https://wiki.fkkt.uni-lj.si/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Erik+Starc 2026-04-08T14:05:01Z User contributions MediaWiki 1.39.3 https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=EF-dlan_(EF-hand)&diff=8505 2013-11-10T14:33:30Z

<p>Erik Starc: New page: EF-dlan oziroma EF-hand je strukturna domena proteina, ki vsebuje motiv vijačnica-zanka-vijačnica, sestavljen ponavadi iz dveh alfa vijačnic (E-vijačnica in F-vijačnica) in kratke zan...</p> <hr /> <div>EF-dlan oziroma EF-hand je strukturna domena proteina, ki vsebuje motiv vijačnica-zanka-vijačnica, sestavljen ponavadi iz dveh alfa vijačnic (E-vijačnica in F-vijačnica) in kratke zanke (običajno okoli 12 aminokislin), ki veže kalcijeve ione. ([http://en.wikipedia.org/wiki/File:Basic_helix_loop_helix.png slika dveh alfa vijačnic in zanke])<br /> <br /> Ta motiv je v obliki razširjenega palca in kazalca človeške roke ([http://classconnection.s3.amazonaws.com/234/flashcards/113234/png/41352432396297.png slika EF-dlani]), kjer so kalcijevi (2+) ioni koordinirani ligandi znotraj zanke. Zanka lahko sprejme kalcij ali magnezij z različnimi geometrijami: magnezij se običajno veže z šestimi ligandi v oktaeder, medtem ko pa sedem ligandov na ogljiščih peterokotne bipiramide koordinira kalcij. <br /> <br /> Ime sta zasnovala Kretsinger in Nockolds, pred več kot petindvajsetimi leti, kot grafični opis vezave kalcija v proteinu [http://en.wikipedia.org/wiki/Parvalbumin parvalbumin]. Vezava kalcija lahko povzroči potencialne premike (npr. raztegljivost polipeptidov), ki jih zaznamo v obliki razširjenega palca in kazalca. <br /> Funkcije proteinov ki vsebujejo EF-dlan motive so:<br /> <br /> -kalcijevi pufri v citosolu<br /> <br /> -prenos signalov med celičnimi predelki in mišičnim krčenjem<br /> <br /> Družina proteinov z EF-dlan motivom ima vsaj še 66 poddružin. Ti proteini so razdeljeni v dve glavni skupini: <br /> <br /> -kanonične EF-dlani<br /> <br /> -Navidezne EF-dlani<br /> <br /> Motiv EF dlani se pojavi naprimer v signalnem proteinu [http://en.wikipedia.org/wiki/Calmodulin kalmodulinu] in v mišičnem proteinu [http://en.wikipedia.org/wiki/Troponin_C troponinu-C].<br /> <br /> === Viri in Literatura ===<br /> * [http://web1.johnshopkins.edu/csl/academics/580427/rsc/580427_4_efhandreview_032106.pdf EF-hand calcium-binding proteins, pdf]<br /> * [http://en.wikipedia.org/wiki/EF_hand EF-hand, Wikipedija]<br /> <br /> [[Category:LEX]]</div>

Erik Starc