Quantifly: Difference between revisions
Ema Guštin (talk | contribs) |
Ema Guštin (talk | contribs) No edit summary |
||
| Line 10: | Line 10: | ||
Konstitutivni promotor Pr uravnava izražanje gena za protein XylR. Ta detektorski protein je sposoben vezave aromatskih ogljikovodikov z metilno skupino (npr. toluen in ksilen). Ko veže tako molekulo, se konformacijsko spremeni, dimerizira in se veže na DNA, ob dimerizaciji dveh dimerov pa kot transkripcijski regulator deluje na promotor Pu. Aktivacija promotorja Pu omogoči transkripcijo gena GLuc, ki kodira za reporterski bioluminiscenčni protein luciferazo iz organizmov rodu ''Gaussia''. Ta encim katalizira oksidacijo organske spojine koelenterazin, pri čemer se sprošča modra svetloba z emisijskim maksimumom pri 488 nm. | Konstitutivni promotor Pr uravnava izražanje gena za protein XylR. Ta detektorski protein je sposoben vezave aromatskih ogljikovodikov z metilno skupino (npr. toluen in ksilen). Ko veže tako molekulo, se konformacijsko spremeni, dimerizira in se veže na DNA, ob dimerizaciji dveh dimerov pa kot transkripcijski regulator deluje na promotor Pu. Aktivacija promotorja Pu omogoči transkripcijo gena GLuc, ki kodira za reporterski bioluminiscenčni protein luciferazo iz organizmov rodu ''Gaussia''. Ta encim katalizira oksidacijo organske spojine koelenterazin, pri čemer se sprošča modra svetloba z emisijskim maksimumom pri 488 nm. | ||
== Vir == | |||
[http://2016.igem.org/Team:Ionis_Paris Wiki stran ekipe Ionis Paris 2016] | |||
[[Seminarji SB 12016/17]] | [[Seminarji SB 12016/17]] | ||
Revision as of 17:40, 27 November 2016
Uvod
V zadnjih letih se ljudje čedalje bolj zavedamo problematike onesnaženosti okolja na različnih nivojih. V zraku so na primer prisotni številni plini in trdni delci s škodljivim vplivom na zdravje ljudi in na okolje, ki nastajajo pri nekaterih naravnih pojavih kot so vulkanski izbruhi, požari in razgradnja organskih snovi, ter predvsem kot posledica človeške dejavnosti (npr. industrija, promet, kmetijstvo in ogrevanje). Hlapne organske spojine, med katere spadajo nekateri ciklični aromatski ogljikovodiki in aldehidi, sicer predstavljajo le 2 % snovi, ki prispevajo k onesnaženosti zraka, njihov škodljiv vpliv na zdravje ljudi in na okolje pa je zelo velik. Skupina študentov iz Pariza je v svojem projektu, s katerim je sodelovala na sinteznobiološkem tekmovanju iGEM 2016, izdelala mobilno napravo za zaznavanje in natančno kvantifikacijo omenjenih organskih onesnaževalcev zraka, ki so jo poimenovali Quantifly.
Biosenzor
Biosenzorji so celostne in samostojne merilne naprave oz. sistemi, ki vsebujejo biološko komponento, sposobno prepoznavanja in kvantifikacije specifičnih dražljajev. Lahko gre za makromolekulo, organel, celico ali tkivo. Ključna elementa biosenzorja sta detektor, ki prepozna vhodni dražljaj in reporter, ki sproži izhodni signal.
Mladi francoski sintezni biologi izdelali celični, natančneje bakterijski biosenzor. Kot ogrodje so uporabili nepatogeni laboratorijski sev bakterijske vrste Escherichia coli, DH5α. Genski konstrukt, ki omogoča delovanje biosenzorja, pa je sestavljen iz konstitutivnega promotorja Pr, gena XylR, inducibilnega promotorja Pu in gena GLuc.
Konstitutivni promotor Pr uravnava izražanje gena za protein XylR. Ta detektorski protein je sposoben vezave aromatskih ogljikovodikov z metilno skupino (npr. toluen in ksilen). Ko veže tako molekulo, se konformacijsko spremeni, dimerizira in se veže na DNA, ob dimerizaciji dveh dimerov pa kot transkripcijski regulator deluje na promotor Pu. Aktivacija promotorja Pu omogoči transkripcijo gena GLuc, ki kodira za reporterski bioluminiscenčni protein luciferazo iz organizmov rodu Gaussia. Ta encim katalizira oksidacijo organske spojine koelenterazin, pri čemer se sprošča modra svetloba z emisijskim maksimumom pri 488 nm.
