BIO2 Seminar 2017
Biokemijski seminar
doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022
Seznam seminarjev
Ime Priimek | poglavje | Naslov seminarja | Recenzent 1 | Recenzent 2 | Datum oddaje | Datum recenzije | Datum predstavitve |
Ines Medved | 12 | Receptorji za vonj v epidermisu | Špela Supej | Lea Knez | 20/10/16 | 23/10/16 | 25/10/16 |
Luka Gregorič | 12 | Pozitivne vloge negativnih regulatorjev | Uroš Prešern | Katja Doberšek | 20/10/16 | 23/10/16 | 25/10/16 |
Daria Latysheva | 12 | The role of intrinsically disordered proteins in signallng pathways and regulation | Luka Fratina | Martin Špendl | 20/10/16 | 23/10/16 | 25/10/16 |
Polona Skrt | 12 | Mehanizem zaznavanja okusa maščobe | Andreja Habič | Ajda Galič | 03/11/16 | 06/11/16 | 08/11/16 |
Peter Škrinjar | 12 | Receptorji za okus in njihova povezava z debelostjo | Andrej Race | Nika Zaveršek | 03/11/16 | 06/11/16 | 08/11/16 |
Milica Janković | 12 | Nuklearni receptorji: Karakteristike in regulacija receptorjev ter identifikacija ligandov | Anže Jenko | Nika Goršek | 03/11/16 | 06/11/16 | 08/11/16 |
Tina Turel | 14-15 | Vpliv mikroorganizmov na presnovo glukoze | Ines Medved | Špela Supej | 10/11/16 | 13/11/16 | 15/11/16 |
Barbara Slapnik | 14-15 | Regulacija metabolizma glukoze v celičnih kulturah | Luka Gregorič | Uroš Prešern | 10/11/16 | 13/11/16 | 15/11/16 |
Ana Maklin | 14-15 | Vloga PGP in PHO13 v metabolizmu | Daria Latysheva | Luka Fratina | 10/11/16 | 13/11/16 | 15/11/16 |
Ajda Krč | 16 | Spremembe v delovanju Krebsovega cikla in sposobnost prilagajanja parazitov na razmere v okolju | Polona Skrt | Andreja Habič | 17/11/16 | 20/11/16 | 22/11/16 |
Urban Hribar | 16 | Metabolizem polariziranih makrofagov | Peter Škrinjar | Andrej Race | 17/11/16 | 20/11/16 | 22/11/16 |
Urška Zagorc | 16 | Salmonela in citratni cikel | Milica Janković | Anže Jenko | 17/11/16 | 20/11/16 | 22/11/16 |
Patrik Levačić | 17 | Ceramidi in njihova povezava z debelostjo | Tina Turel | Ines Medved | 24/11/16 | 27/11/16 | 29/11/16 |
Jerneja Nimac | 17 | Ketonska telesca kot signalni metaboliti | Barbara Slapnik | Luka Gregorič | 24/11/16 | 27/11/16 | 29/11/16 |
Lija Srnovršnik | 17 | Hepatična oksidacija maščobnih kislin med stradanjem | Ana Maklin | Daria Latysheva | 24/11/16 | 27/11/16 | 29/11/16 |
Nika Mikulič | 18 | Hiperamoniemija in metode zdravljenja | Ajda Krč | Polona Skrt | 01/12/16 | 04/12/16 | 06/12/16 |
Tanja Zupan | 18 | Presnovne bolezni aminokislin | Urban Hribar | Peter Škrinjar | 01/12/16 | 04/12/16 | 06/12/16 |
Anja Tavčar | 18 | Regulacija imunskega odziva z metabolizmom l-argenina | Urška Zagorc | Milica Janković | 01/12/16 | 04/12/16 | 06/12/16 |
Maja Vrabec | 19 | Poškodbe mitohondrijske DNA in njihov vpliv na izražanje mitohondrijskih genov | Patrik Levačić | Tina Turel | 08/12/16 | 11/12/16 | 13/12/16 |
Špela Deučman | 19 | Vloga reaktivnih kisikovih zvrsti (ROS) pri celičnem signaliziranju | Jerneja Nimac | Barbara Slapnik | 08/12/16 | 11/12/16 | 13/12/16 |
Anja Černe | 19 | Mitohondrijski stres obnavlja odgovor na toplotni šok in preprečuje padec proteostaze med staranjem | Lija Srnovršnik | Ana Maklin | 08/12/16 | 11/12/16 | 13/12/16 |
Lea Knez | 20 | Ogljikovi hidrati kot signalne molekule v rastlinah | Nika Mikulič | Ajda Krč | 15/12/16 | 18/12/16 | 20/12/16 |
Katja Doberšek | 20 | Tanja Zupan | Urban Hribar | 15/12/16 | 18/12/16 | 20/12/16 | |
Martin Špendl | 20 | Anja Tavčar | Urška Zagorc | 15/12/16 | 18/12/16 | 20/12/16 | |
Ajda Galič | 21 | Maja Vrabec | Patrik Levačić | 29/12/16 | 01/01/17 | 03/01/17 | |
Nika Zaveršek | 21 | Špela Deučman | Jerneja Nimac | 29/12/16 | 01/01/17 | 03/01/17 | |
Nika Goršek | 21 | Anja Černe | Lija Srnovršnik | 29/12/16 | 01/01/17 | 03/01/17 | |
Špela Supej | 22 | Lea Knez | Nika Mikulič | 05/01/17 | 08/01/17 | 10/01/17 | |
Uroš Prešern | 22 | Katja Doberšek | Tanja Zupan | 05/01/17 | 08/01/17 | 10/01/17 | |
Luka Fratina | 22 | Martin Špendl | Anja Tavčar | 05/01/17 | 08/01/17 | 10/01/17 | |
Andreja Habič | 23 | Ajda Galič | Maja Vrabec | 12/01/17 | 15/01/17 | 17/01/17 | |
Andrej Race | 23 | Nika Zaveršek | Špela Deučman | 12/01/17 | 15/01/17 | 17/01/17 | |
Anže Jenko | 23 | Nika Goršek | Anja Černe | 12/01/17 | 15/01/17 | 17/01/17 | |
Katja Dolenc | 23 | ? | ? | 20/01/17 | 22/01/17 | 24/01/17 |
- številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada
Gradivo za predavanja
Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame
Naloga
Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.
Za pripravo seminarja velja naslednje:
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Zelo pomembno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
- Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
- Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
- Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
- Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v toku celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili vpišite na tukaj.
- Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
- Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.
Imena datotek
Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:
- 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
- 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
- 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
- 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
- 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Citiranje virov
Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno.
Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.
Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C.
Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.
Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.
Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.