BIO2 Seminar 2023

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

ime in priimek	poglavje	naslov seminarja	recenzent 1	recenzent 2	datum oddaje	datum recenzije	datum predstavitve
Veler, Jakob Urh	12		Ferjančič, Lara	Kolenc, Klara	24/10/2023	25/10/2023	25/10/2023
Majerle, Nina	12		Perc, Anže	Škarabot, Anja	24/10/2023	25/10/2023	25/10/2023
Kokol, Anja	12		Bernik, Miha	Čerenak, Blaž	24/10/2023	25/10/2023	25/10/2023
Trontelj, Domen	12		Janc, Nika	Puhov, Špela	24/10/2023	25/10/2023	25/10/2023
Kozel, Vid	12		Oman Sušnik, Tonja	Boštjančič, Ava	24/10/2023	25/10/2023	25/10/2023
Kunstelj, Karin	14-15		Veler, Jakob Urh	Ferjančič, Lara	06/11/2023	07/11/2023	08/11/2023
Jordan Ferbežar, Uma	14-15		Majerle, Nina	Perc, Anže	06/11/2023	07/11/2023	08/11/2023
Hvalec, Jan	14-15		Kokol, Anja	Bernik, Miha	06/11/2023	07/11/2023	08/11/2023
Oman Sušnik, Tonja	14-15		Trontelj, Domen	Janc, Nika	06/11/2023	07/11/2023	08/11/2023
Frantar, Mark	14-15		Kozel, Vid	Oman Sušnik, Tonja	06/11/2023	07/11/2023	08/11/2023
Kostanjšek, Žan	16		Kunstelj, Karin	Veler, Jakob Urh	13/11/2023	14/11/2023	15/11/2023
Makuc, Nika	16		Jordan Ferbežar, Uma	Majerle, Nina	13/11/2023	14/11/2023	15/11/2023
Robek, Tinkara	16		Hvalec, Jan	Kokol, Anja	13/11/2023	14/11/2023	15/11/2023
Klinar, Brina	16		Bervar, Amber	Trontelj, Domen	13/11/2023	14/11/2023	15/11/2023
Bajec, Lana	16		Frantar, Mark	Kozel, Vid	13/11/2023	14/11/2023	15/11/2023
Kociper, Debora	17		Kostanjšek, Žan	Kunstelj, Karin	20/11/2023	21/11/2023	22/11/2023
Cankar, Nina	17		Makuc, Nika	Jordan Ferbežar, Uma	20/11/2023	21/11/2023	22/11/2023
Žulič, Jošt	17		Robek, Tinkara	Hvalec, Jan	20/11/2023	21/11/2023	22/11/2023
Bartol, Mojca	17		Klinar, Brina	Bervar, Amber	20/11/2023	21/11/2023	22/11/2023
Ciglar, Nika	17		Bajec, Lana	Frantar, Mark	20/11/2023	21/11/2023	22/11/2023
Bregar, Jana	18		Kociper, Debora	Kostanjšek, Žan	27/11/2023	28/11/2023	29/11/2023
Kosovel, Tina	18	Kako aminokisline podpirajo naš imunski sistem	Cankar, Nina	Makuc, Nika	27/11/2023	28/11/2023	29/11/2023
Dular, Maj	18		Žulič, Jošt	Robek, Tinkara	27/11/2023	28/11/2023	29/11/2023
Matek, Nik	18		Bartol, Mojca	Klinar, Brina	27/11/2023	28/11/2023	29/11/2023
Trobiš, Veronika	18		Ciglar, Nika	Bajec, Lana	27/11/2023	28/11/2023	29/11/2023
Osterc, Igor	19		Bregar, Jana	Kociper, Debora	04/12/2023	05/12/2023	06/12/2023
Kramar, Zala	19	Vloga proteinov družine Bcl-2 pri intrinzični poti apoptoze	Kosovel, Tina	Cankar, Nina	04/12/2023	05/12/2023	06/12/2023
Kolnik, Dan	19		Dular, Maj	Žulič, Jošt	04/12/2023	05/12/2023	06/12/2023
Lešnik, Tjaša	19	Vloga napak mitohondrijske DNA pri nevrodegenerativnih boleznih in staranju	Matek, Nik	Bregar, Jana	04/12/2023	05/12/2023	06/12/2023
Habot, Hanna	19		Trobiš, Veronika	Ciglar, Nika	04/12/2023	05/12/2023	06/12/2023
Mulalić, Anita	20		Osterc, Igor	Bartol, Mojca	11/12/2023	12/12/2023	13/12/2023
Gričar Vintar, Peter	20	Fotosintetski mikroorganizmi za oksigenacijo naprednih 3D biotiskanih tkiv	Kramar, Zala	Kosovel, Tina	11/12/2023	12/12/2023	13/12/2023
Pajnhart, Lara	20		Kolnik, Dan	Dular, Maj	11/12/2023	12/12/2023	13/12/2023
Hudobivnik, Laura	20		Lešnik, Tjaša	Matek, Nik	11/12/2023	12/12/2023	13/12/2023
Vogrič, Vanja	20		Habot, Hanna	Trobiš, Veronika	11/12/2023	12/12/2023	13/12/2023
Pšeničnik, Tiara	21		Mulalić, Anita	Osterc, Igor	18/12/2023	19/12/2023	20/12/2023
Snedec, Andraž	21		Gričar Vintar, Peter	Kramar, Zala	18/12/2023	19/12/2023	20/12/2023
Polutnik, Patricija	21		Pajnhart, Lara	Kolnik, Dan	18/12/2023	19/12/2023	20/12/2023
Longar, Špela	21		Hudobivnik, Laura	Lešnik, Tjaša	18/12/2023	19/12/2023	20/12/2023
Kristl, Simon	21		Vogrič, Vanja	Habot, Hanna	18/12/2023	19/12/2023	20/12/2023
Čarman, Jasna	22	Inhibitorji sinteze nukleotidov kot kemoterapevtiki	Pšeničnik, Tiara	Mulalić, Anita	21/12/2023	22/12/2023	03/01/2024
Kolenc, Klara	22		Snedec, Andraž	Gričar Vintar, Peter	21/12/2023	22/12/2023	03/01/2024
Škarabot, Anja	22	Sinteza nukleotidov kot osnova bakterijske patogeneze	Polutnik, Patricija	Pajnhart, Lara	21/12/2023	22/12/2023	03/01/2024
Čerenak, Blaž	22	Zapletena biosinteza vitamina B12 in prilagoditve evkariontov na njegovo absorpcijo	Longar, Špela	Hudobivnik, Laura	21/12/2023	22/12/2023	03/01/2024
Puhov, Špela	22		Kristl, Simon	Vogrič, Vanja	21/12/2023	22/12/2023	03/01/2024
Boštjančič, Ava	23		Čarman, Jasna	Pšeničnik, Tiara	08/01/2024	09/01/2024	10/01/2024
Ferjančič, Lara	23		Kolenc, Klara	Snedec, Andraž	08/01/2024	09/01/2024	10/01/2024
Perc, Anže	23		Škarabot, Anja	Polutnik, Patricija	08/01/2024	09/01/2024	10/01/2024
Bernik, Miha	23		Čerenak, Blaž	Longar, Špela	08/01/2024	09/01/2024	10/01/2024
Janc, Nika	23		Puhov, Špela	Kristl, Simon	08/01/2024	09/01/2024	10/01/2024
Bervar, Amber	23		Boštjančič, Ava	Čarman, Jasna	15/01/2024	16/01/2024	17/01/2024

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim, da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo, in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom. Pvzetek je tudi del pisnega izdelka.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5–12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli, v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva, določenega v tabeli, določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 15 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji. Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili, vpišite na tukaj.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate, poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.docx za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.docx za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.docx za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.pptx za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
• 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje ... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.