TBK2014-seminar

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič in so na urniku vsak ponedeljek od 11:00 do 12:30. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prištejeh končnipisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih.

Seznam seminarjev

Ime in priimek	Naslov seminarja	Povezava	Rok za oddajo	Rok za recenzijo	Datum predstavitve	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3
Črt Kovač	Naslov	link	03.03.	06.03.	10.03.	Liza Otorepec	Marija Srnko	Luka Dejanović
Bine Tršavec	Stikalo, ki pove, da je čas za spanje	Povezava	03.03.	06.03.	10.03.	Naida Hajdarević	Eva Škrjanec	Katja Malovrh
Jernej Vidmar	Boljša slikovna obdelava z nanozamrzovanjem	Povezava	03.03.	06.03.	10.03.	Nuša Kelhar	Vesna Podgrajšek	Nina Mavec
Ernest Šprager	Doslej najuspešnejše utišanje genov v jetrih z RNA interferenco po zaslugi novih nanodelcev	Povezava	03.03.	06.03.	10.03.	Tamara Božič	Nives Mikešić	Ana Kompan
Andrej Žulič	Prva umetna celica z delujočimi organeli	Povezava	10.03.	13.03.	17.03.	Črt Kovač	Liza Otorepec	Marija Srnko
Urška Černe	Boj imunskega sistema proti malariji	Povezava	10.03.	13.03.	17.03.	Bine Tršavec	Naida Hajdarević	Eva Škrjanec
Tadej Ulčnik	Prisotnost proteinov UCP določa metabolizem celice	Povezava	10.03.	13.03.	17.03.	Jernej Vidmar	Nuša Kelhar	Vesna Podgrajšek
Jerneja Kocutar	Odziv celic na stresne situacije	Povezava	10.03.	13.03.	17.03.	Ernest Šprager	Tamara Božič	Nives Mikešić
Hrvoje Malkoč	Adsorbcija mielinskega bazičnega proteina na membrane mielinskih lipidnih dvoslojev	Povezava	17.03.	20.03.	24.03.	Andrej Žulič	Črt Kovač	Liza Otorepec
Janja Krapež	Nanopore omogočajo transport DNA skozi membrane	Povezava	17.03.	20.03.	24.03.	Urška Černe	Bine Tršavec	Naida Hajdarević
Inge Sotlar	CPEB proteini oblikujejo dolgoročni spomin	Povezava	24.03.	27.03.	31.03.	Tadej Ulčnik	Jernej Vidmar	Nuša Kelhar
Monika Pepelnjak	Odpornost tumorjev na kemoterapijo	Povezava	24.03.	27.03.	31.03.	Jerneja Kocutar	Ernest Šprager	Tamara Božič
Jerneja Ovčar	Vztrajno zavezujoč mehanizem za vizualni nadzor gibanja	Povezava	24.03.	27.03.	31.03.	Hrvoje Malkoč	Andrej Žulič	Črt Kovač
Anja Tanšek	Potrditev ključne beljakovine odgovorne za razrešitev skrivnosti mitoze	Povezava	24.03.	27.03.	31.03.	Janja Krapež	Urška Černe	Bine Tršavec
			24.03.	27.03.	31.03.	Inge Sotlar	Tadej Ulčnik	Jernej Vidmar
Angela Mihajloska	Proteine ki so odkriti v gonoreje lahko ponudijo novi pristop k zdravljenju	Povezava	31.03.	03.04.	07.04.	Monika Pepelnjak	Jerneja Kocutar	Ernest Šprager
Božin Krstanoski	Uporaba bakterij pri naftnih razlitjih	Povezava	31.03.	03.04.	07.04.	Jerneja Ovčar	Hrvoje Malkoč	Andrej Žulič
Domagoj Majić	Low vitamin D levels raise anemia risk in children	Povezava	31.03.	03.04.	07.04.	Anja Tanšek	Janja Krapež	Urška Černe
Amadeja Lapornik	Nanodelci, ki omogočajo zgodnje odkrivanje krvnih strdkov	Povezava	31.03.	03.04.	07.04.	Anja Šantl	Inge Sotlar	Tadej Ulčnik
Peter Pečan	Reprogramiranje kožnih celic v srčne	Povezava	07.04.	10.04.	14.04.	Angela Mihajloska	Monika Pepelnjak	Jerneja Kocutar
Živa Moravec	Ključen korak naprej pri tiskanju 3D tkiv	Povezava	07.04.	10.04.	14.04.	Božin Krstanoski	Jerneja Ovčar	Hrvoje Malkoč
Tjaša Sorčan	Posamezni Iks kanali na površini celic sesalcev vsebujejo dve KCNE1 podenoti	Povezava	21.04.	24.04.	05.05.	Domagoj Majić	Anja Tanšek	Janja Krapež
Tomaž Žagar	Ključna proteina pri uravnavanju celične smrti	Povezava	21.04.	24.04.	05.05.	Amadeja Lapornik	Anja Šantl	Inge Sotlar
Fran Krstanović	Breast milk protein may be key to protecting babies from HIV	Povezava	21.04.	24.04.	05.05.	Peter Pečan	Angela Mihajloska	Monika Pepelnjak
Jure Zadravec	Vloga tumorskih označevalcev CA19-9, CA125 in CA72-4 pri diagnozi raka trebušne slinavke	Povezava	21.04.	24.04.	05.05.	Živa Moravec	Božin Krstanoski	Jerneja Ovčar
Primož Tič	Regeneracija ostarelega priželjca z enim samim transkripcijskim faktorjem	Povezava	05.05.	08.05.	12.05.	Tjaša Sorčan	Domagoj Majić	Anja Tanšek
Valentina Levak	Protein Juno je receptor proteina Izumo1 in potreben za fertilizacijo	Povezava	05.05.	08.05.	12.05.	Tomaž Žagar	Amadeja Lapornik	Anja Šantl
Enja Kokalj	Celice med mitozo onemogočijo popravljanje DNA zaradi spajanja telomer	Povezava	05.05.	08.05.	12.05.	Fran Krstanović	Peter Pečan	Angela Mihajloska
Luka Dejanović	Zaščita mrežnice s pomočjo kave	Povezava	12.05.	15.05.	19.05.	Primož Tič	Tjaša Sorčan	Domagoj Majić
Katja Malovrh	Spremembe cistinskih ledvičnih kamnov ob zdravljenju	Povezava	12.05.	15.05.	19.05.	Valentina Levak	Tomaž Žagar	Amadeja Lapornik
Nina Mavec	Specifične spremembe serumskih proteinov pri ljudeh s Parkinsonovo boleznijo	Povezava	12.05.	15.05.	19.05.	Enja Kokalj	Fran Krstanović	Peter Pečan
Anja Šantl	Černobilske ptice so se prilagodile ionizirajočemu sevanju	Povezava	12.05.	15.05.	19.05.	Hasiba Kamenjaković	Jure Zadravec	Živa Moravec
Marija Srnko	[1]	Povezava	19.05.	22.05.	26.05.	Luka Dejanović	Primož Tič	Tjaša Sorčan
Eva Škrjanec			19.05.	22.05.	26.05.	Katja Malovrh	Valentina Levak	Tomaž Žagar
Vesna Podgrajšek	Odkrivanje spremenjene morfologije hipokampusa pri depresiji povezani z multiplo sklerozo	Povezava	19.05.	22.05.	26.05.	Nina Mavec	Enja Kokalj	Fran Krstanović
Nives Mikešić	Uporaba matičnih celic in virusa Herpes Simplex pri zdrvljenju možganskega raka	Povezava	19.05.	22.05.	26.05.	Ana Kompan	Hasiba Kamenjaković	Jure Zadravec
Liza Otorepec	Napoved razvoja multiple skleroze s pomočjo vitamina D	Povezava	26.05.	29.05.	02.06.	Marija Srnko	Luka Dejanović	Primož Tič
Naida Hajdarević	GDF11: Protein, ki zavrti čas nazaj	Povezava	26.05.	29.05.	02.06.	Eva Škrjanec	Katja Malovrh	Valentina Levak
Nuša Kelhar	GroEL/ES šaperonini pospešijo in uravnavajo zvijanje domene TIM-barrel (TIM-sodčka)	Povezava	26.05.	29.05.	02.06.	Vesna Podgrajšek	Nina Mavec	Enja Kokalj
Tamara Božič	Pomen proteina CFIm25 za rast možganskega tumorja	Povezava	26.05.	29.05.	02.06.	Nives Mikešić	Ana Kompan	Hasiba Kamenjaković

Naloga

• samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2013. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
• članke na temo lahko iščete v PubMed povezavi tukaj
• naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
• Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 12 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
• Predstavitvi sledi razprava do 8 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
• En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš!

• TBK_2014_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2014_Guncar_Gregor.docx
• TBK_2014_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• TBK_2014_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2014_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• TBK_2014_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2014_Guncar_Gregor.pptx

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.). Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.