Wiki FKKT - User contributions [en]

Nukleaza S1

2013-01-03T20:14:31Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena) 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni pH njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost, so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[natrijev dodecil sulfat|NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-03T20:11:58Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena) 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni pH njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[natrijev dodecil sulfat|NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-03T20:04:35Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena) 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni pH njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS|natrijevega dodecil sulfata]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-03T20:02:44Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena) 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni pH njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS|natrijev dodecil sulfat]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-03T19:50:53Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena) 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4,0 – 4,6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni, v nekaterih primerih so aktivatorji lahko tudi Co2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-03T01:40:42Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://www.sigmaaldrich.com/prodimages/n/nucleases1_reaction_l.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

Nukleaza S1

2013-01-03T01:15:15Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]] [http://upload.wikimedia.org/wikipedia/sl/thumb/b/bb/Cepitev_2.jpg/315px-Cepitev_2.jpg (skica cepitve)].

Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

Nukleaza S1

2013-01-03T00:55:36Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA [[nukleaza S1#Viri|[1]]] 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1 from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma Aldrich Inc]
* [http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 Nuclease S1 EC=3.1.30.1, The Universal Protein Resource (UniProt)]

Nukleaza S1

2013-01-03T00:28:55Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 [[nukleaza S1#Viri|[1]]] ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

== Zunanje povezave ==
* [http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ S1 Mapping, Recent News, Molecular Station]
* [http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf Nuclease S1
from Aspergillus oryzae, Product Information, Sigma-Aldrich, Inc.]

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-03T00:12:38Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 [[nukleaza S1#Viri|[1]]] ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[2]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
* [1] [http://www.jbc.org/content/250/22/8848.full.pdf+html R C Wiegand, G N Godson and C M Radding: Specificity of the S1 nuclease from Aspergillus oryzae; The Journal of Biological Chemistry, 250, 8848-8855 / November, 1975.]
* [2] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-02T23:53:12Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov [[nukleaza S1#Viri|[1]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
STROKOVNI ČLANKI: 
* [1] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-02T23:50:25Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov[[nukleaza S1#Viri|[1]]] (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni ''[[Aspergillus Oryzae]]''. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
STROKOVNI ČLANKI: 
* [1] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/ Jose A.Esteban, Margarita Salas and Luis Blanco: Activation of S1 nuclease at neutral pH; Nucleic Acids Research, Volume 20, Number 18: 4932 / September, 1992.]

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-02T22:58:55Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). 
[[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni [[Aspergillus Oryzae]]. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
STROKOVNI ČLANKI: 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-02T22:54:14Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). [[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati, ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). 
Nukleazo S1 večinoma pridobivajo iz plesni [[Aspergillus Oryzae]]. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
STROKOVNI ČLANKI: 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-02T22:49:29Z

Liza Marija Strnad:

[[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). [[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati, ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).
Encim nukleaze S1 se večinoma pridobiva iz plesni [[''Aspergillus Oryzae'']]. 
[[EC številka]]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
STROKOVNI ČLANKI: 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/

Nukleaza S1

2013-01-02T22:26:10Z

Liza Marija Strnad:

[http://sl.wikipedia.org/wiki/Encim Encim] nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [http://sl.wikipedia.org/wiki/Monomer monomer], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim Asn na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [http://sl.wikipedia.org/wiki/PH pH] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). [http://sl.wikipedia.org/wiki/Encimski_inhibitor Inhibitorji], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati, ter visoke koncentracije NaDS (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).
Encim nukleaze S1 se večinoma pridobiva iz plesni [http://en.wikipedia.org/wiki/Aspergillus_oryzae ''Aspergillus Oryzae'']. 
[http://en.wikipedia.org/wiki/EC_number_(chemistry) EC številka]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==
STROKOVNI ČLANKI: 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf 
http://www.jbc.org/content/250/22/8848 

KATALOGI RAZNIH PODJETIJ: 
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf 
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/ 
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html 

BAZE: 
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022 

SPLET: 
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/ 

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-02T22:23:10Z

Liza Marija Strnad:

Nukleaza S1

2013-01-02T22:14:48Z

Liza Marija Strnad:

[http://sl.wikipedia.org/wiki/Encim Encim] nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]].
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [http://sl.wikipedia.org/wiki/Monomer monomer], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim Asn na mestih 92 in 228.

== Funkcije nukleaze S1 ==
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA 
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA 
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena 
- Linearizira dodatno zvite plazmide 
- Specifično cepi antikodone tRNA 
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze 

Optimalni [http://sl.wikipedia.org/wiki/PH pH] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca2+ ioni). [http://sl.wikipedia.org/wiki/Encimski_inhibitor Inhibitorji], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati, ter visoke koncentracije NaDS (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).
Encim nukleaze S1 se večinoma pridobiva iz plesni [http://en.wikipedia.org/wiki/Aspergillus_oryzae ''Aspergillus Oryzae'']. 
[http://en.wikipedia.org/wiki/EC_number_(chemistry) EC številka]: 3.1.30.1

== Alternativni imeni ==
- Deoksiribonukleaza S1 
- Endonukleaza S1 

== Viri ==

* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1581503/pdf/canmedaj00574-0099.pdf Thiouracil in the treatment of thyrotoxicosis by E. M. Watson and L. D. Wilox, London]

* [http://www.viva.si/Bolezni/Avtoimune-bolezni/4743/Gravesova-bolezen-Basedowa-bolezen-bazedovka Gravesova bolezen]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-02T21:58:38Z

Liza Marija Strnad:

Nukleaza S1

2013-01-02T21:17:02Z

Liza Marija Strnad:

[http:\\sl.wikipedia.org/wiki/Encim Encim] nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med nukleinskimi kislinami. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je monomer, torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov, z N-glikoziliranim Asn na mestih 92 in 228.

== Viri ==

* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1581503/pdf/canmedaj00574-0099.pdf Thiouracil in the treatment of thyrotoxicosis by E. M. Watson and L. D. Wilox, London]

* [http://www.viva.si/Bolezni/Avtoimune-bolezni/4743/Gravesova-bolezen-Basedowa-bolezen-bazedovka Gravesova bolezen]

[[Category:LEX]]

Nukleaza S1

2013-01-02T21:15:49Z

Liza Marija Strnad: New page: [http:\\http://sl.wikipedia.org/wiki/Encim Encim] nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med nukleinskimi kislinami. Pogosto se uporablja v laboratoriju pr...

[http:\\http://sl.wikipedia.org/wiki/Encim Encim] nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med nukleinskimi kislinami. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji.
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je monomer, torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov, z N-glikoziliranim Asn na mestih 92 in 228.

erov [[tiouracil]]a s formulo C4H4N2OS [http://en.wikipedia.org/wiki/File:Thiouracil.png Skeletna formula]. Njegovo kemijsko ime je 2,3-dihidro-2-tiokso-4(1H)-pirimidinon, poleg ketonske pa poznamo tudi njegovo enolno obliko. Je grenka, bela kristalinična snov, topna v fluorovodikovi kislini in bazičnih raztopinah a le rahlo topna v vodi in etanolu. Nad 340°C se stali in razpade.
Sintetiziramo ga lahko s kondenzacijo etil formilacetata in [[tiourea|tiouree]], najdemo pa ga tudi v naravi, na primer v družini rastlin Brassicaceae, kamor med drugim prištevamo tudi cvetačo in brokoli, ki ga vsebujejo v zelo majhnih količinah.

2-Tiouracil je najbolj poznan kot hormonski antagonist [[tiroksin]]a in [[trijodtironin]]a ter je prvo uspešno [[tionamid]]sko zdravilo proti hipertirodizmu (z njim se torej zdravi Gravesovo bolezen). Kot prvi je leta 1943 njegovo uporabo opisal Edwin Bennett Astwood, ki ga je, tako kot tioureo, uspešno uporabljal na pacientih in jim tako blažil simptome ter izboljšal njihovo zdravstveno stanje. Kasneje so ga zamenjale bolj učinkovite oziroma manj nevarne snovi (npr. [[propiltiouracil]]). 2-Tiouracil je namreč potencialno rakotvoren (dokazano na živalih; sum na ljudeh), povzroča pa tudi druge stranske učinke kot je agranulocitoza.

== Viri ==

* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1581503/pdf/canmedaj00574-0099.pdf Thiouracil in the treatment of thyrotoxicosis by E. M. Watson and L. D. Wilox, London]

* [http://www.thebeefsite.com/news/34892/brassica-has-traces-of-natural-thiouracil Thebeefsite: Brassica has traces of natural thiouracil]

* [http://en.wikipedia.org/wiki/Thiouracil Wikipedia: Thiouracil]

* [http://www.thefreedictionary.com/thiouracil Thefreedictionary: Thiouracil]

== Zunanje povezave ==

* [http://en.wikipedia.org/wiki/Hormone_antagonist Hormonski antagonist]

* [http://www.viva.si/Bolezni/Avtoimune-bolezni/4743/Gravesova-bolezen-Basedowa-bolezen-bazedovka Gravesova bolezen]

[[Category:LEX]]