BIO2 2010 Seminar
14. januarja se predavanje začne že ob 8:30 v Veliki predavalnici IJS!
21. januarja bo predavanje v Kolarjevi predavalnici ob 9:00
Biokemijski seminar
Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.
Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.
Ime in priimek | Naslov članka | Rok za oddajo | Rok za recenzijo | Datum predstavitve | Recenzent1 | Recenzent2 |
Gregor Gunčar | naslov seminarja | |||||
DIMITRIJEVIĆ ĐORĐE | PLC regulacija: nastajajoči modeli molekularnih mehanizmov | 20.10. | 25.10. | 29.10. | Berčič Tjaša | Berki Barbara |
KRAJNC ALEKSANDER | Oligomerske oblike z G proteinom sklopljenih receptorjev (GPCR) | 20.10. | 25.10. | 29.10. | Bevc Luka | Bezeljak Urban |
FRANČIČ VITO | Proteini WD40: središča v omrežju celičnih biokemijskih interakcij | 20.10. | 25.10. | 29.10. | Bigec Tjaša | Bratuš Maruša |
CAF - FELDIN ŽAN | Glycolysis: a bioenergetic or a survival pathway? | 20.10. | 27.10. | 3.11. | Simonič Nataša | Bremec Kristina |
ŽELEZNIK ŽAN | Biokemijska in strukturna osnova za trans-v-cis izomerizacijo retinoidov v kemiji vida | 28.10. | 2.11. | 5.11. | Caf-Feldin | Dimitrijević |
PRIMC TISA | Apoptoza inducirana prek smrtnih receptorjev | 28.10. | 2.11. | 5.11. | Frančič | Hadanović |
RAZBORŠEK BRIGITA | Adhezijski GPCR-ji: odkrivanje pomena novih receptorjev | 28.10. | 3.11. | 10.11. | Hriberšek | Juvančič |
SIMONIČ NATAŠA | Botulin in tetanus nevrotoksin: struktura, delovanje in terapevtska uporaba | 29.10. | 5.11. | 12.11. | Kogoj | Kolar |
OGRIN LAURA | Kooperativni in nekooperativni ionski kanali CNG | 29.10. | 5.11. | 12.11. | Kolenc | Krajnc |
DIMITRIJEVIČ ĐORĐE | 3.11. | 10.11. | 17.11. | |||
PERME NEJC | Mehanizmi zaznavanja glukoze v evkariontskih celicah | 5.11. | 12.11. | 19.11. | Primc | Ogrin |
PODJED ŠPELA | Strukturne lastnosti RNA-stikal, ki vežejo metabolite | 5.11. | 12.11. | 19.11. | Perme | Rot |
ŽBOGAR URŠKA | Multifunkcionalnost glikolitičnih encimov | 10.11. | 17.11. | 24.11. | Podjed | Razboršek |
NARAGLAV NIVES | Protein kinaze: evolucija dinamično reguliranih proteinov | 12.11. | 19.11. | 26.11. | Rovanšek | Rupar |
BEZELJAK URBAN | Na novo odkrite skrivnosti aktomiozinskega delovnega takta | 12.11. | 19.11. | 26.11. | Stupar | Šćuk |
ŽLAJPAH MARGARETA | Regulacija HIF-1 proteina | 12.11. | 19.11. | 26.11. | Tolar | Žbogar |
KOLAR SABINA | Bridging the GAP between insulin signaling and GLUT4 translocation | 19.11. | 24.11. | 1.12. | Umek | Korpar |
HANDANOVIĆ ELMINA | Biokemijski pristop k staranju | 26.11. | 1.12. | 3.12. | Žlajpah | Železnik |
BRATUŠ MARUŠA | Mitohondriji kot jih ne poznamo | 26.11. | 1.12. | 3.12. | Pavlovič | Primec |
RUPAR KAJA | Sirtuini - reguliranje mitohondrija | 2.12. | 6.12. | 8.12. | Gorečan | Gregorič |
BERKI BARBARA | Evolucija mitohondrijev | 3.12. | 7.12. | 10.12. | Tolar | Rovanšek |
JUVANČIČ JANJA | Uvoz proteinov v mitohondrij | 3.12. | 7.12. | 10.12. | Caf-Feldin | Berčič |
ROT ZALA | Homologi mitohondrijskega razklopnega proteina UCP1 | 3.12. | 8.12. | 15.12. | Primec | Korpar |
KOLENC FILIP | Post-translational modifications in signal integration | 3.12. | 10.12. | 17.12. | Bevc | Flis |
ŠČUK DINO | Mechanisms of lipid-body formation | 6.12. | 13.12. | 17.12. | Bigec | Železnik |
BEVC LUKA | Hormon sensitive lipase | 5.12. | 10.12. | 17.12. | Gorečan | Kolenc |
nihče | Regulatory crosstalk of the metabolic network | 8.12. | 15.12. | 22.12. | ||
ROVANŠEK VERONIKA | The yin-yang of cobalamin biochemistry | 17.12. | 19.12. | 24.12. | Bezeljak | Ogrin |
BERČIČ TJAŠA | The thiolase superfamily: condensing enzymes with diverse reaction specificities | 17.12. | 19.12. | 24.12. | Hriberšek | Bremec |
BIGEC TJAŠA | Glutamine addiction | 17.12. | 19.12. | 24.12. | Juvančič | Razboršek |
KOGOJ MAJA | Kontrola metabolizma s cirkadianim ritmom in obratno | 22.12. | 29.12. | 5.1. | Rupar | Gregorič |
BREMEC KRISTINA | Eukaryotic transcription factors as direct nutrient sensors | 24.12. | 3.1. | 7.1. | Stupar | Žlajpah |
STUPAR UROŠ | Many paths to methyltransfer: a chronicle of convergence | 24.12. | 3.1. | 7.1. | Handanović | Pavlovič |
TOLAR EVA | Light-regulated transcriptional networks in higher plants | 24.12. | 3.1. | 7.1. | Dimitrijević | Podjed |
UMEK ŠPELA | Membrane lipids: where they are and how they behave | 3.1. | 7.1. | 12.1. | Kranjc | Primc |
HRIBERŠEK DAMJANA | Prenos signalov preko biološko aktivnih lipidov: Sfingolipidi | 3.1. | 7.1. | 14.1. | Naraglav | Rot |
KORPAR TANJA | Cellular strategies for the assembly of molecular machines | 3.1. | 7.1. | 14.1. | Perme | Bratuš |
PAVLOVIČ TONJA | Adipokines as novel modulators of lipid metabolism | 7.1. | 11.1. | 14.1. | Frančič | Žbogar |
GOREČAN PETRA | Leptin and the regulation of body weight in mammals | 5.1. | 12.1. | 19.1. | Simonič | Kolar |
GREGORIČ TINA | mTOR- from growth signal integration to cancer, diabetes and ageing | 13.1. | 17.1. | 21.1. | Kogoj | Umek |
PRIMEC SARA | Inventory control: cytochrome c oxidase assembly regulates mitochondrial translation | 13.1. | 17.1. | 21.1. | Berki | Flis |
FLIS TJAŠA | Fructose induced lipogenesis + sami poiščite še dodatne vire! | 13.1. | 17.1. | 21.1. | Ščuk | Naraglav |
Gradivo za seminarje
Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame
Naloga
Vaša naloga za seminar je:
A) v skupini še z enim kolegom pripraviti opis enega gesla v poglavju Biokemijski leksikon
B) samostojno pripraviti seminar, katerega osnova je znanstveni članek, ki ga določi docent
A: Leksikografsko geslo
Za vpis gesla veljajo naslednja pravila:
- Geslo je lahko iz katere od že vpisanih kategorij ali pa izberete svoje. Če geslo še ni vpisano v kazalu, ga smiselno uvrstite vanj.
- Do 12. decembra 2010 do 12. ure vpišite v tabelo skupin BIO2 Seminar-geslo, katero temo ste si izbrali. Preden se odločite za svojo temo, preverite, da si ni iste izbral že kdo drug.
- Razlaga gesla naj obsega med 500 in 600 besed in vsaj eno povezavo na slikovno gradivo drugje na internetu. Ne nalagajte slik, ki so avtorsko zaščitene!
- Opis pod A morate dokončati do 12. januarja 2010 do 12. ure.
B: Seminar
Za pripravo seminarja velja naslednje:
- Docent določi članek, ki ga boste obravnavali v okviru seminarja
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom. Povezave do slik so dobrodošle, niso pa nujne.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2800 do 3000 besed), vsebovati mora vsaj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
- Natisnjen seminar oddajte dva tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
- Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
- Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsaj dve vprašanji.
- Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
- Seminarska naloga, povzetek in opis gesla morajo biti v slovenskem jeziku!
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Citiranje virov
Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.
Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.
Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.
Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.
Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.