Nukleozidi in nukleotidi - Revision history

MDolinar: /* Viri */

2010-10-22T13:37:36Z

Viri

← Older revision		Revision as of 13:37, 22 October 2010
Line 88:		Line 88:
	*http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotides		*http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotides
	*http://sl.wikipedia.org/wiki/Nukleotid		*http://sl.wikipedia.org/wiki/Nukleotid

			[[Category:LEX]] [[Category:BMB]]

MDolinar: /* Sinteza */

2010-04-07T13:35:35Z

Sinteza

← Older revision		Revision as of 13:35, 7 April 2010
Line 62:		Line 62:
	število G = število C<br>		število G = število C<br>
	število purinov (A+G) = število pirimidinov (C+T)<br>		število purinov (A+G) = število pirimidinov (C+T)<br>
	Nukleotidi so med seboj povezani z kovalentnimi vezmi.		Nukleotidi so med seboj povezani s kovalentnimi vezmi.

	Dušikove organske baze določajo 20 različnih amino kislin. Eno amino kislino določa zaporedje treh nukleotidov, ki ga menujemo kodon. 61 kodonov predstavlja zapis za eno od dvajsetih amino kislin, 3 kodoni pa so stop-kodoni. Ti ne nosijo zapisa za aminokislino ampak ustavijo sintezo proteina.		Dušikove organske baze določajo 20 različnih amino kislin. Eno amino kislino določa zaporedje treh nukleotidov, ki ga menujemo kodon. 61 kodonov predstavlja zapis za eno od dvajsetih amino kislin, 3 kodoni pa so stop-kodoni. Ti ne nosijo zapisa za aminokislino ampak ustavijo sintezo proteina.

MDolinar: /* Sinteza */

2010-04-07T13:34:59Z

Sinteza

← Older revision		Revision as of 13:34, 7 April 2010
Line 55:		Line 55:
	Ena kisla skupina fosfatne skupine je prosta, kar daje nukleinski kislini kisel značaj.V celicah se na nukleotide vežejo kovinski ioni, kot sta Mg+ in Mn+ in s tem nevtralizirajo naboj.		Ena kisla skupina fosfatne skupine je prosta, kar daje nukleinski kislini kisel značaj.V celicah se na nukleotide vežejo kovinski ioni, kot sta Mg+ in Mn+ in s tem nevtralizirajo naboj.

	Dve ~~polipeptidni~~ verigi v molekuli DNA, ki tvorita dvojno vijačnico sta povezani antiparalelno. Povezujejo ju vezi med dušikovimi bazami. Adenin se poveže s timinom z ~~dvojno vodikovo vezjo~~, gvanin pa se poveže s citozinom z ~~trojno vodikovo vezjo~~. Pri RNA se adenin poveže z uracilom. Vodikove vezi so šibke vezi. Prekinejo se že ob zvišanju temperature. Ta pojav se imenuje denaturacija.		Dve polinukleotidni verigi v molekuli DNA, ki tvorita dvojno vijačnico, sta povezani antiparalelno. Povezujejo ju vodikove vezi med dušikovimi bazami. Adenin se poveže s timinom z dvema vodikovima vezema, gvanin pa se poveže s citozinom z tremi vodikovimi vezmi. Pri RNA se adenin poveže z uracilom. Vodikove vezi so šibke vezi. Prekinejo se že ob zvišanju temperature. Ta pojav se pri nukleinskih kislinah imenuje denaturacija.
	Način povezovanja dušikovih baz imenujemo komplementarno povezovanje.		Način povezovanja dušikovih baz imenujemo komplementarno povezovanje.

	Za dvoverižne nukleinske kisline (DNA) veljajo Chargaffova pravila:		Za dvoverižne nukleinske kisline (DNA) veljajo Chargaffova pravila:<br>
	~~Število~~ A = število T		število A = število T<br>
	~~Števil~~ G = število C		število G = število C<br>
	~~Število~~ purinov (A+G) = število pirimidinov (C+T)		število purinov (A+G) = število pirimidinov (C+T)<br>
	Nukleotidi so ~~medseboj~~ povezani z kovalentnimi vezmi.		Nukleotidi so med seboj povezani z kovalentnimi vezmi.
	~~Štiri dušikove~~ organske baze določajo 20 različnih amino kislin. Eno amino kislino določa zaporedje treh nukleotidov, ki ga menujemo kodon. 61 kodonov predstavlja zapis za eno od dvajsetih amino kislin, 3 kodoni pa so stop kodoni. Ti ne nosijo zapisa za ~~amino kislino~~ ampak ustavijo sintezo proteina.
			Dušikove organske baze določajo 20 različnih amino kislin. Eno amino kislino določa zaporedje treh nukleotidov, ki ga menujemo kodon. 61 kodonov predstavlja zapis za eno od dvajsetih amino kislin, 3 kodoni pa so stop-kodoni. Ti ne nosijo zapisa za aminokislino ampak ustavijo sintezo proteina.

	==Razgradnja==		==Razgradnja==

MDolinar: /* Struktura */

2010-04-07T13:31:23Z

Struktura

← Older revision		Revision as of 13:31, 7 April 2010
Line 7:		Line 7:
	Nukleotid sestavljajo tri komponente:		Nukleotid sestavljajo tri komponente:

	• oglijkov hidrat (aldopentoza) : V [http://en.wikipedia.org/wiki/DNA DNA] se nahaja 2-deoksiriboza, v [http://en.wikipedia.org/wiki/RNA RNA] pa riboza.		• oglijkov hidrat (aldopentoza): v [http://en.wikipedia.org/wiki/DNA DNA] se nahaja 2-deoksiriboza, v [http://en.wikipedia.org/wiki/RNA RNA] pa riboza.

	• dušikove baze :purinski bazi [http://sl.wikipedia.org/wiki/Adenin adenin (A)] in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Gvanin gvanin (G)], ~~pirimidinski bazi pa~~ [http://sl.wikipedia.org/wiki/Timin timin (T)], [http://sl.wikipedia.org/wiki/Citozin citozin (C)]in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Uracil uracil (U)].		• dušikove baze: purinski bazi [http://sl.wikipedia.org/wiki/Adenin adenin (A)] in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Gvanin gvanin (G)], pirimidinske baze [http://sl.wikipedia.org/wiki/Timin timin (T)] (ta samo v DNA), [http://sl.wikipedia.org/wiki/Citozin citozin (C)]in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Uracil uracil (U)] (ta samo v RNA).

	• fosfatne skupine		• fosfatne skupine
Line 22:		Line 22:
	</tr>		</tr>
	<tr>		<tr>
	<td>~~Adenin~~ (A)</td>		<td>adenin (A)</td>
	<td >adenozin / deoksiadenozin</td>		<td >adenozin / deoksiadenozin</td>
	<td >5'-adenilat / adenozin 5'-monofosfat		<td >5'-adenilat / adenozin 5'-monofosfat
Line 28:		Line 28:
	</tr>		</tr>
	<tr>		<tr>
	<td>~~Citozin~~ (C)</td>		<td>citozin (C)</td>
	<td>citidin / deoksicitidin</td>		<td>citidin / deoksicitidin</td>
	<td>5'-citidilat / 5'-deoksicitidilat</td>		<td>5'-citidilat / 5'-deoksicitidilat</td>
	</tr>		</tr>
	<tr>		<tr>
	<td>~~Gvanin~~ (G)</td>		<td>gvanin (G)</td>
	<td>gvanozin / deoksigvanozin</td>		<td>gvanozin / deoksigvanozin</td>
	<td>5'-gvanilat / 5'-deoksigvanilat</td>		<td>5'-gvanilat / 5'-deoksigvanilat</td>
	</tr>		</tr>
	<tr>		<tr>
	<td>~~Timin~~ (T)</td>		<td>timin (T)</td>
	<td >deoksitimidin</td>		<td >deoksitimidin</td>
	<td >5'-deoksitimidilat</td>		<td >5'-deoksitimidilat</td>
	</tr>		</tr>
	<tr>		<tr>
	<td>~~Uracil~~ (U)</td>		<td>uracil (U)</td>
	<td >uridin </td>		<td >uridin </td>
	<td >5'-uridilat</td>		<td >5'-uridilat</td>
Line 49:		Line 49:
	<tr>		<tr>
	</table>		</table>


	==Sinteza==		==Sinteza==

MDolinar: /* Nukleotidna degradacija */

2010-04-07T13:28:06Z

Nukleotidna degradacija

← Older revision		Revision as of 13:28, 7 April 2010
Line 66:		Line 66:
	Štiri dušikove organske baze določajo 20 različnih amino kislin. Eno amino kislino določa zaporedje treh nukleotidov, ki ga menujemo kodon. 61 kodonov predstavlja zapis za eno od dvajsetih amino kislin, 3 kodoni pa so stop kodoni. Ti ne nosijo zapisa za amino kislino ampak ustavijo sintezo proteina.		Štiri dušikove organske baze določajo 20 različnih amino kislin. Eno amino kislino določa zaporedje treh nukleotidov, ki ga menujemo kodon. 61 kodonov predstavlja zapis za eno od dvajsetih amino kislin, 3 kodoni pa so stop kodoni. Ti ne nosijo zapisa za amino kislino ampak ustavijo sintezo proteina.

	==~~Nukleotidna degradacija~~==		==Razgradnja==

	Nukleinske kisline v hrani so ~~izpostavljene kislemu mediju, ki je~~ v želodcu~~. So namreč degradirane~~ do nukleotidov. Ionske ~~komponente~~, ki ne morejo prehajati skozi celično membrano, se ~~zato~~ hidrolizirajo do nukleozidov. Ti se lahko direktno absorbirajo skozi črevesno sluznico ali pa se ~~naprej degradirajo~~ do prostih dušikovih baz in riboze ~~preko~~ nukleozidaze ~~ali pa~~ se ~~degradirajo do riboze~~-1-~~fosfata~~ z nukleozid fosforilazami:		Nukleinske kisline v hrani so v želodcu izpostavljene kislini in se zato razgradijo do nukleotidov. Ionske sestavine, ki ne morejo prehajati skozi celično membrano, se hidrolizirajo do nukleozidov. Ti se lahko direktno absorbirajo skozi črevesno sluznico ali pa se nadalje razgradijo do prostih dušikovih baz in riboze (ob delovanju nukleozidaze) oziroma se pretvorijo v riboza-1-fosfat z nukleozid-fosforilazami:

	~~Nukleozid~~ + ~~H2O~~ + nukleozidaza = baza + riboza		nukleozid + H<sub>2</sub>O + nukleozidaza = baza + riboza

	~~Nukleozid~~ + Pi + nukleozid fosforilaza = baza + riboza-1-P		nukleozid + Pi + nukleozid-fosforilaza = baza + riboza-1-P


	==Uporaba==		==Uporaba==

Sbaus at 21:55, 30 November 2009

2009-11-30T21:55:40Z

← Older revision		Revision as of 21:55, 30 November 2009
Line 88:		Line 88:
	*Kuhelj, R.Biokemija v praksi: načela in tehnike. UL, FKKT, 2003		*Kuhelj, R.Biokemija v praksi: načela in tehnike. UL, FKKT, 2003
	*http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotides		*http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotides
			*http://sl.wikipedia.org/wiki/Nukleotid

Sbaus at 21:53, 30 November 2009

2009-11-30T21:53:21Z

← Older revision		Revision as of 21:53, 30 November 2009
Line 9:		Line 9:
	• oglijkov hidrat (aldopentoza) : V [http://en.wikipedia.org/wiki/DNA DNA] se nahaja 2-deoksiriboza, v [http://en.wikipedia.org/wiki/RNA RNA] pa riboza.		• oglijkov hidrat (aldopentoza) : V [http://en.wikipedia.org/wiki/DNA DNA] se nahaja 2-deoksiriboza, v [http://en.wikipedia.org/wiki/RNA RNA] pa riboza.

	• dušikove baze :purinski bazi adenin (A) in gvanin (G), pirimidinski bazi pa timin (T), citozin (C)in uracil (U).		• dušikove baze :purinski bazi [http://sl.wikipedia.org/wiki/Adenin adenin (A)] in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Gvanin gvanin (G)], pirimidinski bazi pa [http://sl.wikipedia.org/wiki/Timin timin (T)], [http://sl.wikipedia.org/wiki/Citozin citozin (C)]in [http://sl.wikipedia.org/wiki/Uracil uracil (U)].

	• fosfatne skupine		• fosfatne skupine
Line 53:		Line 53:
	==Sinteza==		==Sinteza==

	Fosforilna skupina (5'-fosfat ) se poveže na hidroksilno skupino ogljikovega hidrata (3'-hidroksilno skupino) v nukleozidu. Nastane fosfodiestrska vez.		Fosforilna skupina (5'-fosfat ) se poveže na hidroksilno skupino [http://sl.wikipedia.org/wiki/Ogljikovi_hidrati ogljikovega hidrata] (3'-hidroksilno skupino) v nukleozidu. Nastane fosfodiestrska vez.
	Ena kisla skupina fosfatne skupine je prosta, kar daje nukleinski kislini kisel značaj.V celicah se na nukleotide vežejo kovinski ioni, kot sta Mg+ in Mn+ in s tem nevtralizirajo naboj.		Ena kisla skupina fosfatne skupine je prosta, kar daje nukleinski kislini kisel značaj.V celicah se na nukleotide vežejo kovinski ioni, kot sta Mg+ in Mn+ in s tem nevtralizirajo naboj.

Sbaus at 21:46, 30 November 2009

2009-11-30T21:46:02Z

← Older revision		Revision as of 21:46, 30 November 2009
Line 7:		Line 7:
	Nukleotid sestavljajo tri komponente:		Nukleotid sestavljajo tri komponente:

	• oglijkov hidrat (aldopentoza) : V DNA se nahaja 2-deoksiriboza, v RNA pa riboza.		• oglijkov hidrat (aldopentoza) : V [http://en.wikipedia.org/wiki/DNA DNA] se nahaja 2-deoksiriboza, v [http://en.wikipedia.org/wiki/RNA RNA] pa riboza.

	• dušikove baze :purinski bazi adenin (A) in gvanin (G), pirimidinski bazi pa timin (T), citozin (C)in uracil (U).		• dušikove baze :purinski bazi adenin (A) in gvanin (G), pirimidinski bazi pa timin (T), citozin (C)in uracil (U).

Sbaus at 21:37, 30 November 2009

2009-11-30T21:37:52Z

← Older revision		Revision as of 21:37, 30 November 2009
Line 1:		Line 1:
	Nukleotidi so monomerne molekule, ki tvorijo molekule nukleinskih kislin.		Nukleotidi so monomerne molekule, ki tvorijo molekule nukleinskih kislin.
	Nukleotidi nosijo zapis za informacijo o tridimenzionalni strukturi nukleinskih kislin in njihovem delovanju v celici. Najpomembnejši in najpogostejši nukleotid v celici je adenozin-5'-monofosfat (AMP).		Nukleotidi nosijo zapis za informacijo o tridimenzionalni strukturi nukleinskih kislin in njihovem delovanju v celici. Najpomembnejši in najpogostejši [http://images.google.si/imgres?imgurl=http://celica.enki.si/images/sheme1.jpg&imgrefurl=http://celica.enki.si/podvojevanje-dna&usg=__udR8kqbuWH_tO3_ItdFsImb1y-M=&h=316&w=580&sz=104&hl=sl&start=2&um=1&tbnid=OY9rguLCEN2hEM:&tbnh=73&tbnw=134&prev=/images%3Fq%3Dnukleotidi%26hl%3Dsl%26client%3Dfirefox-a%26channel%3Ds%26rls%3Dorg.mozilla:sl:official%26sa%3DG%26um%3D1 nukleotid] v celici je adenozin-5'-monofosfat (AMP).

Sbaus at 21:32, 30 November 2009

2009-11-30T21:32:59Z

← Older revision		Revision as of 21:32, 30 November 2009
Line 4:		Line 4:

	==Struktura==		==Struktura==

	Nukleotid sestavljajo tri komponente:		Nukleotid sestavljajo tri komponente:

Line 12:		Line 13:
	• fosfatne skupine		• fosfatne skupine
	Povezava ogljikovega hidrata z dušikovo bazo tvori nukleozid. Povežeta se z N-glikozidno vezjo. V naravnih nukleozidih ima N-glikozidna vez β-konfiguracijo.		Povezava ogljikovega hidrata z dušikovo bazo tvori nukleozid. Povežeta se z N-glikozidno vezjo. V naravnih nukleozidih ima N-glikozidna vez β-konfiguracijo.


	<table border=1 cellpadding=2 cellspacing=0>		<table border=1 cellpadding=2 cellspacing=0>
Line 47:		Line 49:
	<tr>		<tr>
	</table>		</table>


	==Sinteza==		==Sinteza==

	Fosforilna skupina (5'-fosfat ) se poveže na hidroksilno skupino ogljikovega hidrata (3'-hidroksilno skupino) v nukleozidu. Nastane fosfodiestrska vez.		Fosforilna skupina (5'-fosfat ) se poveže na hidroksilno skupino ogljikovega hidrata (3'-hidroksilno skupino) v nukleozidu. Nastane fosfodiestrska vez.
	Ena kisla skupina fosfatne skupine je prosta, kar daje nukleinski kislini kisel značaj.V celicah se na nukleotide vežejo kovinski ioni, kot sta Mg+ in Mn+ in s tem nevtralizirajo naboj.		Ena kisla skupina fosfatne skupine je prosta, kar daje nukleinski kislini kisel značaj.V celicah se na nukleotide vežejo kovinski ioni, kot sta Mg+ in Mn+ in s tem nevtralizirajo naboj.
Line 63:		Line 67:

	==Nukleotidna degradacija==		==Nukleotidna degradacija==

	Nukleinske kisline v hrani so izpostavljene kislemu mediju, ki je v želodcu. So namreč degradirane do nukleotidov. Ionske komponente, ki ne morejo prehajati skozi celično membrano, se zato hidrolizirajo do nukleozidov. Ti se lahko direktno absorbirajo skozi črevesno sluznico ali pa se naprej degradirajo do prostih dušikovih baz in riboze preko nukleozidaze ali pa se degradirajo do riboze-1-fosfata z nukleozid fosforilazami:		Nukleinske kisline v hrani so izpostavljene kislemu mediju, ki je v želodcu. So namreč degradirane do nukleotidov. Ionske komponente, ki ne morejo prehajati skozi celično membrano, se zato hidrolizirajo do nukleozidov. Ti se lahko direktno absorbirajo skozi črevesno sluznico ali pa se naprej degradirajo do prostih dušikovih baz in riboze preko nukleozidaze ali pa se degradirajo do riboze-1-fosfata z nukleozid fosforilazami:

Line 68:		Line 73:

	Nukleozid + Pi + nukleozid fosforilaza = baza + riboza-1-P		Nukleozid + Pi + nukleozid fosforilaza = baza + riboza-1-P


	==Uporaba==		==Uporaba==

	Sintetični nukleozidi se večinoma uporabljajo za zdravljenje raka in drugih bolezni (tudi AIDSa).		Sintetični nukleozidi se večinoma uporabljajo za zdravljenje raka in drugih bolezni (tudi AIDSa).
	Nukleotidi so sestavine kofaktorjev, kot sta koencim A (CoA) in nikotinamidadenindinukleotid (NAD+ in NADP+).		Nukleotidi so sestavine kofaktorjev, kot sta koencim A (CoA) in nikotinamidadenindinukleotid (NAD+ in NADP+).
	GTP, ciklični AMP, ciklični GMP so pomembne signalne molekule. Pomemben je tudi gvanozin-5'-trifosfat, ki je vključen v celično sporočanje. Ribocimi imajo značilno terciarno strukturo, ki se prilagaja spremembam v katalitičnem ciklusu.		GTP, ciklični AMP, ciklični GMP so pomembne signalne molekule. Pomemben je tudi gvanozin-5'-trifosfat, ki je vključen v celično sporočanje. Ribocimi imajo značilno terciarno strukturo, ki se prilagaja spremembam v katalitičnem ciklusu.


	==Viri==		==Viri==

	*Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005		*Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005
	*Voet, D. et al. Biochemistry. John Wiley & Sons Inc., 2004.		*Voet, D. et al. Biochemistry. John Wiley & Sons Inc., 2004.
	*Kuhelj, R.Biokemija v praksi: načela in tehnike. UL, FKKT, 2003		*Kuhelj, R.Biokemija v praksi: načela in tehnike. UL, FKKT, 2003
	*http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotides		*http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotides