Wiki FKKT - User contributions [en]

Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo

2010-03-14T10:22:07Z

Jaka Glavac: /* Encimatika */

=Seznam novic po področjih=
Novico, ki jo boste predstavili, uvrstite v kategorijo, kamor mislite, da najbolj sodi. Vpišite naslov seminarja v slovenščini, hkrati pa naj bo naslov povezava na novo stran, kjer boste pripravili opis (kratki povzetek - 200 besed). Dopišite svoje ime in datum predstavitve. (Če si ne predstavljate, kako naj bi to naredili, si oglejte [[BiokemSeminar-SeznamNovic-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]).

===Encimatika===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] Jaka Glavač, 31.3.2010 

===Biokemija bolezni===

===Nevrobiokemija===

===Genomika===

===Celična biokemija===

===Hormonska regulacija===

===Metabolizem===

===Signalne poti v celicah===

===Imunologija===

===Molekularna genetika===

===Proteomika===

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-14T10:11:07Z

Jaka Glavac: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 
''Recenzenta: ''
2 Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''
3 Nina Kostevšek 
''Recenzenta: ''
4 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: ''
5 Petra Metul 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer 
''Recenzenta: ''
2 Jerca Pahor 
''Recenzenta: ''
3 Simon Kovačič 
''Recenzenta: ''
4 Sarah Klemenak 
''Recenzenta: ''
5 Špela Smukavec 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer 
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10 
''Recenzenta: ''

Odkrite nove stopnje TauD reakcije

2010-03-14T10:03:25Z

Jaka Glavac:

Ekipa znanstvenikov z [http://www.msu.edu/ Michigan State University] je z novo razvito metodo hlajenja odkrila nove stopnje delovanja encima taurin/α-ketoglutarat-dioksigenaza, poznanega kot [http://en.wikipedia.org/wiki/Taurine_dioxygenase TauD]. Odkritje je zanimivo zlasti zato, ker bi lahko pripomoglo raziskovalcem razviti nova zdravila in razumeti kako encimi popravljajo DNA.

TauD je bakterijski encim, ki je pomemben pri metabolizmu. Sposoben je popravljati DNA, zaznavati kisik in pomagati proizvajati antibiotike. Ekipo z MSU so še posebej zanimale reakcije kisika in železa v encimu. »Razumevanje delovanja TauD, ki služi kot primer za mnogo ostalih proteinov, ima uporabno vrednost tudi na drugih znanstvenih področjih,« pravi [http://www.bch.msu.edu/faculty/hausinger.htm Robert Hausinger], profesor mikrobiologije in molekularne genetike na MSU.

Za primer je Hausinger navedel, da lahko razumevanje delovanja TauD pomaga znanstvenikom razviti inhibitorje, ki preprečujejo delovanje tega encima, kar je ključnega pomena pri preprečevanju nekaterih bolezni. Razumevanje kako železo vstavlja kisikove atome v druge molekule omogoča vpogled v to, kako encimi v človeškem telesu presnavljajo večino zdravil ali škodljivih tujkov.

Ker je delovanje encimov lahko zelo zapleteno, je ekipa z MSU razvila novo metodo sledenja TauD reakcije. Njen potek so spremljali tako, da so z [http://en.wikipedia.org/wiki/Raman_spectroscopy Ramanovo spektroskopijo] opazovali vibracije železovih in kisikovih atomov v TauD. Pri tem so opazili nove stopnje TauD reakcije.

Najtežji del raziskovanja je bil upočasniti reakcijo do te mere, da so lahko opazovali posamezne korake. To so dosegli z znižanjem temperature na -36°C, pri čemer so uporabili tok mrzlega dušika. Da so preprečili zmrzovanje reakcijske zmesi, so uporabili etilen glikol.

Odkrite nove stopnje TauD reakcije

2010-03-14T10:02:56Z

Jaka Glavac: User:Jaka Glavac moved to Odkrite nove stopnje TauD reakcije

'''Odkrite nove stopnje TauD reakcije'''

Ekipa znanstvenikov z [http://www.msu.edu/ Michigan State University] je z novo razvito metodo hlajenja odkrila nove stopnje delovanja encima taurin/α-ketoglutarat-dioksigenaza, poznanega kot [http://en.wikipedia.org/wiki/Taurine_dioxygenase TauD]. Odkritje je zanimivo zlasti zato, ker bi lahko pripomoglo raziskovalcem razviti nova zdravila in razumeti kako encimi popravljajo DNA.

TauD je bakterijski encim, ki je pomemben pri metabolizmu. Sposoben je popravljati DNA, zaznavati kisik in pomagati proizvajati antibiotike. Ekipo z MSU so še posebej zanimale reakcije kisika in železa v encimu. »Razumevanje delovanja TauD, ki služi kot primer za mnogo ostalih proteinov, ima uporabno vrednost tudi na drugih znanstvenih področjih,« pravi [http://www.bch.msu.edu/faculty/hausinger.htm Robert Hausinger], profesor mikrobiologije in molekularne genetike na MSU.

Za primer je Hausinger navedel, da lahko razumevanje delovanja TauD pomaga znanstvenikom razviti inhibitorje, ki preprečujejo delovanje tega encima, kar je ključnega pomena pri preprečevanju nekaterih bolezni. Razumevanje kako železo vstavlja kisikove atome v druge molekule omogoča vpogled v to, kako encimi v človeškem telesu presnavljajo večino zdravil ali škodljivih tujkov.

Ker je delovanje encimov lahko zelo zapleteno, je ekipa z MSU razvila novo metodo sledenja TauD reakcije. Njen potek so spremljali tako, da so z [http://en.wikipedia.org/wiki/Raman_spectroscopy Ramanovo spektroskopijo] opazovali vibracije železovih in kisikovih atomov v TauD. Pri tem so opazili nove stopnje TauD reakcije.

Najtežji del raziskovanja je bil upočasniti reakcijo do te mere, da so lahko opazovali posamezne korake. To so dosegli z znižanjem temperature na -36°C, pri čemer so uporabili tok mrzlega dušika. Da so preprečili zmrzovanje reakcijske zmesi, so uporabili etilen glikol.

Odkrite nove stopnje TauD reakcije

2010-03-14T10:00:22Z

Jaka Glavac: New page: '''Odkrite nove stopnje TauD reakcije''' Ekipa znanstvenikov z [http://www.msu.edu/ Michigan State University] je z novo razvito metodo hlajenja odkrila nove stopnje delovanja encima tau...

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-01T10:19:39Z

Jaka Glavac: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 
''Recenzenta: ''
2 
''Recenzenta: ''
3 Nina Kostevšek 
''Recenzenta: ''
4 Jaka Glavač 
''Recenzenta: ''
5 Petra Metul 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer 
''Recenzenta: ''
2 Jerca Pahor 
''Recenzenta: ''
3 Simon Kovačič 
''Recenzenta: ''
4 Sarah Klemenak 
''Recenzenta: ''
5 Špela Smukavec 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin 
''Recenzenta: ''Katja Klun
2 
''Recenzenta: ''Lara Pavcnik
3 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer 
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 
''Recenzenta: ''
3 
''Recenzenta: ''
4 
''Recenzenta: ''
5 
''Recenzenta: ''

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-01T10:18:35Z

Jaka Glavac: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 
''Recenzenta: ''
2 
''Recenzenta: ''
3 Nina Kostevšek 
''Recenzenta: ''
4 Jaka Glavač 
''Recenzenta: ''
5 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer 
''Recenzenta: ''
2 Jerca Pahor 
''Recenzenta: ''
3 Simon Kovačič 
''Recenzenta: ''
4 Sarah Klemenak 
''Recenzenta: ''
5 Špela Smukavec 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin 
''Recenzenta: ''Katja Klun
2 
''Recenzenta: ''Lara Pavcnik
3 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer 
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 
''Recenzenta: ''
3 
''Recenzenta: ''
4 
''Recenzenta: ''
5 
''Recenzenta: ''