BIO2 Seminar 2019

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

ime in priimek	poglavje	naslov seminarja	recenzent 1	recenzent 2	datum oddaje	datum recenzije	datum predstavitve
Tevž Levstek	12	Glicinski transporterji kot terapevtske tarče	Sašo Jakob	Andrej Špenko	18/10/2019	21/10/2019	23/10/2019
Ana Potočnik	12	Fosfatidilserin kot signalna molekula	Marjeta Milostnik	Maja Mahorič	18/10/2019	21/10/2019	23/10/2019
Kim Glavič	12	ATP kot signalna molekula živali in rastlin	Tina Logonder	Tim Nograšek	18/10/2019	21/10/2019	23/10/2019
Nika Vegelj	12	Formacija biofilma v povezavi s c-di-GMP signalizacijo.	Žan Fortuna	Nina Varda	25/10/2019	28/10/2019	30/10/2019
Tadej Uršič	12	TLR signalizacija in njena vloga pri revmatičnih boleznih	Michelle Oletič	Tina Arnšek	25/10/2019	28/10/2019	30/10/2019
Natalija Razpotnik	12		Maša Gabrič	Timotej Zgonik	25/10/2019	28/10/2019	30/10/2019
Maja Kolar	14-15	Biokemijska logika glikolize	Tevž Levstek	Sašo Jakob	01/11/2019	04/11/2019	06/11/2019
Jure Povšin	14-15	Vpliv dimetil fumarata na GAPDH in aerobno glikolizo pri modulaciji imunosti	Ana Potočnik	Marjeta Milostnik	01/11/2019	04/11/2019	06/11/2019
Manca Osolin	14-15	Regulacija metabolizma glukoze in laktata v možganih	Kim Glavič	Tina Logonder	01/11/2019	04/11/2019	06/11/2019
Greta Junger	16	Intermediati cikla citronske kisline: signalne molekule pod krinko	Nika Vegelj	Žan Fortuna	08/11/2019	11/11/2019	13/11/2019
Oskar Nemec	16	Uravnavanje delovanja levkocitov z intermediati cikla citronske kisline	Tadej Uršič	Michelle Oletič	08/11/2019	11/11/2019	13/11/2019
Teo Nograšek	16	GPR91: Premikanje meja intermediatov Krebsovega cikla	Natalija Razpotnik	Maša Gabrič	08/11/2019	11/11/2019	13/11/2019
Ana Babnik	17	Regulacija oksidacije maščobnih kislin v skeletnih mišicah pri aerobni vadbi	Maja Kolar	Tevž Levstek	15/11/2019	18/11/2019	20/11/2019
Maša Andoljšek	17	Dobre stare maščobe: Povezava med signalizacijo lipidov in življenjsko dobo	Jure Povšin	Ana Potočnik	15/11/2019	18/11/2019	20/11/2019
Nastja Feguš	17	Večdimenzionalna vloga ketonskih teles	Manca Osolin	Kim Glavič	15/11/2019	18/11/2019	20/11/2019
Vivian Nemanič	18	Vpliv stresa in glukokortikoidov na prenos glutamata	Greta Junger	Nika Vegelj	22/11/2019	25/11/2019	27/11/2019
Lena Trnovec	18	Karbamoilacija: mehanizmi in posledice	Oskar Nemec	Tadej Uršič	22/11/2019	25/11/2019	27/11/2019
Sonja Gabrijelčič	18		Teo Nograšek	Natalija Razpotnik	22/11/2019	25/11/2019	27/11/2019
Maja Trifkovič	19	Vpliv mutacij mitohondrijske DNA na delovanje celic	Ana Babnik	Maja Kolar	29/11/2019	02/12/2019	04/12/2019
Anja Konjc	19	Superkompleksi	Maša Andoljšek	Jure Povšin	29/11/2019	02/12/2019	04/12/2019
Ana Vičič	19	Vloga mitohondrijev pri oksidativnem stresu	Nastja Feguš	Manca Osolin	29/11/2019	02/12/2019	04/12/2019
Andrej Špenko	20		Vivian Nemanič	Greta Junger	06/12/2019	09/12/2019	11/12/2019
Maja Mahorič	20	Poti fiksacije ogljika pri avtotrofih	Lena Trnovec	Oskar Nemec	06/12/2019	09/12/2019	11/12/2019
Tim Nograšek	20	Tioredoksini in njihov vpliv pri fotosintezi in biosintezi ogljikovih hidratov	Sonja Gabrijelčič	Teo Nograšek	06/12/2019	09/12/2019	11/12/2019
Nina Varda	21	Biosinteza levkotriena B4	Maja Trifkovič	Ana Babnik	13/12/2019	16/12/2019	18/12/2019
Tina Arnšek	21	Regulacija sinteze lipidov s fosfatidatom	Anja Konjc	Maša Andoljšek	13/12/2019	16/12/2019	18/12/2019
Timotej Zgonik	21	Nadzor homeostaze lipidnega dvosloja	Ana Vičič	Nastja Feguš	13/12/2019	16/12/2019	18/12/2019
Sašo Jakob	22	Vpliv metabolizma aminokislin na imunski sistem	Andrej Špenko	Vivian Nemanič	03/01/2020	06/01/2020	08/01/2020
Marjeta Milostnik	22	Biologija hema v eritroidnih celicah sesalcev ter povezane bolezni	Maja Mahorič	Lena Trnovec	03/01/2020	06/01/2020	08/01/2020
Tina Logonder	22	Serin v rastlinah	Tim Nograšek	Sonja Gabrijelčič	03/01/2020	06/01/2020	08/01/2020
Žan Fortuna	23	Grelin: Struktura in funkcija	Nina Varda	Maja Trifkovič	10/01/2020	13/01/2020	15/01/2020
Michelle Oletič	23	Kostni hormon: osteokalcin	Tina Arnšek	Anja Konjc	10/01/2020	13/01/2020	15/01/2020
Maša Gabrič	23	Funkcija serotonina v perifernih tkivih in celicah imunskega sistema	Timotej Zgonik	Ana Vičič	10/01/2020	13/01/2020	15/01/2020

Dokončno razporeditev bom objavil naknadno.

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Sporočite mi morebitne napake ali če vas nisem razporedil.

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Zelo pomembno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v toku celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili vpišite na tukaj.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
• 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.