<?xml version="1.0"?>
<feed xmlns="http://www.w3.org/2005/Atom" xml:lang="en">
	<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?action=history&amp;feed=atom&amp;title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1</id>
	<title>Biogeneza in delovanje spliceosomske komponente U1 - Revision history</title>
	<link rel="self" type="application/atom+xml" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?action=history&amp;feed=atom&amp;title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1"/>
	<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;action=history"/>
	<updated>2026-05-23T03:23:49Z</updated>
	<subtitle>Revision history for this page on the wiki</subtitle>
	<generator>MediaWiki 1.45.3</generator>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25705&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* U1 snRNP kompleks */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25705&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T21:28:57Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;U1 snRNP kompleks&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 21:28, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l5&quot;&gt;Line 5:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 5:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &amp;#039;&amp;#039;SNRNP70&amp;#039;&amp;#039; gen, U1-A, ki ga kodira &amp;#039;&amp;#039;SNRPA&amp;#039;&amp;#039; gen, in &amp;lt;br&amp;gt;U1-C, ki ga kodira &amp;#039;&amp;#039;SNRPC&amp;#039;&amp;#039; gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&amp;#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&amp;#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS). Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &amp;#039;&amp;#039;SNRNP70&amp;#039;&amp;#039; gen, U1-A, ki ga kodira &amp;#039;&amp;#039;SNRPA&amp;#039;&amp;#039; gen, in &amp;lt;br&amp;gt;U1-C, ki ga kodira &amp;#039;&amp;#039;SNRPC&amp;#039;&amp;#039; gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&amp;#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&amp;#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS). Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;pokvarjenih &lt;/del&gt;RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;okvarjenih &lt;/ins&gt;RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Biogeneza U1 snRNP=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Biogeneza U1 snRNP=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25704&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* U1 snRNP kompleks */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25704&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T20:06:13Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;U1 snRNP kompleks&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 20:06, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l3&quot;&gt;Line 3:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 3:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &#039;&#039;SNRNP70&#039;&#039; gen, U1-A, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPA&#039;&#039; gen, in &amp;lt;br&amp;gt;U1-C, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPC&#039;&#039; gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS) &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;in transkripcijska zaustavitev&lt;/del&gt;. Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &#039;&#039;SNRNP70&#039;&#039; gen, U1-A, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPA&#039;&#039; gen, in &amp;lt;br&amp;gt;U1-C, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPC&#039;&#039; gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS). Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&amp;#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo pokvarjenih RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&amp;#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo pokvarjenih RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25673&amp;oldid=prev</id>
		<title>JS at 12:00, 14 April 2026</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25673&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T12:00:31Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 12:00, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l34&quot;&gt;Line 34:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 34:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;==Imunski odziv proti U1 snRNP==&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;==Imunski odziv proti U1 snRNP==&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Dokazano je bilo, da se avtoprotitelesa proti komponentam U1 snRNP pojavljajo v značilnem zaporedju, pri čemer sta U1-70K in Sm-B/B′ zgodnja imunogena. Analiza pri bolnikih je pokazala, da se protitelesa proti U1-70K in Sm-B/B′ pojavijo prej kot proti drugim komponentam, medtem ko se protitelesa proti U1A, U1C in Sm-D pojavijo kasneje. To skupaj z dejstvom, da se U1-70K med apoptozo modificira, podpira hipotezo, da so apoptotske spremembe U1-70K ključne za sprožitev imunskega odziva proti kompleksu U1 snRNP.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Dokazano je bilo, da se avtoprotitelesa proti komponentam U1 snRNP pojavljajo v značilnem zaporedju, pri čemer sta U1-70K in Sm-B/B′ zgodnja imunogena. Analiza pri bolnikih je pokazala, da se protitelesa proti U1-70K in Sm-B/B′ pojavijo prej kot proti drugim komponentam, medtem ko se protitelesa proti U1A, U1C in Sm-D pojavijo kasneje. To skupaj z dejstvom, da se U1-70K med apoptozo modificira, podpira hipotezo, da so apoptotske spremembe U1-70K ključne za sprožitev imunskega odziva proti kompleksu U1 snRNP.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;U1 snRNA neposredno prispeva k aktivaciji imunskega sistema z interakcijo z endosomskimi Tollu podobnimi receptorji (TLR), zlasti TLR7 in TLR8.&lt;/del&gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Med celično smrtjo se kompleks U1 snRNP, ki vsebuje U1 snRNA, premakne na apoptotska telesca, kjer postane dostopen avtoprotitelesom. Ta avtoprotitelesa omogočijo nastanek imunskih kompleksov, ki jih nato prevzamejo imunske celice, kar omogoči da pride do aktivacije TLR-odvisnih signalnih poti. U1 snRNA ima dvoverižno sekundarno strukturo, zaradi katere lahko deluje kot ligand za TLR receptorje in sproži prirojeni imunski odziv, vendar mora biti prisotna v endosomih. Ko vstopi v endosom, kot del snRNP kompleksa ali kot del imunskega kompleksa vezanega na avtoprotitelesa, neposredno aktivira TLR7 in TLR8, kar vodi do močne produkcije pro-vnetnih citokinov, kot je interlevkin-1β. Ti povečajo vnetje (aktivacijo drugih imunskih celic), zvišanjo telesno temperaturo in spodbujanjo izražanje drugih vnetnih molekul.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Med celično smrtjo se kompleks U1 snRNP, ki vsebuje U1 snRNA, &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;premakne iz jedra v citoplazmo. Po izhodu iz jedra se kompleks U1 snRNP &lt;/del&gt;premakne na apoptotska telesca, kjer postane dostopen avtoprotitelesom. Ta avtoprotitelesa omogočijo nastanek imunskih kompleksov, ki jih nato prevzamejo imunske celice, kar omogoči da pride do aktivacije TLR-odvisnih signalnih poti. U1 snRNA ima dvoverižno sekundarno strukturo, zaradi katere lahko deluje kot ligand za TLR receptorje in sproži prirojeni imunski odziv, vendar mora biti prisotna v endosomih. Ko vstopi v endosom, kot del snRNP kompleksa ali kot del imunskega kompleksa vezanega na avtoprotitelesa, neposredno aktivira TLR7 in TLR8, kar vodi do močne produkcije pro-vnetnih citokinov, kot je interlevkin-1β. Ti povečajo vnetje (aktivacijo drugih imunskih celic), zvišanjo telesno temperaturo in spodbujanjo izražanje drugih vnetnih molekul.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-side-added&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Zaključek=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Zaključek=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>JS</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25672&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* Zaključek */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25672&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:55:45Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;Zaključek&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:55, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l38&quot;&gt;Line 38:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 38:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Zaključek=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Zaključek=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks je ključna komponenta spliceosoma, ki prepozna 5’ izrezovalno mesto na pre-mRNA in sproži sestavo kompleksa za izrezovanje intronov&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;. U1 je sestavljena iz snRNA, Sm proteinskega jedra in specifičnih proteinov (U1-70K, U1-A, U1-C), ki skupaj omogočijo natančno prepoznavo cepitvenih mest&lt;/del&gt;. Poleg osnovne vloge pri splicingu ima U1 snRNP pomembno vlogo tudi pri transkripciji.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks je ključna komponenta spliceosoma, ki prepozna 5’ izrezovalno mesto na pre-mRNA in sproži sestavo kompleksa za izrezovanje intronov. Poleg osnovne vloge pri splicingu ima U1 snRNP pomembno vlogo tudi pri transkripciji.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Biogeneza U1 snRNP vključuje sintezo U1 snRNA v jedru, sestavljanje Sm jedra v citoplazmi s pomočjo SMN kompleksa ter ponovni transport nazaj v jedro, kjer nastane funkcionalen kompleks, ki se veže v spliceosom. U1 ima sposobnost prepoznati izrezovalno mesto, &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;klub &lt;/del&gt;vezavi navzgor ali navzdol od mesta spoja eksona in introna.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Biogeneza U1 snRNP vključuje sintezo U1 snRNA v jedru, sestavljanje Sm jedra v citoplazmi s pomočjo SMN kompleksa ter ponovni transport nazaj v jedro, kjer nastane funkcionalen kompleks, ki se veže v spliceosom. U1 ima sposobnost prepoznati izrezovalno mesto, &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;kljub &lt;/ins&gt;vezavi navzgor ali navzdol od mesta spoja eksona in introna.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Motnje v delovanju U1 snRNP so povezane z boleznimi, kot je spinalna mišična atrofija, ki nastane pri napakah v splicingu. U1 snRNP kompleks ima vlogo tudi pri apoptozi in lahko sproži imunski odziv, kar je pomembno pri avtoimunskih boleznih, kot je SLE.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Motnje v delovanju U1 snRNP so povezane z boleznimi, kot je spinalna mišična atrofija, ki nastane pri napakah v splicingu. U1 snRNP kompleks ima vlogo tudi pri apoptozi in lahko sproži imunski odziv, kar je pomembno pri avtoimunskih boleznih, kot je SLE.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&lt;/del&gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-side-added&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Viri=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Viri=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25671&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* U1 snRNP kompleks */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25671&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:52:35Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;U1 snRNP kompleks&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:52, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l3&quot;&gt;Line 3:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 3:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &#039;&#039;SNRNP70&#039;&#039; gen, U1-A, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPA&#039;&#039; gen, in U1-C, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPC&#039;&#039; gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS) in transkripcijska zaustavitev. Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &#039;&#039;SNRNP70&#039;&#039; gen, U1-A, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPA&#039;&#039; gen, in &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/ins&gt;U1-C, ki ga kodira &#039;&#039;SNRPC&#039;&#039; gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS) in transkripcijska zaustavitev. Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&amp;#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo pokvarjenih RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&amp;#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo pokvarjenih RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25670&amp;oldid=prev</id>
		<title>JS at 11:51, 14 April 2026</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25670&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:51:44Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:51, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l26&quot;&gt;Line 26:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 26:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Delovanje apoptoze na U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Delovanje apoptoze na U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Med apoptozo se U1 snRNP spremeni zaradi delovanja kaspaz in drugih &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;proteazm &lt;/del&gt;kar povzroči &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;do &lt;/del&gt;cepitve U1 kompleksa in &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;njegove funkcionalne inaktivacije&lt;/del&gt;. Te spremembe prispevajo k zaustavitvi transkripcije in procesiranja RNA, ter spodbujajo potek celične smrti.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Med apoptozo se U1 snRNP spremeni zaradi delovanja kaspaz in drugih &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;proteaz &lt;/ins&gt;kar povzroči cepitve U1 kompleksa in &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;njegovo funkcionalno inaktivacijo&lt;/ins&gt;. Te spremembe prispevajo k zaustavitvi transkripcije in procesiranja RNA, ter spodbujajo potek celične smrti.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Specifična cepitev proteina U1-70K je značilen biokemični znak apoptoze, zato se cepitev U1-70K pogosto uporablja kot marker apoptoze. Protein U1-70K cepi kaspaza-3 na mestu D341, kar vodi do nastanka N-terminalnega fragmenta velikosti 40 kDa in C-terminalnega fragmenta velikosti 22 kDa.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Specifična cepitev proteina U1-70K je značilen biokemični znak apoptoze, zato se cepitev U1-70K pogosto uporablja kot marker apoptoze. Protein U1-70K cepi kaspaza-3 na mestu D341, kar vodi do nastanka N-terminalnega fragmenta velikosti 40 kDa in C-terminalnega fragmenta velikosti 22 kDa.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Dokazano je bilo, da se U1-70K cepi, medtem ko je še vedno del nespremenjenega kompleksa U1 snRNP, pri cepitvi 40 kDa fragment ostane povezan s kompleksom. Med apoptozo se avtoantigeni kopičijo v dveh populacijah membranskih izboklin (blebov) na površini celice. U1-70K je zgodaj lokaliziran v jedru, kasneje pa se njegovi epitopi kopičijo v apoptotskih telescah.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Dokazano je bilo, da se U1-70K cepi, medtem ko je še vedno del nespremenjenega kompleksa U1 snRNP, pri cepitvi 40 kDa fragment ostane povezan s kompleksom. Med apoptozo se avtoantigeni kopičijo v dveh populacijah membranskih izboklin (blebov) na površini celice. U1-70K je zgodaj lokaliziran v jedru, kasneje pa se njegovi epitopi kopičijo v apoptotskih telescah.&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Pri različnih oblikah celične smrti se U1-70K obnaša različno, na primer pri nekrozi se razgradi v nedoločljive fragmenta. Pri CTL-inducirani (citoksični limfocit T)apoptozi granzim B cepi kompleks v 60kDa fragment, pri oksidativnih procesih pa se lahko razgradi v fragmente velike 33-38 kDa.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Pri različnih oblikah celične smrti se U1-70K obnaša različno, na primer pri nekrozi se razgradi v nedoločljive fragmenta. Pri CTL-inducirani (citoksični limfocit T)apoptozi granzim B cepi kompleks v 60kDa fragment, pri oksidativnih procesih pa se lahko razgradi v fragmente velike 33-38 kDa.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Apoptoza aktivira kaspaze, ki cepijo Sm-F blizu C-konca, ta cepitev destabilizira strukturo splicesoma. Nastane 9 kDa velik fragmenta, ki ostane povezan z U snRNP kompleksi. Spliceosomski Sm proteini so tarča anti-Sm avtoprotiteles, ki se pojavljajo izključno pri bolnikih s sistemskim lupusom eritematozusom (SLE)&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;. Zato se ta protitelesa uporabljajo kot diagnostični markerji&lt;/del&gt;.&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Apoptoza aktivira kaspaze, ki cepijo Sm-F blizu C-konca, ta cepitev destabilizira strukturo splicesoma. Nastane 9 kDa velik fragmenta, ki ostane povezan z U snRNP kompleksi. Spliceosomski Sm proteini so tarča anti-Sm avtoprotiteles, ki se pojavljajo izključno pri bolnikih s sistemskim lupusom eritematozusom (SLE).&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;==Imunski odziv proti U1 snRNP==&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;==Imunski odziv proti U1 snRNP==&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>JS</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25669&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* Uvod */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25669&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:46:08Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;Uvod&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:46, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l1&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Uvod=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Uvod=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Človeški spliceosom je sestavljen iz petih majhnih ribonukleoproteinskih kompleksov&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;: U1, U2, U4&lt;/del&gt;, &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;U5 in U6. Ti &lt;/del&gt;se stopenjsko sestavijo na pre-mRNA. Slika 1A iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka] prikazuje sistem sestavljanja spliceosoma po intronskem modelu, kjer se snRNP kompleksi povezujejo čez introne. &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;V &lt;/del&gt;transkriptih z dolgimi introni in kratkimi eksoni &lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;pa se spliceosom običajno sestavi po eksonskem modelu, kjer pride do vezave čez ekson&lt;/del&gt;. Tekom sestave spliceosoma 5‘ cepitveno mesto tvori intronski lariat, ki se sprosti s cepitvijo na 3’ cepitvenem mestu in eksoni se povežejo. Ti lariati niso nujno popolnoma razgrajeni temveč se lahko modificirajo v funkcionalno nekodirajočo RNA (ncRNA). To sta lahko majhna nukleolarna RNA (snoRNA) in mikro RNA (miRNA), ki imata regulatorno vlogo pri modifikacijah RNA in ekspresiji genov. U1 snRNP kompleks je med kompleksi spliceosoma najbolj številčen (1 milijon kopij na celico), ker je ključen za iniciacijo izrezovanja intronov in inhibicijo cepitve 3&#039; konca ter poliadenilacije pre-mRNA. Njegova disfunkcija je bila povezana z rakom, nevrodegeneracijo in starostnimi boleznimi, kar poudarja njen biološki in klinični pomen[1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Človeški spliceosom je sestavljen iz petih majhnih ribonukleoproteinskih kompleksov, &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;ki &lt;/ins&gt;se stopenjsko sestavijo na pre-mRNA. Slika 1A iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka] prikazuje sistem sestavljanja spliceosoma po intronskem modelu, kjer se snRNP kompleksi povezujejo čez introne. &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;Možna je tudi vezava čez ekson, ki je pogosta v &lt;/ins&gt;transkriptih z dolgimi introni in kratkimi eksoni. Tekom sestave spliceosoma 5‘ cepitveno mesto tvori intronski lariat, ki se sprosti s cepitvijo na 3’ cepitvenem mestu in eksoni se povežejo. Ti lariati niso nujno popolnoma razgrajeni temveč se lahko modificirajo v funkcionalno nekodirajočo RNA (ncRNA). To sta lahko majhna nukleolarna RNA (snoRNA) in mikro RNA (miRNA), ki imata regulatorno vlogo pri modifikacijah RNA in ekspresiji genov. U1 snRNP kompleks je med kompleksi spliceosoma najbolj številčen (1 milijon kopij na celico), ker je ključen za iniciacijo izrezovanja intronov in inhibicijo cepitve 3&#039; konca ter poliadenilacije pre-mRNA. Njegova disfunkcija je bila povezana z rakom, nevrodegeneracijo in starostnimi boleznimi, kar poudarja njen biološki in klinični pomen[1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25668&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* Uvod */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25668&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:41:54Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;Uvod&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:41, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l1&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Uvod=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Uvod=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;Splicing nadzira spliceosom, dinamičen ribonukleoproteinski kompleks sestavljen iz malih jedrnih RNA (snRNA) in vezanih proteinov. Prepozna ustrezna mesta med introni in eksoni, ki so običajno GU dinukleotidi na 5&#039; koncih intronov in AG dinukleotidi na 3&#039; koncih intronov. &lt;/del&gt;Človeški spliceosom je sestavljen iz petih majhnih ribonukleoproteinskih kompleksov: U1, U2, U4, U5 in U6. Ti se stopenjsko sestavijo na pre-mRNA. Slika 1A iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka] prikazuje sistem sestavljanja spliceosoma po intronskem modelu, kjer se snRNP kompleksi povezujejo čez introne. V transkriptih z dolgimi introni in kratkimi eksoni pa se spliceosom običajno sestavi po eksonskem modelu, kjer pride do vezave čez ekson. Tekom sestave spliceosoma 5‘ cepitveno mesto tvori intronski lariat, ki se sprosti s cepitvijo na 3’ cepitvenem mestu in eksoni se povežejo. Ti lariati niso nujno popolnoma razgrajeni temveč se lahko modificirajo v funkcionalno nekodirajočo RNA (ncRNA). To sta lahko majhna nukleolarna RNA (snoRNA) in mikro RNA (miRNA), ki imata regulatorno vlogo pri modifikacijah RNA in ekspresiji genov. U1 snRNP kompleks je med kompleksi spliceosoma najbolj številčen (1 milijon kopij na celico), ker je ključen za iniciacijo izrezovanja intronov in inhibicijo cepitve 3&#039; konca ter poliadenilacije pre-mRNA. Njegova disfunkcija je bila povezana z rakom, nevrodegeneracijo in starostnimi boleznimi, kar poudarja njen biološki in klinični pomen[1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Človeški spliceosom je sestavljen iz petih majhnih ribonukleoproteinskih kompleksov: U1, U2, U4, U5 in U6. Ti se stopenjsko sestavijo na pre-mRNA. Slika 1A iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka] prikazuje sistem sestavljanja spliceosoma po intronskem modelu, kjer se snRNP kompleksi povezujejo čez introne. V transkriptih z dolgimi introni in kratkimi eksoni pa se spliceosom običajno sestavi po eksonskem modelu, kjer pride do vezave čez ekson. Tekom sestave spliceosoma 5‘ cepitveno mesto tvori intronski lariat, ki se sprosti s cepitvijo na 3’ cepitvenem mestu in eksoni se povežejo. Ti lariati niso nujno popolnoma razgrajeni temveč se lahko modificirajo v funkcionalno nekodirajočo RNA (ncRNA). To sta lahko majhna nukleolarna RNA (snoRNA) in mikro RNA (miRNA), ki imata regulatorno vlogo pri modifikacijah RNA in ekspresiji genov. U1 snRNP kompleks je med kompleksi spliceosoma najbolj številčen (1 milijon kopij na celico), ker je ključen za iniciacijo izrezovanja intronov in inhibicijo cepitve 3&#039; konca ter poliadenilacije pre-mRNA. Njegova disfunkcija je bila povezana z rakom, nevrodegeneracijo in starostnimi boleznimi, kar poudarja njen biološki in klinični pomen[1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25667&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* Uvod */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25667&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:39:25Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;Uvod&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:39, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l1&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 1:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Uvod=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=Uvod=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;del style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;Pri translaciji genetske informacije se mora RNA ustrezno modificirati. Zato mora biti prekurzorska sporočevalna RNA (pre-mRNA) deležna splicinga oz. spajanja eksonov. &lt;/del&gt;Splicing nadzira spliceosom, dinamičen ribonukleoproteinski kompleks sestavljen iz malih jedrnih RNA (snRNA) in vezanih proteinov. Prepozna ustrezna mesta med introni in eksoni, ki so običajno GU dinukleotidi na 5&#039; koncih intronov in AG dinukleotidi na 3&#039; koncih intronov. Človeški spliceosom je sestavljen iz petih majhnih ribonukleoproteinskih kompleksov: U1, U2, U4, U5 in U6. Ti se stopenjsko sestavijo na pre-mRNA. Slika 1A iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka] prikazuje sistem sestavljanja spliceosoma po intronskem modelu, kjer se snRNP kompleksi povezujejo čez introne. V transkriptih z dolgimi introni in kratkimi eksoni pa se spliceosom običajno sestavi po eksonskem modelu, kjer pride do vezave čez ekson. Tekom sestave spliceosoma 5‘ cepitveno mesto tvori intronski lariat, ki se sprosti s cepitvijo na 3’ cepitvenem mestu in eksoni se povežejo. Ti lariati niso nujno popolnoma razgrajeni temveč se lahko modificirajo v funkcionalno nekodirajočo RNA (ncRNA). To sta lahko majhna nukleolarna RNA (snoRNA) in mikro RNA (miRNA), ki imata regulatorno vlogo pri modifikacijah RNA in ekspresiji genov. U1 snRNP kompleks je med kompleksi spliceosoma najbolj številčen (1 milijon kopij na celico), ker je ključen za iniciacijo izrezovanja intronov in inhibicijo cepitve 3&#039; konca ter poliadenilacije pre-mRNA. Njegova disfunkcija je bila povezana z rakom, nevrodegeneracijo in starostnimi boleznimi, kar poudarja njen biološki in klinični pomen[1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Splicing nadzira spliceosom, dinamičen ribonukleoproteinski kompleks sestavljen iz malih jedrnih RNA (snRNA) in vezanih proteinov. Prepozna ustrezna mesta med introni in eksoni, ki so običajno GU dinukleotidi na 5&#039; koncih intronov in AG dinukleotidi na 3&#039; koncih intronov. Človeški spliceosom je sestavljen iz petih majhnih ribonukleoproteinskih kompleksov: U1, U2, U4, U5 in U6. Ti se stopenjsko sestavijo na pre-mRNA. Slika 1A iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka] prikazuje sistem sestavljanja spliceosoma po intronskem modelu, kjer se snRNP kompleksi povezujejo čez introne. V transkriptih z dolgimi introni in kratkimi eksoni pa se spliceosom običajno sestavi po eksonskem modelu, kjer pride do vezave čez ekson. Tekom sestave spliceosoma 5‘ cepitveno mesto tvori intronski lariat, ki se sprosti s cepitvijo na 3’ cepitvenem mestu in eksoni se povežejo. Ti lariati niso nujno popolnoma razgrajeni temveč se lahko modificirajo v funkcionalno nekodirajočo RNA (ncRNA). To sta lahko majhna nukleolarna RNA (snoRNA) in mikro RNA (miRNA), ki imata regulatorno vlogo pri modifikacijah RNA in ekspresiji genov. U1 snRNP kompleks je med kompleksi spliceosoma najbolj številčen (1 milijon kopij na celico), ker je ključen za iniciacijo izrezovanja intronov in inhibicijo cepitve 3&#039; konca ter poliadenilacije pre-mRNA. Njegova disfunkcija je bila povezana z rakom, nevrodegeneracijo in starostnimi boleznimi, kar poudarja njen biološki in klinični pomen[1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
	<entry>
		<id>https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25666&amp;oldid=prev</id>
		<title>Tadej Vertnik: /* U1 snRNP kompleks */</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="https://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php?title=Biogeneza_in_delovanje_spliceosomske_komponente_U1&amp;diff=25666&amp;oldid=prev"/>
		<updated>2026-04-14T11:34:43Z</updated>

		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;U1 snRNP kompleks&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table style=&quot;background-color: #fff; color: #202122;&quot; data-mw=&quot;interface&quot;&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-marker&quot; /&gt;
				&lt;col class=&quot;diff-content&quot; /&gt;
				&lt;tr class=&quot;diff-title&quot; lang=&quot;en&quot;&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
				&lt;td colspan=&quot;2&quot; style=&quot;background-color: #fff; color: #202122; text-align: center;&quot;&gt;Revision as of 11:34, 14 April 2026&lt;/td&gt;
				&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot; id=&quot;mw-diff-left-l3&quot;&gt;Line 3:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 3:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;=U1 snRNP kompleks=&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;−&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira SNRNP70 gen, U1-A, ki ga kodira SNRPA gen, in U1-C, ki ga kodira SNRPC gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS) in transkripcijska zaustavitev. Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot; data-marker=&quot;+&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;U1 snRNP kompleks iniciira sestavo spliceosoma, tako da prepozna in se veže na cepitvena mesta na pre-mRNA. Ta vezava omogoči naknadno vezavo ostalih snRNP-jev. Interakcije protein-protein med snRNP-ji olajšajo sestavo celotnega spliceosoma. U1 snRNP je sestavljen iz U1 snRNA, Sm heptamera in treh specifičnih proteinov U1-70K, ki ga kodira &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&#039;&#039;&lt;/ins&gt;SNRNP70&lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&#039;&#039; &lt;/ins&gt;gen, U1-A, ki ga kodira &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&#039;&#039;&lt;/ins&gt;SNRPA&lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&#039;&#039; &lt;/ins&gt;gen, in U1-C, ki ga kodira &lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&#039;&#039;&lt;/ins&gt;SNRPC&lt;ins style=&quot;font-weight: bold; text-decoration: none;&quot;&gt;&#039;&#039; &lt;/ins&gt;gen (slika 1B iz [https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.70026 članka]). Sm heptamer je vezan na Sm vezavno mesto na snRNA. Gre za heptamer proteinov, ki so pomembni za stabilizacijo U1 snRNA, sestavljanje U1 snRNP kompleksa in prepoznavo 5&#039; cepitvenega mesta na pre-mRNA pri splicingu. Prisotnost vseh teh komponent omogoča natančno prepoznavo cepitvenih mest [1][2].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt; Vezava samega U1 snRNP kompleksa na 5&#039; cepitvenih mestih v novo prepisanih intronih ima pomembno vlogo pri transkripciji, ker aktivno povečuje elongacijsko hitrost RNA polimeraze II. To zmanjša možnosti, da RNA polimeraza II naleti na ovire kot so poliadenilacijska mesta (PAS) in transkripcijska zaustavitev. Tako se zagotovi popolna transkripcija dolgih genov. Pri tem ima U1-70K ključno vlogo, ker interagira neposredno s CPSF in se tako vmeša v cepitev in sestavo poliadenilacijskega kompleksa. Inhibicija prekurzorske poliadenilacije in omogočenje celotne transkripcije, zaradi elongacije le te z navzgornjimi promotorji daje U1 snRNP kompleksu dodatno vlogo promocije dostopnosti kromatina in ojačitve serin 5 fosforilacije RNA polimeraz II pri navzdoljnih promotorjih, kar vodi do njihove aktivacije.&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Še ena kotranskripcijska regulatorna vloga U1 snRNP kompleksa je telescripting. Gre za utišanje prekurzorskega cepljenja na 3&amp;#039; koncu in poliadenilcije v transkriptih RNA polimeraze II, kar je pomembno za celotno transkripcijo tisočerih kodirajočih mRNA in dolgih nekodirajočih RNA (lncRNA) [3].&amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&amp;#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo pokvarjenih RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class=&quot;diff-marker&quot;&gt;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background-color: #f8f9fa; color: #202122; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;&quot;&gt;&lt;div&gt;Kadar pride do prepisa transkriptov, ki vsebujejo intronske PAS, morajo biti le ti razgrajeni s strani RNA eksosomov, da se prepreči sinteza skrajšanih in nefunkcionalnih proteinov. Takšni transkripti vsebujejo kombinacijo 5&amp;#039; cepitvenega mesta in poli(A) stika. Ta kombinacija se imenuje jedrni RNA degradacijski kod (NRDC), ki ni prisoten pri pravilno procesiranih RNA, saj sproži njihovo razgradnjo. U1 snRNP kompleks skupaj s cepitvenimi in polidaenilacijskimi faktorji se veže na NRDC in kooperativno rekrutira PAXT (angl. Poly(A) tail exosome targeting) adaptor, ki omogoča vezavo RNA eksosoma in razgradnjo pokvarjenih RNA. &amp;lt;br&amp;gt;&amp;lt;br&amp;gt;U1 snRNP kompleks ima tako pomembno vlogo v kontroli kvalitete transkriptoma, zaradi njegovih vlog pri razgradnji RNA, transkripcijski elongaciji in telescriptingu [1].&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Tadej Vertnik</name></author>
	</entry>
</feed>