Molekularna biologija RNA

Seminarji pri Molekularni biologiji v študijskem letu 2024/25 obravnavajo široko področje RNA, od njenih posebnih strukturnih lastnosti, različnih tipov RNA v živih celicah, proteinov, ki se vežejo na RNA, regulatorne vloge pri izražanju genov, pa vse do sprememb, ki so povezane s patološkimi stanji in do uporabe RNA pri pripravi cepiv in razvoju zdravil.

Naslovi seminarskih tem so navedeni na spodnjem seznamu.

Vse teme temeljijo na preglednih člankih, kar pomeni, da obravnavajo zaključene tematike, na katerih je bilo opravljenega že veliko dela. Zato praviloma vsako temo obdelajo po trije študenti. Vsaka skupina mora pripraviti povzetek seminarja z vsaj 1200 besedami in ne več kot 1800 besedami in ga objaviti na tem wikiju. Povzetek ne vsebuje slikovnega gradiva, lahko pa vključuje povezave do slik in videov na spletu. Navedite do 5 ključnih virov (ti ne štejejo v vsoto 1200–1800 besed), ki ste jih uporabili. Če izjemoma seminar pripravita dva študenta, je obseg povzetka 1000-1500 besed, če je študent sam, pa 800-1200 besed.

Vsaka skupina mora objaviti povzetek seminarja na wikiju najkasneje 24 h pred predstavitvijo svojega seminarja. Kateri del povzetka je napisal kdo, navedite v zavihku 'discussion'. Predstavitev naj bo dolga 15–20 minut, temu pa bo sledila razprava (pribl. 5 minut). Vsak član skupine mora predstaviti en del seminarja, pri čemer mora biti delo enakomerno razdeljeno med vse. Osredotočite se na osnovno temo, ki ste si jo izbrali, in vključite le malo splošnega uvoda, kjer je mogoče pa izpostavite ključne razlike v procesih med bakterijami, evkarionti in arhejami. Če seminar predstavljata dva študenta, imata na voljo 12-15 minut, če je študent sam, pa 8-10 minut.

Seminarske predstavitve bodo potekale med 16. aprilom in 14. majem 2024. V tem času ne bo klasičnih predavanj, torej bodo tako ponedeljkovi kot sredini termini namenjeni seminarjem.

Vsebina seminarjev je izpitna snov. Iz teme seminarjev je ~10 % vprašanj na izpitu (oz. ~10 % točk dobite za odgovore iz snovi seminarjev).

Razdelitev seminarjev je potekala v okolju Google Drive, kjer so (bile) navedene povezave do izhodiščnih člankov, s katerimi lahko začnete iskanje literature. Večinoma navedeni viri ne zadoščajo, da bi pripravili kvaliteten 15-minutni seminar, zato boste morali pregledati tudi nekaj primarnih virov (raziskovalnih člankov), ki jih boste poiskali sami oz. jih boste našli citirane v preglednih člankih. Vaši seminarji naj se osredotočijo na osnovno temo iz naslova in naj nimajo dolgih splošnih uvodov. Seminarji si bodo namreč sledili dokaj hitro eden za drugim, tako da boste osnove hitro osvojili in jih ni treba ponavljati.

Ko boste pripravljali povzetek, naslov izbrane teme, ki ga vpišete na spodnji seznam, povežite z novo wiki stranjo, ki bo vsebovala povzetek. Na koncu besedila povzetka (pod viri) v novo vrstico dodajte oznako: [[Category:SEM]] [[Category:BMB]]. Primer, kako so bili urejeni seminarji lani, si lahko ogledate na strani Molekularna biologija plazmidov.

Seznam tem in referenti:

16. april:

• RNA kataliza: napredek pri ribocimsko kataliziranem prenosu alkilne skupine (Julija Dolinšek, Tjaša Turk, Jošt Žulič)
• Kanonične in nekanonične funkcije​ nekodirajoče RNA-komponente (TERC)​ telomeraznega kompleksa (Veronika Štrekelj Istinič, Anamarija Rozina, Hana Funa)
• Vloga metilacije RNA pri uravnavanju usode matičnih celic (Tinkara Pepelnjak, Lana Traven)
  
• Vpliv strukturnih značilnosti 5’-UTR na kontrolo translacije pri evkariontih (Vita Šavli, Zala Kek, Anja Kokol)

23. april:

• Vloga malih nekodirajočih RNA pri regulaciji RNA metabolizma rastlin (Manja Drobne, Jana Likar Ivanov, Zoja Mramor)
• Biogeneza in funkcija endogenih malih nekodirajočih RNA pri živalih (Rok Sušnik, David Šuštar, Samo Volovšek)
• Heterogenost in funkcionalna specializacija ribosomov (Art Špegel, Taja Tepuš, Hana Vozelj)
• LncRNA-ključni dejavnik pri vplivu telesne aktivnosti na razvoj raka (Sara Kragelj)

5. maj:

• snoRNA pri človeku in njihova vloga pri razvoju bolezni (Lan Tanko, David Marinko, David Kranjc)
• Vloga tsRNA v praživalskih parazitih (Maša Markun, Jedrt Šinkovec, Vita Škarabot)
• Vloga tsRNA pri regulaciji celične smrti in razvoju bolezni (Tjaša Velkavrh, Ema Mataln Smehov, Laura Savič)
• Vloga RNA in RNA epigenetskih procesov pri HTLV-1 (Ema Kafol, Neja Prodan, Hana Marovt)
• Viroidi in retrocimi - krožne RNA zmožne avtonomne replikacije (Nina Kokalovikj, Lola Ilievska, Nejc Ljubič)

7. maj:

• RNA vezavni proteini (Žan Kos, Loti Rotar, Katja Schrader)
• MiRNA v bolezenskih stanjih (David Lenart, Aljaž Kos, Urban Črv)
• Zdravljenje luskavice: možna vloga miRNA (Manca Pintar, Mia Plantan)
• Raziskave RNA v razvoju zdravil: preboji, priložnosti in izzivi (Luka Planinc, Nejc Kovačič, Matic Krašna)

12. maj:

• seminar 1
• seminar 2
• seminar 3
• RNA interferenca in uporaba v agrikulturi (Maša Kovačič, Nika Ciglar, Blaž Zajc)

14. maj:

• seminar 1