.sciencedirect.com.nukweb.nuk.uni-lj.si/science/article/pii/S03088146140196572015 [[Poenostavljena in točna detekcija gensko spemenjene pšenice MON71800 z enim kalibratorskim plazmidom]]. Matej Lesar, 20. marca 2015<br /> <br /> '''Gensko spremenjene živali'''&lt;br&gt;<br /> # [[A novel adenoviral vector carrying an all-in-one Tet-On system with an autoregulatory loop for tight, inducible transgene expresion]] (H. Chen; et all.; BMC Biotechnology 2015, 15:4, doi:10.1186/s12896-015-0121-4; http://www.biomedcentral.com/1472-6750/15/4). Edvinas Grauželis, 27. marca 2015 (in English)<br /> # Production of functional active human growth factors in insects used as living biofactories (B. Dudognon, et al; Journal of Biotechnology 184, 229–239, 2014; http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2014.05.030). [[Proizvodnja funkcionalno aktivnih človeških rastnih faktorjev v insektih uporabljenih kot žive biotovarne]] Maxi Sagmeister, 27. marca 2015<br /> <br /> '''Okolje'''&lt;br&gt;<br /> # Bioremediation of pesticide contaminated water using an organophosphate degrading enzyme immobilized on nonwoven polyester textiles (Yuan Gao ''et al.'', Enzyme and Microbial Technology, vol. 54, pages 38-44, 10.1.2014, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141022913002044). [[Bioremediacija s pesticidi okužene vode z uporabo encima, ki razgrajuje organofosfate in je vezan na netkan poliestrski tekstil]]. Mitja Crček, 3. aprila 2015<br /> # Biodegradation of atrazine by three transgenic grasses and alfalfa expressing a modified bacterial atrazine chlorohydrolase gene (A. W. Vail ''et al.''; Transgenic Research, 29. 11. 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-014-9851-7). [[Biorazgradnja atrazina s tremi transgenskimi travami in lucerno, ki izražajo gen za modificirano bakterijsko atrazin klorohidrolazo]]. Mirjam Kmetič, 3. aprila 2015 <br /> <br /> '''Terapevtiki'''&lt;br&gt;<br /> # Glycosylated enfuvirtide: A long-lasting glycopeptide with potent anti-HIV activity; http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jm5016582 [[Glikoliziran Enfuvirtid: glikopeptid z močno proti HIV aktivnostjo s podaljšanim delovanjem]]. Sebastian Pleško, 10. aprila <br /> # Microbicidal effects of α- and θ-defensins against antibiotic-resistant Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa; http://ini.sagepub.com/content/21/1/17.long. [[Mikrobicidno delovanje α in θ defenzinov na antibiotik-odporne Staphylococcus aureus in Pseudomonas aeruginosa]]. Ana Kapraljević, 10. aprila<br /> <br /> '''Encimi'''&lt;br&gt;<br /> # Immobilization and controlled release of β-galactosidase from chitosan-grafted hydrogels; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0308814615001028. [[Imobilizacija in nadzorovano sproščanje β-galaktozidaze iz hitozanskega hidrogela]]. Mojca Banič, 16. aprila 2015<br /> # Construction of efficient xylose utilizing ''Pichia pastoris'' for industrial enzyme production (Li ''et al''; Microbial Cell Factories 14:22, 1-10, 2015; http://www.microbialcellfactories.com/content/14/1/22). [[Priprava Pichie pastoris, ki učinkovito uporablja ksilozo, za industrijsko proizvodnjo encimov]]. Špela Tomaž, 17. aprila 2015<br /> # Postharvest application of a novel chitinase cloned from ''Metschnikowia fructicola'' and overexpressed in ''Pichia pastoris'' to control brown rot of peaches; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168160515000033. [[Uporaba hitinaze, klonirane iz Metschnikowie fructicola in prekomerno izražene v Pichii pastoris za nadzor rjave gnilobe breskev po obiranju]] Špela Pohleven, 17. aprila 2015<br /> <br /> '''Protitelesa'''&lt;br&gt; <br /> # Optimization of heavy chain and light chain signal peptides for high level expression of therapeutic antibodies in CHO cells; http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0116878. Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah. [[Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah]] Tjaša Blatnik, 23. aprila 2015<br /> # Ethanol precipitation for purification of recombinant antibodies (A. Tscheliessnig ''et al''; Journal of Biotechnology 188, 17-28, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165614007810). [[Čiščenje rekombinantnih protiteles z obarjanjem z etanolom]]. Urška Rauter, 24. aprila 2015<br /> # Functional mutations in and characterization of VHH against ''Helicobacter pylori'' urease (R. Hoseinpoor ''et al''; Applied Biochemistry and Biotechnology 172, 3079-3091, 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s12010-014-0750-4). [[Funkcionalne mutacije in karakterizacija VHH proti ureazi Helicobacter pylori]]. Marko Radojković, 7. maja 2015<br /> <br /> '''Cepiva'''&lt;br&gt;<br /> # Development of anti-E6 pegylated lipoplexes for mucosal application in the context of cervical preneoplastic lesions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517315001507. [[Razvoj pegiliranih lipopleksov proti E6 za aplikacijo na sluznico pri predrakavih spremembah materničnega vratu]]. Tanja Korpar, 7. maja 2015<br /> # A novel “priming-boosting” strategy for immune interventions in cervical cancer (S. Liao et al.; Molecular Immunology 64, 295-305, 2015, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589014003460. [[Nova &quot;priming-boosting&quot; strategija za imunsko posredovanje pri raku materničnega vratu]]. Anita Kustec, 8. maja 2015<br /> # Potentiation of anthrax vaccines using protective antigen-expressing viral replicon vectors (H.C. Wang et al.; Immunology letters 163, 206-213, 2015, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25102364 ) [[Izboljšava cepiv proti antraksu z uporabo iz virusnih replikonov izvedenih vektorjev, ki omogočajo izražanje zaščitnega antigena.]] Daša Pavc, 8. maja 2015<br /> <br /> '''Male molekule in polimeri'''&lt;br&gt;<br /> # Methanol-induced chain termination in poly(3-hydroxybutyrate) biopolymers: Molecular weight control; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008307. [[Z metanolom inducirana terminacija polimerizacije poli(3-hidroksibutiratnih) polimerov: Vpliv na molekulsko maso]]. Gašper Lavrenčič, 14. maja 2015<br /> # Purification and characterization of gamma poly glutamic acid from newly Bacillus licheniformis NRC20; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008216. Uroš Stupar, 14. maja 2015<br /> # Sequence-specific antimicrobials using efficiently delivered RNA-guided nucleases (Citorik RJ. ''et al''; Nature Biotechnology 32, 1141-1145, 2014; http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n11/full/nbt.3011.html). [[Sekven%C4%8Dno specifi%C4%8Dna protimikrobna sredstva]] Iza Ogris, 15. maja 2015<br /> # Chromosomal integration of hyaluronic acid synthesis (''has'') genes enhances the molecular weight of hyaluronan produced in ''Lactococcus lactis'' (R. V. Hmar et al; Biotechnol. J. 9 (12), 2014; http://dx.doi.org/10.1002/biot.201400215) [[Integracija genov za sintezo hialuronske kisline v kromosom bakterije Lactococcus lactis izboljša sintezo visokomolekularne hialuronske kisline]] Maja Grdadolnik, 15. maja 2015<br /> <br /> '''Pretvorba biomase'''&lt;br&gt;<br /> # Effect of pretreatment methods on the synergism of cellulase and xylanase during the hydrolysis of bagasse (L. Jia ''et al''; Bioresource Technology 185, 2015; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415002114) [[Vpliv metod predobdelave na sinergizem celulaze in ksilanaze pri hidrolizi bagase]]. Eva Lucija Kozak, 21. maja 2015<br /> # Third generation biohydrogen production by Clostridium butyricum and adapted mixed cultures from Scenedesmus obliquus microalga biomass; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016236115002550?np=y [[Tretja generacija proizvodnje biovodika s pomočjo, z mikroalgami Scenedesmus obliquus hranjenimi bakterijami Clostridium butyricum in mešanico prilagojenih mikroorganizmov]] Nives Naraglav, 22. maja 2015<br /> # Bio-catalytic action of twin-screw extruder enzymatic hydrolysis on the deconstruction of annual plant material: Case of sweet corn co-products; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926669015000436 [[Biokatalitični učinek encimske hidrolize dvovijačnega ekstruderja na destrukturiranje rastlinskega materiala]]. Griša Prinčič, 22. maja 2015<br /> <br /> '''Metabolično inženirstvo'''&lt;br&gt;<br /> # Engineering lipid overproduction in the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica (K. Qiao ''et al.''; Metabolic Engineering 29, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717615000166) [[Povečanje proizvodnje lipidov v kvasovki Yarrowia lipolytica]]. Andreja Bratovš, 28. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals (Weerawat Runguphana, Jay D. Keasling; Metabolic Engineering, vol 21, January 2014, Pages 103–113; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717613000670). [[Metabolno inženirstvo kvasovke Saccharomyces cerevisiae za proizvodnjo biogoriva in kemikalij iz maščobnih kislin]]. Dominik Kert, 29. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Klebsiella pneumoniae for the production of cis,cis-muconic acid (Jung,H.-M. Jung,M.-Y. Oh, M.-K.;Applied Microbiology and Biotechnology, Published online: 14 February 2015; http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-015-6442-3). [[Metabolno inženirstvo Klebsiella pneumoniae za produkcijo cis,cis-mukonične kisline]]. Jure Zabret, 29. maja 2015<br /> <br /> '''Biološki viri energije'''&lt;br&gt;<br /> # Anodic and cathodic microbial communities in single chamber microbial fuel cells; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1871678414021694. [[Anodna in katodna mikrobna združba v eno-celični mikrobni gorivni celici]] Tamara Marić, 4. junija 2015<br /> # Combination of dry dark fermentation and mechanical pretreatment for lignocellulosic deconstruction: An innovative strategy for biofuels and volatile fatty acids recovery; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0306261915002196. [[Kombinacija temne fermentacije v trdnem stanju in mehanske obdelave za razgradnjo lignoceluloze: Inovativen pristop za proizvodnjo biogoriv in hlapnih organskih kislin.]] Jernej Pušnik, 4. junija 2015<br /> # Potential use of feedlot cattle manure for bioethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415001960. [[Uporaba govejega gnoja v proizvodnji bioetanola.]] Nastja Pirman, 5. junija 2015<br /> # Cellulolytic enzymes produced by a newly isolated soil fungus Penicillium sp. TG2 with potential for use in cellulosic ethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960148114007022. [[Celulolitični encimi talne glive Penicillium sp. TG2 in njihov potencial pri proizvodnji etanola.]] Jana Verbančič, 5. junija 2015<br /> <br /> '''Novi pristopi v molekularni biotehnologiji'''&lt;br&gt;<br /> # Exploring the potential of algae/bacteria interactions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166915000269. Matja Zalar, 11. junija<br /> # How close we are to achieving commercially viable large-scale photobiological hydrogen production by cyanobacteria: A review of the biological aspects; http://www.mdpi.com/2075-1729/5/1/997/htm. Monika Škrjanc, 11. junija<br /> # Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant (M. Folcher; Nature Communications 5, 1–11, 2014; http://www.nature.com/ncomms/2014/141111/ncomms6392/full/ncomms6392.html) [[Z EEG nadzorovano izražanje transgena preko brezžično napajanega optogenetskega celičnega vsadka.]] Luka Smole, 11. junija 2015</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=MBT_seminarji_2015&diff=10648 2015-06-08T18:05:09Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2014/15'''<br /> <br /> Tabela za razpored po tednih bo objavljena v spletni učilnici, vanjo pa se vpišite tudi za kratke predstavitve novic (3 min, dvakrat v semestru). Na tej strani bo samo seznam odobrenih člankov za seminar in povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje tri dni pred predstavitvijo (ponedeljek oz. torek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. lani).<br /> <br /> Način vnosa:<br /> <br /> # The importance of ''Arabidopsis'' glutathione peroxidase 8 for protecting ''Arabidopsis'' plant and ''E. coli'' cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops &amp; Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline ''Arabidopsis thaliana'' in bakterije ''Escherichia coli'' pred oksidativnim stresom. Janez Novak, 15. marca 2014<br /> (slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)<br /> <br /> <br /> '''Naslovi odobrenih člankov po temah:'''<br /> <br /> '''Gensko spremenjene rastline'''&lt;br&gt;<br /> # Successful high-level accumulation of fish oil omega-3 long-chain polyunsaturated fatty acids in a transgenic oilseed crop (Ruiz-Lopez, N., et al; The plant journal 77, 198-208, 2014; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24308505). [[Uspešna priprava gensko spremenjene oljne rastline z visoko vsebnostjo omega-3 polinenasičenih maščobnih kislin.]] Petra Malavašič, 20. marca 2015<br /> #A simplified and accurate detection of the genetically modified wheat MON71800 with one calibrator plasmid (Jae Juan, S.,et al; Food Chemistry 176, 1-6, ;http://www.sciencedirect.com.nukweb.nuk.uni-lj.si/science/article/pii/S03088146140196572015 [[Poenostavljena in točna detekcija gensko spemenjene pšenice MON71800 z enim kalibratorskim plazmidom]]. Matej Lesar, 20. marca 2015<br /> <br /> '''Gensko spremenjene živali'''&lt;br&gt;<br /> # [[A novel adenoviral vector carrying an all-in-one Tet-On system with an autoregulatory loop for tight, inducible transgene expresion]] (H. Chen; et all.; BMC Biotechnology 2015, 15:4, doi:10.1186/s12896-015-0121-4; http://www.biomedcentral.com/1472-6750/15/4). Edvinas Grauželis, 27. marca 2015 (in English)<br /> # Production of functional active human growth factors in insects used as living biofactories (B. Dudognon, et al; Journal of Biotechnology 184, 229–239, 2014; http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2014.05.030). [[Proizvodnja funkcionalno aktivnih človeških rastnih faktorjev v insektih uporabljenih kot žive biotovarne]] Maxi Sagmeister, 27. marca 2015<br /> <br /> '''Okolje'''&lt;br&gt;<br /> # Bioremediation of pesticide contaminated water using an organophosphate degrading enzyme immobilized on nonwoven polyester textiles (Yuan Gao ''et al.'', Enzyme and Microbial Technology, vol. 54, pages 38-44, 10.1.2014, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141022913002044). [[Bioremediacija s pesticidi okužene vode z uporabo encima, ki razgrajuje organofosfate in je vezan na netkan poliestrski tekstil]]. Mitja Crček, 3. aprila 2015<br /> # Biodegradation of atrazine by three transgenic grasses and alfalfa expressing a modified bacterial atrazine chlorohydrolase gene (A. W. Vail ''et al.''; Transgenic Research, 29. 11. 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-014-9851-7). [[Biorazgradnja atrazina s tremi transgenskimi travami in lucerno, ki izražajo gen za modificirano bakterijsko atrazin klorohidrolazo]]. Mirjam Kmetič, 3. aprila 2015 <br /> <br /> '''Terapevtiki'''&lt;br&gt;<br /> # Glycosylated enfuvirtide: A long-lasting glycopeptide with potent anti-HIV activity; http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jm5016582 [[Glikoliziran Enfuvirtid: glikopeptid z močno proti HIV aktivnostjo s podaljšanim delovanjem]]. Sebastian Pleško, 10. aprila <br /> # Microbicidal effects of α- and θ-defensins against antibiotic-resistant Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa; http://ini.sagepub.com/content/21/1/17.long. [[Mikrobicidno delovanje α in θ defenzinov na antibiotik-odporne Staphylococcus aureus in Pseudomonas aeruginosa]]. Ana Kapraljević, 10. aprila<br /> <br /> '''Encimi'''&lt;br&gt;<br /> # Immobilization and controlled release of β-galactosidase from chitosan-grafted hydrogels; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0308814615001028. [[Imobilizacija in nadzorovano sproščanje β-galaktozidaze iz hitozanskega hidrogela]]. Mojca Banič, 16. aprila 2015<br /> # Construction of efficient xylose utilizing ''Pichia pastoris'' for industrial enzyme production (Li ''et al''; Microbial Cell Factories 14:22, 1-10, 2015; http://www.microbialcellfactories.com/content/14/1/22). [[Priprava Pichie pastoris, ki učinkovito uporablja ksilozo, za industrijsko proizvodnjo encimov]]. Špela Tomaž, 17. aprila 2015<br /> # Postharvest application of a novel chitinase cloned from ''Metschnikowia fructicola'' and overexpressed in ''Pichia pastoris'' to control brown rot of peaches; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168160515000033. [[Uporaba hitinaze, klonirane iz Metschnikowie fructicola in prekomerno izražene v Pichii pastoris za nadzor rjave gnilobe breskev po obiranju]] Špela Pohleven, 17. aprila 2015<br /> <br /> '''Protitelesa'''&lt;br&gt; <br /> # Optimization of heavy chain and light chain signal peptides for high level expression of therapeutic antibodies in CHO cells; http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0116878. Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah. [[Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah]] Tjaša Blatnik, 23. aprila 2015<br /> # Ethanol precipitation for purification of recombinant antibodies (A. Tscheliessnig ''et al''; Journal of Biotechnology 188, 17-28, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165614007810). [[Čiščenje rekombinantnih protiteles z obarjanjem z etanolom]]. Urška Rauter, 24. aprila 2015<br /> # Functional mutations in and characterization of VHH against ''Helicobacter pylori'' urease (R. Hoseinpoor ''et al''; Applied Biochemistry and Biotechnology 172, 3079-3091, 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s12010-014-0750-4). [[Funkcionalne mutacije in karakterizacija VHH proti ureazi Helicobacter pylori]]. Marko Radojković, 7. maja 2015<br /> <br /> '''Cepiva'''&lt;br&gt;<br /> # Development of anti-E6 pegylated lipoplexes for mucosal application in the context of cervical preneoplastic lesions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517315001507. [[Razvoj pegiliranih lipopleksov proti E6 za aplikacijo na sluznico pri predrakavih spremembah materničnega vratu]]. Tanja Korpar, 7. maja 2015<br /> # A novel “priming-boosting” strategy for immune interventions in cervical cancer (S. Liao et al.; Molecular Immunology 64, 295-305, 2015, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589014003460. [[Nova &quot;priming-boosting&quot; strategija za imunsko posredovanje pri raku materničnega vratu]]. Anita Kustec, 8. maja 2015<br /> # Potentiation of anthrax vaccines using protective antigen-expressing viral replicon vectors (H.C. Wang et al.; Immunology letters 163, 206-213, 2015, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25102364 ) [[Izboljšava cepiv proti antraksu z uporabo iz virusnih replikonov izvedenih vektorjev, ki omogočajo izražanje zaščitnega antigena.]] Daša Pavc, 8. maja 2015<br /> <br /> '''Male molekule in polimeri'''&lt;br&gt;<br /> # Methanol-induced chain termination in poly(3-hydroxybutyrate) biopolymers: Molecular weight control; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008307. [[Z metanolom inducirana terminacija polimerizacije poli(3-hidroksibutiratnih) polimerov: Vpliv na molekulsko maso]]. Gašper Lavrenčič, 14. maja 2015<br /> # Purification and characterization of gamma poly glutamic acid from newly Bacillus licheniformis NRC20; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008216. Uroš Stupar, 14. maja 2015<br /> # Sequence-specific antimicrobials using efficiently delivered RNA-guided nucleases (Citorik RJ. ''et al''; Nature Biotechnology 32, 1141-1145, 2014; http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n11/full/nbt.3011.html). [[Sekven%C4%8Dno specifi%C4%8Dna protimikrobna sredstva]] Iza Ogris, 15. maja 2015<br /> # Chromosomal integration of hyaluronic acid synthesis (''has'') genes enhances the molecular weight of hyaluronan produced in ''Lactococcus lactis'' (R. V. Hmar et al; Biotechnol. J. 9 (12), 2014; http://dx.doi.org/10.1002/biot.201400215) [[Integracija genov za sintezo hialuronske kisline v kromosom bakterije Lactococcus lactis izboljša sintezo visokomolekularne hialuronske kisline]] Maja Grdadolnik, 15. maja 2015<br /> <br /> '''Pretvorba biomase'''&lt;br&gt;<br /> # Effect of pretreatment methods on the synergism of cellulase and xylanase during the hydrolysis of bagasse (L. Jia ''et al''; Bioresource Technology 185, 2015; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415002114) [[Vpliv metod predobdelave na sinergizem celulaze in ksilanaze pri hidrolizi bagase]]. Eva Lucija Kozak, 21. maja 2015<br /> # Third generation biohydrogen production by Clostridium butyricum and adapted mixed cultures from Scenedesmus obliquus microalga biomass; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016236115002550?np=y [[Tretja generacija proizvodnje biovodika s pomočjo, z mikroalgami Scenedesmus obliquus hranjenimi bakterijami Clostridium butyricum in mešanico prilagojenih mikroorganizmov]] Nives Naraglav, 22. maja 2015<br /> # Bio-catalytic action of twin-screw extruder enzymatic hydrolysis on the deconstruction of annual plant material: Case of sweet corn co-products; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926669015000436 [[Biokatalitični učinek encimske hidrolize dvovijačnega ekstruderja na destrukturiranje rastlinskega materiala]]. Griša Prinčič, 22. maja 2015<br /> <br /> '''Metabolično inženirstvo'''&lt;br&gt;<br /> # Engineering lipid overproduction in the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica (K. Qiao ''et al.''; Metabolic Engineering 29, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717615000166) [[Povečanje proizvodnje lipidov v kvasovki Yarrowia lipolytica]]. Andreja Bratovš, 28. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals (Weerawat Runguphana, Jay D. Keasling; Metabolic Engineering, vol 21, January 2014, Pages 103–113; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717613000670). [[Metabolno inženirstvo kvasovke Saccharomyces cerevisiae za proizvodnjo biogoriva in kemikalij iz maščobnih kislin]]. Dominik Kert, 29. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Klebsiella pneumoniae for the production of cis,cis-muconic acid (Jung,H.-M. Jung,M.-Y. Oh, M.-K.;Applied Microbiology and Biotechnology, Published online: 14 February 2015; http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-015-6442-3). [[Metabolno inženirstvo Klebsiella pneumoniae za produkcijo cis,cis-mukonične kisline]]. Jure Zabret, 29. maja 2015<br /> <br /> '''Biološki viri energije'''&lt;br&gt;<br /> # Anodic and cathodic microbial communities in single chamber microbial fuel cells; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1871678414021694. [[Anodna in katodna mikrobna združba v eno-celični mikrobni gorivni celici]] Tamara Marić, 4. junija 2015<br /> # Combination of dry dark fermentation and mechanical pretreatment for lignocellulosic deconstruction: An innovative strategy for biofuels and volatile fatty acids recovery; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0306261915002196. [[Kombinacija temne fermentacije v trdnem stanju in mehanske obdelave za razgradnjo lignoceluloze: Inovativen pristop za proizvodnjo biogoriv in hlapnih organskih kislin.]] Jernej Pušnik, 4. junija 2015<br /> # Potential use of feedlot cattle manure for bioethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415001960. [[Uporaba govejega gnoja v proizvodnji bioetanola.]] Nastja Pirman, 5. junija 2015<br /> # Cellulolytic enzymes produced by a newly isolated soil fungus Penicillium sp. TG2 with potential for use in cellulosic ethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960148114007022. [[Celulolitični encimi talne glive Penicillium sp. TG2 in njihov potencial pri proizvodnji etanola.]] Jana Verbančič, 5. junija 2015<br /> <br /> '''Novi pristopi v molekularni biotehnologiji'''&lt;br&gt;<br /> # Exploring the potential of algae/bacteria interactions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166915000269. Matja Zalar, 11. junija<br /> # How close we are to achieving commercially viable large-scale photobiological hydrogen production by cyanobacteria: A review of the biological aspects; http://www.mdpi.com/2075-1729/5/1/997/htm. [[Kako blizu smo dosegu komercialno izvedljive masovne fotobiološke proizvodnje vodika s cianobakterijam: pregled z biološkega vidika.]] Monika Škrjanc, 11. junija<br /> # Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant (M. Folcher; Nature Communications 5, 1–11, 2014; http://www.nature.com/ncomms/2014/141111/ncomms6392/full/ncomms6392.html) [[Z EEG nadzorovano izražanje transgena preko brezžično napajanega optogenetskega celičnega vsadka.]] Luka Smole, 11. junija 2015</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=MBT_seminarji_2015&diff=10647 2015-06-08T18:03:46Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2014/15'''<br /> <br /> Tabela za razpored po tednih bo objavljena v spletni učilnici, vanjo pa se vpišite tudi za kratke predstavitve novic (3 min, dvakrat v semestru). Na tej strani bo samo seznam odobrenih člankov za seminar in povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje tri dni pred predstavitvijo (ponedeljek oz. torek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. lani).<br /> <br /> Način vnosa:<br /> <br /> # The importance of ''Arabidopsis'' glutathione peroxidase 8 for protecting ''Arabidopsis'' plant and ''E. coli'' cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops &amp; Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline ''Arabidopsis thaliana'' in bakterije ''Escherichia coli'' pred oksidativnim stresom. Janez Novak, 15. marca 2014<br /> (slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)<br /> <br /> <br /> '''Naslovi odobrenih člankov po temah:'''<br /> <br /> '''Gensko spremenjene rastline'''&lt;br&gt;<br /> # Successful high-level accumulation of fish oil omega-3 long-chain polyunsaturated fatty acids in a transgenic oilseed crop (Ruiz-Lopez, N., et al; The plant journal 77, 198-208, 2014; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24308505). [[Uspešna priprava gensko spremenjene oljne rastline z visoko vsebnostjo omega-3 polinenasičenih maščobnih kislin.]] Petra Malavašič, 20. marca 2015<br /> #A simplified and accurate detection of the genetically modified wheat MON71800 with one calibrator plasmid (Jae Juan, S.,et al; Food Chemistry 176, 1-6, ;http://www.sciencedirect.com.nukweb.nuk.uni-lj.si/science/article/pii/S03088146140196572015 [[Poenostavljena in točna detekcija gensko spemenjene pšenice MON71800 z enim kalibratorskim plazmidom]]. Matej Lesar, 20. marca 2015<br /> <br /> '''Gensko spremenjene živali'''&lt;br&gt;<br /> # [[A novel adenoviral vector carrying an all-in-one Tet-On system with an autoregulatory loop for tight, inducible transgene expresion]] (H. Chen; et all.; BMC Biotechnology 2015, 15:4, doi:10.1186/s12896-015-0121-4; http://www.biomedcentral.com/1472-6750/15/4). Edvinas Grauželis, 27. marca 2015 (in English)<br /> # Production of functional active human growth factors in insects used as living biofactories (B. Dudognon, et al; Journal of Biotechnology 184, 229–239, 2014; http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2014.05.030). [[Proizvodnja funkcionalno aktivnih človeških rastnih faktorjev v insektih uporabljenih kot žive biotovarne]] Maxi Sagmeister, 27. marca 2015<br /> <br /> '''Okolje'''&lt;br&gt;<br /> # Bioremediation of pesticide contaminated water using an organophosphate degrading enzyme immobilized on nonwoven polyester textiles (Yuan Gao ''et al.'', Enzyme and Microbial Technology, vol. 54, pages 38-44, 10.1.2014, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141022913002044). [[Bioremediacija s pesticidi okužene vode z uporabo encima, ki razgrajuje organofosfate in je vezan na netkan poliestrski tekstil]]. Mitja Crček, 3. aprila 2015<br /> # Biodegradation of atrazine by three transgenic grasses and alfalfa expressing a modified bacterial atrazine chlorohydrolase gene (A. W. Vail ''et al.''; Transgenic Research, 29. 11. 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-014-9851-7). [[Biorazgradnja atrazina s tremi transgenskimi travami in lucerno, ki izražajo gen za modificirano bakterijsko atrazin klorohidrolazo]]. Mirjam Kmetič, 3. aprila 2015 <br /> <br /> '''Terapevtiki'''&lt;br&gt;<br /> # Glycosylated enfuvirtide: A long-lasting glycopeptide with potent anti-HIV activity; http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jm5016582 [[Glikoliziran Enfuvirtid: glikopeptid z močno proti HIV aktivnostjo s podaljšanim delovanjem]]. Sebastian Pleško, 10. aprila <br /> # Microbicidal effects of α- and θ-defensins against antibiotic-resistant Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa; http://ini.sagepub.com/content/21/1/17.long. [[Mikrobicidno delovanje α in θ defenzinov na antibiotik-odporne Staphylococcus aureus in Pseudomonas aeruginosa]]. Ana Kapraljević, 10. aprila<br /> <br /> '''Encimi'''&lt;br&gt;<br /> # Immobilization and controlled release of β-galactosidase from chitosan-grafted hydrogels; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0308814615001028. [[Imobilizacija in nadzorovano sproščanje β-galaktozidaze iz hitozanskega hidrogela]]. Mojca Banič, 16. aprila 2015<br /> # Construction of efficient xylose utilizing ''Pichia pastoris'' for industrial enzyme production (Li ''et al''; Microbial Cell Factories 14:22, 1-10, 2015; http://www.microbialcellfactories.com/content/14/1/22). [[Priprava Pichie pastoris, ki učinkovito uporablja ksilozo, za industrijsko proizvodnjo encimov]]. Špela Tomaž, 17. aprila 2015<br /> # Postharvest application of a novel chitinase cloned from ''Metschnikowia fructicola'' and overexpressed in ''Pichia pastoris'' to control brown rot of peaches; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168160515000033. [[Uporaba hitinaze, klonirane iz Metschnikowie fructicola in prekomerno izražene v Pichii pastoris za nadzor rjave gnilobe breskev po obiranju]] Špela Pohleven, 17. aprila 2015<br /> <br /> '''Protitelesa'''&lt;br&gt; <br /> # Optimization of heavy chain and light chain signal peptides for high level expression of therapeutic antibodies in CHO cells; http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0116878. Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah. [[Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah]] Tjaša Blatnik, 23. aprila 2015<br /> # Ethanol precipitation for purification of recombinant antibodies (A. Tscheliessnig ''et al''; Journal of Biotechnology 188, 17-28, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165614007810). [[Čiščenje rekombinantnih protiteles z obarjanjem z etanolom]]. Urška Rauter, 24. aprila 2015<br /> # Functional mutations in and characterization of VHH against ''Helicobacter pylori'' urease (R. Hoseinpoor ''et al''; Applied Biochemistry and Biotechnology 172, 3079-3091, 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s12010-014-0750-4). [[Funkcionalne mutacije in karakterizacija VHH proti ureazi Helicobacter pylori]]. Marko Radojković, 7. maja 2015<br /> <br /> '''Cepiva'''&lt;br&gt;<br /> # Development of anti-E6 pegylated lipoplexes for mucosal application in the context of cervical preneoplastic lesions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517315001507. [[Razvoj pegiliranih lipopleksov proti E6 za aplikacijo na sluznico pri predrakavih spremembah materničnega vratu]]. Tanja Korpar, 7. maja 2015<br /> # A novel “priming-boosting” strategy for immune interventions in cervical cancer (S. Liao et al.; Molecular Immunology 64, 295-305, 2015, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589014003460. [[Nova &quot;priming-boosting&quot; strategija za imunsko posredovanje pri raku materničnega vratu]]. Anita Kustec, 8. maja 2015<br /> # Potentiation of anthrax vaccines using protective antigen-expressing viral replicon vectors (H.C. Wang et al.; Immunology letters 163, 206-213, 2015, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25102364 ) [[Izboljšava cepiv proti antraksu z uporabo iz virusnih replikonov izvedenih vektorjev, ki omogočajo izražanje zaščitnega antigena.]] Daša Pavc, 8. maja 2015<br /> <br /> '''Male molekule in polimeri'''&lt;br&gt;<br /> # Methanol-induced chain termination in poly(3-hydroxybutyrate) biopolymers: Molecular weight control; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008307. [[Z metanolom inducirana terminacija polimerizacije poli(3-hidroksibutiratnih) polimerov: Vpliv na molekulsko maso]]. Gašper Lavrenčič, 14. maja 2015<br /> # Purification and characterization of gamma poly glutamic acid from newly Bacillus licheniformis NRC20; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008216. Uroš Stupar, 14. maja 2015<br /> # Sequence-specific antimicrobials using efficiently delivered RNA-guided nucleases (Citorik RJ. ''et al''; Nature Biotechnology 32, 1141-1145, 2014; http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n11/full/nbt.3011.html). [[Sekven%C4%8Dno specifi%C4%8Dna protimikrobna sredstva]] Iza Ogris, 15. maja 2015<br /> # Chromosomal integration of hyaluronic acid synthesis (''has'') genes enhances the molecular weight of hyaluronan produced in ''Lactococcus lactis'' (R. V. Hmar et al; Biotechnol. J. 9 (12), 2014; http://dx.doi.org/10.1002/biot.201400215) [[Integracija genov za sintezo hialuronske kisline v kromosom bakterije Lactococcus lactis izboljša sintezo visokomolekularne hialuronske kisline]] Maja Grdadolnik, 15. maja 2015<br /> <br /> '''Pretvorba biomase'''&lt;br&gt;<br /> # Effect of pretreatment methods on the synergism of cellulase and xylanase during the hydrolysis of bagasse (L. Jia ''et al''; Bioresource Technology 185, 2015; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415002114) [[Vpliv metod predobdelave na sinergizem celulaze in ksilanaze pri hidrolizi bagase]]. Eva Lucija Kozak, 21. maja 2015<br /> # Third generation biohydrogen production by Clostridium butyricum and adapted mixed cultures from Scenedesmus obliquus microalga biomass; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016236115002550?np=y [[Tretja generacija proizvodnje biovodika s pomočjo, z mikroalgami Scenedesmus obliquus hranjenimi bakterijami Clostridium butyricum in mešanico prilagojenih mikroorganizmov]] Nives Naraglav, 22. maja 2015<br /> # Bio-catalytic action of twin-screw extruder enzymatic hydrolysis on the deconstruction of annual plant material: Case of sweet corn co-products; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926669015000436 [[Biokatalitični učinek encimske hidrolize dvovijačnega ekstruderja na destrukturiranje rastlinskega materiala]]. Griša Prinčič, 22. maja 2015<br /> <br /> '''Metabolično inženirstvo'''&lt;br&gt;<br /> # Engineering lipid overproduction in the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica (K. Qiao ''et al.''; Metabolic Engineering 29, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717615000166) [[Povečanje proizvodnje lipidov v kvasovki Yarrowia lipolytica]]. Andreja Bratovš, 28. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals (Weerawat Runguphana, Jay D. Keasling; Metabolic Engineering, vol 21, January 2014, Pages 103–113; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717613000670). [[Metabolno inženirstvo kvasovke Saccharomyces cerevisiae za proizvodnjo biogoriva in kemikalij iz maščobnih kislin]]. Dominik Kert, 29. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Klebsiella pneumoniae for the production of cis,cis-muconic acid (Jung,H.-M. Jung,M.-Y. Oh, M.-K.;Applied Microbiology and Biotechnology, Published online: 14 February 2015; http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-015-6442-3). [[Metabolno inženirstvo Klebsiella pneumoniae za produkcijo cis,cis-mukonične kisline]]. Jure Zabret, 29. maja 2015<br /> <br /> '''Biološki viri energije'''&lt;br&gt;<br /> # Anodic and cathodic microbial communities in single chamber microbial fuel cells; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1871678414021694. [[Anodna in katodna mikrobna združba v eno-celični mikrobni gorivni celici]] Tamara Marić, 4. junija 2015<br /> # Combination of dry dark fermentation and mechanical pretreatment for lignocellulosic deconstruction: An innovative strategy for biofuels and volatile fatty acids recovery; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0306261915002196. [[Kombinacija temne fermentacije v trdnem stanju in mehanske obdelave za razgradnjo lignoceluloze: Inovativen pristop za proizvodnjo biogoriv in hlapnih organskih kislin.]] Jernej Pušnik, 4. junija 2015<br /> # Potential use of feedlot cattle manure for bioethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415001960. [[Uporaba govejega gnoja v proizvodnji bioetanola.]] Nastja Pirman, 5. junija 2015<br /> # Cellulolytic enzymes produced by a newly isolated soil fungus Penicillium sp. TG2 with potential for use in cellulosic ethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960148114007022. [[Celulolitični encimi talne glive Penicillium sp. TG2 in njihov potencial pri proizvodnji etanola.]] Jana Verbančič, 5. junija 2015<br /> <br /> '''Novi pristopi v molekularni biotehnologiji'''&lt;br&gt;<br /> # Exploring the potential of algae/bacteria interactions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166915000269. Matja Zalar, 11. junija<br /> # How close we are to achieving commercially viable large-scale photobiological hydrogen production by cyanobacteria: A review of the biological aspects; http://www.mdpi.com/2075-1729/5/1/997/htm.[[Kako blizu smo dosegu komercialno izvedljive masovne fotobiološke proizvodnje vodika s cianobakterijam: pregled z biološkega vidika.]] Monika Škrjanc, 11. junija<br /> # Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant (M. Folcher; Nature Communications 5, 1–11, 2014; http://www.nature.com/ncomms/2014/141111/ncomms6392/full/ncomms6392.html) [[Z EEG nadzorovano izražanje transgena preko brezžično napajanega optogenetskega celičnega vsadka.]] Luka Smole, 11. junija 2015</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Izbolj%C5%A1ava_cepiv_proti_antraksu_z_uporabo_iz_virusnih_replikonov_izvedenih_vektorjev,_ki_omogo%C4%8Dajo_izra%C5%BEanje_za%C5%A1%C4%8Ditnega_antigena.&diff=10453 2015-05-06T19:25:56Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''UVOD'''<br /> ----<br /> <br /> Za raziskavo možnosti izboljšanja cepiva proti antraksu pri ljudeh so se znanstveniki odločili, kljub temu, da je človeku nevarna oblika redka v naravi, zaradi visoke smrtnosti in enostavnega širjenja spor ter trdoživosti ''B. anthracis''. Trenutno licenčno cepivo proti antraksu v ZDA je osnovano na zaščitnem antigenu antraksa (PA ''protective antigen''), katerega slabi lastnosti sta, da je zelo reaktogeno ter da je potrebnih več odmerkov cepiva (6x cepljenje). <br /> PA ima glavno vlogo pri nastanku toksinov in je tako najpomembnejša komponenta antraks toksina. PA je sestavljen iz 4 domen, med katerimi je za vezavo antraks toksina na receptorje pomembna domena PA4, zato predvidevajo, da je PA4 ključni antigen pri ojačitvi imunskega odgovora, na s cepivom povzročeno okužbo z antraksom.<br /> Trenutne so raziskave na tem področju usmerjene v pridobivanje cepiv, ki vsebujejo rekombinantni PA ali pa DNA cepiva z novimi adjuvansi ali dostavnimi sistemi. DNA cepiva na živalskih modelih dokazano izzovejo humoralni in celični imunski odgovor, potreben je le razvoj cepiva ki bi ga lahko uporabili na ljudeh.<br /> V študiji so testirali imunogenost in izboljšanje učinkovitosti konvencionalnih nevirulentnih DNA cepiv ter virulentnih DNA cepiv, ki so vsebovala virusni replikon iz ''Semliki forest virus'' (SFV). Imunogenost in povečanju učinkovitosti DNA cepiv so primerjali tudi s SFV VRP (''viral replicon particle'') cepivi. <br /> <br /> '''METODE IN REZULTATI'''<br /> ----<br /> <br /> Pripravili so 8 rekombinantnih DNA plazmidov (4 nevirulenti plazmidi in 4 virulentni SFV replikonski plazmidi). Konstrukti so izražali PA ali PA4 antigen, ter so vsebovali signalno zaporedje ali pa le tega ni bilo. Poleg tega so pripravili SFV VRP s kotransfekcijo BHK-21 celic s predhodnje pripravljenimi SFV vektorji in pomožnim virusnim vektorjem. Povečanje učinkovitosti in imunogenost cepiv so testirali na miših Balb/c ki so jih imunizirali s DNA ali VRP cepivi, kot negativno kontorolo pa so uporabili DNA in VRP cepiva, katerih vektorji niso vsebovali vključka za PA ali PA4 antigen. Imunogenost cepiv so preverili s testiranjem seruma imuniziranih miši z ELISA testom. Določili so tudi IgG titer ter titer razmerja izotipov IgG1/IgG2a. Učinkovitost protiteles proti PA so določili s TNA testom. Z ELISA testom so določili tudi raven citokinov IL-4 in IFN- γ. <br /> Pri primerjavi 8 DNA cepiv so ugotovili, da vsa DNA cepiva, ki vsebujejo zaporedje za izražanje PA izzovejo močnejši humoralni in celično posredovan imunski odgovor kot DNA cepiva, ki si vsebovala zaporedje za PA4. Močnejši PA specifični imunski odgovor sprožijo SFV replikonska DNA cepiva v primerjavi z nevirulentnimi DNA cepivi. Prisotnost oziroma odsotnost signalne sekvence ni imela vpliva na učinkovitost DNA cepiv. Opazili so še, da vsa DNA cepiva sprožijo prednostno s Th2 celicami posredovan humoralni imunski odgovor. Po imunizaciji miši z DNA cepivi so ugotovili, da so ustrezno zaščito prejele samo miši cepljene z DNA cepivi s SFV replikoni, ki so izražali PA antigen z ali brez signalnega zaporedja, medtem ko so miši izpostavljene ostalim DNA cepivom ter negativni kontroli poginile. Po izpostavitvi miši večji količini cepiva so dobili enake rezultate.<br /> Preučili so tudi vpliv SFV VRP cepiv, pri čemer so ugotovili, da VRP cepiva, ki vsebujejo zaporedje za PA sprožijo močnejši PA specifični imunski odziv kot cepiva, ki so vsebovala zaporedje za PA4. Vsa VRP cepiva prednostno izzovejo s Th2 celicami posredovan humoralni imunski odziv ne glede na prisotnost signalnih zaporedij. Cepiva VRP, ki so vsebovala zaporedje za izražanje PA so imuniziranim mišim nudila popolno zaščito, medtem ko so cepiva, ki so vsebovala zaporedje za PA4 imuniziranim mišim nudila le delno zaščito. <br /> <br /> '''ZAKLJUČEK'''<br /> ----<br /> <br /> Rezultati študije kažejo, da DNA cepiva z SFV replikoni in VRP cepiva izzovejo močnejši PA specifični imunski odgovor kot konvencionalna nevirulentna DNA cepiva, ter imuniziranim mišim nudijo učinkovito zaščito. SFV replikonska DNA cepiva izzovejo poleg humoralnega tudi celično posredovani imunski odgovor, kar je dobro za doseganje optimalne imunosti. Cilj raziskave in tudi prihodnjih raziskav je konstrukcija DNA vektorja, ki bo izražal velike količine antigena in bo sposoben sprožiti močan imunski odziv. DNA cepiva s SFV replikoni so učinkovita, poleg tega ne zahtevajo velikih odmerkov kot konvencionalna nevirulentna DNA cepiva, zato so potencialni kandidati za klinične aplikacije, vendar so pri samem postopku izdelave vektorjev potrebne še številne optimizacije. Nadaljnje študije bodo usmerjene v raziskave učinkov cepiva na nečloveških primatih z drugimi dostavnimi sistemi, pri tem upajo, da jim bo to pripomoglo pri uporabi cepiva na človeka.</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Izbolj%C5%A1ava_cepiv_proti_antraksu_z_uporabo_iz_virusnih_replikonov_izvedenih_vektorjev,_ki_omogo%C4%8Dajo_izra%C5%BEanje_za%C5%A1%C4%8Ditnega_antigena.&diff=10452 2015-05-06T19:22:09Z

<p>Daša Pavc: New page: &#039;&#039;&#039;UVOD&#039;&#039;&#039; Za raziskavo možnosti izboljšanja cepiva proti antraksu pri ljudeh so se znanstveniki odločili, kljub temu, da je človeku nevarna oblika redka v naravi, zaradi visoke smrtno...</p> <hr /> <div>'''UVOD'''<br /> Za raziskavo možnosti izboljšanja cepiva proti antraksu pri ljudeh so se znanstveniki odločili, kljub temu, da je človeku nevarna oblika redka v naravi, zaradi visoke smrtnosti in enostavnega širjenja spor ter trdoživosti ''B. anthracis''. Trenutno licenčno cepivo proti antraksu v ZDA je osnovano na zaščitnem antigenu antraksa (PA ''protective antigen''), katerega slabi lastnosti sta, da je zelo reaktogeno ter da je potrebnih več odmerkov cepiva (6x cepljenje). <br /> PA ima glavno vlogo pri nastanku toksinov in je tako najpomembnejša komponenta antraks toksina. PA je sestavljen iz 4 domen, med katerimi je za vezavo antraks toksina na receptorje pomembna domena PA4, zato predvidevajo, da je PA4 ključni antigen pri ojačitvi imunskega odgovora, na s cepivom povzročeno okužbo z antraksom.<br /> Trenutne so raziskave na tem področju usmerjene v pridobivanje cepiv, ki vsebujejo rekombinantni PA ali pa DNA cepiva z novimi adjuvansi ali dostavnimi sistemi. DNA cepiva na živalskih modelih dokazano izzovejo humoralni in celični imunski odgovor, potreben je le razvoj cepiva ki bi ga lahko uporabili na ljudeh.<br /> V študiji so testirali imunogenost in izboljšanje učinkovitosti konvencionalnih nevirulentnih DNA cepiv ter virulentnih DNA cepiv, ki so vsebovala virusni replikon iz ''Semliki forest virus'' (SFV). Imunogenost in povečanju učinkovitosti DNA cepiv so primerjali tudi s SFV VRP (''viral replicon particle'') cepivi. <br /> <br /> '''METODE IN REZULTATI'''<br /> Pripravili so 8 rekombinantnih DNA plazmidov (4 nevirulenti plazmidi in 4 virulentni SFV replikonski plazmidi). Konstrukti so izražali PA ali PA4 antigen, ter so vsebovali signalno zaporedje ali pa le tega ni bilo. Poleg tega so pripravili SFV VRP s kotransfekcijo BHK-21 celic s predhodnje pripravljenimi SFV vektorji in pomožnim virusnim vektorjem. Povečanje učinkovitosti in imunogenost cepiv so testirali na miših Balb/c ki so jih imunizirali s DNA ali VRP cepivi, kot negativno kontorolo pa so uporabili DNA in VRP cepiva, katerih vektorji niso vsebovali vključka za PA ali PA4 antigen. Imunogenost cepiv so preverili s testiranjem seruma imuniziranih miši z ELISA testom. Določili so tudi IgG titer ter titer razmerja izotipov IgG1/IgG2a. Učinkovitost protiteles proti PA so določili s TNA testom. Z ELISA testom so določili tudi raven citokinov IL-4 in IFN- γ. <br /> Pri primerjavi 8 DNA cepiv so ugotovili, da vsa DNA cepiva, ki vsebujejo zaporedje za izražanje PA izzovejo močnejši humoralni in celično posredovan imunski odgovor kot DNA cepiva, ki si vsebovala zaporedje za PA4. Močnejši PA specifični imunski odgovor sprožijo SFV replikonska DNA cepiva v primerjavi z nevirulentnimi DNA cepivi. Prisotnost oziroma odsotnost signalne sekvence ni imela vpliva na učinkovitost DNA cepiv. Opazili so še, da vsa DNA cepiva sprožijo prednostno s Th2 celicami posredovan humoralni imunski odgovor. Po imunizaciji miši z DNA cepivi so ugotovili, da so ustrezno zaščito prejele samo miši cepljene z DNA cepivi s SFV replikoni, ki so izražali PA antigen z ali brez signalnega zaporedja, medtem ko so miši izpostavljene ostalim DNA cepivom ter negativni kontroli poginile. Po izpostavitvi miši večji količini cepiva so dobili enake rezultate.<br /> Preučili so tudi vpliv SFV VRP cepiv, pri čemer so ugotovili, da VRP cepiva, ki vsebujejo zaporedje za PA sprožijo močnejši PA specifični imunski odziv kot cepiva, ki so vsebovala zaporedje za PA4. Vsa VRP cepiva prednostno izzovejo s Th2 celicami posredovan humoralni imunski odziv ne glede na prisotnost signalnih zaporedij. Cepiva VRP, ki so vsebovala zaporedje za izražanje PA so imuniziranim mišim nudila popolno zaščito, medtem ko so cepiva, ki so vsebovala zaporedje za PA4 imuniziranim mišim nudila le delno zaščito. <br /> <br /> '''ZAKLJUČEK'''<br /> Rezultati študije kažejo, da DNA cepiva z SFV replikoni in VRP cepiva izzovejo močnejši PA specifični imunski odgovor kot konvencionalna nevirulentna DNA cepiva, ter imuniziranim mišim nudijo učinkovito zaščito. SFV replikonska DNA cepiva izzovejo poleg humoralnega tudi celično posredovani imunski odgovor, kar je dobro za doseganje optimalne imunosti. Cilj raziskave in tudi prihodnjih raziskav je konstrukcija DNA vektorja, ki bo izražal velike količine antigena in bo sposoben sprožiti močan imunski odziv. DNA cepiva s SFV replikoni so učinkovita, poleg tega ne zahtevajo velikih odmerkov kot konvencionalna nevirulentna DNA cepiva, zato so potencialni kandidati za klinične aplikacije, vendar so pri samem postopku izdelave vektorjev potrebne še številne optimizacije. Nadaljnje študije bodo usmerjene v raziskave učinkov cepiva na nečloveških primatih z drugimi dostavnimi sistemi, pri tem upajo, da jim bo to pripomoglo pri uporabi cepiva na človeka.</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=MBT_seminarji_2015&diff=10448 2015-05-06T15:15:26Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2014/15'''<br /> <br /> Tabela za razpored po tednih bo objavljena v spletni učilnici, vanjo pa se vpišite tudi za kratke predstavitve novic (3 min, dvakrat v semestru). Na tej strani bo samo seznam odobrenih člankov za seminar in povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje tri dni pred predstavitvijo (ponedeljek oz. torek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. lani).<br /> <br /> Način vnosa:<br /> <br /> # The importance of ''Arabidopsis'' glutathione peroxidase 8 for protecting ''Arabidopsis'' plant and ''E. coli'' cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops &amp; Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline ''Arabidopsis thaliana'' in bakterije ''Escherichia coli'' pred oksidativnim stresom. Janez Novak, 15. marca 2014<br /> (slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)<br /> <br /> <br /> '''Naslovi odobrenih člankov po temah:'''<br /> <br /> '''Gensko spremenjene rastline'''&lt;br&gt;<br /> # Successful high-level accumulation of fish oil omega-3 long-chain polyunsaturated fatty acids in a transgenic oilseed crop (Ruiz-Lopez, N., et al; The plant journal 77, 198-208, 2014; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24308505). [[Uspešna priprava gensko spremenjene oljne rastline z visoko vsebnostjo omega-3 polinenasičenih maščobnih kislin.]] Petra Malavašič, 20. marca 2015<br /> #A simplified and accurate detection of the genetically modified wheat MON71800 with one calibrator plasmid (Jae Juan, S.,et al; Food Chemistry 176, 1-6, ;http://www.sciencedirect.com.nukweb.nuk.uni-lj.si/science/article/pii/S03088146140196572015 [[Poenostavljena in točna detekcija gensko spemenjene pšenice MON71800 z enim kalibratorskim plazmidom]]. Matej Lesar, 20. marca 2015<br /> <br /> '''Gensko spremenjene živali'''&lt;br&gt;<br /> # [[A novel adenoviral vector carrying an all-in-one Tet-On system with an autoregulatory loop for tight, inducible transgene expresion]] (H. Chen; et all.; BMC Biotechnology 2015, 15:4, doi:10.1186/s12896-015-0121-4; http://www.biomedcentral.com/1472-6750/15/4). Edvinas Grauželis, 27. marca 2015 (in English)<br /> # Production of functional active human growth factors in insects used as living biofactories (B. Dudognon, et al; Journal of Biotechnology 184, 229–239, 2014; http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2014.05.030). [[Proizvodnja funkcionalno aktivnih človeških rastnih faktorjev v insektih uporabljenih kot žive biotovarne]] Maxi Sagmeister, 27. marca 2015<br /> <br /> '''Okolje'''&lt;br&gt;<br /> # Bioremediation of pesticide contaminated water using an organophosphate degrading enzyme immobilized on nonwoven polyester textiles (Yuan Gao ''et al.'', Enzyme and Microbial Technology, vol. 54, pages 38-44, 10.1.2014, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141022913002044). [[Bioremediacija s pesticidi okužene vode z uporabo encima, ki razgrajuje organofosfate in je vezan na netkan poliestrski tekstil]]. Mitja Crček, 3. aprila 2015<br /> # Biodegradation of atrazine by three transgenic grasses and alfalfa expressing a modified bacterial atrazine chlorohydrolase gene (A. W. Vail ''et al.''; Transgenic Research, 29. 11. 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-014-9851-7). [[Biorazgradnja atrazina s tremi transgenskimi travami in lucerno, ki izražajo gen za modificirano bakterijsko atrazin klorohidrolazo]]. Mirjam Kmetič, 3. aprila 2015 <br /> <br /> '''Terapevtiki'''&lt;br&gt;<br /> # Glycosylated enfuvirtide: A long-lasting glycopeptide with potent anti-HIV activity; http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jm5016582 [[Glikoliziran Enfuvirtid: glikopeptid z močno proti HIV aktivnostjo s podaljšanim delovanjem]]. Sebastian Pleško, 10. aprila <br /> # Microbicidal effects of α- and θ-defensins against antibiotic-resistant Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa; http://ini.sagepub.com/content/21/1/17.long. [[Mikrobicidno delovanje α in θ defenzinov na antibiotik-odporne Staphylococcus aureus in Pseudomonas aeruginosa]]. Ana Kapraljević, 10. aprila<br /> <br /> '''Encimi'''&lt;br&gt;<br /> # Immobilization and controlled release of β-galactosidase from chitosan-grafted hydrogels; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0308814615001028. [[Imobilizacija in nadzorovano sproščanje β-galaktozidaze iz hitozanskega hidrogela]]. Mojca Banič, 16. aprila 2015<br /> # Construction of efficient xylose utilizing ''Pichia pastoris'' for industrial enzyme production (Li ''et al''; Microbial Cell Factories 14:22, 1-10, 2015; http://www.microbialcellfactories.com/content/14/1/22). [[Priprava Pichie pastoris, ki učinkovito uporablja ksilozo, za industrijsko proizvodnjo encimov]]. Špela Tomaž, 17. aprila 2015<br /> # Postharvest application of a novel chitinase cloned from ''Metschnikowia fructicola'' and overexpressed in ''Pichia pastoris'' to control brown rot of peaches; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168160515000033. [[Uporaba hitinaze, klonirane iz Metschnikowie fructicola in prekomerno izražene v Pichii pastoris za nadzor rjave gnilobe breskev po obiranju]] Špela Pohleven, 17. aprila 2015<br /> <br /> '''Protitelesa'''&lt;br&gt; <br /> # Optimization of heavy chain and light chain signal peptides for high level expression of therapeutic antibodies in CHO cells; http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0116878. Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah. [[Optimizacija signalnih peptidov težkih in lahkih verig za večjo ekspresijo terapevtskih protiteles v CHO celičnih linijah]] Tjaša Blatnik, 23. aprila 2015<br /> # Ethanol precipitation for purification of recombinant antibodies (A. Tscheliessnig ''et al''; Journal of Biotechnology 188, 17-28, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165614007810). [[Čiščenje rekombinantnih protiteles z obarjanjem z etanolom]]. Urška Rauter, 24. aprila 2015<br /> # Functional mutations in and characterization of VHH against ''Helicobacter pylori'' urease (R. Hoseinpoor ''et al''; Applied Biochemistry and Biotechnology 172, 3079-3091, 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s12010-014-0750-4). [[Funkcionalne mutacije in karakterizacija VHH proti ureazi Helicobacter pylori]]. Marko Radojković, 7. maja 2015<br /> <br /> '''Cepiva'''&lt;br&gt;<br /> # Development of anti-E6 pegylated lipoplexes for mucosal application in the context of cervical preneoplastic lesions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517315001507. [[Razvoj pegiliranih lipopleksov proti E6 za aplikacijo na sluznico pri predrakavih spremembah materničnega vratu]]. Tanja Korpar, 7. maja 2015<br /> # A novel “priming-boosting” strategy for immune interventions in cervical cancer (S. Liao et al.; Molecular Immunology 64, 295-305, 2015, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589014003460. [[Nova &quot;priming-boosting&quot; strategija za imunsko posredovanje pri raku materničnega vratu]]. Anita Kustec, 8. maja 2015<br /> # Potentiation of anthrax vaccines using protective antigen-expressing viral replicon vectors (H.C. Wang et al.; Immunology letters 163, 206-213, 2015, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25102364 ) [[Izboljšava cepiv proti antraksu z uporabo iz virusnih replikonov izvedenih vektorjev, ki omogočajo izražanje zaščitnega antigena.]] Daša Pavc, 8. maja 2015<br /> <br /> '''Male molekule in polimeri'''&lt;br&gt;<br /> # Methanol-induced chain termination in poly(3-hydroxybutyrate) biopolymers: Molecular weight control; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008307. Gašper Lavrenčič, 14. maja 2015<br /> # Purification and characterization of gamma poly glutamic acid from newly Bacillus licheniformis NRC20; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813014008216. Uroš Stupar, 14. maja 2015<br /> # Sequence-specific antimicrobials using efficiently delivered RNA-guided nucleases (Citorik RJ. ''et al''; Nature Biotechnology 32, 1141-1145, 2014; http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n11/full/nbt.3011.html). [[Sekven%C4%8Dno specifi%C4%8Dni antimikrobiki z uporabo RNA-usmerjenih nukleaz]] Iza Ogris, 15. maja 2015<br /> # Chromosomal integration of hyaluronic acid synthesis (''has'') genes enhances the molecular weight of hyaluronan produced in ''Lactococcus lactis'' (R. V. Hmar et al; Biotechnol. J. 9 (12), 2014; http://dx.doi.org/10.1002/biot.201400215) Integracija genov za sintezo hialuronske kisline v kromosom bakterije ''Lactococcus lactis'' izboljša sintezo visokomolekularne hialuronske kisline. Maja Grdadolnik, 15. maja 2015<br /> <br /> '''Pretvorba biomase'''&lt;br&gt;<br /> # Effect of pretreatment methods on the synergism of cellulase and xylanase during the hydrolysis of bagasse; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415002114. Eva Lucija Kozak, 21. maja 2015<br /> # Third generation biohydrogen production by Clostridium butyricum and adapted mixed cultures from Scenedesmus obliquus microalga biomass; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0016236115002550?np=y. Nives Naraglav, 22. maja 2015<br /> # Bio-catalytic action of twin-screw extruder enzymatic hydrolysis on the deconstruction of annual plant material: Case of sweet corn co-products; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0926669015000436. Griša Prinčič, 22. maja 2015<br /> <br /> '''Metabolično inženirstvo'''&lt;br&gt;<br /> # Engineering lipid overproduction in the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica;http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717615000166. Andreja Bratovš, 28. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals (Weerawat Runguphana, Jay D. Keasling; Metabolic Engineering, vol 21, January 2014, Pages 103–113; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717613000670). Metabolično inženirstvo ''Saccharomyces cerevisiae'' za proizvodnjo derivatov maščobnih kislin, ki so primerni za biogorivo in kemikalije. Dominik Kert, 29. maja 2015<br /> # Metabolic engineering of Klebsiella pneumoniae for the production of cis,cis-muconic acid (Jung,H.-M. Jung,M.-Y. Oh, M.-K.;Applied Microbiology and Biotechnology, Published online: 14 February 2015; http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-015-6442-3). Metabolno inženirstvo Klebsiella pneumoniae za produkcijo cis,cis-mukonične kisline. Jure Zabret, 29. maja 2015<br /> <br /> '''Biološki viri energije'''&lt;br&gt;<br /> # Anodic and cathodic microbial communities in single chamber microbial fuel cells; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1871678414021694. Tamara Marić, 4. junija 2015<br /> # Combination of dry dark fermentation and mechanical pretreatment for lignocellulosic deconstruction: An innovative strategy for biofuels and volatile fatty acids recovery; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0306261915002196. Jernej Pušnik, 4. junija 2015<br /> # Potential use of feedlot cattle manure for bioethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852415001960. Nastja Pirman, 5. junija 2015<br /> # Cellulolytic enzymes produced by a newly isolated soil fungus Penicillium sp. TG2 with potential for use in cellulosic ethanol production; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960148114007022. Jana Verbančič, 5. junija 2015<br /> <br /> '''Novi pristopi v molekularni biotehnologiji'''&lt;br&gt;<br /> # Exploring the potential of algae/bacteria interactions; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166915000269. Matja Zalar, 11. junija<br /> # How close we are to achieving commercially viable large-scale photobiological hydrogen production by cyanobacteria: A review of the biological aspects; http://www.mdpi.com/2075-1729/5/1/997/htm. Monika Škrjanc, 11. junija<br /> # Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant (M. Folcher; Nature Communications 5, 1–11, 2014; http://www.nature.com/ncomms/2014/141111/ncomms6392/full/ncomms6392.html) Z EEG nadzorovano izražanje transgena preko brezžično napajanega optogenetskega celičnega vsadka. Luka Smole, 11. junija 2015</div>

Daša Pavc https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=MBT_seminarji_2015&diff=10174 2015-03-14T17:45:36Z

<p>Daša Pavc: </p> <hr /> <div>'''Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2014/15'''<br /> <br /> Tabela za razpored po tednih bo objavljena v spletni učilnici, vanjo pa se vpišite tudi za kratke predstavitve novic (3 min, dvakrat v semestru). Na tej strani bo samo seznam odobrenih člankov za seminar in povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje tri dni pred predstavitvijo (ponedeljek oz. torek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. lani).<br /> <br /> Način vnosa:<br /> <br /> # The importance of ''Arabidopsis'' glutathione peroxidase 8 for protecting ''Arabidopsis'' plant and ''E. coli'' cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops &amp; Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline ''Arabidopsis thaliana'' in bakterije ''Escherichia coli'' pred oksidativnim stresom. Janez Novak, 15. marca 2014<br /> (slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)<br /> <br /> <br /> '''Naslovi odobrenih člankov po temah:'''<br /> <br /> '''Gensko spremenjene rastline'''&lt;br&gt;<br /> <br /> # Successful high-level accumulation of fish oil omega-3 long-chain polyunsaturated fatty acids in a transgenic oilseed crop (Ruiz-Lopez, N., et al; The plant journal 77, 198-208, 2014; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24308505). [[Uspešna priprava gensko spremenjene oljne rastline z visoko vsebnostjo omega-3 polinenasičenih maščobnih kislin.]] Petra Malavašič, 20. marca 2015<br /> # Matej Lesar, 20.marca 2015<br /> <br /> '''Gensko spremenjene živali'''&lt;br&gt;<br /> <br /> # A novel adenoviral vector carrying an all-in-one Tet-On system with an autoregulatory loop for tight, inducible transgene expresion (H. Chen; et all.; BMC Biotechnology 2015, 15:4, doi:10.1186/s12896-015-0121-4; http://www.biomedcentral.com/1472-6750/15/4). Edvinas Grauželis, 27. marca 2015 (in English)<br /> # Production of functional active human growth factors in insects used as living biofactories (B. Dudognon, et al; Journal of Biotechnology 184, 229–239, 2014; http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2014.05.030). Proizvodnja funkcionalno aktivnih človeških rastnih faktorjev v insektih uporabljenih kot žive biotovarne. Maxi Sagmeister, 27. marca 2015<br /> <br /> '''Okolje'''&lt;br&gt;<br /> # Bioremediation of pesticide contaminated water using an organophosphate degrading enzyme immobilized on nonwoven polyester textiles (Yuan Gao ''et al.'', Enzyme and Microbial Technology, vol. 54, pages 38-44, 10.1.2014, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141022913002044). Bioremediacija s pesticidi okužene vode z uporabo encima, ki razgrajuje organofosfate in je vezan na netkan poliesterski tekstil. Mitja Crček,<br /> # Mirjam Kmetič<br /> <br /> '''Terapevtiki'''&lt;br&gt;<br /> # Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant (M. Folcher; Nature Communications 5, 1–11, 2014; http://www.nature.com/ncomms/2014/141111/ncomms6392/full/ncomms6392.html) Z EEG nadzorovano izražanje transgena preko brezžično napajanega optogenetskega celičnega vsadka. Luka Smole, 9. marca 2015<br /> <br /> '''Encimi'''&lt;br&gt;<br /> <br /> # Construction of efficient xylose utilizing ''Pichia pastoris'' for industrial enzyme production (Li ''et al''; Microbial Cell Factories 14:22, 1-10, 2015; http://www.microbialcellfactories.com/content/14/1/22). Priprava ''Pichie pastoris'', ki učinkovito uporablja ksilozo, za industrijsko proizvodnjo encimov. Špela Tomaž<br /> <br /> '''Protitelesa'''&lt;br&gt; <br /> <br /> # Functional mutations in and characterization of VHH against Helicobacter pylori urease (R. Hoseinpoor ''et al''; Applied Biochemistry and Biotechnology 172, 3079-3091, 2014; http://link.springer.com/article/10.1007/s12010-014-0750-4.html). Funkcionalne mutacije in karakterizacija VHH proti ureazi ''Helicobacter pylori''. Marko Radojković, 9. marca 2015<br /> #Ethanol precipitation for purification of recombinant antibodies (A. Tscheliessnig ''et al''; Journal of Biotechnology 188, 17-28, 2014; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165614007810). Čiščenje rekombinantnih protiteles z obarjanjem z etanolom. Urška Rauter, 10. marca 2015<br /> <br /> '''Cepiva'''&lt;br&gt;<br /> <br /> # A novel “priming-boosting” strategy for immune interventions in cervical cancer (S. Liao et al.; Molecular Immunology 64, 295-305, 2015, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589014003460. Nova &quot;priming-boosting&quot; strategija za imunsko posredovanje pri raku materničnega vratu. Anita Kustec, 11. marca 2015<br /> # Potentiation of anthrax vaccines using protective antigen-expressing viral replicon vectors (H.C. Wang et al.; Immunology letters 163, 206-213, 2015, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25102364 ) Izboljšava cepiv proti antraksu z uporabo iz virusnih replikonov izvedenih vektorjev, ki omogočajo izražanje zaščitnega antigena. Daša Pavc<br /> <br /> '''Male molekule in polimeri'''&lt;br&gt;<br /> Iza Ogris&lt;br&gt;<br /> Maja Grdadolnik<br /> <br /> '''Pretvorba biomase'''&lt;br&gt;<br /> <br /> '''Metabolično inženirstvo'''&lt;br&gt;<br /> <br /> # Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for production of fatty acid-derived biofuels and chemicals (Weerawat Runguphana, Jay D. Keasling; Metabolic Engineering, vol 21, January 2014, Pages 103–113; http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1096717613000670). Metabolično inženirstvo ''Saccharomyces cerevisiae'' za proizvodnjo derivatov maščobnih kislin, ki so primerni za biogorivo in kemikalije. Dominik Kert, 9. marca 2015<br /> <br /> '''Biološki viri energije'''&lt;br&gt;</div>

Daša Pavc