BIO2 Seminar 2013

Biokemijski seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak petek od 13:00 do 16:00.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev

Ime Priimek	Tema*	Naslov seminarja	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3	Datum oddaje	Datum recenzije	Datum predstavitve
Triplat Katjuša	12	Signalizacija s člani TGF – β pri žilni morfogenezi in boleznih	Ipšek Rok	Štukelj Sabina	Krmpotić Luka	04.11.2013	06.11.2013	08.11.2013
Krišelj Ana	12	Signalna pot sfingozin-1-fosfata in njegova vloga v boleznih	Tavčar Petra	Zgonc Alja	Petrič Boštjan	04.11.2013	06.11.2013	08.11.2013
Zupančič Maja	12	Menin: ogrodni protein, ki nadzoruje ekspresijo genov in celično signalizacijo	Guštin Ema	Jakše Helena	Bolta Simon	04.11.2013	06.11.2013	08.11.2013
Božič Tim	12	Motorični protein z regulacijo serotoninskega receptorja vpliva na razpoloženje	Oblak Zvonar Eva	Strašek Nika	Juteršek Mojca	04.11.2013	06.11.2013	08.11.2013
Vidmar Vita	14	Vloga pentozafosfatne poti v metabolizmu rakavih celic	Rupert Jakob	Nagode Toni	Vidak Eva	04.11.2013	06.11.2013	08.11.2013
Radić Vesna	14	Vloga betatrofina pri zdravljenju diabetesa	Triplat Katjuša	Ipšek Rok	Štukelj Sabina	04.11.2013	08.11.2013	15.11.2013
Guštin Ema	14	Warburgov efekt in možnosti za zdravljenje raka	Krišelj Ana	Tavčar Petra	Zgonc Alja	04.11.2013	08.11.2013	15.11.2013
Kapš Urša	15	Uravnavanje maščob: lipidi in človeške bolezni	Zupančič Maja	Guštin Ema	Jakše Helena	04.11.2013	08.11.2013	15.11.2013
Kavčič Luka	15	Vloga glikolitičnega regulatornega encima PKM2 v metabolizmu rakave celice	Božič Tim	Oblak Zvonar Eva	Strašek Nika	04.11.2013	08.11.2013	15.11.2013
Mihalič Filip	15	Pomen microRNA molekul v metabolizmu in metabolnih nepravilnostih	Vidmar Vita	Rupert Jakob	Nagode Toni	04.11.2013	08.11.2013	15.11.2013
Košenina Sara	16	Zdravljenje hipoksije in z njo povezanega nastanka raka preko citratnega cikla	Radić Vesna	Triplat Katjuša	Ipšek Rok	08.11.2013	15.11.2013	22.11.2013
Bensa Tjaša	16	α-ketoglutarat dehidrogenazni kompleks in nevrodegenerativne bolezni	Horvat Marjeta	Krišelj Ana	Tavčar Petra	08.11.2013	15.11.2013	22.11.2013
Ferenc Rok	16	Medsebojne fizične povezave encimov TCA cikla v Bacillus subtilis	Kapš Urša	Zupančič Maja	Guštin Ema	08.11.2013	15.11.2013	22.11.2013
Buh Tajda	16	Mutacije izocitrat dehidrogenaze 1 in 2 pri raku	Kavčič Luka	Božič Tim	Oblak Zvonar Eva	08.11.2013	15.11.2013	22.11.2013
Jazbec Vid	17	Vpliv maščobnih kislin na rakave celice	Mihalič Filip	Vidmar Vita	Rupert Jakob	08.11.2013	15.11.2013	22.11.2013
Tahirović Aneja	17	Omega - 3 maščobne kisline in njihov vpliv na človeško telo	Košenina Sara	Radić Vesna	Triplat Katjuša	15.11.2013	22.11.2013	29.11.2013
Klofutar Domen	17	Lipoliza - reguliran multiencimski kompleks, ki vpliva na katabolizem zalog maščobe	Bensa Tjaša	Horvat Marjeta	Krišelj Ana	15.11.2013	22.11.2013	29.11.2013
Prolič - Kalinšek Maruša	17	Vloga PPAR pri razgradnji maščobnih kislin	Ferenc Rok	Kapš Urša	Zupančič Maja	15.11.2013	22.11.2013	29.11.2013
Fabjan Jure	18	Oksidativni in nitrozativni stres v nevrotoksičnosti amoniaka	Buh Tajda	Kavčič Luka	Božič Tim	15.11.2013	22.11.2013	29.11.2013
Rozman Jan	18	Proteini - Alternativni vir energije rastlin ob pomanjkanju ogljikovih hidratov	Jazbec Vid	Mihalič Filip	Vidmar Vita	15.11.2013	22.11.2013	29.11.2013
Prezelj Peter	18	Aminokisline in regulacija proteinske sinteze v skeletnem mišičnem tkivu	Tahirović Aneja	Košenina Sara	Radić Vesna	22.11.2013	29.11.2013	06.12.2013
Omahna Aljaž	18	Sinteza melanina v celicah	Klofutar Domen	Bensa Tjaša	Horvat Marjeta	22.11.2013	29.11.2013	06.12.2013
Taškar Jan	19	Zgodnje napake pri oksidativni fosforilaciji v odpovedujočem človeškem srcu	Prolič - Kalinšek Maruša	Ferenc Rok	Kapš Urša	22.11.2013	29.11.2013	06.12.2013
Kašnik Urška	19	Moj izbrani naslov	Fabjan Jure	Buh Tajda	Kavčič Luka	22.11.2013	29.11.2013	06.12.2013
Kostanjevec Mojca	19	Mitohondrijske reaktivne kisikove spojine	Rozman Jan	Jazbec Vid	Mihalič Filip	22.11.2013	29.11.2013	06.12.2013
Krmpotić Luka	19	Vpliv Ca2+ na metabolično homeostazo	Prezelj Peter	Tahirović Aneja	Košenina Sara	29.11.2013	06.12.2013	13.12.2013
Petrič Boštjan	19	Regulacija in inhibicija citokrom c oksidaze	Omahna Aljaž	Klofutar Domen	Bensa Tjaša	29.11.2013	06.12.2013	13.12.2013
Bolta Simon	20	Fotosinteza C4	Taškar Jan	Prolič - Kalinšek Maruša	Ferenc Rok	29.11.2013	06.12.2013	13.12.2013
Juteršek Mojca	20	Regulacija sinteze peptidoglikanske celične stene	Kašnik Urška	Fabjan Jure	Buh Tajda	29.11.2013	06.12.2013	13.12.2013
Vidak Eva	20	Fotosintetska plastičnost CAM fotosinteze: evolucijska novost za trajnostno proizvodnjo	Kostanjevec Mojca	Rozman Jan	Jazbec Vid	29.11.2013	06.12.2013	13.12.2013
Štukelj Sabina	21	Sfingolipidi in vloga njihovega metabolizma pri raku	Krmpotić Luka	Prezelj Peter	Tahirović Aneja	20.12.2013	24.12.2013	03.01.2014
Zgonc Alja	21	Regulacija metabolizma lipidov z miRNA	Petrič Boštjan	Omahna Aljaž	Klofutar Domen	20.12.2013	24.12.2013	03.01.2014
Jakše Helena	21	Inhibicija skvalen sintaze kot alternativa statinom	Bolta Simon	Taškar Jan	Prolič - Kalinšek Maruša	20.12.2013	24.12.2013	03.01.2014
Strašek Nika	22	Porfirija	Juteršek Mojca	Kašnik Urška	Fabjan Jure	20.12.2013	24.12.2013	03.01.2014
Nagode Toni	22	Encimi in snovi ključne pri vključevanju uracila v DNA	Vidak Eva	Kostanjevec Mojca	Rozman Jan	20.12.2013	24.12.2013	03.01.2014
Ipšek Rok	22	Glutation - celični antioksidant	Štukelj Sabina	Krmpotić Luka	Prezelj Peter	24.12.2013	03.01.2014	10.01.2014
Tavčar Petra	23	Sestavine plastike vplivajo na delovanje endokrinega sistema	Zgonc Alja	Petrič Boštjan	Omahna Aljaž	24.12.2013	03.01.2014	10.01.2014
Horvat Marjeta	23	Metabolizem železa pri sesalcih in vloga hepcidina	Jakše Helena	Bolta Simon	Taškar Jan	24.12.2013	03.01.2014	10.01.2014
Oblak Zvonar Eva	23	Leptin in kognicija	Strašek Nika	Juteršek Mojca	Kovačič Matic	24.12.2013	03.01.2014	10.01.2014
Rupert Jakob	23	"Lačen si ful drugačen": Grelin in njegovi vplivi na telo	Nagode Toni	Vidak Eva	Kostanjevec Mojca	24.12.2013	03.01.2014	10.01.2014

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju (peta izdaja), v katerega naj izbrana tema spada

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo!

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v sedmih dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.