Wiki FKKT - User contributions [en]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:54:06Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v [[dsDNA|dsDNA]] (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'').
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. [[transposon|transposonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

[[Category:LEX]]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:53:01Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v [[dsDNA|dsDNA]] (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. [[transposon|transposonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

[[Category:LEX]]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:52:04Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. [[transposon|transposonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

[[Category:LEX]]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:51:34Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. [[transposon|transposonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:48:58Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:44:05Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
{| border=3
![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
|}

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:38:02Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:30:40Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1

Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: [[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]
* [3] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [4] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
== Zunanje povezave ==
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002]
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:04:10Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvira tudi ime encima.

Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)

Proces reverzne transkripcije:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [3] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
* [4] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T21:03:53Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]] Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvira tudi ime encima.

Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]

Katalizira procese v:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]
* retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
* retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
* retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)

Proces reverzne transkripcije:[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]
* [2] [http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase]
* [3] [http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078 http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078]
* [4] [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T20:25:52Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T14:10:51Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T14:07:45Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T14:03:13Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T14:00:38Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T13:55:58Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T13:50:35Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T13:49:29Z

Miha Virant:

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T13:45:14Z

Miha Virant:

'''Reverzna transkriptaza''' je encim (EC 2.7.7.49)[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ). Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]]

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.

Katalizira procese v:
* retrovirusih
* hepadnavirusih in caulimovirusih
* retrotransposonih
* bakterijki msDNA
* intronih tipa II

Reakcija, ki jo katalizira:
deoxynucleoside triphosphate + <math>DNA_n</math> = diphosphate + <math>DNA_{n+1}</math>

== Viri ==
* [1] [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html]

Reverzna transkriptaza

2010-12-12T13:42:11Z

Miha Virant: New page: '''Reverzna transkriptaza''' je encim (EC 2.7.7.49)[1], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi...