Temelji biokemije 2023 - seminar

Seminarje vodi doc. dr. Miha Pavšič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.

Seznam seminarjev

Priimek in ime	Naslov seminarja	Povezava	Rok za oddajo	Rok za recenzijo	Datum predstavitve	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3
Fink, Luka	Protitumorsko zdravilo spodbuja hujšanje pri miših	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220224140853.htm	04.03.	07.03.	10.03.	Bunc, Zara	Pečovnik Wutt, Naja	Malik, Lara
Kogoj, Lena	Umetno narejene proteinske mišice zdaj realnost	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/01/220128141254.htm	04.03.	07.03.	10.03.	Pucihar, Samo	Pojbič, Taja	Novel, Matija
Korošec, Tinkara	Superbakterije in novi pristopi k razumevanju vzroka rezistence	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220217181730.htm	04.03.	07.03.	10.03.	Kovaček, Lucija	Trček, Laura	Petrovič, Filip
Krašna, Deni	Odkrit ključ za nadzor celične smrti	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220218100724.htm	04.03.	07.03.	10.03.	Stojić, Ivana	Bernik, Miha	Kolenc, Klara
Mezek, Tajda	Multipla skleroza verjetno posledica okužbe z Epstein-Barr virusom	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/01/220113151342.htm	04.03.	07.03.	10.03.	Trajković, Miljan	Jeromelj, Tonja	Koren, Žiga
Auer, Špela	Vpliv proteina na vnetja	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/01/220125124029.htm	11.03.	14.03.	17.03.	Žerovnik, Klara	Poljanšek, Aleš	Matek, Nik
Mikoš, Ula	Unikaten tubulin, ki se v amebi igra skrivalnice	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220225085843.htm	11.03.	14.03.	17.03.	Zupanc, Lara	Vogrič, Vanja	Trost, Teo
Mužič, Taja	Smrtonosna kombinacija, ki neposredno sproži celično smrt	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/01/220113111451.htm	11.03.	14.03.	17.03.	Petrov, Mario	Vranješ, Tin	Varlamov, Mark
Rajterič, Lara	Z novim sistemom do hitrejšega nadzora nad nanodelci za dostavo zdravil	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220210114055.htm	11.03.	14.03.	17.03.	Trobiš, Veronika	Agrež, Tim-David	Justin, Klemen
Simonič, Laura	Yin in Yang mitohondrijske arhitekture	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220210154147.htm	11.03.	14.03.	17.03.	Velkovska, Tamara	Bunc, Zara	Kresal, Martin
Kristanc, Pia	pH odgovoren za bakterijsko rezistenco	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220218080243.htm	18.03.	21.03.	24.03.	Fink, Luka	Pucihar, Samo	Pečovnik Wutt, Naja
Lah, Urša	Kolibaktin; bakterijski toksin, ki sproži indukcijo profaga	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220223111242.htm	18.03.	21.03.	24.03.	Kogoj, Lena	Kovaček, Lucija	Pojbič, Taja
Mohar, Teja	(Bio)zaznavanje proteinskih interakcij	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220223104855.htm	18.03.	21.03.	24.03.	Korošec, Tinkara	Stojić, Ivana	Trček, Laura
Tušek, Marcel	Protein, ki izrazito pospeši izrazitev genov	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/03/220310143750.htm	18.03.	21.03.	24.03.	Krašna, Deni	Trajković, Miljan	Bernik, Miha
Brajer, Mirta	Sodelovanje virusov in bakterij pri nastanku raka	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220224112615.htm	25.03.	28.03.	31.03.	Mezek, Tajda	Žerovnik, Klara	Jeromelj, Tonja
Kastelic, Gal	avtofagija pomaga pri celjenju ran	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/03/220310115134.htm	25.03.	28.03.	31.03.	Auer, Špela	Zupanc, Lara	Poljanšek, Aleš
Malik, Lara			25.03.	28.03.	31.03.	Mikoš, Ula	Petrov, Mario	Vogrič, Vanja
Novel, Matija		https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220211102033.htm	25.03.	28.03.	31.03.	Mužič, Taja	Trobiš, Veronika	Vranješ, Tin
Petrovič, Filip	Reprogramiranje možganskih tumorjev	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/01/220105103131.htm	25.03.	28.03.	31.03.	Rajterič, Lara	Velkovska, Tamara	Agrež, Tim-David
Kolenc, Klara	Odkrili kako virusi povzročijo avtoimune bolezni	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220228103805.htm	01.04.	04.04.	07.04.	Simonič, Laura	Fink, Luka	Bunc, Zara
Koren, Žiga			01.04.	04.04.	07.04.	Kristanc, Pia	Kogoj, Lena	Pucihar, Samo
Matek, Nik			01.04.	04.04.	07.04.	Lah, Urša	Korošec, Tinkara	Kovaček, Lucija
Trost, Teo	Sonogenetika in aktivacija živalskih celic z ultrazvokom	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220209093410.htm	01.04.	04.04.	07.04.	Mohar, Teja	Krašna, Deni	Stojić, Ivana
Varlamov, Mark	Razmnoževanje virusa ošpic	https://www.sciencedaily.com/releases/2021/09/210923115553.htm	01.04.	04.04.	07.04.	Tušek, Marcel	Mezek, Tajda	Trajković, Miljan
Justin, Klemen	Protein SARS-CoV-2 krivec za okužbe, a tudi pot do rešitve	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220216121828.htm	08.04.	11.04.	14.04.	Brajer, Mirta	Auer, Špela	Žerovnik, Klara
Kresal, Martin			08.04.	11.04.	14.04.	Kastelic, Gal	Mikoš, Ula	Zupanc, Lara
Pečovnik Wutt, Naja			08.04.	11.04.	14.04.	Malik, Lara	Mužič, Taja	Petrov, Mario
Pojbič, Taja			08.04.	11.04.	14.04.	Novel, Matija	Rajterič, Lara	Trobiš, Veronika
Trček, Laura			08.04.	11.04.	14.04.	Petrovič, Filip	Simonič, Laura	Velkovska, Tamara
Bernik, Miha			15.04.	18.04.	21.04.	Kolenc, Klara	Kristanc, Pia	Fink, Luka
Jeromelj, Tonja			15.04.	18.04.	21.04.	Koren, Žiga	Lah, Urša	Kogoj, Lena
Poljanšek, Aleš	Nov koncept za boj proti odpornosti bakterij na antibiotike	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220222135331.htm	15.04.	18.04.	21.04.	Matek, Nik	Mohar, Teja	Korošec, Tinkara
Vogrič, Vanja			15.04.	18.04.	21.04.	Trost, Teo	Tušek, Marcel	Krašna, Deni
Vranješ, Tin			15.04.	18.04.	21.04.	Varlamov, Mark	Brajer, Mirta	Mezek, Tajda
Agrež, Tim-David			22.04.	25.04.	28.04.	Justin, Klemen	Kastelic, Gal	Auer, Špela
Bunc, Zara		https://www.sciencedaily.com/releases/2022/03/220307113136.htm	22.04.	25.04.	28.04.	Kresal, Martin	Malik, Lara	Mikoš, Ula
Pucihar, Samo			22.04.	25.04.	28.04.	Pečovnik Wutt, Naja	Novel, Matija	Mužič, Taja
Dehondt, Johan		https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220225100249.htm	22.04.	25.04.	28.04.
Vitard, Arthur			22.04.	25.04.	28.04.
Kovaček, Lucija		https://www.sciencedaily.com/releases/2022/03/220301192417.htm	29.04.	02.05.	05.05.	Pojbič, Taja	Petrovič, Filip	Rajterič, Lara
Stojić, Ivana	Biološke nevrone kmalu nadomestili umetni	https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220222121302.htm	29.04.	02.05.	05.05.	Trček, Laura	Kolenc, Klara	Simonič, Laura
Trajković, Miljan			29.04.	02.05.	05.05.	Bernik, Miha	Koren, Žiga	Kristanc, Pia
Žerovnik, Klara		https://www.sciencedaily.com/releases/2022/03/220314120705.htm	29.04.	02.05.	05.05.	Jeromelj, Tonja	Matek, Nik	Lah, Urša
Zupanc, Lara		https://www.sciencedaily.com/releases/2022/02/220228190958.htm	29.04.	02.05.	05.05.	Poljanšek, Aleš	Trost, Teo	Mohar, Teja
Petrov, Mario			06.05.	09.05.	12.05.	Vogrič, Vanja	Varlamov, Mark	Tušek, Marcel
Trobiš, Veronika			06.05.	09.05.	12.05.	Vranješ, Tin	Justin, Klemen	Brajer, Mirta
Velkovska, Tamara			06.05.	09.05.	12.05.	Agrež, Tim-David	Kresal, Martin	Kastelic, Gal

Naloga

• Samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2021. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
• Članke na temo lahko iščete z Google učenjakom.
• Naslov izbrane teme (naslov seminarja v slovenščini) in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo .
• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah – najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1–2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
• Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu. Povezava je objavljena v [spletni učilnici https://ucilnica.fkkt.uni-lj.si/].
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 10 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
• Predstavitvi sledi razprava do 5 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve, tako kot ostali kolegi.
• En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Torej, povzeto:

1. Seminarsko nalogo avtor do določenega datuma odda tukaj, istočasno pa se povzetek v odda tukaj.

2. Do določenega datuma recenzenti pregledajo nalogo in oddajo datoteko z morebitnimi komentarji/popravki tukaj, istočasno pa oddajo svojo recenzentsko oceno preko povezave v spletni učilnici.

3. Avtor pripravi končno obliko seminarske naloge in jo odda tukaj vsaj 1 dan pred predstavitvijo.

4. Po predstavitvi vsi (tako recenzenti kot ostali kolegi) oddate oceno predstavitve preko povezave v spletni učilnici.

Ne pozabite na pravila pri poimenovanju datotek.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate, poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:

• TBK_2022_Priimek_Ime.docx za seminar, npr. TBK_2022_Guncar_Gregor.docx
• TBK_2022_Priimek_ime_final.docx za končno verzijo seminarja
• TBK_2022_Priimek_Ime_rec_Priimek2.docx za recenzijo (ne TBK_2022_Priimek_Ime.docx_rec_Priimek2.docx), kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2022_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• TBK_2022_Priimek_Ime.pdf za prezentacijo (PowerPoint -> Shrani kot PDF), npr TBK_2022_Guncar_Gregor.pdf
• TBK_2022_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2022_Guncar_Gregor_clanek.pdf

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije, za katero želite izvedeti faktor vpliva, in pritisnite na gumb POIŠČI. Če želite videti vse revije, enostavno v iskalno polje vpišite *. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za tekoče leto faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.