BIO2 Seminar 2016

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

Ime Priimek	poglavje	Naslov seminarja	Recenzent 1	Recenzent 2	Datum oddaje	Datum recenzije	Datum predstavitve
Vida Štrancar	12	Zaznavanje vročine pri rastlinah	Jošt Hočevar	Neli Sedej	19/10/16	21/10/16	26/10/16
Janja Murn	12	Wnt signalizacija in njena regulacija	Ana Halužan Vasle	Domen Vaupotič	19/10/16	21/10/16	26/10/16
Katarina Petra van Midden	12	Nekroptoza- programirana celična smrt	Veronika Razpotnik	Tina Ivančir	19/10/16	21/10/16	26/10/16
Dominik Rebek	12	Vloga proteinske družine Bcl-2 pri apoptozi	Maša Bratkovič	Katja Malenšek	26/10/16	28/10/16	02/11/16
Maksimiljan Adamek	12	Avksin in njegova vloga v fototropizmu rastlin	David Dolhar	Maša Zorman	26/10/16	28/10/16	02/11/16
David Dolhar	12	Delovanje interferonov tipa I pri imunskem odzivu	Andrej Ivanovski	Jurij Nastran	26/10/16	28/10/16	02/11/16
Anja Šantl	14-15	Vloga FOXO proteinov pri sladkorni bolezni tipa 2	Vida Štrancar	Jošt Hočevar	02/11/16	04/11/16	09/11/16
Lana Vogrinec	14-15	Metabolizem laktata v možganih	Janja Murn	Ana Halužan Vasle	02/11/16	04/11/16	09/11/16
Ajda Cafun	14-15	Transkripcijska regulacija hepatičnega metabolizma lipidov	Katarina Petra van Midden	Ana Obaha	02/11/16	04/11/16	09/11/16
Iztok Štuhec	16	Vpliv povišanih koncentracij intermediatov citratnega cikla na nastanek tumorjev	Dominik Rebek	Maša Bratkovič	09/11/16	11/11/16	16/11/16
Valentina Novak	16	Alternativni načini organizacije cikla citronske kisline v rastlinah	Maksimiljan Adamek	David Dolhar	09/11/16	11/11/16	16/11/16
Zala Živič	16	Vpliv intermediatov Krebsovega cikla na staranje organizma	Ana Obaha	Andrej Ivanovski	09/11/16	11/11/16	16/11/16
Natalija Pucihar	17	Izkoriščanje katabolizma maščobnih kislin za goriva in druge kemijske produkte	Mateja Luzar	Kristina Piškur	15/11/16	17/11/16	22/11/16
Aljaž Božič	17	Regulacija katabolizma maščob: vpliv vadbe in okoljskega stresa	Anja Šantl	Vida Štrancar	16/11/16	18/11/16	23/11/16
Ajda Lenardič	17	Ketonska telesca-nova vrsta dopinga?	Lana Vogrinec	Janja Murn	16/11/16	18/11/16	23/11/16
Tanja Peric	17	Vpliv fitokemikalij na regulacijo katabolizma maščobnih kislin	Ajda Cafun	Katarina Petra van Midden	16/11/16	18/11/16	23/11/16
Kristina Piškur	18		Natalija Pucihar	Mateja Luzar	22/11/16	25/11/16	29/11/16
Nejc Arh	18	Metabolizem L-arginina in imunski sistem	Iztok Štuhec	Dominik Rebek	23/11/16	26/11/16	30/11/16
Tomaž Žigon	18	Vloga ureaz v naravi [1]	Valentina Novak	Maksimiljan Adamek	23/11/16	26/11/16	30/11/16
Urban Ferčec	18	Možganska glutaminaza in njena vloga v metabolizmu	Zala Živič	Veronika Razpotnik	23/11/16	26/11/16	30/11/16
Eva Klemenčič	19	Mitohondrijske kriste in lepota njihove dinamičnosti	Aljaž Božič	Anja Šantl	30/11/16	03/12/16	07/12/16
David Titovšek	19	Nastanek in odstranjevanje ROS v mitohondrijih	Ajda Lenardič	Lana Vogrinec	30/11/16	03/12/16	07/12/16
Karmen Žbogar	19		Tanja Peric	Ajda Cafun	30/11/16	03/12/16	07/12/16
Aljoša Marinko	20		Nejc Arh	Iztok Štuhec	07/12/16	10/12/16	14/12/16
Pia Lavriha	20	Vpogled v strukturo in delovanje celuloznih sintaz pri rastlinah ter bakterijah	Tomaž Žigon	Valentina Novak	07/12/16	10/12/16	14/12/16
Samo Purič	20	Glikozilacija bakterijskih proteinov	Urban Ferčec	Zala Živič	07/12/16	10/12/16	14/12/16
Mateja Luzar	21		Kristina Piškur	Natalija Pucihar	13/12/16	16/12/16	20/12/16
Ela Hudovernik	21		Eva Klemenčič	Aljaž Božič	14/12/16	17/12/16	21/12/16
Neli Sedej	21		David Titovšek	Ajda Lenardič	14/12/16	17/12/16	21/12/16
Domen Vaupotič	21		Karmen Žbogar	Tanja Peric	14/12/16	17/12/16	21/12/16
Tina Ivančir	22	Biosinteza serotonina iz triptofana v povezavi s prehrano in počutjem	Aljoša Marinko	Nejc Arh	28/12/16	02/01/16	04/01/17
Katja Malenšek	22		Pia Lavriha	Tomaž Žigon	28/12/16	02/01/16	04/01/17
Maša Zorman	22		Samo Purič	Urban Ferčec	28/12/16	02/01/16	04/01/17
Jurij Nastran	23		Ela Hudovernik	Eva Klemenčič	04/01/17	07/01/17	11/01/17
Jošt Hočevar	23		Neli Sedej	David Titovšek	04/01/17	07/01/17	11/01/17
Ana Halužan Vasle	23		Domen Vaupotič	Karmen Žbogar	04/01/17	07/01/17	11/01/17
Ana Obaha	23		Tina Ivančir	Aljoša Marinko	10/01/17	13/01/17	17/01/17
Maša Bratkovič	23		Katja Malenšek	Pia Lavriha	11/01/17	14/01/17	18/01/17
Veronika Razpotnik	23		Maša Zorman	Samo Purič	11/01/17	14/01/17	18/01/17
Andrej Ivanovski	23		Jurij Nastran	Ela Hudovernik	11/01/17	14/01/17	18/01/17

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Zelo pomembno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v toku celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili vpišite na tukaj.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
• 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.