Sintetični: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
| Line 2: | Line 2: | ||
==Uvod== | ==Uvod== | ||
Sintetična biologija omogoča dekodiranje in oblikovanje genetskih sistemov za boljše razumevanje delovanja celic. Natančna, prostorsko in časovno usklajena regulacija izražanja genov je ključna za celične funkcije in prilagodljivost. Pri rekonstrukciji večgenskih sistemov se pogosto uporablja pristop »od spodaj navzgor«, s katerim lahko ustvarimo sisteme za raziskovanje naravnih procesov ali razvoj novih funkcij. | |||
Cilj predstavljene raziskave v izhodiščnem članku je bil razviti knjižnico sintetičnih nastavljivih promotorjev (STP-jev), ki omogočajo fleksibilno, večnivojsko in neodvisno regulacijo izražanja več genov v sesalskih celicah. Uporabili so metodo MPRA (“massively parallel reporter assays”), ki omogoča natančno kvantifikacijo aktivnosti številnih promotorjev hkrati preko njihovih unikatnih črtnih kod. | |||
Obstoječi konstitutivni promotorji niso primerni za dinamično uravnavanje, saj imajo stalno izražanje in ne reagirajo na spremembe v celičnem okolju. Zato so v tej raziskavi uporabili CRISPRa sistem, ki omogoča inducibilno aktivacijo transkripcije s pomočjo neaktivne dCas9, povezane z aktivacijsko domeno in vodene z gRNA. | |||
Razviti sintetični nastavljivi promotorji vsebujejo univerzalna in specifična aktivacijska mesta, kar omogoča natančno in prilagodljivo regulacijo izražanja posameznih genov brez medsebojnega vpliva. V študiji so potrdili njihovo učinkovitost pri enogenski in večgenski ekspresiji ter pokazali, da omogočajo ortogonalno in stopnjevano regulacijo izražanja v sesalskih celicah. | |||
==Materiali in metode== | ==Materiali in metode== | ||
Revision as of 16:30, 25 May 2025
Izhodiščni članek: Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
Uvod
Sintetična biologija omogoča dekodiranje in oblikovanje genetskih sistemov za boljše razumevanje delovanja celic. Natančna, prostorsko in časovno usklajena regulacija izražanja genov je ključna za celične funkcije in prilagodljivost. Pri rekonstrukciji večgenskih sistemov se pogosto uporablja pristop »od spodaj navzgor«, s katerim lahko ustvarimo sisteme za raziskovanje naravnih procesov ali razvoj novih funkcij. Cilj predstavljene raziskave v izhodiščnem članku je bil razviti knjižnico sintetičnih nastavljivih promotorjev (STP-jev), ki omogočajo fleksibilno, večnivojsko in neodvisno regulacijo izražanja več genov v sesalskih celicah. Uporabili so metodo MPRA (“massively parallel reporter assays”), ki omogoča natančno kvantifikacijo aktivnosti številnih promotorjev hkrati preko njihovih unikatnih črtnih kod. Obstoječi konstitutivni promotorji niso primerni za dinamično uravnavanje, saj imajo stalno izražanje in ne reagirajo na spremembe v celičnem okolju. Zato so v tej raziskavi uporabili CRISPRa sistem, ki omogoča inducibilno aktivacijo transkripcije s pomočjo neaktivne dCas9, povezane z aktivacijsko domeno in vodene z gRNA. Razviti sintetični nastavljivi promotorji vsebujejo univerzalna in specifična aktivacijska mesta, kar omogoča natančno in prilagodljivo regulacijo izražanja posameznih genov brez medsebojnega vpliva. V študiji so potrdili njihovo učinkovitost pri enogenski in večgenski ekspresiji ter pokazali, da omogočajo ortogonalno in stopnjevano regulacijo izražanja v sesalskih celicah.
