Receptorju podobna kinaza bogata s cisteini, pšenici daje odpornost proti širokemu spektru pegavosti Septoria tritici: Difference between revisions
Andrej Race (talk | contribs) |
Andrej Race (talk | contribs) No edit summary |
||
| (4 intermediate revisions by the same user not shown) | |||
| Line 3: | Line 3: | ||
Listna bolezen pegavosti Septoria tritici (''ang.'' Septoria tritici blotch (STB)), ki jo povzroča gliva ''Zymoseptoria tritici'', bistveno vpliva na pridelek na nekaterih največjih območjih, kjer pridelujejo pšenico. Do danes je bilo kartiranih 22 glavnih genov za odpornost proti STB (imenovanih ''Stb'') v pšenici <sup>1</sup>, ki omogočajo kvalitativno odpornost. Kvalitativna odpornost je ponavadi monogenska, specifična za genotip in netrajna. Za večino genov Stb se je izkazalo da so učinkovite proti manjšini avirulentnih izolatov ''Z. tritici'' <sup>2</sup>. | Listna bolezen pegavosti Septoria tritici (''ang.'' Septoria tritici blotch (STB)), ki jo povzroča gliva ''Zymoseptoria tritici'', bistveno vpliva na pridelek na nekaterih največjih območjih, kjer pridelujejo pšenico. Do danes je bilo kartiranih 22 glavnih genov za odpornost proti STB (imenovanih ''Stb'') v pšenici <sup>1</sup>, ki omogočajo kvalitativno odpornost. Kvalitativna odpornost je ponavadi monogenska, specifična za genotip in netrajna. Za večino genov Stb se je izkazalo da so učinkovite proti manjšini avirulentnih izolatov ''Z. tritici'' <sup>2</sup>. | ||
Kloniranje prvega gena ''Stb'' (''Stb6'') je pred kratkim pokazalo, da kodira s steno povezan receptor, ki daje gen-za-gen tip odpornosti proti izolatom, ki nosijo ujemajoči se gen AvrStb6 1. Še en gen, ki je še posebej zanimiv, je ''Stb16q'', ki je bil učinkovit proti vsem doslej testiranih izolatih ''Z. tritici''<sup>2</sup>. V tem članku so ta gen klonirali in analizirali iz sintetične heksaploidne pšenice (SHW), ki je odporna na STB <sup>1</sup>. SHW so umetno ustvarjeni plodni hibridi med tetraploidno pšenico in diploidnim sorodnikom pšenice. S tem se omogoči prenos agronomsko pomembnih genov iz divjih sorodnikov na navadno pšenico <sup>3</sup>. | Kloniranje prvega gena ''Stb'' (''Stb6'') je pred kratkim pokazalo, da kodira s steno povezan receptor, ki daje gen-za-gen tip odpornosti proti izolatom, ki nosijo ujemajoči se gen AvrStb6 <sup>1</sup>. Še en gen, ki je še posebej zanimiv, je ''Stb16q'', ki je bil učinkovit proti vsem doslej testiranih izolatih ''Z. tritici''<sup>2</sup>. V tem članku so ta gen klonirali in analizirali iz sintetične heksaploidne pšenice (SHW), ki je odporna na STB <sup>1</sup>. SHW so umetno ustvarjeni plodni hibridi med tetraploidno pšenico in diploidnim sorodnikom pšenice. S tem se omogoči prenos agronomsko pomembnih genov iz divjih sorodnikov na navadno pšenico <sup>3</sup>. | ||
==Rezulatati== | ==Rezulatati== | ||
| Line 11: | Line 11: | ||
Da bi | Da bi jim preverili funkcijo, primerjali so sekvence teh genov v odpornih in dovzetnih sevih. Ugotovili so, da so vsi sevi, ki vsebujejo ali ''Crk6'' ali ''Unk1'' haplotip iz TA4152-19, odporni na ''Z. tritici'', dokler jih dovzeten sev ND495 ne vsebuje. Po tem so preverjali fenotipe 310 družin mutageniziranih TA4152-19 in opazili, da so dovzetne rastline vsebovale škodljivo mutacijo S508F v kinazni aktivacijski zanki ''Crk6'', medtem ko v genu ''Unk1'' niso opazili mutacije. Ugotovili so da je homozigotnost te mutacije povzročila dovzetnost, kar dokazuje da gen ''Crk6'' predstavlja ''Stb16q''. Na koncu so še stabilno transformirali dovzetni sev Courtot z genomsko sekvenco ''Crk6'' in T2 generacijo okužili z 11 sevi Z. tritici. Opazili so da so vse rastline, ki so vsebovale transgen, bile odporne na vse seve. Na podlagi tega so sklenili da ''Crk6'' omogoča odpornost širokega spektra proti Z. tritici <sup>1</sup>. | ||
===Funkcija ''Stb16q''=== | ===Funkcija ''Stb16q''=== | ||
''Stb16q'' kodira receptorju podobno kinazo bogato s cisteini, transmembranski protein z | ''Stb16q'' kodira receptorju podobno kinazo bogato s cisteini, transmembranski protein z dvema ekstracelularnima DUF26 domenama in intracelularno serin/treonin protein kinazno domeno. Na osnovi aminokislinske ohranjenosti DUF26 domene med ''Gnk2'' in ''Stb16q'' proteinom, predpostavljajo da ''Stb16q'' veže apoplastično manozo, ki prihaja iz glive ali rastline in s tem aktivira imunski odziv. Imunski odziv prepreči širjenje glive pred vhodom skozi stomatno režo, ali v njeni votlini, pri čemer ne ubije patogena. Člani CRK familije, med katere sovpada ''Stb16q'', so pokazali vlogo v odpornosti proti patogenih pri drugih rastlinah. Pri ''Arabidopsis'' so tudi dobro preučeni, ampak odsotnost ortologov onemogoča predpostavljanje mehanizma reakcije <sup>1</sup>. | ||
===Razširjenost in uporabnost ''Stb16q''=== | ===Razširjenost in uporabnost ''Stb16q''=== | ||
| Line 23: | Line 23: | ||
==Zaključek in pomisleki== | ==Zaključek in pomisleki== | ||
V članku so pokazali da ''Stb16q'' omogoča odpornim SHW odpornost širokega spektra proti vseh preverjenih sevih ''Z. tritici'', | V članku so pokazali, da ''Stb16q'' omogoča odpornim SHW odpornost širokega spektra proti vseh preverjenih sevih ''Z. tritici'' tudi, če ne moremo izključiti, da imajo ti sevi druge obrambne mehanizme proti tem patogenu. Z druge strani odsotnost ''Stb16q'' iz gojenih sort pšenice nakazuje, da za patogen ni bilo selekcijskega pritiska, kaj je verjetno tudi razlog za odpornost širokega spektra. To pomeni, da je treba ta gen skrbno uporabiti z drugimi kvalitativnimi ali kvantitativnimi odpornostmi za vzrejo trajnih sort pšenice, odpornih na širok spekter ''Z. tritici'' <sup>1</sup>. | ||
==Literatura== | ==Literatura== | ||
Latest revision as of 13:06, 6 April 2021
Odpornost pšenice proti pegavosti Septoria tritici
Listna bolezen pegavosti Septoria tritici (ang. Septoria tritici blotch (STB)), ki jo povzroča gliva Zymoseptoria tritici, bistveno vpliva na pridelek na nekaterih največjih območjih, kjer pridelujejo pšenico. Do danes je bilo kartiranih 22 glavnih genov za odpornost proti STB (imenovanih Stb) v pšenici 1, ki omogočajo kvalitativno odpornost. Kvalitativna odpornost je ponavadi monogenska, specifična za genotip in netrajna. Za večino genov Stb se je izkazalo da so učinkovite proti manjšini avirulentnih izolatov Z. tritici 2.
Kloniranje prvega gena Stb (Stb6) je pred kratkim pokazalo, da kodira s steno povezan receptor, ki daje gen-za-gen tip odpornosti proti izolatom, ki nosijo ujemajoči se gen AvrStb6 1. Še en gen, ki je še posebej zanimiv, je Stb16q, ki je bil učinkovit proti vsem doslej testiranih izolatih Z. tritici2. V tem članku so ta gen klonirali in analizirali iz sintetične heksaploidne pšenice (SHW), ki je odporna na STB 1. SHW so umetno ustvarjeni plodni hibridi med tetraploidno pšenico in diploidnim sorodnikom pšenice. S tem se omogoči prenos agronomsko pomembnih genov iz divjih sorodnikov na navadno pšenico 3.
Rezulatati
Kartiranje Stb16q
Z uporabo QTL (ang. Quantitative Trait Loci) analize odpornosti dupliranih haplotipov križanja SHW TA4152-19 z dovzetno linijo ND495 na Z. tritici so ugotovili, da je gen na lokusu Stb16q, ali gen, ki je direktno povezan z njim odgovoren za fenotipsko varijacijo 1,4. Primerjali so sekvenco z referenčno genetsko karto visoke gostote in opazili, da se 5 mikrosatelitnih markerjev skupaj deduje s Stb16q. Markerje so uporabili da iščejo rekombinacijske dogodke pri 1305 imunih in 675 dovzetnih rastlinah s čimer so omejili Stb16q na 272 kb interval, z zapisom za dva gena Crk6 in Unk1 1.
Da bi jim preverili funkcijo, primerjali so sekvence teh genov v odpornih in dovzetnih sevih. Ugotovili so, da so vsi sevi, ki vsebujejo ali Crk6 ali Unk1 haplotip iz TA4152-19, odporni na Z. tritici, dokler jih dovzeten sev ND495 ne vsebuje. Po tem so preverjali fenotipe 310 družin mutageniziranih TA4152-19 in opazili, da so dovzetne rastline vsebovale škodljivo mutacijo S508F v kinazni aktivacijski zanki Crk6, medtem ko v genu Unk1 niso opazili mutacije. Ugotovili so da je homozigotnost te mutacije povzročila dovzetnost, kar dokazuje da gen Crk6 predstavlja Stb16q. Na koncu so še stabilno transformirali dovzetni sev Courtot z genomsko sekvenco Crk6 in T2 generacijo okužili z 11 sevi Z. tritici. Opazili so da so vse rastline, ki so vsebovale transgen, bile odporne na vse seve. Na podlagi tega so sklenili da Crk6 omogoča odpornost širokega spektra proti Z. tritici 1.
Funkcija Stb16q
Stb16q kodira receptorju podobno kinazo bogato s cisteini, transmembranski protein z dvema ekstracelularnima DUF26 domenama in intracelularno serin/treonin protein kinazno domeno. Na osnovi aminokislinske ohranjenosti DUF26 domene med Gnk2 in Stb16q proteinom, predpostavljajo da Stb16q veže apoplastično manozo, ki prihaja iz glive ali rastline in s tem aktivira imunski odziv. Imunski odziv prepreči širjenje glive pred vhodom skozi stomatno režo, ali v njeni votlini, pri čemer ne ubije patogena. Člani CRK familije, med katere sovpada Stb16q, so pokazali vlogo v odpornosti proti patogenih pri drugih rastlinah. Pri Arabidopsis so tudi dobro preučeni, ampak odsotnost ortologov onemogoča predpostavljanje mehanizma reakcije 1.
Razširjenost in uporabnost Stb16q
Analizirali so zastopanost otpornega haplotipa Stb16q in ga opazili samo pri SHW. Od 805 vzorkcev iz osnovne zbirke pšenic in sort iz glavnih območji za proizvodnjo pšenice, je otporen alel imelo samo 6 sort. Stb16q verjetno izvira iz sevov Ae. tauschii pri Kaspijskem jezeru in je pred kratkim vnesen v SHW z rejskihmi programi. Ugotovili so tudi to, da Stb16q ne daje dovzetnosti za druge bolezni, s čimer so pokazali, da je gen uporaben za vzrejo 1.
Zaključek in pomisleki
V članku so pokazali, da Stb16q omogoča odpornim SHW odpornost širokega spektra proti vseh preverjenih sevih Z. tritici tudi, če ne moremo izključiti, da imajo ti sevi druge obrambne mehanizme proti tem patogenu. Z druge strani odsotnost Stb16q iz gojenih sort pšenice nakazuje, da za patogen ni bilo selekcijskega pritiska, kaj je verjetno tudi razlog za odpornost širokega spektra. To pomeni, da je treba ta gen skrbno uporabiti z drugimi kvalitativnimi ali kvantitativnimi odpornostmi za vzrejo trajnih sort pšenice, odpornih na širok spekter Z. tritici 1.
Literatura
1. Saintenac, C. et al. A wheat cysteine-rich receptor-like kinase confers broad-spectrum resistance against Septoria tritici blotch. Nat. Commun. 12, 1–10 (2021).
2. Brown, J. K. M., Chartrain, L., Lasserre-Zuber, P. & Saintenac, C. Genetics of resistance to Zymoseptoria tritici and applications to wheat breeding. Fungal Genet. Biol. 79, 33–41 (2015).
3. Li, A., Liu, D., Yang, W., Kishii, M. & Mao, L. Synthetic Hexaploid Wheat: Yesterday, Today, and Tomorrow. Engineering vol. 4 552–558 (2018).
4. Kearsey, M. J. & Farquhar, A. G. L. QTL analysis in plants; where are we now? Heredity (Edinb). 80, 137–142 (1998).
