Primer X-inaktiviranega gena: O-GlcNAc transferaza - Revision history

Tulcnik: /* Viri */

2015-05-11T21:41:20Z

Viri

← Older revision		Revision as of 21:41, 11 May 2015
Line 32:		Line 32:
	* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.		* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.
	* Bond, M. R, Hanover J. A. A little sugar goes a long way: The cell biology of O-GlcNAc, JCB, 2015, letn. 208, št. 7, str. 869-880.		* Bond, M. R, Hanover J. A. A little sugar goes a long way: The cell biology of O-GlcNAc, JCB, 2015, letn. 208, št. 7, str. 869-880.
	* Olivier-Van Stichelen, S. in Hanover, J. A. X-inactivation normalizes O-GlcNAc transferase levels and generates an O-GlcNAc-depleted Barr body. Frontiers in genetics, 2014, letn. 5, str. 256-270.		* Olivier-Van Stichelen, S. in Hanover, J. A. X-inactivation normalizes O-GlcNAc transferase levels and generates an O-GlcNAc-depleted Barr body, Frontiers in genetics, 2014, letn. 5, str. 256-270.
	* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.		* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.
	* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.		* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.
	*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.		*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.
	[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]		[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]

Tulcnik: /* Viri */

2015-05-11T21:40:51Z

Viri

← Older revision		Revision as of 21:40, 11 May 2015
Line 31:		Line 31:
	==Viri==		==Viri==
	* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.		* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.
	* Bond, M. R, Hanover J. A. A little sugar goes a long way: The cell biology of O-GlcNAc, JCB, 2015, letn. 208, št. 7, str. 869-880		* Bond, M. R, Hanover J. A. A little sugar goes a long way: The cell biology of O-GlcNAc, JCB, 2015, letn. 208, št. 7, str. 869-880.
			* Olivier-Van Stichelen, S. in Hanover, J. A. X-inactivation normalizes O-GlcNAc transferase levels and generates an O-GlcNAc-depleted Barr body. Frontiers in genetics, 2014, letn. 5, str. 256-270.
	* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.		* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.
	* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.		* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.
	*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.		*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.
	[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]		[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]

Tulcnik: /* Delovanje encima in njegova funkcija */

2015-05-11T21:31:21Z

Delovanje encima in njegova funkcija

← Older revision		Revision as of 21:31, 11 May 2015
Line 3:		Line 3:
	==Delovanje encima in njegova funkcija==		==Delovanje encima in njegova funkcija==
	O-GlcNAc transferaza (OGT) je encim, ki pripenja N-acetilglukozaminske enote na proteine. Ta posttranslacijska modifikacija pomembno vpliva na njihovo aktivnost. OGT deluje kot senzor za povišano koncentracijo glukoze. Ko je v celici prisotna večja količina glukoze, se 2 do 3 procente glukoze v heksozaminski poti pretvori v N-acetilglukozamin. OGT ima funkcijo pripenjanja N-acetilglukozaminskih enot z O-glikozidno vezjo na serinske ali treoninske ostanke v proteinih. Proces dodajanja N-acetilglukozaminskih enot na te ostanke je dinamičen proces, saj obstaja nasprotno delujoči encim O-GlcNAcaza, ki pa razceplja O-glikozidno vez.		O-GlcNAc transferaza (OGT) je encim, ki pripenja N-acetilglukozaminske enote na proteine. Ta posttranslacijska modifikacija pomembno vpliva na njihovo aktivnost. OGT deluje kot senzor za povišano koncentracijo glukoze. Ko je v celici prisotna večja količina glukoze, se 2 do 3 procente glukoze v heksozaminski poti pretvori v N-acetilglukozamin. OGT ima funkcijo pripenjanja N-acetilglukozaminskih enot z O-glikozidno vezjo na serinske ali treoninske ostanke v proteinih. Proces dodajanja N-acetilglukozaminskih enot na te ostanke je dinamičen proces, saj obstaja nasprotno delujoči encim O-GlcNAcaza, ki pa razceplja O-glikozidno vez.
	Na proteine s serinskimi ali treoninskimi ostanki se poleg sadkorja lahko veže tudi fosfatna skupina. Kaj od tega dvojega se bo vezalo je odvisno od koncentracije glukoze in ATP. OGT deluje kot senzor glukoze ravno preko tega, da vzdržuje razmerje med fosforiliranimi in glikoziliranimi proteini, kar povzroči ustrezen odziv na povečano koncentracijo glukoze. Ker je v celici za fosforilacijo skrbi več kot tisoč različnih vrst kinaz, za dodajanje N-acetilglukozamina pa le OGT, je prisotnost in ustrezna količina le tega za celico zelo pomembna. Nepravilnosti v izražanju ali delovanju proteina OGT se tako kažejo v povezavi z nevrodegenerativnimi kot tudi metabolnimi boleznimi, ko so npr. diabetes tipa 2 ter razne kardiovaskularne bolezni.		Na proteine s serinskimi ali treoninskimi ostanki se poleg sadkorja lahko veže tudi fosfatna skupina. Kaj od tega dvojega se bo vezalo je odvisno od koncentracije glukoze in ATP. OGT deluje kot senzor glukoze ravno preko tega, da vzdržuje ustrezno razmerje med fosforiliranimi in glikoziliranimi proteini, kar povzroči ustrezen odziv na povečano koncentracijo glukoze. Ker je v celici za fosforilacijo skrbi več kot tisoč različnih vrst kinaz, za dodajanje N-acetilglukozamina pa le OGT, je prisotnost in ustrezna količina le tega za celico zelo pomembna. Nepravilnosti v izražanju ali delovanju proteina OGT se tako kažejo v povezavi z nevrodegenerativnimi kot tudi metabolnimi boleznimi, ko so npr. diabetes tipa 2 ter razne kardiovaskularne bolezni.

	==Inaktivacija kromosoma X==		==Inaktivacija kromosoma X==

Tulcnik at 21:27, 11 May 2015

2015-05-11T21:27:28Z

← Older revision		Revision as of 21:27, 11 May 2015
Line 1:		Line 1:
			O-GlcNAc transferaza je encim, ki je nujno potreben za normalen razvoj posameznika. Gen za ta encim se nahaja na kromosomu X. Pri ženskah pride do inaktivacije enega od dveh X kromosomov, kar je zelo pomembno, saj neustrezna količina izraženega encima močno vpiva na razvoj mnogih z metabolizmom povezanih bolezni.

	==Delovanje encima in njegova funkcija==		==Delovanje encima in njegova funkcija==
	O-GlcNAc transferaza (OGT) je encim, ki pripenja N-acetilglukozaminske enote na proteine. Ta posttranslacijska modifikacija pomembno vpliva na njihovo aktivnost. OGT deluje kot senzor za povišano koncentracijo glukoze. Ko je v celici prisotna večja količina glukoze, se 2 do 3 procente glukoze v heksozaminski poti pretvori v N-acetilglukozamin. OGT ima funkcijo pripenjanja N-acetilglukozaminskih enot z O-glikozidno vezjo na serinske ali treoninske ostanke v proteinih. Proces dodajanja N-acetilglukozaminskih enot na te ostanke je dinamičen proces, saj obstaja nasprotno delujoči encim O-GlcNAcaza, ki pa razceplja O-glikozidno vez.		O-GlcNAc transferaza (OGT) je encim, ki pripenja N-acetilglukozaminske enote na proteine. Ta posttranslacijska modifikacija pomembno vpliva na njihovo aktivnost. OGT deluje kot senzor za povišano koncentracijo glukoze. Ko je v celici prisotna večja količina glukoze, se 2 do 3 procente glukoze v heksozaminski poti pretvori v N-acetilglukozamin. OGT ima funkcijo pripenjanja N-acetilglukozaminskih enot z O-glikozidno vezjo na serinske ali treoninske ostanke v proteinih. Proces dodajanja N-acetilglukozaminskih enot na te ostanke je dinamičen proces, saj obstaja nasprotno delujoči encim O-GlcNAcaza, ki pa razceplja O-glikozidno vez.
	Na proteine s serinskimi ali treoninskimi ostanki se poleg sadkorja lahko veže tudi fosfatna skupina. Kaj od tega dvojega se bo vezalo je odvisno od koncentracije glukoze in ATP. OGT deluje kot senzor glukoze ravno preko tega, da ~~skrbi za ustrezno~~ razmerje med fosforiliranimi in glikoziliranimi proteini, kar povzroči ustrezen odziv na povečano koncentracijo glukoze. Ker je v celici za fosforilacijo skrbi več kot tisoč različnih vrst kinaz, za dodajanje N-acetilglukozamina pa le OGT, je prisotnost in ustrezna količina le tega za celico zelo pomembna. Nepravilnosti v izražanju ali delovanju proteina OGT se tako kažejo v povezavi z nevrodegenerativnimi kot tudi metabolnimi boleznimi, ko so npr. diabetes tipa 2 ter razne kardiovaskularne bolezni.		Na proteine s serinskimi ali treoninskimi ostanki se poleg sadkorja lahko veže tudi fosfatna skupina. Kaj od tega dvojega se bo vezalo je odvisno od koncentracije glukoze in ATP. OGT deluje kot senzor glukoze ravno preko tega, da vzdržuje razmerje med fosforiliranimi in glikoziliranimi proteini, kar povzroči ustrezen odziv na povečano koncentracijo glukoze. Ker je v celici za fosforilacijo skrbi več kot tisoč različnih vrst kinaz, za dodajanje N-acetilglukozamina pa le OGT, je prisotnost in ustrezna količina le tega za celico zelo pomembna. Nepravilnosti v izražanju ali delovanju proteina OGT se tako kažejo v povezavi z nevrodegenerativnimi kot tudi metabolnimi boleznimi, ko so npr. diabetes tipa 2 ter razne kardiovaskularne bolezni.

	==Inaktivacija kromosoma X==		==Inaktivacija kromosoma X==

Tulcnik: /* Viri */

2015-05-11T21:17:47Z

Viri

← Older revision		Revision as of 21:17, 11 May 2015
Line 29:		Line 29:
	==Viri==		==Viri==
	* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.		* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.
			* Bond, M. R, Hanover J. A. A little sugar goes a long way: The cell biology of O-GlcNAc, JCB, 2015, letn. 208, št. 7, str. 869-880
	* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.		* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.
	* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.		* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.
	*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.		*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.
	[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]		[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]

Tic123: /* Viri */

2015-05-11T21:11:34Z

Viri

← Older revision		Revision as of 21:11, 11 May 2015
Line 28:		Line 28:

	==Viri==		==Viri==
	* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, ~~vol~~. 453, str. 201-207.		* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, letn. 453, str. 201-207.
	* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, ~~vol~~. 41, str. 60-71.		* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, letn. 41, str. 60-71.
	* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, ~~vol~~. 10, št. 4, str. 365-380.		* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, letn. 10, št. 4, str. 365-380.
	*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, ~~vol~~. 29, str. 2831-2842.		*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, letn. 29, str. 2831-2842.
	[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]		[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]

Tic123: /* Razvoj bolezni */

2015-05-11T21:03:02Z

Razvoj bolezni

← Older revision		Revision as of 21:03, 11 May 2015
Line 16:		Line 16:

	==Razvoj bolezni==		==Razvoj bolezni==
	Prekomerno izražanje gena ~~O-GlcNAc transferaze (~~OGT) je povezano z diabetesom tipa 2, debelostjo, avtoimunskimi boleznimi in rakom.		Prekomerno izražanje gena OGT je povezano z diabetesom tipa 2, debelostjo, avtoimunskimi boleznimi in rakom.
	===Rak===		===Rak===
	Rak kot primaren vir energije uporablja glikolizo, zaradi česar ima tudi povečano privzemanje glukoze v celico. Del glukoze vstopi v heksozaminsko biosintezno pot (HBP) , kar poveča koncentracijo UDP-GlcNAc. Povečana koncentracija UDP-GlcNAc povzroči povečano izražanje proteina OGT in glikozilacijo proteinov. Glikozilacija povzroči spremembe v interakcijah med proteini, zato lahko pride do sprememb v specifičnih kompleksih, ki nadzorujejo onkogene poti. Če inhibiramo glikozilacijo proteinov, pride do zmanjšanja rasti tumorja, upočasni se celični cikel in izražajo se inhibitorji. Inhibitor vpliva na izražanje transkripcijskega faktorja FoxM1, ki skrbi za celično delitev med razvojem organov. Nadzoruje prehoda G1/S (v fazi G1 celica raste in se pripravlja na celično delitev; v fazi S se podvoji DNA) in G2/M (v fazi G2 celica raste in se pripravlja na mitozo; v fazi M pride do nastanka hčerinskih celic). Transkripcijski faktor poveča tudi invazivnost celic preko metaloproteinov. Spremembe v privzemanju glukoze vplivajo na anabolne in katabolne poti preko glikozilacije proteinov mTOR (angl. mammalian target of rapamycin- anabolizem) in AMPK (angl. 5' AMP-activated protein kinase- katabolizem). Poskusi so pokazali, da zmanjšana količina proteina p53 (tumor supresor) poveča stopnjo glikozilacije proteinov in tako ne nadzoruje več onkogenega fenotipa.		Rak kot primaren vir energije uporablja glikolizo, zaradi česar ima tudi povečano privzemanje glukoze v celico. Del glukoze vstopi v heksozaminsko biosintezno pot (HBP) , kar poveča koncentracijo UDP-GlcNAc. Povečana koncentracija UDP-GlcNAc povzroči povečano izražanje proteina OGT in glikozilacijo proteinov. Glikozilacija povzroči spremembe v interakcijah med proteini, zato lahko pride do sprememb v specifičnih kompleksih, ki nadzorujejo onkogene poti. Če inhibiramo glikozilacijo proteinov, pride do zmanjšanja rasti tumorja, upočasni se celični cikel in izražajo se inhibitorji. Inhibitor vpliva na izražanje transkripcijskega faktorja FoxM1, ki skrbi za celično delitev med razvojem organov. Nadzoruje prehoda G1/S (v fazi G1 celica raste in se pripravlja na celično delitev; v fazi S se podvoji DNA) in G2/M (v fazi G2 celica raste in se pripravlja na mitozo; v fazi M pride do nastanka hčerinskih celic). Transkripcijski faktor poveča tudi invazivnost celic preko metaloproteinov. Spremembe v privzemanju glukoze vplivajo na anabolne in katabolne poti preko glikozilacije proteinov mTOR (angl. mammalian target of rapamycin- anabolizem) in AMPK (angl. 5' AMP-activated protein kinase- katabolizem). Poskusi so pokazali, da zmanjšana količina proteina p53 (tumor supresor) poveča stopnjo glikozilacije proteinov in tako ne nadzoruje več onkogenega fenotipa.
Line 26:		Line 26:
	===Avtoimunske bolezni ===		===Avtoimunske bolezni ===
	Avtoimunska bolezen lupus napade zdrava, normalna tkiva. Je posledica zunanjih dejavnikov, ki inhibirajo DNA metilacijo v celicah T. Metiltransferaze utišajo gen z metilacijo citozina v CG paru, kar stabilizira heterokromatin (represivna oblika kromatina). Oslabljena metilacija DNA povzroči izražanje nezaželenih ali nepotrebnih proteinov v celici. Tudi inaktiviran X-kromosom se demetilira in izraža OGT, kar povzroči povečanje glikozilacije. To lahko poslabša ali celo sproži bolezen.		Avtoimunska bolezen lupus napade zdrava, normalna tkiva. Je posledica zunanjih dejavnikov, ki inhibirajo DNA metilacijo v celicah T. Metiltransferaze utišajo gen z metilacijo citozina v CG paru, kar stabilizira heterokromatin (represivna oblika kromatina). Oslabljena metilacija DNA povzroči izražanje nezaželenih ali nepotrebnih proteinov v celici. Tudi inaktiviran X-kromosom se demetilira in izraža OGT, kar povzroči povečanje glikozilacije. To lahko poslabša ali celo sproži bolezen.



	==Viri==		==Viri==

Tic123: /* Viri */

2015-05-11T21:00:37Z

Viri

← Older revision		Revision as of 21:00, 11 May 2015
Line 30:		Line 30:

	==Viri==		==Viri==
			* Olivier-Van Stichelen, S., Abramowitz, L. K. in Hanover J. A. X marks the spot: Does it matter that O-GlcNAc Transferase is an X-linked gene?, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, vol. 453, str. 201-207.
			* Hewagama, A., Gorelik, G., Patel, D., Liyanarachchi, P., McCune, W. J., Somer, E., Gonzalez-Rivera, T., The Michigan Lupus Cohort, Strickland, F. in Richardson, B. Overexpression of X-Linked genes in T cells from women with lupus, Journal of Autoimmunity, 2013, vol. 41, str. 60-71.
			* Ma, J. in Hart, W. G. Protein O-GlcNAcylation in diabetes and diabetic complications, Expert Reviews Proteomics, 2013, vol. 10, št. 4, str. 365-380.
			*Caldwell, S. A., Jackson, S. R., Shahriari, K. S., Lynch, T. P., Sethi, G., Walker, S., Vosseller, K. in Reginato, M. J. Nutrient sensor O-GlcNAc transferase regulates breast cancer tumorgenesis through targeting of the oncogenic transcription factor FoxM1, Oncogene, 2010, vol. 29, str. 2831-2842.
			[[Category:SEM]] [[Category:BMB]]

Tulcnik at 20:57, 11 May 2015

2015-05-11T20:57:20Z

← Older revision		Revision as of 20:57, 11 May 2015
Line 26:		Line 26:
	===Avtoimunske bolezni ===		===Avtoimunske bolezni ===
	Avtoimunska bolezen lupus napade zdrava, normalna tkiva. Je posledica zunanjih dejavnikov, ki inhibirajo DNA metilacijo v celicah T. Metiltransferaze utišajo gen z metilacijo citozina v CG paru, kar stabilizira heterokromatin (represivna oblika kromatina). Oslabljena metilacija DNA povzroči izražanje nezaželenih ali nepotrebnih proteinov v celici. Tudi inaktiviran X-kromosom se demetilira in izraža OGT, kar povzroči povečanje glikozilacije. To lahko poslabša ali celo sproži bolezen.		Avtoimunska bolezen lupus napade zdrava, normalna tkiva. Je posledica zunanjih dejavnikov, ki inhibirajo DNA metilacijo v celicah T. Metiltransferaze utišajo gen z metilacijo citozina v CG paru, kar stabilizira heterokromatin (represivna oblika kromatina). Oslabljena metilacija DNA povzroči izražanje nezaželenih ali nepotrebnih proteinov v celici. Tudi inaktiviran X-kromosom se demetilira in izraža OGT, kar povzroči povečanje glikozilacije. To lahko poslabša ali celo sproži bolezen.



			==Viri==

Tulcnik at 20:51, 11 May 2015

2015-05-11T20:51:58Z

← Older revision		Revision as of 20:51, 11 May 2015
Line 6:		Line 6:
	Gen Ogt se nahaja na X kromosomu v bližini mesta XIC (X inaktivacijski center), kjer se inaktivacija prične. Ker se mora v celici tako moških kot žensk nahajati približno enaka količina OGT, je nujno, da pride ob inaktivaciji kromosoma X tudi do utišanja Ogt gena. Ta se tako zaradi svojega položaja relativno kmalu po začetku inaktivacije utiša. Inaktivacijo prične XIC s tem, da sintetizira nekodirajoče RNA (nrRNA), med katere spada tudi Xist RNA. Te se vežejo na več specifičnih mest na X kromosomu. Ko je posamezna Xist RNA vezana, se zaradi njene ustrezne koformacije na njo povežejo proteinski kompleksi PcG (ang. polycomb group protein). Kompleksi PcG so ključni pri epigenetskem utišanju genov. Povzročijo represivne modifikacije histonov in utišanje genov, s tem ko metilirajo lizin 27 na histonu H3, in ubikvitinirajo lizin 119 na histonu H2. Da pride do popolne inaktivacije pa poskrbijo drugi proteinski kompleksi, ki zamenjajo ubikvitiniran histon H2 z macroH2A. S tem je vezava DNA na histone še močnejša DNA se ni več zmožna odviti. Ta postopek se ponovi na sosednjih histonskih oktamerih in na ta način se veča delež heterokromatina, dokler ne pride do popolne inaktivacije (razen nekaterih genov) in nastanka barovega telesca.		Gen Ogt se nahaja na X kromosomu v bližini mesta XIC (X inaktivacijski center), kjer se inaktivacija prične. Ker se mora v celici tako moških kot žensk nahajati približno enaka količina OGT, je nujno, da pride ob inaktivaciji kromosoma X tudi do utišanja Ogt gena. Ta se tako zaradi svojega položaja relativno kmalu po začetku inaktivacije utiša. Inaktivacijo prične XIC s tem, da sintetizira nekodirajoče RNA (nrRNA), med katere spada tudi Xist RNA. Te se vežejo na več specifičnih mest na X kromosomu. Ko je posamezna Xist RNA vezana, se zaradi njene ustrezne koformacije na njo povežejo proteinski kompleksi PcG (ang. polycomb group protein). Kompleksi PcG so ključni pri epigenetskem utišanju genov. Povzročijo represivne modifikacije histonov in utišanje genov, s tem ko metilirajo lizin 27 na histonu H3, in ubikvitinirajo lizin 119 na histonu H2. Da pride do popolne inaktivacije pa poskrbijo drugi proteinski kompleksi, ki zamenjajo ubikvitiniran histon H2 z macroH2A. S tem je vezava DNA na histone še močnejša DNA se ni več zmožna odviti. Ta postopek se ponovi na sosednjih histonskih oktamerih in na ta način se veča delež heterokromatina, dokler ne pride do popolne inaktivacije (razen nekaterih genov) in nastanka barovega telesca.

	==~~vpliv~~ OGT pri inaktivaciji==		==Vpliv OGT pri inaktivaciji==
	Gen Ogt, ki zapisuje za O-GlcNAc transferazo se nahaja samo na kromosomu X. Značilnost tega gena je, da je pri sesalcih prisoten le v eni kopiji, se pravi, da se na enem kromosomu X se nahaja ena kopija gena Ogt. Ker imamo le en gen za ta encim in ker je njegova vloga v celici zelo pomembna, je ključnega pomena, da je njegovo izražanje močno nadzorovano za njeno normalno delovanje. Na to kaže njegov položaj na kromosomu, saj se nahaja v bližini lokusa Xist, ta pa je ključen za inaktivacijo samega X-kromosoma. Poleg tega pa njegovo nahajanje na spolnem kromosomu prispeva k spolno-specifičnim tveganjem za številne bolezni, saj imajo ženske na celico dve kopiji gena Ogt, in posledično se lahko v primeru nepravilne inaktivacije kromosoma X pojavijo različne nevrološke in metabolne bolezni, kot posledica njegovega nepravilnega izražanja.		Gen Ogt, ki zapisuje za O-GlcNAc transferazo se nahaja samo na kromosomu X. Značilnost tega gena je, da je pri sesalcih prisoten le v eni kopiji, se pravi, da se na enem kromosomu X se nahaja ena kopija gena Ogt. Ker imamo le en gen za ta encim in ker je njegova vloga v celici zelo pomembna, je ključnega pomena, da je njegovo izražanje močno nadzorovano za njeno normalno delovanje. Na to kaže njegov položaj na kromosomu, saj se nahaja v bližini lokusa Xist, ta pa je ključen za inaktivacijo samega X-kromosoma. Poleg tega pa njegovo nahajanje na spolnem kromosomu prispeva k spolno-specifičnim tveganjem za številne bolezni, saj imajo ženske na celico dve kopiji gena Ogt, in posledično se lahko v primeru nepravilne inaktivacije kromosoma X pojavijo različne nevrološke in metabolne bolezni, kot posledica njegovega nepravilnega izražanja.
	Encim OGT je epigenetski regulator in odkrita je bila povezava med encimom OGT in PcG kompleksom pri sesalcih, kar nakazuje vpliv encima OGT na transkripcijo. Encim OGT je pomemben pri trimetilaciji histona 3 na mestu K27 (lizin 27), da se tvori modifikacijo H3K27me3, saj to spremembo katalizira encim EZH2, del PRC2. Encim OGT O-GlcNAcetilira protein EZH2, komponento PRC2, ki je eden ključnih proteinov, ki sodelujejo pri inaktivaciji kromosoma X, na serinu 75 in ga s tem stabilizira ter olajša nastajanje te modifikacije. Nasprotno pa zmanjšanje koncentracije encima OGT vodi k zmanjšani pogostosti metilacije histonov. Ta modifikacija pa je ena najpomembnejših, ki sodeluje pri utišanju kromatina.		Encim OGT je epigenetski regulator in odkrita je bila povezava med encimom OGT in PcG kompleksom pri sesalcih, kar nakazuje vpliv encima OGT na transkripcijo. Encim OGT je pomemben pri trimetilaciji histona 3 na mestu K27 (lizin 27), da se tvori modifikacijo H3K27me3, saj to spremembo katalizira encim EZH2, del PRC2. Encim OGT O-GlcNAcetilira protein EZH2, komponento PRC2, ki je eden ključnih proteinov, ki sodelujejo pri inaktivaciji kromosoma X, na serinu 75 in ga s tem stabilizira ter olajša nastajanje te modifikacije. Nasprotno pa zmanjšanje koncentracije encima OGT vodi k zmanjšani pogostosti metilacije histonov. Ta modifikacija pa je ena najpomembnejših, ki sodeluje pri utišanju kromatina.