TBK2015-seminar

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prištejeh končnipisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih.

Seznam seminarjev

Ime in priimek	Naslov seminarja	Povezava	Rok za oddajo	Rok za recenzijo	Datum predstavitve	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3
Klara Lenart	Permanentno označevanje nevronskih povezav	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150212141453.htm	10.03.	13.03.	16.03.	Maja Zupanc	Matej Hvalec	Urša Kopač
Uroš Zavrtanik	Popravljalni mehanizem DNA (NER)	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/01/150128141423.htm	10.03.	13.03.	16.03.	Eva Rajh	Lara Jerman	Neža Koritnik
Blaž Lebar	Preučitev imunskega odziva komarja po piku	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150206174850.htm	10.03.	13.03.	16.03.	Elvira Boršić	Kristjan Stibilj	Katja Čop
Gašper Žun	Antibiotiki uničujejo bakterije z okvaro izgradnje celične stene	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/12/141205114011.htm	17.03.	20.03.	23.03.	Nejc Kejžar	Samo Smole	Klara Kuret
Rok Miklavčič	Kontrola prenašalnih RNA na CCA-dodajajočem encimu	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/01/150129151612.htm	17.03.	20.03.	23.03.	Tilen Tršelič	Miha Koprivnikar Krajnc	Matej Hvalec
Simon Aleksič	Zorenje mRNA pri lignjih zaznamujejo A-I deaminacije	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150212114327.htm	17.03.	20.03.	23.03.	Klara Lenart	Maja Zupanc	Lara Jerman
Tjaša Lukšič	Ključne biološke funkcije skakajočih genov	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150219133102.htm	17.03.	20.03.	23.03.	Uroš Zavrtanik	Eva Rajh	Kristjan Stibilj
Špela Malenšek	Smo zaradi endogenih retrovirusov pametnejši?	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/01/150112093129.htm	24.03.	27.03.	30.03.	Blaž Lebar	Elvira Boršić	Samo Smole
Ema Gašperšič	Dvojedrni bakrov kompleks naj bi preprečil širjenje raka	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/03/150302071134.htm	24.03.	27.03.	30.03.	Gašper Žun	Nejc Kejžar	Miha Koprivnikar Krajnc
Tilen Tršelič	Transport proteinov v celico s pomočjo nanodelcev	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/01/150108141444.htm	24.03.	27.03.	30.03.	Miha Koprivnikar Krajnc	Klara Kuret	Samo Purič
Gašper Virant	Vezava agonista na adenozinske receptorje lajša kronično bolečino	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/11/141126132639.htm	24.03.	27.03.	30.03.	Simon Aleksič	Klara Lenart	Eva Rajh
Manca Zupan			07.04.	10.04.	13.04.	Tjaša Lukšič	Uroš Zavrtanik	Elvira Boršić
Urša Čerček	Odkrita struktura encima Dbr1 predstavlja nove možnosti za zdravljenje ALS in FTD	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/09/140911094721.htm	07.04.	10.04.	13.04.	Špela Malenšek	Blaž Lebar	Nejc Kejžar
Katja Brezovar	HIV nadzoruje svojo aktivnost neodvisno od gostiteljske celice	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150227112749.htm	07.04.	10.04.	13.04.	Ema Gašperšič	Gašper Žun	Tilen Tršelič
Lovro Kotnik	Acetilacija lizina in spremembe v proteomu astrocitov možganske skorje pri okužbi s Toxoplasma gondii	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/03/150318153918.htm	07.04.	10.04.	13.04.	Petra Hruševar	Rok Miklavčič	Klara Lenart
Maruša Grošelj			14.04.	17.04.	20.04.	Gašper Virant	Simon Aleksič	Uroš Zavrtanik
Tadej Satler	Določanje zaporedja DNK s pomočjo grafena	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/03/150330095403.htm	14.04.	17.04.	20.04.	Manca Zupan	Tjaša Lukšič	Blaž Lebar
Aleksandra Uzar	Vzbujanje REM faze z aktivacijo holinergičnih nevronov	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150203123423.htm	14.04.	17.04.	20.04.	Urša Čerček	Špela Malenšek	Gašper Žun
Niko Šetar	Preprečevanje širjenja raka z inhibicijo ERK1/2 kaskade.	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/03/150330122615.htm	14.04.	17.04.	20.04.	Katja Brezovar	Ema Gašperšič	Rok Miklavčič
Lija Srnovršnik	Zaviranje rasti tumorjev z rušenjem strukture tumorskega stromalnega mikrookolja	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/08/140815102231.htm	24.04.	30.04.	04.05.	Lovro Kotnik	Petra Hruševar	Simon Aleksič
Sara Tekavec	Cistična fibroza: odkrita dodatna okvara imunskega sistema	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/09/140904084508.htm	24.04.	30.04.	04.05.	Maruša Grošelj	Gašper Virant	Tjaša Lukšič
Jaka Kos	Aktivacija in kontrola genov s pomočjo svetlobe	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150209113249.htm	24.04.	30.04.	04.05.	Tadej Satler	Manca Zupan	Špela Malenšek
Samo Purič	Desifrirana enigma: virusne infekcije	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150204075224.htm	24.04.	30.04.	04.05.	Aleksandra Uzar	Urša Čerček	Ema Gašperšič
Urša Kopač	Protein SOD5 prisoten v obrambnem sistemu gliv	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/04/140416143311.htm	05.05.	08.05.	11.05.	Niko Šetar	Katja Brezovar	Petra Hruševar
Neža Koritnik	Vpliv nekodirajoče DNA na tvorbo raka: interakcije na dolge razdalje	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150219090349.htm	05.05.	08.05.	11.05.	Lija Srnovršnik	Lovro Kotnik	Gašper Virant
Katja Čop	Ključna vloga proteina RBFox2 pri srčnem popuščanju	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/03/150305125144.htm	05.05.	08.05.	11.05.	Sara Tekavec	Maruša Grošelj	Manca Zupan
Klara Kuret	Novo odkriti biosenzor omogoča vpogled v delovanje rastlinskega obrambnega sistema	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/01/150116115436.htm	05.05.	08.05.	11.05.	Jaka Kos	Tadej Satler	Urša Čerček
Matej Hvalec	Odkritja dodatnhih nukleotidov DNA	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/05/150504101254.htm	12.05.	15.05.	18.05.	Samo Purič	Aleksandra Uzar	Katja Brezovar
Lara Jerman	Dedovanje: za vse ni kriva DNA	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/04/150402161751.htm	12.05.	15.05.	18.05.	Urša Kopač	Niko Šetar	Lovro Kotnik
Kristjan Stibilj	Uporaba nannožičnih-bakterijskih hibridov pri samostojni svetlobno odvisni fiksaciji co2 na umetne organske spojine	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/04/150416132638.htm	12.05.	15.05.	18.05.	Neža Koritnik	Lija Srnovršnik	Maruša Grošelj
Samo Smole			12.05.	15.05.	18.05.	Katja Čop	Sara Tekavec	Tadej Satler
Miha Koprivnikar Krajnc	Boj za železo	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150206111519.htm	19.05.	22.05.	25.05.	Klara Kuret	Jaka Kos	Aleksandra Uzar
Maja Zupanc	Zviti paraziti: Trojanski konj kot ideja za ugrabitev imunskega sistema	http://www.sciencedaily.com/releases/2014/11/141125111818.htm	19.05.	22.05.	25.05.	Matej Hvalec	Samo Purič	Niko Šetar
Eva Rajh	Vloga Elongaze 7 pri replikaciji človeškega citomegalovirusa	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/03/150323162358.htm	19.05.	22.05.	25.05.	Lara Jerman	Urša Kopač	Lija Srnovršnik
Elvira Boršić	Inaktivacija kromosoma X z RNA genom	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/04/150427133117.htm	19.05.	22.05.	25.05.	Kristjan Stibilj	Neža Koritnik	Sara Tekavec
Nejc Kejžar	Novi 'pametni' inzulin	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/02/150209161141.htm	26.05.	29.05.	01.06.	Samo Smole	Katja Čop	Jaka Kos
Petra Hruševar	Zmanjšanje invazivnosti melanomskih celic in tumorigeneze z inhibiranjem GMPS	http://www.sciencedaily.com/releases/2015/05/150506095251.htm	26.05.	29.05.	01.06.	Rok Miklavčič	Tilen Tršelič	Maja Zupanc

Naloga

• samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2014. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
• članke na temo lahko iščete v PubMed povezavi tukaj
• naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
• Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 12 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
• Predstavitvi sledi razprava do 8 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
• En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš!

• TBK_2015_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2015_Guncar_Gregor.docx
• TBK_2015_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• TBK_2015_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2015_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• TBK_2015_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2015_Guncar_Gregor.pptx

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.). Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.