Wiki FKKT - User contributions [en]

Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo

2010-03-25T19:18:02Z

Jerca Pahor:

[http://en.wikipedia.org/wiki/Aminoacyl_tRNA_synthetase Aminoacil-tRNA-sinteaza] je encim proteinske sestave, ključen pri [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_biosynthesis sintezi proteinov]. Ker je nemogoče, da bi bili primitivni proteini na začetku evolucije sintetizirani s pomočjo kompleksnega proteinskega encima, znanstveniki predpostavljajo, da je pri tem sodelovala RNA. Raziskovalna skupina iz univerze v Koloradu v raziskavi objavljeni v [http://www.pnas.org/content/early/2010/02/12/0912895107.full.pdf+html?sid=f667bacd-17ff-4a4e-8f2a-7f9dd287f97f Proceedings of the National Academy of Sciences] pokaže, da enaka aktivnost obstoji tudi v zelo majhni, zgolj 5 nukleotidov dolgi RNA.

Kompleks pet nukleotidov dolgega [http://en.wikipedia.org/wiki/Ribozyme ribocima] in štiri nukleotide dolgega substrata je najmanjši, ki je še uspešno kataliziral raziskovano aminoacilacijo. Poskusi pokažejo, da ribocim veže aminokislino na delno komplementarno štiri nukleotide dolgo RNA (substrat) na 2`-terminalno hidroksilno skupino, mesto vezave je torej identično kot v moderni encimski aminoacil-tRNA sintezi.

Poleg začetnega produkta aminoacil-RNA pri reakciji nastanejo tudi večkratni produkti (dipeptidil- in tripeptidi-RNA), torej ribocim poleg vezave aminokisline na RNA poskrbi tudi za nadaljnjo podaljševanje peptidne verige.

V nasprotju z večino ribocimov kompleks za svoje delovanje ne potrebuje dvovalentnih kationov. Reakcija poteka tudi v prisotnosti le enovalentih, kar potrjuje možnost, da bi mehanizem lahko deloval v primitivnem okolju, kjer je prisotnost različnih ionov variirala.

Odkritje tega majhnega segmenta RNA, močno potrjuje možnost, da je bila RNA ena prvih funkcionalnih biomolekul na zemlji in da so bile prve sinteze preprostih proteinov katalizirane prav z RNA.

Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo

2010-03-24T11:02:41Z

Jerca Pahor:

[http://en.wikipedia.org/wiki/Aminoacyl_tRNA_synthetase Aminoacil-tRNA-sinteaza] je encim proteinske sestave, ključen pri [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_biosynthesis sintezi proteinov]. Ker je nemogoče, da bi bili primitivni proteini na začetku evolucije sintetizirani s pomočjo kompleksnega proteinskega encima, znanstveniki predpostavljajo, da je pri tem sodelovala RNA. Raziskovalna skupina iz univerze v Koloradu v raziskavi objavljeni v [http://www.pnas.org/content/early/2010/02/12/0912895107.full.pdf+html?sid=f667bacd-17ff-4a4e-8f2a-7f9dd287f97f Proceedings of the National Academy of Sciences pokaže], da enaka aktivnost obstoji tudi v zelo majhni, zgolj 5 nukleotidov dolgi RNA.

Kompleks pet nukleotidov dolgega [http://en.wikipedia.org/wiki/Ribozyme ribocima] in štiri nukleotide dolgega substrata je najmanjši, ki je še uspešno kataliziral raziskovano aminoacilacijo. Poskusi pokažejo, da ribocim veže aminokislino na delno komplementarno štiri nukleotide dolgo RNA (substrat) na 2`-terminalno hidroksilno skupino, mesto vezave je torej identično kot v moderni encimski aminoacil-tRNA sintezi.

Poleg začetnega produkta aminoacil-RNA pri reakciji nastanejo tudi večkratni produkti (dipeptidil- in tripeptidi-RNA), torej ribocim poleg vezave aminokisline na RNA poskrbi tudi za nadaljnjo podaljševanje peptidne verige.

V nasprotju z večino ribocimov kompleks za svoje delovanje ne potrebuje dvovalentnih kationov. Reakcija poteka tudi v prisotnosti le enovalentih, kar potrjuje možnost, da bi mehanizem lahko deloval v primitivnem okolju, kjer je prisotnost različnih ionov variirala.

Odkritje tega majhnega segmenta RNA, močno potrjuje možnost, da je bila RNA ena prvih funkcionalnih biomolekul na zemlji in da so bile prve sinteze preprostih proteinov katalizirane prav z RNA.

Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo

2010-03-24T10:59:31Z

Jerca Pahor:

[http://en.wikipedia.org/wiki/Aminoacyl_tRNA_synthetase Aminoacil-tRNA-sinteaza] je encim proteinske sestave, ključen pri [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_biosynthesis sintezi proteinov]. Ker je nemogoče, da bi bili primitivni proteini na začetku evolucije sintetizirani s pomočjo kompleksnega proteinskega encima, znanstveniki predpostavljajo, da je pri tem sodelovala RNA. Raziskovalna skupina iz univerze v Koloradu v raziskavi objavljeni v [http://www.pnas.org/content/early/2010/02/12/0912895107.full.pdf+html?sid=f667bacd-17ff-4a4e-8f2a-7f9dd287f97f Proceedings of the National Academy] of Sciences pokaže, da enaka aktivnost obstoji tudi v zelo majhni, zgolj 5 nukleotidov dolgi RNA.

Kompleks pet nukleotidov dolgega [http://en.wikipedia.org/wiki/Ribozyme ribocima] in štiri nukleotide dolgega substrata je najmanjši, ki je še uspešno kataliziral raziskovano aminoacilacijo. Poskusi pokažejo, da ribocim veže aminokislino na delno komplementarno štiri nukleotide dolgo RNA (substrat) na 2`-terminalno hidroksilno skupino, mesto vezave je torej identično kot v moderni encimski aminoacil-tRNA sintezi.

Poleg začetnega produkta aminoacil-RNA pri reakciji nastanejo tudi večkratni produkti (dipeptidil- in tripeptidi-RNA), torej ribocim poleg vezave aminokisline na RNA poskrbi tudi za nadaljnjo podaljševanje peptidne verige.

V nasprotju z večino ribocimov, kompleks za svoje delovanje ne potrebuje dvovalentnih kationov. Reakcija poteka tudi v prisotnosti le enovalentih, kar potrjuje možnost, da bi mehanizem lahko deloval v primitivnem okolju, kjer je prisotnost različnih ionov variirala.

Odkritje tega majhnega segmenta RNA, močno potrjuje možnost, da je bila RNA ena prvih funkcionalnih biomolekul na zemlji in da so bile prve sinteze preprostih proteinov katalizirane prav z RNA.

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-24T10:57:15Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 Nina Kostevšek - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100305112157.htm ] 
''Recenzentki: Majda Pavlin, Marta Jagodic ''
2 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: Matic Pavlin, Katja Krancan ''
3 Petra Metul - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] [http://www.sciencedaily.com/releases/2009/12/091222122025.htm] [http://www.pnas.org/content/107/4/1289.full] 
''Recenzenta: Barbara Komatar, Aljoša Bolje ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] [[http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100311175041.htm]] 
''Recenzentki: Anita Podgoršek, Laura Učakar ''
2 Jerca Pahor - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/02/100222162009.htm] 
''Recenzentki: Monika Podgoršek, Petra Rusjan ''
3 Simon Kovačič - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] 
''Recenzenta: Alen Vižintin, Katja Klun ''
4 Sarah Klemenak - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100303141930.htm] 
''Recenzentki: Lara Pavčnik, Jana Štok ''
5 Špela Smukavec - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave][http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=assisted-reproduction-genetics] ''Recenzentki: Jerneja Koren, Maša Benedičič ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar - Drug Metabolism: How Enzymes Interact Is Important to Toxicity and Effectiveness 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic - Nivo izražanja nekaterih genov je ključen pri Altzheimerjevi bolezni. 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin -Ali raziskave nove hormonske terapije zmanjšujejo neplodnost pri ženskah?
 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje-Prostorsko urejena dinamika (ciano)bakterijske vezave ogljika [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100304142247.htm][http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/327/5970/1258]

''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek -Chemical in Bananas Identified as Potent Inhibitor of HIV Infection 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek- Communication Breakdown: What Happens to Nerve Cells in Parkinson's Disease 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar - What Makes You Unique? Not Genes So Much as Surrounding Sequences, Study Finds 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan - [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100125173246.htm Uporaba aktivne oblike človeškega inzulina, osnovanega na strukturnem zbliževanju visoko aktivnih analogov hormona] 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin - Odstranjevanje peptida Aß preprečuje toksičnost in spodbuja njegovo razgradnjo in vivo [http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000334] 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer Mechanism of herpes simplex virus type 2 suppression by propolis extracts
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10.Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''

Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo

2010-03-24T10:55:28Z

Jerca Pahor: /* Encimatika */

=Seznam novic po področjih=
Novico, ki jo boste predstavili, uvrstite v kategorijo, kamor mislite, da najbolj sodi. Vpišite naslov seminarja v slovenščini, hkrati pa naj bo naslov povezava na novo stran, kjer boste pripravili opis (kratki povzetek - 200 besed). Dopišite svoje ime in datum predstavitve. (Če si ne predstavljate, kako naj bi to naredili, si oglejte [[BiokemSeminar-SeznamNovic-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]).

===Encimatika===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] Jaka Glavač, 31.3.2010 
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo] Jerca Pahor, 7.4.2010 

===Biokemija bolezni===

===Nevrobiokemija===

===Genomika===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave] Špela Smukavec, 7.4.2010

===Celična biokemija===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] Petra Metul, 31.3.2010

[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] Simon Kovačič, 7.4.2010

===Hormonska regulacija===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] Nina Kostevšek, 31.3.2010

===Metabolizem===

===Signalne poti v celicah===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] Lovro Kramer, 7. 4. 2010

===Imunologija===

===Molekularna genetika===
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje] Sarah Klemenak, 7.4.2010

===Proteomika===

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-24T10:51:20Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 Nina Kostevšek - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100305112157.htm ] 
''Recenzentki: Majda Pavlin, Marta Jagodic ''
2 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: Matic Pavlin, Katja Krancan ''
3 Petra Metul - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] [http://www.sciencedaily.com/releases/2009/12/091222122025.htm] [http://www.pnas.org/content/107/4/1289.full] 
''Recenzenta: Barbara Komatar, Aljoša Bolje ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] [[http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100311175041.htm]] 
''Recenzentki: Anita Podgoršek, Laura Učakar ''
2 Jerca Pahor - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/02/100222162009.htm]

''Recenzentki: Monika Podgoršek, Petra Rusjan ''
3 Simon Kovačič - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] 
''Recenzenta: Alen Vižintin, Katja Klun ''
4 Sarah Klemenak - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100303141930.htm] 
''Recenzentki: Lara Pavčnik, Jana Štok ''
5 Špela Smukavec - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave][http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=assisted-reproduction-genetics] ''Recenzentki: Jerneja Koren, Maša Benedičič ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar - Drug Metabolism: How Enzymes Interact Is Important to Toxicity and Effectiveness 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic - Nivo izražanja nekaterih genov je ključen pri Altzheimerjevi bolezni. 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin -Ali raziskave nove hormonske terapije zmanjšujejo neplodnost pri ženskah?
 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje-Prostorsko urejena dinamika (ciano)bakterijske vezave ogljika [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100304142247.htm][http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/327/5970/1258]

''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek -Chemical in Bananas Identified as Potent Inhibitor of HIV Infection 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek- Communication Breakdown: What Happens to Nerve Cells in Parkinson's Disease 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar - What Makes You Unique? Not Genes So Much as Surrounding Sequences, Study Finds 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan - [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100125173246.htm Uporaba aktivne oblike človeškega inzulina, osnovanega na strukturnem zbliževanju visoko aktivnih analogov hormona] 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin - Odstranjevanje peptida Aß preprečuje toksičnost in spodbuja njegovo razgradnjo in vivo [http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000334] 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer Mechanism of herpes simplex virus type 2 suppression by propolis extracts
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10.Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-24T10:50:17Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 Nina Kostevšek - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100305112157.htm ] 
''Recenzentki: Majda Pavlin, Marta Jagodic ''
2 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: Matic Pavlin, Katja Krancan ''
3 Petra Metul - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] [http://www.sciencedaily.com/releases/2009/12/091222122025.htm] [http://www.pnas.org/content/107/4/1289.full] 
''Recenzenta: Barbara Komatar, Aljoša Bolje ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] [[http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100311175041.htm]] 
''Recenzentki: Anita Podgoršek, Laura Učakar ''
2 Jerca Pahor - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/02/100222162009.htm]
''Recenzentki: Monika Podgoršek, Petra Rusjan ''
3 Simon Kovačič - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] 
''Recenzenta: Alen Vižintin, Katja Klun ''
4 Sarah Klemenak - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100303141930.htm] 
''Recenzentki: Lara Pavčnik, Jana Štok ''
5 Špela Smukavec - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave][http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=assisted-reproduction-genetics] ''Recenzentki: Jerneja Koren, Maša Benedičič ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar - Drug Metabolism: How Enzymes Interact Is Important to Toxicity and Effectiveness 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic - Nivo izražanja nekaterih genov je ključen pri Altzheimerjevi bolezni. 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin -Ali raziskave nove hormonske terapije zmanjšujejo neplodnost pri ženskah?
 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje-Prostorsko urejena dinamika (ciano)bakterijske vezave ogljika [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100304142247.htm][http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/327/5970/1258]

''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek -Chemical in Bananas Identified as Potent Inhibitor of HIV Infection 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek- Communication Breakdown: What Happens to Nerve Cells in Parkinson's Disease 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar - What Makes You Unique? Not Genes So Much as Surrounding Sequences, Study Finds 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan - [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100125173246.htm Uporaba aktivne oblike človeškega inzulina, osnovanega na strukturnem zbliževanju visoko aktivnih analogov hormona] 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin - Odstranjevanje peptida Aß preprečuje toksičnost in spodbuja njegovo razgradnjo in vivo [http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000334] 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer Mechanism of herpes simplex virus type 2 suppression by propolis extracts
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10.Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-24T10:48:01Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 Nina Kostevšek - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100305112157.htm ] 
''Recenzentki: Majda Pavlin, Marta Jagodic ''
2 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: Matic Pavlin, Katja Krancan ''
3 Petra Metul - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] [http://www.sciencedaily.com/releases/2009/12/091222122025.htm] [http://www.pnas.org/content/107/4/1289.full] 
''Recenzenta: Barbara Komatar, Aljoša Bolje ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] [[http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100311175041.htm]] 
''Recenzentki: Anita Podgoršek, Laura Učakar ''
2 Jerca Pahor - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/02/100222162009.htm]

''Recenzentki: Monika Podgoršek, Petra Rusjan ''
3 Simon Kovačič - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] 
''Recenzenta: Alen Vižintin, Katja Klun ''
4 Sarah Klemenak - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100303141930.htm] 
''Recenzentki: Lara Pavčnik, Jana Štok ''
5 Špela Smukavec - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave][http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=assisted-reproduction-genetics] ''Recenzentki: Jerneja Koren, Maša Benedičič ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar - Drug Metabolism: How Enzymes Interact Is Important to Toxicity and Effectiveness 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic - Nivo izražanja nekaterih genov je ključen pri Altzheimerjevi bolezni. 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin -Ali raziskave nove hormonske terapije zmanjšujejo neplodnost pri ženskah?
 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje-Prostorsko urejena dinamika (ciano)bakterijske vezave ogljika [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100304142247.htm][http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/327/5970/1258]

''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek -Chemical in Bananas Identified as Potent Inhibitor of HIV Infection 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek- Communication Breakdown: What Happens to Nerve Cells in Parkinson's Disease 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar - What Makes You Unique? Not Genes So Much as Surrounding Sequences, Study Finds 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan - [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100125173246.htm Uporaba aktivne oblike človeškega inzulina, osnovanega na strukturnem zbliževanju visoko aktivnih analogov hormona] 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin - Odstranjevanje peptida Aß preprečuje toksičnost in spodbuja njegovo razgradnjo in vivo [http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000334] 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer Mechanism of herpes simplex virus type 2 suppression by propolis extracts
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10.Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-24T10:46:54Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 Nina Kostevšek - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100305112157.htm ] 
''Recenzentki: Majda Pavlin, Marta Jagodic ''
2 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: Matic Pavlin, Katja Krancan ''
3 Petra Metul - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] [http://www.sciencedaily.com/releases/2009/12/091222122025.htm] [http://www.pnas.org/content/107/4/1289.full] 
''Recenzenta: Barbara Komatar, Aljoša Bolje ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] [[http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100311175041.htm]] 
''Recenzentki: Anita Podgoršek, Laura Učakar ''
2 Jerca Pahor - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo]
''Recenzentki: Monika Podgoršek, Petra Rusjan ''
3 Simon Kovačič - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] 
''Recenzenta: Alen Vižintin, Katja Klun ''
4 Sarah Klemenak - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100303141930.htm] 
''Recenzentki: Lara Pavčnik, Jana Štok ''
5 Špela Smukavec - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave][http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=assisted-reproduction-genetics] ''Recenzentki: Jerneja Koren, Maša Benedičič ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar - Drug Metabolism: How Enzymes Interact Is Important to Toxicity and Effectiveness 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic - Nivo izražanja nekaterih genov je ključen pri Altzheimerjevi bolezni. 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin -Ali raziskave nove hormonske terapije zmanjšujejo neplodnost pri ženskah?
 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje-Prostorsko urejena dinamika (ciano)bakterijske vezave ogljika [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100304142247.htm][http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/327/5970/1258]

''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek -Chemical in Bananas Identified as Potent Inhibitor of HIV Infection 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek- Communication Breakdown: What Happens to Nerve Cells in Parkinson's Disease 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar - What Makes You Unique? Not Genes So Much as Surrounding Sequences, Study Finds 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan - [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100125173246.htm Uporaba aktivne oblike človeškega inzulina, osnovanega na strukturnem zbliževanju visoko aktivnih analogov hormona] 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin - Odstranjevanje peptida Aß preprečuje toksičnost in spodbuja njegovo razgradnjo in vivo [http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000334] 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer Mechanism of herpes simplex virus type 2 suppression by propolis extracts
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10.Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-03-24T10:46:11Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Temo za seminar pošljite na naslov [mailto:marko.dolinar@fkkt.uni-lj.si docenta] najkasneje 3 tedne pred datumom predstavitve, novica, ki jo boste obdelali, pa na dan predstavitve ne sme biti starejša kot 2 meseca. Na naslov [mailto:metka.renko@fkkt.uni-lj.si prof. Renkove] pošljite ~ dvostranski seminar (900-1100 besed) do roka, ki je vpisan kot 'rok za oddajo 1. verzije' in to najkasneje do polnoči dneva, ki je naveden. Seminar morata do tega roka dobiti tudi oba recenzenta.

Če si ne predstavljate, kako naj bi ta seznam bil oblikovan, si oglejte [[BiokemSeminar-SkupineNovica-B09 | seznam letošnjih 2. letnikov Biokemije]]. 
Slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri nato opišite novico (200 besed). Hkrati vpišite slovenski naslov, svoje ime in datum predstavitve v [[Biokemijski seminar K3 - 2009/10 - Kazalo | kazalo]] in to v kategorijo, ki se vam zdi najustreznejša. Vpišete lahko tudi novo kategorijo.

Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji ([http://en.wikipedia.org/wiki/Help:Editing tule] v angleščini in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Wikipedija:Urejanje_strani tu] v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. ''Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.'' Recenzente bomo vpisali, ko bo seznam končan. Na posamezni uri so lahko na vrsti največ tri predstavitve.

----

== Seminarski roki: ==

'''Predstavitev 31.3.''' {rok za oddajo 1. verzije 17.3., recenzenti popravijo do 24.3.} 
1 Nina Kostevšek - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_vitamina_D_na_mpi%C5%A1i%C4%8Dno_mo%C4%8D_in_mi%C5%A1i%C4%8Dno_ma%C5%A1%C4%8Dobo_pri_mladih_%C5%BEenskah Vpliv vitamina D na mišično moč in mišično maščobo pri mladih ženskah] [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100305112157.htm ] 
''Recenzentki: Majda Pavlin, Marta Jagodic ''
2 Jaka Glavač - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Odkrite_nove_stopnje_TauD_reakcije Odkrite nove stopnje TauD reakcije] [http://news.msu.edu/story/7514/ (Vir)] 
''Recenzenta: Matic Pavlin, Katja Krancan ''
3 Petra Metul - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Metabolično_preoblikovanje_membrane_eritrocitov_pri_človeku Metabolično preoblikovanje membrane eritrocitov pri človeku] [http://www.sciencedaily.com/releases/2009/12/091222122025.htm] [http://www.pnas.org/content/107/4/1289.full] 
''Recenzenta: Barbara Komatar, Aljoša Bolje ''

'''Predstavitev 7.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 24.3., recenzenti popravijo do 31.3.} 
1 Lovro Kramer - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Prostorske_mutacije:_nov_na%C4%8Din_mehanskega_vpliva_na_signalni_proteinski_kompleks,_bistven_za_metastazo_rakastih_celic Prostorske mutacije: nov način mehanskega vpliva na signalni proteinski kompleks, bistven za metastazo rakastih celic] [[http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100311175041.htm]] 
''Recenzentki: Anita Podgoršek, Laura Učakar ''
2 Jerca Pahor - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zgolj_pet_nukleotidov_vsebujo%C4%8Da_molekula_RNA%2C_ki_uspe%C5%A1na_katalizira_aminoacilacijo Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo]
''Recenzentki: Monika Podgoršek, Petra Rusjan ''
3 Simon Kovačič - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Vpliv_SLO3_kalijevih_ionskih_kanalov_na_neplodnost_pri_samcih Vpliv SLO3 kalijevih ionskih kanalov na neplodnost pri samcih] 
''Recenzenta: Alen Vižintin, Katja Klun ''
4 Sarah Klemenak - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Gensko_zdravljenje Gensko zdravljenje][http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100303141930.htm] 
''Recenzentki: Lara Pavčnik, Jana Štok ''
5 Špela Smukavec - [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Umetno_oplojeni_otroci_imajo_večje_tveganje_za_zdravstvene_težave Umetno oplojeni otroci imajo večje tveganje za zdravstvene težave][http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=assisted-reproduction-genetics] ''Recenzentki: Jerneja Koren, Maša Benedičič ''

'''Predstavitev 14.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 31.3., recenzenti popravijo do 7.4.} 
1 Matic Pavlin 
''Recenzenta: ''
2 Barbara Komatar - Drug Metabolism: How Enzymes Interact Is Important to Toxicity and Effectiveness 
''Recenzenta: ''
3 Marta Jagodic - Nivo izražanja nekaterih genov je ključen pri Altzheimerjevi bolezni. 
''Recenzenta: ''
4 Majda Pavlin -Ali raziskave nove hormonske terapije zmanjšujejo neplodnost pri ženskah?
 
''Recenzenta: ''
5 Aljoša Bolje-Prostorsko urejena dinamika (ciano)bakterijske vezave ogljika [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/03/100304142247.htm][http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/327/5970/1258]

''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 21.4.''' {rok za oddajo 1. verzije 7.4., recenzenti popravijo do 14.4.} 
1 Katja Krancan 
''Recenzenta: ''
2 Anita Podgoršek -Chemical in Bananas Identified as Potent Inhibitor of HIV Infection 
''Recenzenta: ''
3 Monika Podgoršek- Communication Breakdown: What Happens to Nerve Cells in Parkinson's Disease 
''Recenzenta: ''
4 Laura Učakar - What Makes You Unique? Not Genes So Much as Surrounding Sequences, Study Finds 
''Recenzenta: ''
5 Petra Rusjan - [http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100125173246.htm Uporaba aktivne oblike človeškega inzulina, osnovanega na strukturnem zbliževanju visoko aktivnih analogov hormona] 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 5.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 14.4., recenzenti popravijo do 21.4.} 
1 Alen Vižintin - Odstranjevanje peptida Aß preprečuje toksičnost in spodbuja njegovo razgradnjo in vivo [http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1000334] 
''Recenzenta: ''
2 Katja Klun 
''Recenzenta: ''
3 Lara Pavcnik 
''Recenzenta: ''
4 Jana Štok 
''Recenzenta: ''
5 Jerneja Koren 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 12.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 21.4., recenzenti popravijo do 5.5.} 
1 Maša Benedičič 
''Recenzenta: ''
2 Danijela Pešl 
''Recenzenta: ''
3 Doroteja Špec 
''Recenzenta: '' 
4 Anja Pajer Mechanism of herpes simplex virus type 2 suppression by propolis extracts
''Recenzenta: ''
5 Anja Lah 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 19.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 5.5., recenzenti popravijo do 12.5.} 
1 Lea Kavčič 
''Recenzenta: ''
2 Melita Rutar 
''Recenzenta: ''
3 Mario Kurtjak 
''Recenzenta: ''
4 Simona Krošelj 
''Recenzenta: ''
5 Eva Aljancic 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 26.5.''' {rok za oddajo 1. verzije 12.5., recenzenti popravijo do 19.5.} 
1 Primoz Jovanovic 
''Recenzenta: ''
2 Žiga Rožman 
''Recenzenta: ''
3 Ema Javornik 
''Recenzenta: ''
4 Tomaž Semenič 
''Recenzenta: ''
5 Jan Bitenc 
''Recenzenta: ''

'''Predstavitev 2.6.''' {rok za oddajo 1. verzije 19.5., recenzenti popravijo do 26.5.} 
Predstavitve 1 - 5 bodo na 2. uri predavanj, 6 - 10 pa na seminarski uri.
1 Petra Špenko 
''Recenzenta: ''
2 Kim Pjevović 
''Recenzenta: ''
3 Tamara Vujanič 
''Recenzenta: ''
4 Vesna Vojska 
''Recenzenta: ''
5 Jan Robin 
''Recenzenta: ''
6 Nives Novak Gramc 
''Recenzenta: ''
7 Kaja Gosak 
''Recenzenta: ''
8 Mojca Peterlin
''Recenzenta: ''
9.Tina Šinkovec
''Recenzenta: ''
10.Marko Zmazek 
''Recenzenta: ''

Zgolj pet nukleotidov vsebujoča molekula RNA, ki uspešna katalizira aminoacilacijo

2010-03-24T10:43:07Z

Jerca Pahor: New page: Aminoacil-tRNA-sinteaza je encim proteinske sestave, ključen pri [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_biosynthesis sintezi proteinov]. Ker je nemogoče, da bi bili primitivni proteini na...

Aminoacil-tRNA-sinteaza je encim proteinske sestave, ključen pri [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_biosynthesis sintezi proteinov]. Ker je nemogoče, da bi bili primitivni proteini na začetku evolucije sintetizirani s pomočjo kompleksnega proteinskega encima, znanstveniki predpostavljajo, da je pri tem sodelovala RNA. Raziskovalna skupina iz univerze v Koloradu v raziskavi objavljeni v [http://www.pnas.org/content/early/2010/02/12/0912895107.full.pdf+html?sid=f667bacd-17ff-4a4e-8f2a-7f9dd287f97f Proceedings of the National Academy] of Sciences pokaže, da enaka aktivnost obstoji tudi v zelo majhni, zgolj 5 nukleotidov dolgi RNA.

Kompleks pet nukleotidov dolgega [http://en.wikipedia.org/wiki/Ribozyme ribocima] in štiri nukleotide dolgega substrata je najmanjši, ki je še uspešno kataliziral raziskovano aminoacilacijo. Poskusi pokažejo, da ribocim veže aminokislino na delno komplementarno štiri nukleotide dolgo RNA (substrat) na 2`-terminalno hidroksilno skupino, mesto vezave je torej identično kot v moderni encimski aminoacil-tRNA sintezi.

Poleg začetnega produkta aminoacil-RNA pri reakciji nastanejo tudi večkratni produkti (dipeptidil- in tripeptidi-RNA), torej ribocim poleg vezave aminokisline na RNA poskrbi tudi za nadaljnjo podaljševanje peptidne verige.

V nasprotju z večino ribocimov, kompleks za svoje delovanje ne potrebuje dvovalentnih kationov. Reakcija poteka tudi v prisotnosti le enovalentih, kar potrjuje možnost, da bi mehanizem lahko deloval v primitivnem okolju, kjer je prisotnost različnih ionov variirala.

Odkritje tega majhnega segmenta RNA, močno potrjuje možnost, da je bila RNA ena prvih funkcionalnih biomolekul na zemlji in da so bile prve sinteze preprostih proteinov katalizirane prav z RNA.

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-02-25T14:33:54Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-02-24T18:34:19Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */

Biokemijski seminar K3 - 2009/10

2010-02-24T17:12:23Z

Jerca Pahor: /* Seminarski roki: */